3863 genes were found for organism Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 39    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Ping_0001  CDS  NC_008709  6451  7047  597  putative transposase  YP_941475  normal  normal  0.260077  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0002  CDS  NC_008709  6998  7483  486  transposase and inactivated derivative  YP_941476  normal  normal  0.367142  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0003  CDS  NC_008709  7861  9195  1335  ATP-dependent protease ATP-binding subunit HslU  YP_941477  normal  normal  0.834513  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0004  CDS  NC_008709  9207  9761  555  ATP-dependent protease peptidase subunit  YP_941478  normal  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0005  CDS  NC_008709  10064  10597  534  cell division protein FtsN  YP_941479  normal  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0006  CDS  NC_008709  10601  12349  1749  arginyl-tRNA synthetase  YP_941480  normal  normal  0.653166  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0007  CDS  NC_008709  12572  13027  456  hypothetical protein  YP_941481  normal  0.250623  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0008  CDS  NC_008709  13204  15375  2172  UvrD/REP helicase  YP_941482  normal  0.680024  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0009  CDS  NC_008709  15412  16119  708  HAD family hydrolase  YP_941483  normal  0.7922  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0010  CDS  NC_008709  16153  17052  900  tyrosine recombinase XerC  YP_941484  normal  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0011  CDS  NC_008709  17602  18108  507  hypothetical protein  YP_941485  normal  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0012  CDS  NC_008709  18217  19665  1449  hypothetical protein  YP_941486  normal  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0013  CDS  NC_008709  19699  20217  519  secreted protein Hcp, potential oxidative stress protein  YP_941487  normal  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0014  CDS  NC_008709  20228  20935  708  hypothetical protein  YP_941488  normal  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0015  CDS  NC_008709  20951  22315  1365  hypothetical protein  YP_941489  normal  0.947734  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0016  CDS  NC_008709  22319  22966  648  hypothetical protein  YP_941490  normal  0.186285  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0017  CDS  NC_008709  22981  26403  3423  hypothetical protein  YP_941491  normal  0.075528  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0018  CDS  NC_008709  26407  28101  1695  hypothetical protein  YP_941492  normal  0.923839  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0019  CDS  NC_008709  28101  28589  489  hypothetical protein  YP_941493  normal  0.965697  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0020  CDS  NC_008709  28589  28993  405  hypothetical protein  YP_941494  normal  0.845021  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0021  CDS  NC_008709  28993  30762  1770  hypothetical protein  YP_941495  normal  0.864029  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0022  CDS  NC_008709  30759  31712  954  hypothetical protein  YP_941496  normal  0.411446  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0023  CDS  NC_008709  31751  34876  3126  Rhs element Vgr protein  YP_941497  normal  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0024  CDS  NC_008709  34893  37742  2850  pentapeptide repeat-containing protein  YP_941498  normal  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0025  CDS  NC_008709  37743  38789  1047  pentapeptide repeat-containing protein  YP_941499  normal  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0026  CDS  NC_008709  38873  39523  651  hypothetical protein  YP_941500  normal  0.913081  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0027  CDS  NC_008709  39545  39958  414  hypothetical protein  YP_941501  normal  0.185446  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0028  CDS  NC_008709  40134  43757  3624  Rhs element Vgr protein  YP_941502  normal  0.645983  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0029  CDS  NC_008709  43781  46711  2931  pentapeptide repeat-containing protein  YP_941503  normal  normal  0.271954  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0030  CDS  NC_008709  46717  47796  1080  pentapeptide repeat-containing protein  YP_941504  normal  normal  0.108145  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0031  CDS  NC_008709  47840  48484  645  hypothetical protein  YP_941505  normal  0.728008  normal  0.0293912  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0032  CDS  NC_008709  48493  48903  411  hypothetical protein  YP_941506  normal  0.397492  normal  0.0135173  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0033  CDS  NC_008709  48954  50753  1800  sensor protein  YP_941507  normal  0.874201  hitchhiker  0.00904791  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0034  CDS  NC_008709  50753  51106  354  hypothetical protein  YP_941508  normal  0.285401  hitchhiker  0.00549172  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0035  CDS  NC_008709  51362  53788  2427  major facilitator transporter  YP_941509  normal  0.0511713  decreased coverage  0.0019821  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0036  