2847 genes were found for organism Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 29    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
SaurJH9_0001  CDS  NC_009487  572  1933  1362  chromosomal replication initiation protein  YP_001245391  hitchhiker  7.95473e-05  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0002  CDS  NC_009487  2211  3344  1134  DNA polymerase III subunit beta  YP_001245392  decreased coverage  0.00213885  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0003  CDS  NC_009487  3734  3970  237  S4 region, YaaA  YP_001245393  normal  0.0386838  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0004  CDS  NC_009487  3967  5079  1113  recombination protein F  YP_001245394  normal  0.320094  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0005  CDS  NC_009487  5101  7023  1923  DNA gyrase, B subunit  YP_001245395  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0006  CDS  NC_009487  7060  9729  2670  DNA gyrase, A subunit  YP_001245396  normal  0.864295  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0007  CDS  NC_009487  9817  10629  813  hypothetical protein  YP_001245397  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0008  CDS  NC_009487  10955  12469  1515  histidine ammonia-lyase  YP_001245398  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0009  CDS  NC_009487  12848  14134  1287  seryl-tRNA synthetase  YP_001245399  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0010  CDS  NC_009487  14785  15480  696  hypothetical protein  YP_001245400  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0011  CDS  NC_009487  15477  15806  330  hypothetical protein  YP_001245401  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0012  CDS  NC_009487  16169  17137  969  alpha/beta hydrolase fold  YP_001245402  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0013  CDS  NC_009487  17430  18368  939  hypothetical protein  YP_001245403  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0014  CDS  NC_009487  18383  20350  1968  hypothetical protein  YP_001245404  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0015  CDS  NC_009487  20347  20793  447  50S ribosomal protein L9  YP_001245405  normal  0.0923688  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0016  CDS  NC_009487  20825  22225  1401  replicative DNA helicase  YP_001245406  normal  0.0124899  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0017  CDS  NC_009487  22503  23786  1284  adenylosuccinate synthetase  YP_001245407  decreased coverage  0.000177457  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0018  CDS  NC_009487  24989  25690  702  two component transcriptional regulator  YP_001245408  normal  0.70243  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0019  CDS  NC_009487  25703  27529  1827  multi-sensor signal transduction histidine kinase  YP_001245409  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0020  CDS  NC_009487  27678  28856  1179  hypothetical protein  YP_001245410  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0021  CDS  NC_009487  28857  29645  789  hypothetical protein  YP_001245411  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0022  CDS  NC_009487  30034  30834  801  beta-lactamase domain-containing protein  YP_001245412  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0023  CDS  NC_009487  31061  33379  2319  cell wall anchor domain-containing protein  YP_001245413  normal  0.244704  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0024  CDS  NC_009487  33747  34226  480  rRNA large subunit methyltransferase  YP_001245414  decreased coverage  0.000337367  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0025  CDS  NC_009487  34548  35804  1257  hypothetical protein  YP_001245415  unclonable  5.09485e-07  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0026  CDS  NC_009487  36490  37164  675  integrase catalytic subunit  YP_001245416  normal  0.159143  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0027  CDS  NC_009487  37429  38172  744  glycerophosphodiester phosphodiesterase  YP_001245417  normal  0.211276  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0028  CDS  NC_009487  38269  38697  429  dehydratase  YP_001245418  normal  0.280729  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0029  CDS  NC_009487  38743  40749  2007  peptidoglycan glycosyltransferase  YP_001245419  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0030  CDS  NC_009487  40849  42606  1758  Beta-lactamase  YP_001245420  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0031  CDS  NC_009487  42606  42977  372  CopY family transcriptional regulator  YP_001245421  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0032  CDS  NC_009487  43485  44594  1110  ROK family protein  YP_001245422  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0033    NC_009487  44708  46042  1335      normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0035  CDS  NC_009487  46075  47139  1065  rhodanese domain-containing protein  YP_001245423  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0036  CDS  NC_009487  47275  47535  261  hypothetical protein  YP_001245424  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0037  CDS  NC_009487  47535  48179  645  hypothetical protein  YP_001245425  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0038  CDS  NC_009487  48518  49180  663  methyltransferase type 12  YP_001245426  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0039  CDS  NC_009487  49676  50407  732  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  YP_001245427  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0040  CDS  NC_009487  50533  51315  783  3''-adenylyltransferase  YP_001245428  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0041  CDS  NC_009487  51466  51843  378  hypothetical protein  YP_001245429  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0042  CDS  NC_009487  51850  53742  1893  phage integrase family protein  YP_001245430  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0043  CDS  NC_009487  53739  54824  1086  phage integrase family protein  YP_001245431  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0044  CDS  NC_009487  54943  55260  318  DNA repair protein RadC  YP_001245432  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0045  CDS  NC_009487  55281  55787  507  hypothetical protein  YP_001245433  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0046  CDS  NC_009487  55805  56116  312  hypothetical protein  YP_001245434  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0047  CDS  NC_009487  56203  56553  351  hypothetical protein  YP_001245435  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0048  CDS  NC_009487  57071  58699  1629  resolvase domain-containing protein  YP_001245436  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0049  CDS  NC_009487  58721  60070  1350  resolvase domain-containing protein  YP_001245437  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0050  CDS  NC_009487  60304  62097  1794  hypothetical protein  YP_001245438  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0051  CDS  NC_009487  