5327 genes were found for organism Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 54    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Mflv_0001  CDS  NC_009338  292  1350  +  1059  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  YP_001131285  normal  1  normal  0.546417  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0002  CDS  NC_009338  1382  1987  -  606  hypothetical protein  YP_001131286  normal  1  normal  0.508363  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0003  CDS  NC_009338  1984  2793  -  810  hypothetical protein  YP_001131287  normal  1  normal  0.548383  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0004  CDS  NC_009338  2793  3440  -  648  hypothetical protein  YP_001131288  normal  1  normal  0.359473  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0005  CDS  NC_009338  3460  4710  -  1251  virulence factor Mce family protein  YP_001131289  normal  1  normal  0.409112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0006  CDS  NC_009338  4710  5951  -  1242  hypothetical protein  YP_001131290  normal  1  normal  0.805588  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0007  CDS  NC_009338  5948  7066  -  1119  virulence factor Mce family protein  YP_001131291  normal  1  normal  0.775898  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0008  CDS  NC_009338  7063  8100  -  1038  virulence factor Mce family protein  YP_001131292  normal  0.611989  normal  1  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0009  CDS  NC_009338  8093  9148  -  1056  virulence factor Mce family protein  YP_001131293  normal  0.629178  normal  1  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0010  CDS  NC_009338  9148  10785  -  1638  hypothetical protein  YP_001131294  normal  0.097844  normal  1  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0011  CDS  NC_009338  10786  11643  -  858  hypothetical protein  YP_001131295  normal  0.305557  normal  1  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0012  CDS  NC_009338  11644  12582  -  939  hypothetical protein  YP_001131296  normal  0.261504  normal  1  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0013  CDS  NC_009338  12770  14044  -  1275  TetR family transcriptional regulator  YP_001131297  normal  0.0542947  normal  1  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0014  CDS  NC_009338  14231  14578  +  348  hypothetical protein  YP_001131298  normal  0.135892  normal  1  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0015  CDS  NC_009338  14637  16280  +  1644  acyl-CoA synthetase  YP_001131299  normal  0.268165  normal  1  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0016  CDS  NC_009338  16371  17072  -  702  GntR domain-containing protein  YP_001131300  normal  0.504347  normal  1  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0017  CDS  NC_009338  17096  18316  +  1221  major facilitator transporter  YP_001131301  normal  0.351593  normal  1  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0018  CDS  NC_009338  18339  19589  +  1251  hypothetical protein  YP_001131302  normal  0.189726  normal  1  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0019  CDS  NC_009338  19599  20222  -  624  NodS family protein  YP_001131303  normal  0.136752  normal  1  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0020  CDS  NC_009338  20219  20986  -  768  LmbE family protein  YP_001131304  normal  0.128438  normal  1  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0021  CDS  NC_009338  20983  21924  -  942  dehydrogenase  YP_001131305  normal  0.0755375  normal  1  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0022  CDS  NC_009338  21921  22625  -  705  glycosyl transferase family protein  YP_001131306  normal  0.647116  normal  1  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0023  CDS  NC_009338  22686  23372  +  687  HAD family hydrolase  YP_001131307  normal  1  normal  0.922489  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0024  CDS  NC_009338  23440  23832  +  393  hypothetical protein  YP_001131308  normal  0.441006  normal  0.869283  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0025  CDS  NC_009338  23836  24747  +  912  naphthoate synthase  YP_001131309  normal  0.234723  normal  0.695361  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0026  CDS  NC_009338  24763  25722  +  960  short chain dehydrogenase  YP_001131310  normal  0.122051  normal  0.68068  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0027  CDS  NC_009338  25729  27258  +  1530  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_001131311  normal  0.141316  normal  0.236103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0028  CDS  NC_009338  27282  27665  +  384  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_001131312  normal  1  normal  0.402975  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0029  CDS  NC_009338  27662  27961  -  300  hypothetical protein  YP_001131313  normal  1  normal  0.405362  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0030  CDS  NC_009338  27972  28259  -  288  hypothetical protein  YP_001131314  normal  1  normal  0.399218  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0031  CDS  NC_009338  28276  29601  -  1326  phosphate transporter  YP_001131315  normal  1  normal  0.499781  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0032  CDS  NC_009338  29760  30077  +  318  hypothetical protein  YP_001131316  normal  0.346325  normal  0.408162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0033  CDS  NC_009338  30134  31219  +  1086  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  YP_001131317  normal  0.648797  normal  0.336703  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0034  