1804 genes were found for organism Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 19    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CHAB381_0001  CDS  NC_009714  1314  1314  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_001405623  normal  0.11482  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0002  CDS  NC_009714  1311  1433  123  hypothetical protein  YP_001405624  normal  0.0670741  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0003  CDS  NC_009714  1447  2517  1071  DNA polymerase III subunit beta  YP_001405625  normal  0.0675072  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0004  CDS  NC_009714  2528  4834  2307  DNA gyrase subunit B  YP_001405626  normal  0.0782517  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0005  CDS  NC_009714  4834  6225  1392  putative diguanylate cyclase/phosphodiesterase  YP_001405627  normal  0.351053  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0006  CDS  NC_009714  6227  6781  555  NADPH-dependent 7-cyano-7-deazaguanine reductase (NADPH-dependent nitrile oxidoreductase)  YP_001405628  normal  0.170262  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0007  CDS  NC_009714  6778  7995  1218  hydrolase  YP_001405629  normal  0.0891222  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0008  CDS  NC_009714  8147  8566  420  hypothetical protein  YP_001405630  normal  0.720576  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0009  CDS  NC_009714  8610  9230  621  putative deoxyribonucleotide triphosphate pyrophosphatase  YP_001405631  normal  0.873505  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0010  CDS  NC_009714  9309  10601  1293  multidrug-efflux transporter  YP_001405632  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0011  CDS  NC_009714  10598  11809  1212  molybdopterin binding domain-containing protein  YP_001405633  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0012  CDS  NC_009714  11819  12451  633  carbonate dehydratase  YP_001405634  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0013  CDS  NC_009714  12448  14496  2049  mechanosensitive ion channel family protein  YP_001405635  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0014  CDS  NC_009714  14483  14674  192  hypothetical protein  YP_001405636  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0015  CDS  NC_009714  14889  16682  1794  putative 5-methylcytosine-specific restriction enzyme B  YP_001405637  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0016  CDS  NC_009714  16776  18089  1314  trigger factor  YP_001405638  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0017  CDS  NC_009714  18089  18676  588  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  YP_001405639  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0018  CDS  NC_009714  18673  19188  516  peptide deformylase  YP_001405640  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0019  CDS  NC_009714  19185  20702  1518  putative Mg chelatase-like protein  YP_001405641  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0020  CDS  NC_009714  20699  22171  1473  YjeF-related protein  YP_001405642  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0021  CDS  NC_009714  22153  22731  579  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  YP_001405643  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0022  CDS  NC_009714  22990  24318  1329  magnesium and cobalt efflux protein CorC  YP_001405644  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0023  CDS  NC_009714  24346  25191  846  fumarate hydratase  YP_001405645  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0024  CDS  NC_009714  25202  25762  561  fumarate hydratase, class I  YP_001405646  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0025  CDS  NC_009714  26169  26315  147  hypothetical protein  YP_001405647  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0026  CDS  NC_009714  26381  27097  717  protein YegH  YP_001405648  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0027  CDS  NC_009714  27130  27573  444  hypothetical protein  YP_001405649  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0028  CDS  NC_009714  27657  28847  1191  Na+/H+ antiporter NhaA  YP_001405650  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0029  CDS  NC_009714  28834  29304  471  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  YP_001405651  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0030  CDS  NC_009714  29306  29701  396  transcription antitermination protein NusB  YP_001405652  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0031  CDS  NC_009714  29698  30381  684  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  YP_001405653  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0032  CDS  NC_009714  30524  31336  813  peptidase M48, Ste24p  YP_001405654  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0033  CDS  NC_009714  31652  32572  921  auxin efflux carrier (AEC) family protein  YP_001405655  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0034  CDS  NC_009714  32839  33813  975  putative transporter  YP_001405656  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0035  CDS  NC_009714  33806  34219  414  putative periplasmic protein  YP_001405657  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0036  CDS  NC_009714  34540  35010  471  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  YP_001405658  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0037  CDS  NC_009714  34988  35254  267  hypothetical protein  YP_001405659  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0038  CDS  NC_009714  35264  36475  1212  hypothetical protein  YP_001405660  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0039  CDS  NC_009714  36540  36752  213  30S ribosomal protein S21  YP_001405661  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0040  CDS  NC_009714  36847  37470  624  hypothetical protein  YP_001405662  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0041  CDS  NC_009714  37787  38371  585  GTP cyclohydrolase I  YP_001405663  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0042  CDS  NC_009714  38443  39633  1191  NifS family cysteine desulfurase  YP_001405664  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0043  CDS  NC_009714  39647  40639  993  nitrogen fixation protein NifU  YP_001405665  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0044  CDS  NC_009714  41321  41434  114  hypothetical protein  YP_001405666  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0045  CDS  NC_009714  41881  42813  933  glycerate dehydrogenase  YP_001405667  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0046    NC_009714  42803  43301  499      normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0047  CDS  NC_009714  43307  44581  1275  coproporphyrinogen III oxidase  YP_001405668  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0048  CDS  NC_009714  44613  44750  138  hypothetical protein  YP_001405669  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0049  CDS  NC_009714  44926  45126  201  hypothetical protein  YP_001405670  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0050  CDS  NC_009714  45659  46636  978  tryptophanyl-tRNA synthetase  YP_001405671  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0051  