196 genes were found for organism Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Smed_6330  CDS  NC_009622  297  965  669  hypothetical protein  YP_001314858  hitchhiker  0.0000557698  normal  0.19569  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6331  CDS  NC_009622  1324  1503  180  hypothetical protein  YP_001314859  normal  0.0297383  normal  0.174549  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6332  CDS  NC_009622  1637  2701  1065  glycoside hydrolase family protein  YP_001314860  normal  0.171538  normal  0.121489  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6333  CDS  NC_009622  2698  3741  1044  hypothetical protein  YP_001314861  normal  0.0138128  normal  0.366541  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6334  CDS  NC_009622  3862  4248  387  hypothetical protein  YP_001314862  normal  0.58146  normal  0.203718  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6335  CDS  NC_009622  4381  5304  924  homocysteine S-methyltransferase  YP_001314863  normal  normal  0.228765  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6336    NC_009622  5461  5701  241      normal  normal  0.198498  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6337    NC_009622  5731  6120  390      normal  normal  0.209129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6338  CDS  NC_009622  6172  6639  468  transposase IS3/IS911 family protein  YP_001314864  normal  normal  0.202859  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6339  CDS  NC_009622  6620  6973  354  IS66 Orf2 family protein  YP_001314865  normal  normal  0.191496  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6340  CDS  NC_009622  7027  8619  1593  transposase IS66  YP_001314866  normal  normal  0.360304  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6341  CDS  NC_009622  8597  10486  1890  putative PAS/PAC sensor protein  YP_001314867  normal  0.433344  normal  0.230755  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6342  CDS  NC_009622  10537  11547  1011  CheB methylesterase  YP_001314868  normal  0.582664  normal  0.191496  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6343  CDS  NC_009622  11534  11827  294  hypothetical protein  YP_001314869  normal  0.219478  normal  0.420777  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6344  CDS  NC_009622  12118  12594  477  putative reverse transcriptase  YP_001314870  normal  0.112164  normal  0.438979  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6345  CDS  NC_009622  13165  13722  558  transposase mutator type  YP_001314871  normal  0.0442764  normal  0.442259  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6346  CDS  NC_009622  14195  14617  423  hypothetical protein  YP_001314872  normal  0.343516  normal  0.443955  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6347  CDS  NC_009622  15134  15307  174  hypothetical protein  YP_001314873  normal  0.623908  normal  0.998154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6348  CDS  NC_009622  15715  16176  462  MgtC/SapB transporter  YP_001314874  normal  0.278806  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6349    NC_009622  16266  16397  132      normal  0.400409  normal  0.973551  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6350  CDS  NC_009622  16538  17029  492  hypothetical protein  YP_001314875  normal  0.041892  normal  0.708608  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6351  CDS  NC_009622  17385  19199  1815  Pyrrolo-quinoline quinone  YP_001314876  normal  0.346402  normal  0.871662  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6352  CDS  NC_009622  19180  20001  822  extracellular solute-binding protein  YP_001314877  normal  normal  0.756783  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6353  CDS  NC_009622  19998  20555  558  cytochrome c class I  YP_001314878  normal  normal  0.708608  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6354  CDS  NC_009622  20563  21567  1005  cytochrome c oxidase subunit II  YP_001314879  normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6355  CDS  NC_009622  21564  23471  1908  cytochrome c oxidase subunit I type  YP_001314880  normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6356  CDS  NC_009622  23472  24068  597  putative cytochrome c oxidase subunit III protein  YP_001314881  normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6357  CDS  NC_009622  24065  24415  351  hypothetical protein  YP_001314882  normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6358  CDS  NC_009622  24412  25398  987  hypothetical protein  YP_001314883  normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6359    NC_009622  25671  26452  782      normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6360    NC_009622  26493  26976  484      normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6361  CDS  NC_009622  27391  27522  132  hypothetical protein  YP_001314884  normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6362  CDS  NC_009622  27690  28001  312  hypothetical protein  YP_001314885  normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6363  CDS  NC_009622  28025  28588  564  yecA family protein  YP_001314886  normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6364  CDS  NC_009622  28585  30159  1575  transposase IS66  YP_001314887  normal  0.39651  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6365  CDS  NC_009622  30208  30564  357  IS66 Orf2 family protein  YP_001314888  normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6366  CDS  NC_009622  30561  31043  483  transposase IS3/IS911 family protein  YP_001314889  normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6367    NC_009622  31072  31496  425      normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6368    NC_009622  31599  31960  362      normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6369  CDS  NC_009622  32353  33642  1290  polysaccharide biosynthesis protein  YP_001314890  normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6370  CDS  NC_009622  33890  35791  1902  K potassium transporter  YP_001314891  normal  0.649313  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6371  CDS  NC_009622  36540  36953  414  MucR family transcriptional regulator  YP_001314892  normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6372    NC_009622  37195  37808  614      normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6373    NC_009622  38080  38535  456      normal  0.865704  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6374  CDS  NC_009622  38838  39398  561  hypothetical protein  YP_001314893  normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6375  CDS  NC_009622  39464  39784  321  XRE family transcriptional regulator  YP_001314894  normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6376  CDS  NC_009622  40123  40425  303  hypothetical protein  YP_001314895  normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6377    NC_009622  40556  40775  220      normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6378  