2195 genes were found for organism Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 22    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CCC13826_0001  CDS  NC_009802  1993500  1993769  270  addiction module antitoxin  YP_001467799  hitchhiker  1.55913e-05  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0002  CDS  NC_009802  1992705  1993361  657  integrase/recombinase  YP_001467798  hitchhiker  0.000442871  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0003  CDS  NC_009802  1992076  1992696  621  putative disulfide oxidoreductase  YP_001467797  hitchhiker  0.00637775  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0004  CDS  NC_009802  1990379  1992028  1650  His kinase A  YP_001467796  hitchhiker  0.00729618  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0005  CDS  NC_009802  1989686  1990375  690  response regulator receiver domain-containing protein  YP_001467795  normal  0.0566865  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0006  CDS  NC_009802  1989443  1989625  183  hypothetical protein  YP_001467794  normal  0.016026  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0007  CDS  NC_009802  1986226  1989171  2946  putative lipoprotein  YP_001467793  normal  0.949934  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0008  CDS  NC_009802  1981886  1982002  117  hypothetical protein  YP_001467792  normal  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0009    NC_009802  1981960  1986096  4137      normal  0.650882  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0010  CDS  NC_009802  1981273  1981809  537  hypothetical protein  YP_001467791  normal  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0011  CDS  NC_009802  1980453  1981187  735  phosphomethylpyrimidine kinase superfamily protein  YP_001467790  normal  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0012  CDS  NC_009802  1978649  1980397  1749  dihydroxy-acid dehydratase  YP_001467789  normal  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0013  CDS  NC_009802  1977596  1978630  1035  putative phage integrase  YP_001467788  normal  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0014  CDS  NC_009802  1977341  1977481  141  hypothetical protein  YP_001467787  normal  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0015  CDS  NC_009802  1974013  1977234  3222  hypothetical protein  YP_001467786  normal  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0016  CDS  NC_009802  1972434  1973840  1407  hypothetical protein  YP_001467785  normal  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0017    NC_009802  1967888  1972273  4386      normal  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0019  CDS  NC_009802  1599620  1600789  1170  hypothetical protein  YP_001467421  normal  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0020  CDS  NC_009802  1598360  1599571  1212  bacteriophage replication gene A protein  YP_001467420  normal  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0021  CDS  NC_009802  929815  930117  303  DNA-binding protein HU 1 (DNA-binding protein II; HB)  YP_001466788  unclonable  1.60012e-06  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0023  CDS  NC_009802  928277  928492  216  anthranilate synthase component II  YP_001466787  hitchhiker  0.000850682  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0024  CDS  NC_009802  927078  928199  1122  recombination protein RecR  YP_001466786  hitchhiker  0.000424013  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0025  CDS  NC_009802  926492  927085  594  hypothetical protein  YP_001466785  normal  0.063546  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0026  CDS  NC_009802  924177  925937  1761  response regulator  YP_001466784  normal  0.0552545  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0027    NC_009802  1246887  1247549  663      normal  0.0357857  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0028  CDS  NC_009802  1246555  1246890  336  branched-chain amino acid transport protein  YP_001467092  normal  0.0792353  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0029  CDS  NC_009802  1245423  1246439  1017  L-asparaginase  YP_001467091  normal  0.304062  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0030  CDS  NC_009802  1244848  1245339  492  hypothetical protein  YP_001467090  normal  0.816321  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0031  CDS  NC_009802  1244586  1244720  135  hypothetical protein  YP_001467089  normal  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0032  CDS  NC_009802  1243937  1244536  600  LysE family translocator protein  YP_001467088  normal  0.787498  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0033  CDS  NC_009802  1243033  1243926  894  hypothetical protein  YP_001467087  normal  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0034  CDS  NC_009802  1242029  1242928  900  hypothetical protein  YP_001467086  normal  0.181254  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0035  CDS  NC_009802  1241264  1241749  486  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  YP_001467085  normal  0.158163  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0036  CDS  NC_009802  1240187  1241254  1068  3-isopropylmalate dehydrogenase  