4463 genes were found for organism Yersinia pestis Angola



Page 1 of 45    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
YpAngola_0001  CDS  NC_010158  87  1109  1023  IS21 family transposase  YP_001604525  normal  hitchhiker  0.000122483  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0002  CDS  NC_010158  1109  1888  780  transposase/IS protein  YP_001604526  normal  hitchhiker  0.000307192  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0003  CDS  NC_010158  2657  2803  147  hypothetical protein  YP_001604527  normal  0.114555  hitchhiker  0.000832094  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0004    NC_010158  2831  3079  249      normal  0.0431874  hitchhiker  0.000957673  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0005    NC_010158  3298  3857  560      normal  0.154899  hitchhiker  0.00173522  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0006  CDS  NC_010158  4355  4780  426  pesticin immunity protein  YP_001604528  normal  0.648621  hitchhiker  0.00392914  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0007  CDS  NC_010158  4815  5888  1074  pesticin  YP_001604529  normal  0.112425  normal  0.0257696  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0008  CDS  NC_010158  5950  6420  471  hypothetical protein  YP_001604530  normal  0.336629  normal  0.167291  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0009  CDS  NC_010158  6663  7601  939  outer membrane protease  YP_001604531  normal  normal  0.481492  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0010  CDS  NC_010158  7788  8087  300  DNA-binding protein  YP_001604532  normal  normal  0.713803  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0011  CDS  NC_010158  8087  8434  348  hypothetical protein  YP_001604533  normal  normal  0.769725  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0012    NC_010158  8559  8759  201      normal  normal  0.717844  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0013  CDS  NC_010158  8863  9036  174  hypothetical protein  YP_001604534  normal  normal  0.986802  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0014  CDS  NC_010158  9264  9638  375  hypothetical protein  YP_001604535  normal  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0015  CDS  NC_010158  9695  10717  1023  IS21 family transposase  YP_001604536  normal  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0016  CDS  NC_010158  10717  11496  780  transposase/IS protein  YP_001604537  normal  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0017  CDS  NC_010158  12265  12411  147  hypothetical protein  YP_001604538  normal  0.38274  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0018    NC_010158  12439  12687  249      normal  0.279458  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0019    NC_010158  12906  13465  560      normal  0.500712  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0020  CDS  NC_010158  13963  14388  426  pesticin immunity protein  YP_001604539  normal  0.688132  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0021  CDS  NC_010158  14423  15496  1074  pesticin  YP_001604540  normal  0.750323  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0022  CDS  NC_010158  15558  16028  471  hypothetical protein  YP_001604541  normal  0.624604  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0023  CDS  NC_010158  16271  17209  939  outer membrane protease  YP_001604542  normal  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0024  CDS  NC_010158  17396  17695  300  DNA-binding protein  YP_001604543  normal  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0025  CDS  NC_010158  17695  18042  348  hypothetical protein  YP_001604544  normal  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0026    NC_010158  18167  18367  201      normal  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0027  CDS  NC_010158  18471  18644  174  hypothetical protein  YP_001604545  normal  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0028  CDS  NC_010158  18872  19246  375  hypothetical protein  YP_001604546  normal  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0029  CDS  NC_010158  19303  20325  1023  IS21 family transposase  YP_001604547  normal  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0030  CDS  NC_010158  20325  21104  780  transposase/IS protein  YP_001604548  normal  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0031  CDS  NC_010158  21208  21603  396  hypothetical protein  YP_001604549  normal  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0032  CDS  NC_010158  21603  21869  267  hypothetical protein  YP_001604550  normal  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0033  CDS  NC_010158  21872  22948  1077  RecA protein  YP_001604551  normal  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0034  CDS  NC_010158  23092  24738  1647  putative ribonucleoside-diphosphate reductase, alpha subunit  YP_001604552  normal  