CDS  NC_009622  41074  41571  498  XRE family transcriptional regulator  YP_001314896  normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6379  CDS  NC_009622  42192  42638  447  hypothetical protein  YP_001314897  normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6380  CDS  NC_009622  42622  43335  714  hypothetical protein  YP_001314898  normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6381  CDS  NC_009622  44025  44426  402  mobilisation protein  YP_001314899  normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6382  CDS  NC_009622  44430  46922  2493  hypothetical protein  YP_001314900  normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6383  CDS  NC_009622  46929  47138  210  hypothetical protein  YP_001314901  normal  0.53931  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6384  CDS  NC_009622  47238  47681  444  hypothetical protein  YP_001314902  normal  0.792832  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6385    NC_009622  48123  48599  477      normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6386  CDS  NC_009622  48721  49623  903  beta-lactamase domain-containing protein  YP_001314903  normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6387    NC_009622  49681  49921  241      normal  0.893879  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6388    NC_009622  50156  50506  351      normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6389    NC_009622  50508  51002  495      normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6390  CDS  NC_009622  51262  52086  825  catalase  YP_001314904  normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6391    NC_009622  52193  52309  117      normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6392  CDS  NC_009622  52465  53127  663  hypothetical protein  YP_001314905  normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6393  CDS  NC_009622  53195  53803  609  hypothetical protein  YP_001314906  normal  0.645123  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6394  CDS  NC_009622  53870  55345  1476  hypothetical protein  YP_001314907  normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6395    NC_009622  55622  56576  955      normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6396  CDS  NC_009622  56661  58760  2100  TRAG family protein  YP_001314908  normal  0.969912  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6397  CDS  NC_009622  58757  59785  1029  P-type DNA transfer ATPase VirB11  YP_001314909  normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6398  CDS  NC_009622  59766  60977  1212  conjugation TrbI family protein  YP_001314910  normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6399  CDS  NC_009622  60977  61786  810  P-type conjugative transfer protein VirB9  YP_001314911  normal  0.474869  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6400  CDS  NC_009622  61783  62478  696  VirB8 family protein  YP_001314912  normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6401  CDS  NC_009622  62504  63532  1029  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  YP_001314913  normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6402  CDS  NC_009622  63548  63775  228  hypothetical protein  YP_001314914  normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6403  CDS  NC_009622  63765  64466  702  conjugal transfer protein  YP_001314915  normal  0.190169  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6404  CDS  NC_009622  64478  65566  1089  lytic transglycosylase catalytic  YP_001314916  normal  0.0649822  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6405  CDS  NC_009622  65563  68022  2460  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  YP_001314917  normal  0.0682909  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6406  CDS  NC_009622  68025  68324  300  type IV secretory pathway VirB3 family protein  YP_001314918  normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6407  CDS  NC_009622  68328  68666  339  VIRB2 type IV secretion fmaily protein  YP_001314919  normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6408  CDS  NC_009622  68678  69439  762  lytic transglycosylase catalytic  YP_001314920  normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6409  CDS  NC_009622  69812  70420  609  hypothetical protein  YP_001314921  normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6410  CDS  NC_009622  70417  70953  537  succinoglycan biosynthesis protein ExoI-like protein  YP_001314922  normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6411  CDS  NC_009622  70950  71651  702  nuclease  YP_001314923  normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6412  CDS  NC_009622  71652  72050  399  hypothetical protein  YP_001314924  normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6413  CDS  NC_009622  72052  72648  597  hypothetical protein  YP_001314925  normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6414  CDS  NC_009622  72669  73085  417  hypothetical protein  YP_001314926  normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6415  CDS  NC_009622  73168  73515  348  hypothetical protein  YP_001314927  normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6416  CDS  NC_009622  73981  74157  177  hypothetical protein  YP_001314928  normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6417  CDS  NC_009622  74230  75240  1011  hypothetical protein  YP_001314929  normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6418  CDS  NC_009622  75230  76843  1614  putative transmembrane protein  YP_001314930  normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6419  CDS  NC_009622  77053  77409  357  hypothetical protein  YP_001314931  normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6420  CDS  NC_009622  77571  78572  1002  integrase catalytic region  YP_001314932  normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6421  CDS  NC_009622  78912  79649  738  hypothetical protein  YP_001314933  normal  0.306621  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6422  CDS  NC_009622  79636  81045  1410  integrase catalytic region  YP_001314934  normal  0.902721  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6423    NC_009622  81822  81979  158      normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6424    NC_009622  81990  82094  105      normal  0.985211  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6425    NC_009622  82106  82462  357      normal  0.640839  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6426    NC_009622  82836  83037  202      normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6427  CDS  NC_009622  83128  83421  294  hypothetical protein  YP_001314935  normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6428  CDS  NC_009622  83690  84022  333  hypothetical protein  YP_001314936  normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Smed_6429  CDS  NC_009622  84145  85755  1611  monophenol monooxygenase  YP_001314937  normal  normal  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>