2436 genes were found for organism Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 25    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Hore_00010  CDS  NC_011899  593  1984  1392  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_002507759  hitchhiker  0.00536902  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00020  CDS  NC_011899  2332  3435  1104  DNA polymerase III, beta subunit  YP_002507760  normal  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00030  CDS  NC_011899  3451  3669  219  RNA-binding S4 domain protein  YP_002507761  normal  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00040  CDS  NC_011899  3670  4797  1128  DNA replication and repair protein RecF  YP_002507762  normal  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00050  CDS  NC_011899  4821  5090  270  hypothetical protein  YP_002507763  normal  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00060  CDS  NC_011899  5083  7011  1929  DNA gyrase, B subunit  YP_002507764  normal  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00070  CDS  NC_011899  7134  9584  2451  DNA gyrase, A subunit  YP_002507765  normal  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00080  CDS  NC_011899  9719  9913  195  hypothetical protein  YP_002507766  normal  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00090  CDS  NC_011899  10003  10833  831  ABC-type sugar transport system periplasmic component  YP_002507767  normal  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00100  CDS  NC_011899  11120  12715  1596  GerA spore germination protein  YP_002507768  normal  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00110  CDS  NC_011899  12699  13796  1098  spore germination protein  YP_002507769  normal  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00120  CDS  NC_011899  13793  14968  1176  spore germination B3 GerAC family protein  YP_002507770  normal  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00130  CDS  NC_011899  15393  15677  285  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  YP_002507771  normal  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00140  CDS  NC_011899  15680  16846  1167  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  YP_002507772  normal  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00150  CDS  NC_011899  17281  17748  468  hypothetical protein  YP_002507773  hitchhiker  0.00627174  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00160  CDS  NC_011899  18276  18533  258  predicted membrane protein  YP_002507774  hitchhiker  3.56401e-08  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00170  CDS  NC_011899  18626  19411  786  zinc/iron permease  YP_002507775  hitchhiker  1.72235e-12  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00180  CDS  NC_011899  26191  27204  1014  transport system permease protein  YP_002507776  hitchhiker  5.07964e-06  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00190  CDS  NC_011899  27211  28467  1257  ABC transporter related  YP_002507777  hitchhiker  0.00177587  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00200  CDS  NC_011899  28875  29462  588  hypothetical protein  YP_002507778  normal  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00210  CDS  NC_011899  29641  30039  399  death-on-curing family protein  YP_002507779  normal  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00220  CDS  NC_011899  30036  30260  225  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  YP_002507780  normal  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00230  CDS  NC_011899  30613  30894  282  hypothetical protein  YP_002507781  normal  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00240  CDS  NC_011899  31073  31786  714  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  YP_002507782  normal  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00250  CDS  NC_011899  31940  32761  822  hypothetical protein  YP_002507783  normal  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00260  CDS  NC_011899  32974  33846  873  hypothetical protein  YP_002507784  normal  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00270    NC_011899  34102  34926  825      normal  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00280  CDS  NC_011899  35574  35870  297  transposase IS3/IS911 family protein  YP_002507785  normal  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00290  CDS  NC_011899  35867  36742  876  Integrase catalytic region  YP_002507786  normal  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00300  CDS  NC_011899  36919  37542  624  Abortive infection protein  YP_002507787  normal  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00310  CDS  NC_011899  37748  38152  405  predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain  YP_002507788  normal  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00320  CDS  NC_011899  38149  38397  249  hypothetical protein  YP_002507789  normal  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00330  CDS  NC_011899  38734  39270  537  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_002507790  normal  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00340    NC_011899  39302  39514  213      normal  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00350  CDS  NC_011899  39531  40334  804  ABC-2 type