CDS  NC_009714  46648  47151  504  hypothetical protein  YP_001405672  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0052  CDS  NC_009714  47155  47667  513  shikimate kinase  YP_001405673  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0053  CDS  NC_009714  47657  49039  1383  GTP-binding protein EngA  YP_001405674  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0054  CDS  NC_009714  49139  50032  894  integral membrane protein  YP_001405675  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0055  CDS  NC_009714  50042  50857  816  2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate aldolase  YP_001405676  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0056  CDS  NC_009714  50992  51258  267  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  YP_001405677  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0057    NC_009714  51283  52044  762      normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0058    NC_009714  52171  52593  423      normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0059    NC_009714  52673  53074  402      normal  0.315887  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0060    NC_009714  53071  53340  270      normal  0.32761  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0061  CDS  NC_009714  53815  55026  1212  saccharopine dehydrogenase  YP_001405678  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0063  CDS  NC_009714  59435  60526  1092  hypothetical protein  YP_001405679  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0064  CDS  NC_009714  60529  61584  1056  modification methylase EcoRI (adenine-specificmethyltransferase EcoRI) (M.EcoRI)  YP_001405680  normal  0.514929  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0065  CDS  NC_009714  61595  62689  1095  modification methylase EcoRI (adenine-specificmethyltransferase EcoRI) (M.EcoRI)  YP_001405681  normal  0.292428  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0066  CDS  NC_009714  63206  63841  636  hypothetical protein  YP_001405682  normal  0.388879  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0067  CDS  NC_009714  63950  64621  672  hypothetical protein  YP_001405683  normal  0.300198  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0068  CDS  NC_009714  64738  64878  141  transposase  YP_001405684  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0069  CDS  NC_009714  65290  65454  165  ComE operon protein 1  YP_001405685  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0070  CDS  NC_009714  65672  65803  132  hypothetical protein  YP_001405686  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0071    NC_009714  65820  65978  159      normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0072  CDS  NC_009714  66054  68882  2829  excinuclease ABC subunit A  YP_001405687  normal  0.804718  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0073  CDS  NC_009714  69049  69549  501  hypothetical protein  YP_001405688  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0074  CDS  NC_009714  69537  70697  1161  hypothetical protein  YP_001405689  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0075  CDS  NC_009714  70699  71337  639  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  YP_001405690  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0076  CDS  NC_009714  71354  71521  168  hypothetical protein  YP_001405691  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0077  tRNA  NC_009714  74074  74149  76  tRNA-Ala    normal  0.329264  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0078  tRNA  NC_009714  74235  74311  77  tRNA-Ile    normal  0.236946  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0079  CDS  NC_009714  75181  75417  237  hypothetical protein  YP_001405692  normal  0.0909286  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0080  CDS  NC_009714  75446  76747  1302  putative aminotransferase  YP_001405693  normal  0.0692072  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0081  CDS  NC_009714  76759  77682  924  ATPase  YP_001405694  hitchhiker  0.00107547  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0082  CDS  NC_009714  77849  78007  159  hypothetical protein  YP_001405695  hitchhiker  2.96527e-05  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0083  CDS  NC_009714  78002  78313  312  30S ribosomal protein S10  YP_001405696  hitchhiker  5.83291e-05  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0084  CDS  NC_009714  78324  78899  576  50S ribosomal protein L3  YP_001405697  decreased coverage  3.54525e-07  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0085  CDS  NC_009714  78896  79510  615  50S ribosomal protein L4  YP_001405698  hitchhiker  0.000177628  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0086  CDS  NC_009714  79512  79793  282  50S ribosomal protein L23  YP_001405699  hitchhiker  0.00130927  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0087  CDS  NC_009714  79795  80625  831  50S ribosomal protein L2  YP_001405700  normal  0.025242  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0088  CDS  NC_009714  80625  80906  282  30S ribosomal protein S19  YP_001405701  normal  0.106882  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0089  CDS  NC_009714  80916  81245  330  50S ribosomal protein L22  YP_001405702  normal  0.0769345  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0090  CDS  NC_009714  81248  81943  696  30S ribosomal protein S3  YP_001405703  normal  0.157712  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0091  CDS  NC_009714  81946  82371  426  50S ribosomal protein L16  YP_001405704  normal  0.453795  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0092  CDS  NC_009714  82358  82543  186  50S ribosomal protein L29  YP_001405705  normal  0.786092  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0093  CDS  NC_009714  82554  82805  252  30S ribosomal protein S17  YP_001405706  normal  0.854  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0094  CDS  NC_009714  82805  83173  369  50S ribosomal protein L14  YP_001405707  normal  0.840193  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0095  CDS  NC_009714  83173  83403  231  50S ribosomal protein L24  YP_001405708  normal  0.713288  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0096  CDS  NC_009714  83407  83952  546  50S ribosomal protein L5  YP_001405709  normal  0.428124  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0097  CDS  NC_009714  83954  84139  186  ribosomal protein S14p/S29e  YP_001405710  normal  0.316233  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0098  CDS  NC_009714  84149  84544  396  30S ribosomal protein S8  YP_001405711  normal  0.578211  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0099  CDS  NC_009714  84620  85156  537  50S ribosomal protein L6  YP_001405712  normal  0.492804  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0100  CDS  NC_009714  85166  85522  357  50S ribosomal protein L18  YP_001405713  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
CHAB381_0101  CDS  NC_009714  85532  85972  441  30S ribosomal protein S5  YP_001405714  normal  n/a    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 19    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>