CDS  NC_008709  53800  54942  1143  D-alanine--D-alanine ligase  YP_941510  normal  0.069564  decreased coverage  0.00131086  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0037  CDS  NC_008709  55201  56406  1206  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  YP_941511  normal  hitchhiker  0.00328203  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0038  CDS  NC_008709  57147  57404  258  hypothetical protein  YP_941512  normal  0.727082  normal  0.011199  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0039    NC_008709  57783  58040  258      normal  normal  0.0115117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0040  CDS  NC_008709  58562  59389  828  diaminopimelate epimerase  YP_941513  normal  hitchhiker  0.00697529  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0041  CDS  NC_008709  59442  60707  1266  diaminopimelate decarboxylase  YP_941514  normal  0.437243  hitchhiker  0.00781145  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0042  CDS  NC_008709  61094  61411  318  frataxin family protein  YP_941515  normal  0.175622  hitchhiker  0.00555697  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0043  CDS  NC_008709  61851  62336  486  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  YP_941516  hitchhiker  0.00738469  hitchhiker  0.00227735  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0044  CDS  NC_008709  63117  64823  1707  hypothetical protein  YP_941517  decreased coverage  0.000379088  hitchhiker  0.00388829  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0045  CDS  NC_008709  65289  66059  771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_941518  normal  hitchhiker  0.00292404  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0046  CDS  NC_008709  66314  67786  1473  transcriptional regulator  YP_941519  normal  normal  0.0170475  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0047  CDS  NC_008709  68054  69061  1008  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  YP_941520  normal  normal  0.0299581  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0048  CDS  NC_008709  69103  69942  840  ABC transporter for nitrate/sulfonate/bicarbonate ATP-binding protein  YP_941521  normal  normal  0.0941519  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0049  CDS  NC_008709  69952  70944  993  ABC taurine transporter, binding protein inner membrane component  YP_941522  normal  normal  0.0656508  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0050  CDS  NC_008709  71683  72420  738  hypothetical protein  YP_941523  normal  normal  0.113555  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0051  CDS  NC_008709  72640  74052  1413  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  YP_941524  normal  normal  0.132142  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0052  CDS  NC_008709  74599  75579  981  hypothetical protein  YP_941525  normal  normal  0.186799  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0053  CDS  NC_008709  76031  76843  813  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  YP_941526  normal  normal  0.0620574  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0054  CDS  NC_008709  77146  77301  156  50S ribosomal protein L33  YP_941527  normal  0.505038  normal  0.0539587  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0055  CDS  NC_008709  77313  77549  237  ribosomal protein L28  YP_941528  normal  0.378886  normal  0.0544728  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0056  CDS  NC_008709  77684  78361  678  DNA repair protein RadC  YP_941529  normal  0.183755  normal  0.0623388  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0057  CDS  NC_008709  78569  79804  1236  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase  YP_941530  normal  0.303644  normal  0.118237  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0058  CDS  NC_008709  79804  80259  456  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  YP_941531  normal  0.120101  normal  0.170537  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0059  CDS  NC_008709  80294  80896  603  nucleoid occlusion protein  YP_941532  normal  0.0445493  normal  0.11202  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0060  CDS  NC_008709  80966  81256  291  transcriptional repressor protein MetJ  YP_941533  normal  0.0897621  normal  0.262444  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0061  CDS  NC_008709  81340  83925  2586  adenylate cyclase  YP_941534  normal  0.0769237  normal  0.405266  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0062  CDS  NC_008709  84139  85116  978  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  YP_941535  normal  normal  0.450631  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0063  CDS  NC_008709  85557  85808  252  hypothetical protein  YP_941536  normal  normal  0.848374  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0064  CDS  NC_008709  86239  87870  1632  L-aspartate oxidase  YP_941537  normal  0.351527  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0065  CDS  NC_008709  88101  88682  582  RNA polymerase sigma factor RpoE  YP_941538  normal  0.0245104  normal  0.695831  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0066  CDS  NC_008709  88695  89228  534  anti sigma-E protein, RseA  YP_941539  hitchhiker  0.00955502  normal  0.708681  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0067  CDS  NC_008709  