4390 genes were found for organism Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 44    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Maqu_0001  CDS  NC_008740  466  1929  1464  chromosomal replication initiation protein  YP_957296  unclonable  1.89853e-05  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0002  CDS  NC_008740  1990  3093  1104  DNA polymerase III, beta subunit  YP_957297  unclonable  3.48538e-06  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0003  CDS  NC_008740  3112  4383  1272  hypothetical protein  YP_957298  hitchhiker  0.00161336  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0004  CDS  NC_008740  4487  5608  1122  DNA replication and repair protein RecF  YP_957299  normal  0.346024  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0005  CDS  NC_008740  5676  8090  2415  DNA gyrase subunit B  YP_957300  normal  0.645478  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0006  CDS  NC_008740  8193  8960  768  hypothetical protein  YP_957301  normal  0.163946  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0007  CDS  NC_008740  9067  10344  1278  aminotransferase class-III  YP_957302  normal  0.383992  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0008  CDS  NC_008740  10433  12205  1773  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  YP_957303  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0009  CDS  NC_008740  12432  14225  1794  ABC transporter related  YP_957304  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0010  CDS  NC_008740  14235  16487  2253  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  YP_957305  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0011  CDS  NC_008740  16484  20209  3726  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  YP_957306  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0012  CDS  NC_008740  20206  23799  3594  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  YP_957307  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0013  CDS  NC_008740  24208  24675  468  hypothetical protein  YP_957308  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0014  CDS  NC_008740  24832  26532  1701  hypothetical protein  YP_957309  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0015  CDS  NC_008740  26529  28781  2253  DEAD_2 domain-containing protein  YP_957310  normal  0.338089  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0016  CDS  NC_008740  28911  29303  393  hypothetical protein  YP_957311  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0017  CDS  NC_008740  29425  30423  999  secretion protein HlyD family protein  YP_957312  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0018  CDS  NC_008740  30416  33145  2730  ABC transporter related  YP_957313  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0019  CDS  NC_008740  33147  34268  1122  ABC-2 type transporter  YP_957314  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0020  CDS  NC_008740  34312  34683  372  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_957315  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0021  CDS  NC_008740  34813  35337  525  Lipocalin family protein  YP_957316  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0022  CDS  NC_008740  35476  35727  252  hypothetical protein  YP_957317  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0023  CDS  NC_008740  35738  37072  1335  hypothetical protein  YP_957318  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0024  CDS  NC_008740  37142  37855  714  hypothetical protein  YP_957319  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0025  CDS  NC_008740  38428  39168  741  IstB ATP binding domain-containing protein  YP_957320  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0026  CDS  NC_008740  39155  40693  1539  integrase catalytic subunit  YP_957321  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0027  CDS  NC_008740  40775  42214  1440  hypothetical protein  YP_957322  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0028  CDS  NC_008740  42216  44471  2256  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  YP_957323  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0029  CDS  NC_008740  44484  45299  816  hypothetical protein  YP_957324  normal  0.232247  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0030  CDS  NC_008740  45550  46857  1308  restriction modification system DNA specificity subunit  YP_957325  normal  0.534213  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0031  CDS  NC_008740  46857  48476  1620  N-6 DNA methylase  YP_957326  normal  0.775177  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0032  CDS  NC_008740  48722  50362  1641  S-type pyocin domain-containing protein  YP_957327  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0033  CDS  NC_008740  50374  50661  288  barstar (barnase inhibitor)  YP_957328  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0034    NC_008740  50712  54238  3527      normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0035  CDS  NC_008740  54420  55172  753  hypothetical protein  YP_957329  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0036  CDS  NC_008740  55169  56221  1053  hypothetical protein  YP_957330  normal  0.104072  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0037  CDS  NC_008740  56683  58128  1446  cation transporter  YP_957331  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0038  CDS  NC_008740  58186  60267  2082  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  YP_957332  normal  0.903555  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0039  CDS  NC_008740  60270  61364  1095  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  YP_957333  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0040  CDS  NC_008740  61427  62830  1404  potassium transporter peripheral membrane component  YP_957334  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0041  CDS  NC_008740  62827  64128  1302  sun protein  YP_957335  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0042  CDS  NC_008740  64131  65066  936  methionyl-tRNA formyltransferase  YP_957336  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0043  CDS  NC_008740  65147  65650  504  peptide deformylase  YP_957337  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0044  CDS  NC_008740  66118  67134  1017  peptidoglycan-binding LysM  YP_957338  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0045  CDS  NC_008740  67168  68385  1218  DNA protecting protein DprA  YP_957339  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0046  CDS  NC_008740  68401  68973  573  SUA5/yciO/yrdC domain-containing protein  YP_957340  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0047  CDS  NC_008740  68982  69908  927  coproporphyrinogen III oxidase  YP_957341  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0048  CDS  NC_008740  69901  70728  828  shikimate 5-dehydrogenase  YP_957342  normal  0.282753  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0049  CDS  NC_008740  70767  71540  774  MotA/TolQ/ExbB proton channel  YP_957343  normal  0.0969592  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0050  CDS  NC_008740  71544  72377  834  OmpA/MotB domain-containing protein  YP_957344  normal  0.177591  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0051  CDS  NC_008740  72503  72820  318  