62097  62393  297  hypothetical protein  YP_001245439  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0052  CDS  NC_009487  62586  63632  1047  hypothetical protein  YP_001245440  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0053  CDS  NC_009487  63883  64305  423  integrase catalytic subunit  YP_001245441  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0054  CDS  NC_009487  64372  64725  354  hypothetical protein  YP_001245442  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0055  CDS  NC_009487  64710  65024  315  hypothetical protein  YP_001245443  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0056  CDS  NC_009487  65535  66437  903  C4-dicarboxylate anaerobic carrier  YP_001245444  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0057  CDS  NC_009487  67183  67878  696  two component transcriptional regulator  YP_001245445  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0058  CDS  NC_009487  67853  70522  2670  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  YP_001245446  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0059  CDS  NC_009487  70790  72466  1677  potassium-transporting ATPase subunit A  YP_001245447  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0060  CDS  NC_009487  72485  74506  2022  potassium-transporting ATPase subunit B  YP_001245448  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0061  CDS  NC_009487  74522  75079  558  potassium-transporting ATPase subunit C  YP_001245449  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0062    NC_009487  75624  77399  1776      normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0063  CDS  NC_009487  77599  78036  438  hypothetical protein  YP_001245450  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0064  CDS  NC_009487  78141  78428  288  hypothetical protein  YP_001245451  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0065  CDS  NC_009487  78518  79144  627  hypothetical protein  YP_001245452  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0066  CDS  NC_009487  79259  80767  1509  protein kinase  YP_001245453  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0067  CDS  NC_009487  81115  81207  93  hypothetical protein  YP_001245454  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0068  CDS  NC_009487  81354  83099  1746  hypothetical protein  YP_001245455  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0069    NC_009487  83197  83618  422      normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0071  CDS  NC_009487  84043  84798  756  hypothetical protein  YP_001245456  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0072  CDS  NC_009487  84798  85058  261  hypothetical protein  YP_001245457  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0073  CDS  NC_009487  85195  86259  1065  rhodanese domain-containing protein  YP_001245458  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0074  CDS  NC_009487  86290  87624  1335  beta-lactamase domain-containing protein  YP_001245459  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0075  CDS  NC_009487  87643  88836  1194  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  YP_001245460  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0076  CDS  NC_009487  89103  89204  102  hypothetical protein  YP_001245461  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0077  CDS  NC_009487  89503  90489  987  hypothetical protein  YP_001245462  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0078  CDS  NC_009487  91050  91346  297  TfoX domain-containing protein  YP_001245463  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0079  CDS  NC_009487  91554  92156  603  hypothetical protein  YP_001245464  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0080    NC_009487  92423  95570  3148      normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0082  CDS  NC_009487  95627  96109  483  hypothetical protein  YP_001245465  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0083  CDS  NC_009487  96315  97301  987  phosphatidylinositol diacylglycerol-lyase  YP_001245466  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0084  CDS  NC_009487  97522  98292  771  putative lipoprotein  YP_001245467  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0085  CDS  NC_009487  98311  99114  804  putative lipoprotein  YP_001245468  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0086  CDS  NC_009487  99182  99949  768  putative lipoprotein  YP_001245469  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0087  CDS  NC_009487  100017  100784  768  putative lipoprotein  YP_001245470  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0088  CDS  NC_009487  100851  101618  768  putative lipoprotein  YP_001245471  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0089  CDS  NC_009487  101715  103952  2238  helix-turn-helix domain-containing protein  YP_001245472  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0090  CDS  NC_009487  104103  105281  1179  amidohydrolase  YP_001245473  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0091  CDS  NC_009487  105283  106671  1389  major facilitator transporter  YP_001245474  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0092  CDS  NC_009487  107155  108822  1668  Na/Pi-cotransporter II-related protein  YP_001245475  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0093  CDS  NC_009487  109141  110916  1776  myosin-cross-reactive antigen  YP_001245476  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0094  CDS  NC_009487  111090  111962  873  hypothetical protein  YP_001245477  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0095  CDS  NC_009487  112144  113472  1329  GntR family transcriptional regulator  YP_001245478  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0096  CDS  NC_009487  113662  114135  474  hypothetical protein  YP_001245479  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0097  CDS  NC_009487  114397  115989  1593  L-lactate transport  YP_001245480  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0098  CDS  NC_009487  116318  117880  1563  cell wall anchor domain-containing protein  YP_001245481  normal  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0099  CDS  NC_009487  118265  119017  753  SarA family transcriptional regulator  YP_001245482  normal  0.0236333  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0100  CDS  NC_009487  119386  120384  999  transport system permease protein  YP_001245483  normal  0.0102196  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0101  CDS  NC_009487  120381  121376  996  transport system permease protein  YP_001245484  hitchhiker  0.000423595  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0102  CDS  NC_009487  121392  122384  993  periplasmic binding protein  YP_001245485  unclonable  1.4163e-07  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
SaurJH9_0103  CDS  NC_009487  122615  123595  981  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  YP_001245486  hitchhiker  1.35752e-05  n/a    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 29    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>