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0035    NC_010158  24805  25390  586      normal  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0036  CDS  NC_010158  25403  26149  747  hypothetical protein  YP_001604553  normal  0.0708602  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0037  CDS  NC_010158  26139  28055  1917  RecF/RecN/SMC domain-containing protein  YP_001604554  hitchhiker  3.59393e-11  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0038  CDS  NC_010158  28064  28288  225  hypothetical protein  YP_001604555  hitchhiker  2.14257e-15  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0039  CDS  NC_010158  28285  29370  1086  Ser/Thr protein phosphatase family protein  YP_001604556  hitchhiker  1.16094e-34  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0040  CDS  NC_010158  29570  29707  138  hypothetical protein  YP_001604557  hitchhiker  2.87266e-44  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0041    NC_010158  29786  30808  1023      hitchhiker  7.29135e-44  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0042  CDS  NC_010158  30946  31092  147  hypothetical protein  YP_001604558  hitchhiker  1.00374e-48  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0043  CDS  NC_010158  31169  31813  645  hypothetical protein  YP_001604559  hitchhiker  1.38161e-52  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0044  CDS  NC_010158  32202  32342  141  hypothetical protein  YP_001604560  hitchhiker  3.0348e-70  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0045  CDS  NC_010158  32568  33632  1065  replication initiation protein  YP_001604561  hitchhiker  3.97445e-86  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0046  CDS  NC_010158  34201  34413  213  hypothetical protein  YP_001604562  hitchhiker  2.36401e-106  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0047    NC_010158  34413  34924  512      hitchhiker  3.73063e-108  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0048  CDS  NC_010158  34965  35240  276  hypothetical protein  YP_001604563  hitchhiker  1.66561e-102  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0049  CDS  NC_010158  35308  35718  411  hypothetical protein  YP_001604564  hitchhiker  3.71684e-99  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0050  CDS  NC_010158  35702  36073  372  hypothetical protein  YP_001604565  hitchhiker  1.41459e-95  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0051  CDS  NC_010158  36227  37057  831  hypothetical protein  YP_001604566  hitchhiker  1.10901e-82  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0052  CDS  NC_010158  37061  37186  126  hypothetical protein  YP_001604567  hitchhiker  9.16264e-88  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0053    NC_010158  37140  37787  648      hitchhiker  1.1035e-81  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0054  CDS  NC_010158  37895  39037  1143  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  YP_001604568  hitchhiker  5.64103e-82  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0055  CDS  NC_010158  39056  39193  138  hypothetical protein  YP_001604569  hitchhiker  6.30631e-95  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0056    NC_010158  39236  39991  756      hitchhiker  1.42686e-105  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0057  CDS  NC_010158  40230  40688  459  IS605 family transposase  YP_001604570  hitchhiker  3.12196e-96  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0058  CDS  NC_010158  40882  41169  288  hypothetical protein  YP_001604571  hitchhiker  1.39198e-71  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0059  CDS  NC_010158  41186  41362  177  hypothetical protein  YP_001604572  hitchhiker  8.98016e-65  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0060  CDS  NC_010158  41836  42108  273  hypothetical protein  YP_001604574  hitchhiker  1.48687e-41  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0061  CDS  NC_010158  41375  41857  483  hypothetical protein  YP_001604573  hitchhiker  2.54535e-52  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0062  CDS  NC_010158  42496  42723  228  hypothetical protein  YP_001604576  hitchhiker  2.47031e-26  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0063  CDS  NC_010158  42375  42518  144  hypothetical protein  YP_001604575  hitchhiker  1.82098e-29  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0064  CDS  NC_010158  42808  43458  651  hypothetical protein  YP_001604577  hitchhiker  1.4606e-19  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0065  CDS  NC_010158  43781  44308  528  putative transcriptional regulator  YP_001604578  hitchhiker  4.93549e-09  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0066  CDS  NC_010158  44313  44735  423  hypothetical protein  YP_001604579  hitchhiker  0.00199934  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0067  CDS  NC_010158  44795  45073  279  hypothetical protein  YP_001604580  normal  0.0882258  