89413  90420  1008  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  YP_941540  decreased coverage  7.51067e-06  normal  0.787106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0068  CDS  NC_008709  90424  90873  450  sigma-E factor regulatory protein RseC  YP_941541  decreased coverage  1.26596e-06  normal  0.71927  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0069  CDS  NC_008709  97662  98561  900  transposase, IS4 family protein  YP_941542  normal  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0070  CDS  NC_008709  98920  99183  264  hypothetical protein  YP_941543  normal  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0071  CDS  NC_008709  99340  100158  819  shikimate 5-dehydrogenase  YP_941544  normal  0.507292  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0072  CDS  NC_008709  100251  100826  576  ribosome maturation factor  YP_941545  normal  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0073  CDS  NC_008709  100832  101341  510  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase, catalytic subunit  YP_941546  normal  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0074  CDS  NC_008709  101393  101956  564  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  YP_941547  normal  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0075  CDS  NC_008709  101958  102431  474  hypothetical protein  YP_941548  normal  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0076  CDS  NC_008709  102477  103535  1059  DNA protecting protein DprA  YP_941549  normal  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0077  CDS  NC_008709  103658  104740  1083  peptidoglycan-binding LysM  YP_941550  normal  normal  0.820269  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0078  CDS  NC_008709  104839  105342  504  peptide deformylase  YP_941551  normal  normal  0.97939  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0079  CDS  NC_008709  105437  106387  951  methionyl-tRNA formyltransferase  YP_941552  normal  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0080  CDS  NC_008709  106392  107702  1311  sun protein  YP_941553  normal  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0081  CDS  NC_008709  107913  109289  1377  potassium transporter peripheral membrane component  YP_941554  normal  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0082  CDS  NC_008709  109302  110747  1446  potassium uptake protein TrkH  YP_941555  normal  normal  0.820269  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0083  CDS  NC_008709  111015  112376  1362  hypothetical protein  YP_941556  normal  normal  0.884602  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0084  CDS  NC_008709  112376  112630  255  hypothetical protein  YP_941557  normal  0.848821  normal  0.731592  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0085  CDS  NC_008709  113145  114980  1836  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  YP_941558  normal  0.800313  normal  0.506708  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0086  CDS  NC_008709  115296  116246  951  transaldolase B  YP_941559  normal  0.946439  normal  0.860525  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0087  CDS  NC_008709  116597  117577  981  transcriptional regulator  YP_941560  normal  0.284033  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0088  CDS  NC_008709  118212  120098  1887  PTS system, mannitol-specific IIABC protein  YP_941561  normal  0.15272  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0089  CDS  NC_008709  120193  121341  1149  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  YP_941562  normal  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0090  CDS  NC_008709  121396  121935  540  mannitol repressor protein  YP_941563  normal  0.345813  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0091  CDS  NC_008709  122411  123406  996  fermentative D-lactate dehydrogenase, NAD-dependent  YP_941564  normal  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0092  CDS  NC_008709  123735  124835  1101  hypothetical protein  YP_941565  normal  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0093  CDS  NC_008709  124919  126550  1632  phosphoenolpyruvate carboxykinase  YP_941566  normal  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0094  CDS  NC_008709  126788  127648  861  Hsp33 protein  YP_941567  normal  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0095  CDS  NC_008709  127724  128128  405  RNA-binding S4 domain-containing protein  YP_941568  normal  0.273746  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0096  CDS  NC_008709  128460  129293  834  general secretion pathway protein C  YP_941569  normal  0.140441  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0097  CDS  NC_008709  129387  131375  1989  general secretion pathway protein D  YP_941570  normal  0.395857  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0098  CDS  NC_008709  131375  132910  1536  general secretory pathway protein E  YP_941571  normal  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0099  CDS  NC_008709  132936  134126  1191  general secretion pathway protein F  YP_941572  normal  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Ping_0100  CDS  NC_008709  134210  134644  435  general secretion pathway protein G  YP_941573  normal  normal  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 39    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>