CDS  NC_009338  31263  31877  +  615  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  YP_001131318  normal  0.203328  normal  0.307577  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0035  CDS  NC_009338  31941  32651  +  711  two component transcriptional regulator  YP_001131319  normal  0.475833  normal  0.306601  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0036  CDS  NC_009338  32638  33660  +  1023  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  YP_001131320  normal  1  normal  0.452006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0037  CDS  NC_009338  33741  34877  -  1137  2-nitropropane dioxygenase, NPD  YP_001131321  normal  1  normal  0.452006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0038  CDS  NC_009338  35209  36078  +  870  1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase  YP_001131322  normal  1  normal  0.621599  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0039  CDS  NC_009338  36123  37124  +  1002  ATPase  YP_001131323  normal  1  normal  0.320822  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0040  CDS  NC_009338  37138  37998  +  861  hypothetical protein  YP_001131324  normal  0.659881  normal  0.473933  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0041  CDS  NC_009338  37988  38461  +  474  hypothetical protein  YP_001131325  normal  0.817316  normal  0.456363  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0042  CDS  NC_009338  38452  39408  +  957  hypothetical protein  YP_001131326  normal  1  normal  0.524449  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0043  CDS  NC_009338  39405  40319  +  915  hypothetical protein  YP_001131327  normal  1  normal  0.4949  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0044  CDS  NC_009338  40316  41026  +  711  hypothetical protein  YP_001131328  normal  1  normal  0.340354  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0045  CDS  NC_009338  41023  41433  -  411  hypothetical protein  YP_001131329  normal  1  normal  0.316354  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0046  CDS  NC_009338  41498  41839  -  342  hypothetical protein  YP_001131330  normal  0.680889  normal  0.317281  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0047  CDS  NC_009338  41889  42053  +  165  hypothetical protein  YP_001131331  normal  1  normal  0.297578  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0048  CDS  NC_009338  42079  43173  -  1095  hypothetical protein  YP_001131332  normal  1  normal  0.352611  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0049  CDS  NC_009338  43177  44151  -  975  cytochrome c assembly protein  YP_001131333  normal  1  normal  0.255683  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0050  CDS  NC_009338  44148  45797  -  1650  ResB family protein  YP_001131334  normal  1  normal  0.194102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0051  CDS  NC_009338  45797  46582  -  786  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  YP_001131335  normal  1  normal  0.160405  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0052  CDS  NC_009338  46579  47181  -  603  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  YP_001131336  normal  1  normal  0.148538  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0053  CDS  NC_009338  47178  47813  -  636  phosphoglycerate mutase  YP_001131337  normal  1  normal  0.0595129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0054  CDS  NC_009338  47810  49108  -  1299  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase  YP_001131338  normal  1  normal  0.0412584  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0055  CDS  NC_009338  49195  50580  -  1386  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  YP_001131339  normal  1  normal  0.119028  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0056  CDS  NC_009338  50785  52146  -  1362  cytochrome P450  YP_001131340  normal  1  normal  0.12099  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0057  CDS  NC_009338  52130  52648  -  519  hypothetical protein  YP_001131341  normal  1  normal  0.232692  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0058  CDS  NC_009338  52680  53015  -  336  hypothetical protein  YP_001131342  normal  1  normal  0.14095  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0059  CDS  NC_009338  53058  53651  -  594  TetR family transcriptional regulator  YP_001131343  normal  1  normal  0.227701  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0060  CDS  NC_009338  53638  54546  -  909  hypothetical protein  YP_001131344  normal  1  normal  0.376201  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0061  CDS  NC_009338  54660  54914  -  255  putative transmembrane protein  YP_001131345  normal  1  normal  0.319514  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0062  CDS  NC_009338  54911  55399  -  489  putative transmembrane protein  YP_001131346  normal  1  normal  0.335335  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0063  CDS  NC_009338  55396  55866  -  471  hypothetical protein  YP_001131347  normal  1  normal  0.346518  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0064  CDS  NC_009338  56297  57277  -  981  delta-aminolevulinic acid dehydratase  YP_001131348  normal  0.812173  normal  0.553721  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0065  CDS  NC_009338  57366  59075  -  1710  uroporphyrinogen III synthase HEM4  YP_001131349  normal  0.255039  normal  0.829091  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0066  CDS  NC_009338  59072  60010  -  939  porphobilinogen deaminase  YP_001131350  normal  0.0447079  normal  0.735502  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0067  CDS  