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0068  CDS  NC_010158  45076  46635  1560  Type III restriction enzyme, res subunit  YP_001604581  normal  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0069    NC_010158  46700  47398  699      normal  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0070  CDS  NC_010158  47398  48066  669  ParB domain-containing protein  YP_001604582  normal  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0071  CDS  NC_010158  48063  48701  639  ABC transporter, ATP-binding protein  YP_001604583  normal  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0072  CDS  NC_010158  48694  48948  255  hypothetical protein  YP_001604584  normal  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0073  CDS  NC_010158  48954  49844  891  hypothetical protein  YP_001604585  normal  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0074  CDS  NC_010158  49854  50120  267  hypothetical protein  YP_001604586  normal  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0075  CDS  NC_010158  50316  50957  642  hypothetical protein  YP_001604587  normal  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0076  CDS  NC_010158  50960  52216  1257  hypothetical protein  YP_001604588  normal  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0077  CDS  NC_010158  52250  53824  1575  hypothetical protein  YP_001604589  normal  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0078  CDS  NC_010158  53847  54743  897  hypothetical protein  YP_001604590  normal  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0079  CDS  NC_010158  54770  55576  807  hypothetical protein  YP_001604591  normal  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0080  CDS  NC_010158  55651  56313  663  Ig-like domain-containing protein  YP_001604592  normal  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0081  CDS  NC_010158  56357  56791  435  hypothetical protein  YP_001604593  normal  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0082  CDS  NC_010158  56791  57624  834  hypothetical protein  YP_001604594  normal  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0083  CDS  NC_010158  57722  58066  345  hypothetical protein  YP_001604595  normal  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0084  CDS  NC_010158  58057  58530  474  hypothetical protein  YP_001604596  normal  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0085  CDS  NC_010158  58532  58915  384  hypothetical protein  YP_001604597  normal  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0086  CDS  NC_010158  58990  59736  747  hypothetical protein  YP_001604598  normal  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0087  CDS  NC_010158  59796  60113  318  hypothetical protein  YP_001604599  normal  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0088  CDS  NC_010158  60239  60463  225  hypothetical protein  YP_001604600  normal  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0089  CDS  NC_010158  60471  65036  4566  putative phage tail tape measure protein  YP_001604601  normal  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0090  CDS  NC_010158  65078  65413  336  phage minor tail protein  YP_001604602  normal  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0091  CDS  NC_010158  65503  66201  699  phage minor tail protein L  YP_001604603  normal  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0092  CDS  NC_010158  66233  66991  759  NlpC/P60 family protein  YP_001604604  normal  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0093  CDS  NC_010158  66979  67566  588  phage tail assembly protein  YP_001604605  normal  normal  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0094  CDS  NC_010158  67588  72219  4632  fibronectin type III domain-containing protein  YP_001604606  normal  hitchhiker  2.0422e-05  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0095    NC_010158  72237  72854  618      normal  hitchhiker  1.90423e-12  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0096  CDS  NC_010158  72935  75823  2889  putative phage tail protein  YP_001604607  normal  hitchhiker  2.12465e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0097  CDS  NC_010158  76125  76733  609  putative tail fiber assembly protein  YP_001604608  hitchhiker  1.64491e-06  hitchhiker  2.58934e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0098  CDS  NC_010158  76867  78342  1476  IS21 family transposase  YP_001604609  hitchhiker  5.29735e-20  hitchhiker  2.05788e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0099  CDS  NC_010158  78424  78945  522  putative exonuclease, truncation  YP_001604610  hitchhiker  1.54613e-37  hitchhiker  7.69558e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
YpAngola_0100  CDS  NC_010158  79006  80034  1029  hypothetical protein  YP_001604611  hitchhiker  2.71646e-93  hitchhiker  3.57842e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 45    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>