YP_001467084  normal  0.246582  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0037  CDS  NC_009802  1239945  1240190  246  hypothetical protein  YP_001467083  normal  0.353644  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0038  CDS  NC_009802  1239532  1239948  417  OorC subunit of 2-oxoglutarate:acceptor oxidoreductase  YP_001467082  normal  0.479419  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0039  CDS  NC_009802  1238400  1239572  1173  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase family protein  YP_001467081  normal  0.607631  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0040  CDS  NC_009802  1237846  1238325  480  RNA methyltransferase  YP_001467080  normal  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0041  CDS  NC_009802  1236467  1237849  1383  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  YP_001467079  normal  0.294388  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0042  CDS  NC_009802  1236311  1236466  156  putative ribosomal RNA adenine dimethylase  YP_001467078  normal  0.712499  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0043  CDS  NC_009802  1234296  1236314  2019  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  YP_001467077  normal  0.778368  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0044    NC_009802  1233997  1234254  258      normal  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0045  CDS  NC_009802  1233305  1234012  708  iron(III) dicitrate-binding protein  YP_001467076  normal  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0046  CDS  NC_009802  1232676  1233251  576  hypothetical protein  YP_001467075  normal  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0047  CDS  NC_009802  1232289  1232603  315  hypothetical protein  YP_001467074  normal  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0048  CDS  NC_009802  1230352  1232280  1929  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  YP_001467073  normal  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0049  CDS  NC_009802  1229813  1230355  543  Maf-like protein  YP_001467072  normal  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0050  CDS  NC_009802  1229316  1229813  498  hypothetical protein  YP_001467071  normal  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0051  CDS  NC_009802  1226761  1229319  2559  alanyl-tRNA synthetase  YP_001467070  normal  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0052  CDS  NC_009802  1225721  1226590  870  thiazole biosynthesis protein ThiH  YP_001467069  normal  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0053  CDS  NC_009802  1224768  1225721  954  ferrochelatase  YP_001467068  normal  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0054  CDS  NC_009802  1224259  1224720  462  hypothetical protein  YP_001467067  normal  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0055  CDS  NC_009802  1222338  1224170  1833  hypothetical protein  YP_001467066  normal  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0056  CDS  NC_009802  1222036  1222329  294  flagellar hook-basal body protein FliE  YP_001467065  normal  0.167472  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0057  CDS  NC_009802  1221536  1222036  501  flagellar basal body rod protein FlgC  YP_001467064  normal  0.223353  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0058  CDS  NC_009802  1221093  1221527  435  flagellar basal body rod protein FlgB  YP_001467063  normal  0.372308  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0059  CDS  NC_009802  1220434  1221030  597  thioredoxin domain-containing protein  YP_001467062  normal  0.457756  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0060  CDS  NC_009802  1219970  1220425  456  SsrA-binding protein  YP_001467061  normal  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0061  CDS  NC_009802  1219215  1219958  744  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  YP_001467060  normal  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0062  CDS  NC_009802  1218988  1219218  231  carbon storage regulator  YP_001467059  normal  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0063  CDS  NC_009802  1218173  1218994  822  tRNA pseudouridine synthase B  YP_001467058  normal  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0064  CDS  NC_009802  1216107  1218176  2070  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  YP_001467057  normal  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0065  CDS  NC_009802  1215606  1216055  450  hypothetical protein  YP_001467056  normal  0.258971  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0066  CDS  NC_009802  1213883  1215604  1722  rhomboid family protein  YP_001467055  normal  0.411672  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0067  CDS  NC_009802  1212428  1213795  1368  serine/threonine transporter SstT  YP_001467054  normal  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0068  CDS  NC_009802  1211084  1212289  1206  S-adenosylmethionine synthetase  YP_001467053  normal  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0069  CDS  NC_009802  1209878  1211041  1164  apolipoprotein N-acyltransferase  YP_001467052  normal  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0070  CDS  