NC_009338  60036  61403  -  1368  glutamyl-tRNA reductase  YP_001131351  decreased coverage  0.00785406  normal  1  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0068  CDS  NC_009338  61548  61802  -  255  glutaredoxin 2  YP_001131352  normal  0.0187457  normal  1  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0069  CDS  NC_009338  61842  62729  +  888  HAD family hydrolase  YP_001131353  normal  0.0248353  normal  1  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0070  CDS  NC_009338  62780  63328  +  549  MaoC-like dehydratase  YP_001131354  normal  0.112282  normal  1  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0071  CDS  NC_009338  63358  64428  -  1071  phospholipid/glycerol acyltransferase  YP_001131355  normal  0.0627764  normal  1  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0072  CDS  NC_009338  64479  65579  -  1101  NAD-dependent epimerase/dehydratase  YP_001131356  normal  0.553166  normal  1  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0073  CDS  NC_009338  65611  65712  -  102  hypothetical protein  YP_001131357  normal  1  normal  1  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0074  CDS  NC_009338  65861  66133  -  273  DNA binding domain-containing protein  YP_001131358  normal  1  normal  1  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0075  CDS  NC_009338  66271  67152  -  882  pyrroline-5-carboxylate reductase  YP_001131359  normal  0.505458  normal  1  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0076  CDS  NC_009338  67186  67998  -  813  hypothetical protein  YP_001131360  normal  0.761689  normal  1  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0077  CDS  NC_009338  68023  68868  -  846  xylose isomerase domain-containing protein  YP_001131361  normal  1  normal  1  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0078  CDS  NC_009338  68896  70197  -  1302  hypothetical protein  YP_001131362  normal  1  normal  1  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0079  CDS  NC_009338  70238  71269  -  1032  Ppx/GppA phosphatase  YP_001131363  normal  1  normal  1  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0080  CDS  NC_009338  71294  72085  +  792  hypothetical protein  YP_001131364  normal  1  normal  1  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0081  CDS  NC_009338  72082  72390  +  309  YCII-related  YP_001131365  normal  1  normal  1  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0082  CDS  NC_009338  72472  73158  -  687  two component transcriptional regulator  YP_001131366  normal  1  normal  1  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0083  CDS  NC_009338  73166  74374  -  1209  histidine kinase  YP_001131367  normal  1  normal  1  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0084  CDS  NC_009338  74514  75266  -  753  phosphoglycerate mutase 1 family protein  YP_001131368  normal  1  normal  1  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0085  CDS  NC_009338  75291  75800  -  510  hypothetical protein  YP_001131369  normal  1  normal  1  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0086  CDS  NC_009338  75797  77125  -  1329  glycosyl transferase, group 1  YP_001131370  normal  1  normal  1  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0087  CDS  NC_009338  77136  78458  -  1323  ROK family protein  YP_001131371  normal  1  normal  1  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0088  CDS  NC_009338  78682  79440  +  759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001131372  normal  1  normal  1  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0089  CDS  NC_009338  79537  80835  -  1299  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  YP_001131373  normal  1  normal  1  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0090  CDS  NC_009338  80851  81900  -  1050  UDP-N-acetylenolpyruvoylglucosamine reductase  YP_001131374  normal  1  normal  1  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0091  CDS  NC_009338  81926  82447  +  522  hypothetical protein  YP_001131375  normal  1  normal  1  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0092  CDS  NC_009338  82469  83263  +  795  hypothetical protein  YP_001131376  normal  0.426294  normal  1  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0093  CDS  NC_009338  83256  84773  -  1518  Na+/solute symporter  YP_001131377  normal  0.620511  normal  1  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0094  CDS  NC_009338  85120  86268  +  1149  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  YP_001131378  normal  0.284033  normal  1  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0095  CDS  NC_009338  86282  87121  +  840  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  YP_001131379  normal  0.225441  normal  1  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0096  CDS  NC_009338  87118  87975  +  858  hypothetical protein  YP_001131380  normal  0.446207  normal  1  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0097  CDS  NC_009338  87972  88649  -  678  deoxyribose-phosphate aldolase  YP_001131381  normal  0.247733  normal  1  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0098  CDS  NC_009338  88649  89059  -  411  hypothetical protein  YP_001131382  normal  0.095292  normal  1  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0099  CDS  NC_009338  89059  89385  -  327  hypothetical protein  YP_001131383  normal  0.0513827  normal  1  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Mflv_0100  CDS  NC_009338  89403  90065  -  663  hypothetical protein  YP_001131384  normal  0.0116427  normal  1  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 54    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>