317 genes were found for organism Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 4    << first  < prev  1  2  3  4    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Pnap_4122    NC_008757  1  198  -  198      normal  1  normal  0.0368102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4123  CDS  NC_008757  483  1040  -  558  resolvase domain-containing protein  YP_973154  normal  1  normal  0.0694671  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4124  CDS  NC_008757  1218  1526  +  309  transposase Tn3  YP_973155  normal  1  normal  0.0632177  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4125  CDS  NC_008757  1477  2436  -  960  transposase, IS4 family protein  YP_973156  normal  1  normal  0.0801199  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4126  CDS  NC_008757  2737  3492  -  756  metallophosphoesterase  YP_973157  normal  1  normal  0.0827574  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4127  CDS  NC_008757  3514  5871  -  2358  hypothetical protein  YP_973158  normal  0.451  normal  0.0546669  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4128  CDS  NC_008757  6104  7399  -  1296  HipA domain-containing protein  YP_973159  normal  0.871834  normal  0.173226  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4129  CDS  NC_008757  7465  7740  +  276  hypothetical protein  YP_973160  normal  0.224951  normal  0.196757  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4130  CDS  NC_008757  8115  8825  +  711  hypothetical protein  YP_973161  normal  0.155206  normal  0.303119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4131    NC_008757  8942  9325  -  384      normal  0.606709  normal  0.37158  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4132    NC_008757  9429  9764  +  336      normal  1  normal  0.36005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4133  CDS  NC_008757  9783  10319  -  537  hypothetical protein  YP_973162  normal  0.739262  normal  0.37291  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4134  CDS  NC_008757  10764  11669  +  906  hypothetical protein  YP_973163  normal  0.334564  normal  0.538805  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4135  CDS  NC_008757  11757  12239  +  483  hypothetical protein  YP_973164  normal  0.132119  normal  0.361248  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4136  CDS  NC_008757  12451  12690  +  240  hypothetical protein  YP_973165  normal  0.0821897  normal  0.24797  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4137  CDS  NC_008757  12802  14004  +  1203  phage integrase family protein  YP_973166  normal  0.031573  normal  0.207643  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4138  CDS  NC_008757  14028  14369  +  342  hypothetical protein  YP_973167  normal  0.0172764  normal  0.111049  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4139  CDS  NC_008757  14356  14679  +  324  putative transcriptional regulator  YP_973168  normal  0.071007  normal  0.169565  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4140  CDS  NC_008757  15183  15839  -  657  OmpW family protein  YP_973169  normal  0.0330312  normal  0.117689  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4141  CDS  NC_008757  15986  16846  -  861  alpha/beta hydrolase fold  YP_973170  normal  0.0556153  normal  0.121245  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4142  CDS  NC_008757  16917  17957  -  1041  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  YP_973171  normal  0.345683  normal  0.184923  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4143  CDS  NC_008757  17975  18889  -  915  acetaldehyde dehydrogenase  YP_973172  normal  1  normal  0.369234  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4144  CDS  NC_008757  18910  19692  -  783  4-oxalocrotonate decarboxylase  YP_973173  normal  1  normal  0.246439  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4145  CDS  NC_008757  19780  20391  -  612  glutathione S-transferase domain-containing protein  YP_973174  normal  1  normal  0.167022  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4146  CDS  NC_008757  20423  21301  -  879  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_973175  normal  0.590632  normal  0.122141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4147  CDS  NC_008757  21312  22142  -  831  2,3-dihydroxy-2,3-dihydrophenylpropionate dehydrogenase  YP_973176  normal  1  normal  0.180269  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4148  CDS  NC_008757  22185  23411  -  1227  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  YP_973177  normal  1  normal  0.284951  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4149  CDS  NC_008757  23408  23737  -  330  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  YP_973178  normal  0.411915  normal  0.231451  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4150  CDS  NC_008757  23849  24256  -  408  membrane protein, biphenyl pathway  YP_973179  normal  0.41331  normal  0.329187  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4151  CDS  NC_008757  24295  24861  -  567  benzene 1,2-dioxygenase  YP_973180  normal  0.0735221  normal  0.34405  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4152  CDS  NC_008757  24982  26352  -  1371  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  YP_973181  normal  0.424226  normal  0.388878  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4153  CDS  