NC_009802  1209501  1209773  273  preprotein translocase subunit YajC  YP_001467051  normal  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0071  CDS  NC_009802  1207921  1209453  1533  preprotein translocase subunit SecD  YP_001467050  normal  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0072  CDS  NC_009802  1206947  1207918  972  preprotein translocase subunit SecF  YP_001467049  normal  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0073  CDS  NC_009802  1206599  1206937  339  MacA  YP_001467048  normal  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0074  CDS  NC_009802  1204125  1206590  2466  leucyl-tRNA synthetase  YP_001467047  normal  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0075  CDS  NC_009802  1203582  1204121  540  penicillin-binding protein  YP_001467046  normal  0.715812  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0076  CDS  NC_009802  1202027  1203601  1575  GGDEF domain-containing protein  YP_001467045  normal  0.790276  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0077  CDS  NC_009802  1200828  1202030  1203  valyl-tRNA synthetase  YP_001467044  normal  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0078  CDS  NC_009802  1197902  1200847  2946  transcription-repair coupling factor  YP_001467043  normal  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0079  CDS  NC_009802  1197141  1197905  765  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  YP_001467042  normal  0.895882  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0080  CDS  NC_009802  1196476  1197144  669  endonuclease III  YP_001467041  normal  0.801844  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0081  CDS  NC_009802  1195477  1196382  906  cysteine synthase A  YP_001467040  normal  0.130263  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0082  CDS  NC_009802  1194921  1195472  552  serine O-acetyltransferase  YP_001467039  normal  0.0605455  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0083  CDS  NC_009802  1194695  1194889  195  DedA family protein  YP_001467038  normal  0.0101751  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0084  CDS  NC_009802  1194254  1194556  303  glutamate racemase 2  YP_001467037  hitchhiker  2.95238e-05  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0085  CDS  NC_009802  894874  896112  1239  hypothetical protein  YP_001466755  unclonable  5.95597e-05  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0086  CDS  NC_009802  893285  894874  1590  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  YP_001466754  hitchhiker  0.00266935  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0087  CDS  NC_009802  892251  893288  1038  3-dehydroquinate synthase  YP_001466753  normal  0.0387598  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0088  CDS  NC_009802  890829  892247  1419  TrkA domain-containing protein  YP_001466752  normal  0.0708937  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0089  CDS  NC_009802  890165  890725  561  hypothetical protein  YP_001466751  normal  0.248367  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0090  CDS  NC_009802  889227  890168  942  mce related protein  YP_001466750  normal  0.0699486  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0091  CDS  NC_009802  888486  889226  741  PP-loop family protein  YP_001466749  normal  0.0135509  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0092  CDS  NC_009802  887383  888489  1107  MTA/SAH nucleosidase  YP_001466748  normal  0.0905172  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0093  CDS  NC_009802  886174  887304  1131  queuine tRNA-ribosyltransferase  YP_001466747  normal  0.0899534  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0094  CDS  NC_009802  885486  886184  699  fkbp-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerases 2  YP_001466746  normal  0.0292624  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0095  CDS  NC_009802  882862  885435  2574  chaperone ClpB 1  YP_001466745  normal  0.0144573  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0097  CDS  NC_009802  1050046  1051518  1473  hypothetical protein  YP_001466896  normal  0.0106852  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0098  CDS  NC_009802  1051515  1052057  543  hydrogenase maturation protease HydD  YP_001466897  normal  0.0404839  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0099    NC_009802  1052057  1052737  681      hitchhiker  0.0062913  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0100  CDS  NC_009802  1052747  1054465  1719  aminodeoxychorismate lyase  YP_001466898  normal  0.0667384  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0101  CDS  NC_009802  1054475  1055680  1206  putative periplasmic protein  YP_001466899  normal  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0102  CDS  NC_009802  1055962  1056669  708  flagellar basal body L-ring protein  YP_001466900  normal  0.354617  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
CCC13826_0103  CDS  NC_009802  1056736  1058103  1368  hydrogenase expression/synthesis, HypA  YP_001466901  normal  0.286543  n/a    Campylobacter concisus 13826  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 22    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>