transporter  YP_002507791  normal  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00360  CDS  NC_011899  41095  41493  399  hypothetical protein  YP_002507792  normal  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00370  CDS  NC_011899  41781  42023  243  hypothetical protein  YP_002507793  normal  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00380  CDS  NC_011899  42408  43676  1269  extracellular solute-binding protein family 1  YP_002507794  normal  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00390  CDS  NC_011899  43746  44894  1149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002507795  normal  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00400  CDS  NC_011899  44864  46255  1392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002507796  normal  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00410  CDS  NC_011899  46539  47552  1014  transcriptional regulator, LacI family  YP_002507797  normal  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00420  CDS  NC_011899  47678  50020  2343  Kojibiose phosphorylase  YP_002507798  normal  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00430  CDS  NC_011899  50126  50776  651  beta-phosphoglucomutase  YP_002507799  normal  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00440  CDS  NC_011899  50996  52012  1017  transcriptional regulator, LacI family  YP_002507800  normal  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00450  CDS  NC_011899  52044  53162  1119  ABC transporter related  YP_002507801  normal  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00460  CDS  NC_011899  53218  53511  294  YabP family protein  YP_002507802  normal  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00470  CDS  NC_011899  53551  53667  117  hypothetical protein  YP_002507803  normal  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00480  CDS  NC_011899  53950  55980  2031  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_002507804  normal  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00490  CDS  NC_011899  56327  56635  309  essential protein for formation of the spore cortex  YP_002507805  normal  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00500  CDS  NC_011899  56638  56919  282  Septum formation initiator  YP_002507806  normal  0.385837  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00510  CDS  NC_011899  56965  59133  2169  RNA binding S1 domain protein  YP_002507807  unclonable  2.09068e-13  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00520  CDS  NC_011899  59206  59580  375  RNA binding S1 domain protein  YP_002507808  unclonable  6.85433e-19  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00530  CDS  NC_011899  59688  60227  540  hypothetical protein  YP_002507809  hitchhiker  2.46936e-12  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00540  CDS  NC_011899  60224  61141  918  Exopolyphosphatase  YP_002507810  hitchhiker  3.36687e-07  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00550  CDS  NC_011899  61533  63905  2373  Serine/threonine specific protein phosphatase spoIIE  YP_002507811  hitchhiker  0.00773403  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00560  CDS  NC_011899  63977  65383  1407  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  YP_002507812  normal  0.0427403  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00570  CDS  NC_011899  65387  65947  561  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  YP_002507813  hitchhiker  0.00463004  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00580  CDS  NC_011899  66050  67942  1893  ATP-dependent metalloprotease FtsH  YP_002507814  hitchhiker  1.19838e-08  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00590  CDS  NC_011899  68192  69574  1383  Sodium:solute symporter  YP_002507815  unclonable  1.30807e-15  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00600  CDS  NC_011899  69708  71372  1665  Formate--tetrahydrofolate ligase  YP_002507816  hitchhiker  0.00136025  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00610  CDS  NC_011899  71776  72297  522  signal transduction histidine kinase, LytS  YP_002507817  normal  0.926743  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00620  CDS  NC_011899  72532  73437  906  quinolinate synthetase complex, A subunit  YP_002507818  normal  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00630  CDS  NC_011899  73468  75066  1599  L-aspartate oxidase  YP_002507819  normal  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00640  CDS  NC_011899  75053  75895  843  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  YP_002507820  normal  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00650  CDS  NC_011899  76101  77303  1203  2-alkenal reductase  YP_002507821  normal  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00660  CDS  NC_011899  77808  78788  981  biotin (acetyl-CoA carboxylase) synthetase  YP_002507822  normal  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00670  CDS  NC_011899  78930  79937  1008  basic membrane lipoprotein  YP_002507823  normal  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00680  CDS  NC_011899  80027  80800  774  pantothenate kinase  YP_002507824  normal  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00690  CDS  NC_011899  80808  81809  1002  putative TIM-barrel