NC_008757  26444  27178  -  735  GntR family transcriptional regulator  YP_973182  normal  0.947697  normal  0.614884  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4154  CDS  NC_008757  27260  27766  -  507  hypothetical protein  YP_973183  normal  0.724646  normal  0.590447  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4155  CDS  NC_008757  27988  28539  -  552  hypothetical protein  YP_973184  normal  0.749309  normal  0.789913  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4156  CDS  NC_008757  28650  29477  +  828  hypothetical protein  YP_973185  normal  0.418419  normal  0.860751  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4157  CDS  NC_008757  30595  31101  +  507  DNA repair protein RadC  YP_973186  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4158    NC_008757  31145  31528  -  384      normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4159  CDS  NC_008757  31719  33758  +  2040  nuclease  YP_973187  normal  0.841229  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4160    NC_008757  34188  34449  -  262      normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4161  CDS  NC_008757  34523  34831  +  309  hypothetical protein  YP_973188  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4162  CDS  NC_008757  34878  35174  -  297  XRE family transcriptional regulator  YP_973189  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4163  CDS  NC_008757  35617  35967  +  351  putative lipoprotein  YP_973190  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4164  CDS  NC_008757  36329  37126  +  798  hypothetical protein  YP_973191  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4165  CDS  NC_008757  37211  37513  +  303  hypothetical protein  YP_973192  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4166  CDS  NC_008757  37549  38400  +  852  putative replication initiator and transcription repressor protein  YP_973193  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4167  CDS  NC_008757  38651  39289  +  639  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  YP_973194  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4168  CDS  NC_008757  39286  39528  +  243  hypothetical protein  YP_973195  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4169  CDS  NC_008757  39525  40070  +  546  hypothetical protein  YP_973196  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4170  CDS  NC_008757  40067  40618  +  552  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  YP_973197  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4171  CDS  NC_008757  41133  43094  +  1962  hypothetical protein  YP_973198  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4172  CDS  NC_008757  43455  44072  +  618  TetR family transcriptional regulator  YP_973199  normal  0.928216  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4173  CDS  NC_008757  44142  44729  +  588  late embryogenesis abundant protein  YP_973200  normal  0.945482  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4174  CDS  NC_008757  44817  45263  +  447  hypothetical protein  YP_973201  normal  0.810945  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4175  CDS  NC_008757  45476  46177  +  702  hypothetical protein  YP_973202  normal  0.0746034  normal  0.650092  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4176  CDS  NC_008757  46177  47925  +  1749  hypothetical protein  YP_973203  normal  0.118279  normal  0.965064  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4177  CDS  NC_008757  47922  50582  +  2661  glycosyltransferase family 28 protein  YP_973204  normal  0.359054  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4178  CDS  NC_008757  50579  51550  +  972  patatin  YP_973205  normal  0.222124  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4179  CDS  NC_008757  51543  52352  +  810  hypothetical protein  YP_973206  normal  0.146971  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4180  CDS  NC_008757  52349  53449  +  1101  RND family efflux transporter MFP subunit  YP_973207  normal  0.249201  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4181  CDS  NC_008757  53446  56727  +  3282  acriflavin resistance protein  YP_973208  normal  0.644693  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4182  CDS  NC_008757  56724  58019  +  1296  outer membrane efflux protein  YP_973209  normal  0.256436  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4183    NC_008757  58169  58306  +  138      normal  0.34276  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4184  CDS  NC_008757  58305  59330  -  1026  helix-turn-helix domain-containing protein  YP_973210  normal  0.26598  normal  0.842889  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4185  CDS  NC_008757  59556  61814  +  2259  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  YP_973211  normal  1  normal  0.452741  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4186  CDS  NC_008757  61877  63517  +  1641  glucose-methanol-choline oxidoreductase  YP_973212  normal  1  normal  0.296115  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4187  CDS  NC_008757  63521  65158  +  1638  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_973213  normal  0.554867  normal  0.517417  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4188  CDS  NC_008757  65158  66897  +  1740  aldehyde dehydrogenase  YP_973214  normal  0.428838  normal  0.498692  