hypothetical protein  YP_957345  normal  0.430392  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0052  CDS  NC_008740  72860  73315  456  heat shock protein Hsp20  YP_957346  normal  0.319643  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0053  CDS  NC_008740  73506  74045  540  anhydrase family 3 protein  YP_957347  normal  0.389701  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0054  CDS  NC_008740  74247  76292  2046  oligopeptidase A  YP_957348  normal  0.0345207  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0055  CDS  NC_008740  76349  76600  252  hypothetical protein  YP_957349  normal  0.630825  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0056  CDS  NC_008740  76659  77981  1323  Na+/H+ antiporter NhaC  YP_957350  normal  0.455554  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0057  CDS  NC_008740  78096  78326  231  hypothetical protein  YP_957351  normal  0.26698  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0058  CDS  NC_008740  78586  80283  1698  diguanylate cyclase  YP_957352  normal  0.714624  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0059  CDS  NC_008740  80286  80672  387  DoxX family protein  YP_957353  normal  0.41597  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0060  CDS  NC_008740  80753  81439  687  hypothetical protein  YP_957354  normal  0.457239  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0061  CDS  NC_008740  81592  82938  1347  MATE efflux family protein  YP_957355  normal  0.871817  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0062  CDS  NC_008740  83127  84251  1125  cytochrome c oxidase, subunit II  YP_957356  normal  0.0885746  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0063  CDS  NC_008740  84309  85892  1584  cytochrome-c oxidase  YP_957357  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0064  CDS  NC_008740  85906  86502  597  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  YP_957358  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0065  CDS  NC_008740  86519  87406  888  cytochrome c oxidase, subunit III  YP_957359  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0066  CDS  NC_008740  87418  87621  204  hypothetical protein  YP_957360  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0067  CDS  NC_008740  87719  88468  750  hypothetical protein  YP_957361  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0068  CDS  NC_008740  88449  89090  642  hypothetical protein  YP_957362  normal  0.612562  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0069  CDS  NC_008740  89106  90212  1107  cytochrome oxidase assembly  YP_957363  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0070  CDS  NC_008740  90209  91129  921  protoheme IX farnesyltransferase  YP_957364  normal  0.915118  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0071  CDS  NC_008740  91162  91818  657  electron transport protein SCO1/SenC  YP_957365  normal  0.420398  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0072  CDS  NC_008740  91901  93103  1203  hypothetical protein  YP_957366  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0073  CDS  NC_008740  93147  95621  2475  ATP-dependent helicase HrpB  YP_957367  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0074  CDS  NC_008740  95575  96453  879  initiation factor 2B related  YP_957368  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0075  CDS  NC_008740  96508  96873  366  hypothetical protein  YP_957369  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0076  CDS  NC_008740  97027  97845  819  RimK domain-containing protein ATP-grasp  YP_957370  normal  0.668019  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0077  CDS  NC_008740  98015  99190  1176  ornithine decarboxylase  YP_957371  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0078  CDS  NC_008740  99221  100423  1203  major facilitator superfamily transporter  YP_957372  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0079  CDS  NC_008740  100435  100830  396  L-ectoine synthase  YP_957373  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0080  CDS  NC_008740  100881  102311  1431  hypothetical protein  YP_957374  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0081  CDS  NC_008740  102308  103720  1413  hypothetical protein  YP_957375  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0082  CDS  NC_008740  103808  104170  363  hypothetical protein  YP_957376  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0083  CDS  NC_008740  104424  106526  2103  putative D--3-hydroxybutyrate oligomer hydrolase lipoprotein transmembrane  YP_957377  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0084  CDS  NC_008740  106662  108074  1413  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  YP_957378  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0085  CDS  NC_008740  108387  109439  1053  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  YP_957379  normal  0.150064  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0086  CDS  NC_008740  109554  110192  639  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  YP_957380  normal  0.370743  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0087  CDS  NC_008740  110192  111556  1365  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  YP_957381  normal  0.816439  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0088  CDS  NC_008740  111570  112349  780  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  YP_957382  normal  0.791092  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0089  CDS  NC_008740  112366  114354  1989  acetoacetyl-CoA synthetase  YP_957383  normal  0.0848036  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0090  CDS  NC_008740  114820  117063  2244  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  YP_957384  normal  0.0350175  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0091  CDS  NC_008740  117139  118332  1194  sodium/hydrogen exchanger  YP_957385  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0092  CDS  NC_008740  118337  118807  471  ybaK/ebsC protein  YP_957386  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0093  CDS  NC_008740  118868  120172  1305  alanine racemase domain-containing protein  YP_957387  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0094  CDS  NC_008740  120175  121584  1410  FAD-linked oxidoreductase  YP_957388  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0095  CDS  NC_008740  121587  121976  390  cytochrome c family protein  YP_957389  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0096  CDS  NC_008740  122103  123326  1224  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  YP_957390  normal  0.758352  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0097  CDS  NC_008740  123398  124684  1287  beta-lactamase  YP_957391  normal  0.734776  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0098  CDS  NC_008740  124774  125076  303  hypothetical protein  YP_957392  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0099  CDS  NC_008740  125081  126085  1005  hypothetical protein  YP_957393  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Maqu_0100  CDS  NC_008740  126187  129735  3549  multi-sensor hybrid histidine kinase  YP_957394  normal  n/a    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 44    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>