protein, nifR3 family  YP_002507825  normal  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00700  CDS  NC_011899  81799  83241  1443  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate-- lysine ligase  YP_002507826  normal  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00710  CDS  NC_011899  83509  84039  531  hypothetical protein  YP_002507827  normal  0.452843  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00720  CDS  NC_011899  84121  85038  918  hypothetical protein  YP_002507828  hitchhiker  0.000877673  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00730  CDS  NC_011899  85052  86140  1089  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  YP_002507829  decreased coverage  2.74075e-09  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00740  CDS  NC_011899  86296  86781  486  transcription elongation factor GreA  YP_002507830  hitchhiker  7.78945e-11  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00750  CDS  NC_011899  86800  88275  1476  Lysyl-tRNA synthetase  YP_002507831  hitchhiker  2.53681e-09  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00760  CDS  NC_011899  88378  88776  399  hypothetical protein  YP_002507832  hitchhiker  4.04598e-06  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00770  CDS  NC_011899  88980  90116  1137  ROK family protein  YP_002507833  hitchhiker  0.000483979  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00780  CDS  NC_011899  90301  91536  1236  extracellular solute-binding protein family 1  YP_002507834  normal  0.0480859  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00790  CDS  NC_011899  91772  92560  789  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002507835  normal  0.772214  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00800  CDS  NC_011899  92550  93392  843  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002507836  normal  0.303025  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00810  CDS  NC_011899  93505  94767  1263  oxidoreductase domain protein  YP_002507837  normal  0.133238  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00820  CDS  NC_011899  100377  100637  261  hypothetical protein  YP_002507838  normal  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00830  CDS  NC_011899  100815  101957  1143  hypothetical protein  YP_002507839  normal  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00840  CDS  NC_011899  102182  102655  474  transcriptional repressor, CtsR  YP_002507840  normal  0.292684  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00850  CDS  NC_011899  102658  103170  513  UvrB/UvrC protein  YP_002507841  normal  0.038021  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00860  CDS  NC_011899  103173  104222  1050  Arginine kinase  YP_002507842  hitchhiker  7.01118e-05  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00870  CDS  NC_011899  104235  106655  2421  ATPase AAA-2 domain protein  YP_002507843  hitchhiker  5.09164e-10  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00880  CDS  NC_011899  106731  108086  1356  DNA repair protein RadA  YP_002507844  unclonable  1.21912e-15  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00890  CDS  NC_011899  108091  109170  1080  DNA integrity scanning protein DisA  YP_002507845  decreased coverage  5.09025e-15  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00900  CDS  NC_011899  109298  109828  531  transcriptional regulator, CarD family  YP_002507846  decreased coverage  8.92061e-17  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00910  CDS  NC_011899  109934  111028  1095  PilT protein domain protein  YP_002507847  decreased coverage  2.74223e-15  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00920  CDS  NC_011899  111039  111728  690  2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase  YP_002507848  hitchhiker  5.94474e-15  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00930  CDS  NC_011899  111733  112230  498  2C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase  YP_002507849  hitchhiker  2.5776e-14  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00940  CDS  NC_011899  112220  113008  789  CBS domain containing protein  YP_002507850  hitchhiker  1.26291e-13  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00950  CDS  NC_011899  113314  114786  1473  glutamyl-tRNA synthetase  YP_002507851  hitchhiker  3.92193e-14  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00960  CDS  NC_011899  115070  116524  1455  cysteinyl-tRNA synthetase  YP_002507852  hitchhiker  8.45689e-10  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00970  CDS  NC_011899  116529  116915  387  ribonuclease III  YP_002507853  hitchhiker  2.06089e-09  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00980  CDS  NC_011899  116918  117604  687  thymidylate synthase, flavin-dependent  YP_002507854  hitchhiker  2.21907e-09  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_00990  CDS  NC_011899  117621  118355  735  RNA methyltransferase  YP_002507855  hitchhiker  3.14375e-09  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Hore_01000  CDS  NC_011899  118418  119065  648  RNA polymerase factor sigma-70  YP_002507856  hitchhiker  2.7918e-10  n/a    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 25    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>