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4189  CDS  NC_008757  66988  67698  +  711  OmpW family protein  YP_973215  normal  0.370837  normal  0.570233  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4190    NC_008757  67791  67981  +  191      normal  0.484967  normal  0.385527  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4191  CDS  NC_008757  68268  69179  +  912  LysR family transcriptional regulator  YP_973216  normal  0.530401  normal  0.614884  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4192  CDS  NC_008757  69191  69433  +  243  hypothetical protein  YP_973217  normal  1  normal  0.724934  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4193  CDS  NC_008757  69719  71710  +  1992  conjugal transfer coupling protein TraG  YP_973218  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4194  CDS  NC_008757  71707  72159  +  453  CopG/DNA-binding domain-containing protein  YP_973219  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4195  CDS  NC_008757  72156  73187  +  1032  type II secretion system protein E  YP_973220  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4196  CDS  NC_008757  73184  73543  +  360  conjugal transfer protein TrbC  YP_973221  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4197  CDS  NC_008757  73540  73824  +  285  putative conjugal transfer TrbD transmembrane protein  YP_973222  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4198  CDS  NC_008757  73846  76287  +  2442  conjugal transfer ATPase TrbE  YP_973223  normal  0.330213  normal  0.981224  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4199  CDS  NC_008757  76284  77012  +  729  conjugal transfer protein TrbJ  YP_973224  normal  0.481376  normal  0.72742  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4200  CDS  NC_008757  77023  78396  +  1374  conjugal transfer protein TrbL  YP_973225  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4201  CDS  NC_008757  78409  79113  +  705  conjugal transfer protein TrbF  YP_973226  normal  1  normal  0.902696  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4202  CDS  NC_008757  79110  80123  +  1014  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  YP_973227  normal  0.250287  normal  0.746968  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4203  CDS  NC_008757  80126  81445  +  1320  conjugation TrbI family protein  YP_973228  normal  0.139872  normal  0.82202  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4204  CDS  NC_008757  81442  81711  +  270  hypothetical protein  YP_973229  normal  0.164434  normal  0.501922  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4205  CDS  NC_008757  82262  82612  -  351  hypothetical protein  YP_973230  normal  0.544899  normal  0.667042  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4206  CDS  NC_008757  82654  83067  -  414  hypothetical protein  YP_973231  normal  0.774995  normal  0.68858  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4207  CDS  NC_008757  83134  83589  -  456  hypothetical protein  YP_973232  normal  0.533801  normal  0.385527  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4208  CDS  NC_008757  83904  84173  -  270  hypothetical protein  YP_973233  normal  0.427854  normal  0.362293  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4209  CDS  NC_008757  85400  85678  +  279  hypothetical protein  YP_973234  normal  0.011129  normal  0.483016  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4210  CDS  NC_008757  85689  85958  +  270  hypothetical protein  YP_973235  normal  0.0814128  normal  0.361111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4211  CDS  NC_008757  86109  86990  +  882  hypothetical protein  YP_973236  normal  0.468561  normal  0.308798  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4212  CDS  NC_008757  87439  87819  +  381  hypothetical protein  YP_973237  normal  0.568947  normal  0.263268  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4213  CDS  NC_008757  87892  88443  +  552  hypothetical protein  YP_973238  normal  0.752451  normal  0.265121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4214  CDS  NC_008757  88638  89492  +  855  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  YP_973239  normal  0.317185  normal  0.300379  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4215  CDS  NC_008757  90124  91254  +  1131  hypothetical protein  YP_973240  normal  0.314419  normal  0.580707  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4216  CDS  NC_008757  91321  91683  +  363  hypothetical protein  YP_973241  normal  1  normal  0.631329  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4217  CDS  NC_008757  91757  92275  +  519  hypothetical protein  YP_973242  normal  1  normal  0.83834  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4218  CDS  NC_008757  92352  92660  +  309  hypothetical protein  YP_973243  normal  1  normal  0.789428  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4219  CDS  NC_008757  92721  93107  +  387  hypothetical protein  YP_973244  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4220  CDS  NC_008757  93235  93642  +  408  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  YP_973245  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Pnap_4221  CDS  NC_008757  94256  94705  +  450  hypothetical protein  YP_973246  normal  1  normal  1  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 4    << first  < prev  1  2  3  4    next >  last >>