81 genes were found for organism Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Acry_3471  CDS  NC_009469  452  1051  -  600  cytochrome c, class I  YP_001220216  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3472  CDS  NC_009469  1381  2487  -  1107  hypothetical protein  YP_001220217  normal  0.39471  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3473  CDS  NC_009469  2688  3359  +  672  hypothetical protein  YP_001220218  normal  0.848098  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3474  CDS  NC_009469  3491  4162  +  672  hypothetical protein  YP_001220219  normal  0.498948  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3475  CDS  NC_009469  4159  5154  +  996  peptidase U32  YP_001220220  normal  0.342696  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3476  CDS  NC_009469  5151  6050  +  900  peptidase U32  YP_001220221  normal  0.627959  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3477  CDS  NC_009469  6120  7280  +  1161  endoribonuclease L-PSP  YP_001220222  normal  0.281015  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3478  CDS  NC_009469  7497  8426  +  930  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  YP_001220223  normal  0.180632  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3479  CDS  NC_009469  8453  9040  +  588  glutamine amidotransferase subunit PdxT  YP_001220224  normal  0.31232  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3480  CDS  NC_009469  9651  11534  +  1884  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  YP_001220225  normal  0.308899  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3481  CDS  NC_009469  11521  12228  +  708  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  YP_001220226  normal  0.326751  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3482  CDS  NC_009469  12650  13633  +  984  transposase, IS4 family protein  YP_001220227  normal  0.249116  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3483  CDS  NC_009469  13617  14444  -  828  transposase, IS4 family protein  YP_001220228  normal  0.274203  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3484  CDS  NC_009469  14666  15412  -  747  IstB ATP binding domain-containing protein  YP_001220229  normal  0.837438  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3485  CDS  NC_009469  15430  16977  -  1548  integrase catalytic subunit  YP_001220230  normal  0.522877  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3486    NC_009469  17083  17289  +  207      normal  0.158379  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3487  CDS  NC_009469  17437  18690  +  1254  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  YP_001220231  normal  0.365735  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3488  CDS  NC_009469  19600  21297  +  1698  potassium-transporting ATPase, A subunit  YP_001220232  normal  0.515132  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3489  CDS  NC_009469  21309  23345  +  2037  K+-transporting ATPase, B subunit  YP_001220233  normal  0.384037  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3490  CDS  NC_009469  23361  23960  +  600  potassium-transporting ATPase, C subunit  YP_001220234  normal  0.0438867  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3491  CDS  NC_009469  23977  24477  +  501  hypothetical protein  YP_001220235  normal  0.0216769  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3492  CDS  NC_009469  24585  25796  +  1212  hypothetical protein  YP_001220236  normal  0.0224816  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3493  CDS  NC_009469  26086  28689  +  2604  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  YP_001220237  normal  0.789076  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3494  CDS  NC_009469  28686  29381  +  696  two component transcriptional regulator  YP_001220238  normal  0.0260421  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3495  CDS  NC_009469  29420  29818  -  399  hypothetical protein  YP_001220239  normal  0.0733733  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3496  CDS  NC_009469  29818  32808  -  2991  transposase Tn3 family protein  YP_001220240  normal  0.0968755  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3497  CDS  NC_009469  32747  33406  -  660  resolvase domain-containing protein  YP_001220241  normal  0.503079  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3498    NC_009469  33407  33646  +  240      normal  0.369661  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3499  CDS  NC_009469  33812  34258  +  447  hypothetical protein  YP_001220242  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3500  CDS  NC_009469  34259  34534  -  276  hypothetical protein  YP_001220243  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3501  CDS  NC_009469  34957  35931  +  975  resolvase domain-containing protein  YP_001220244  normal  0.654072  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3502  CDS  NC_009469  36270  37616  +  1347  transposase, IS4 family protein  YP_001220245  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3503    NC_009469  37793  37963  +  171      normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3504  CDS  NC_009469  38074  38616  -  543  antirestriction protein-like protein  YP_001220246  normal  0.519078  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3505  CDS  NC_009469  38619  39611  -  993  phage integrase family protein  YP_001220247  normal  0.431904  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3506  CDS  NC_009469  39608  40549  -  942  phage integrase family protein  YP_001220248  normal  0.524614  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3507  CDS  NC_009469  40546  41757  -  1212  phage integrase family protein  YP_001220249  normal  0.646395  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3508  CDS  NC_009469  41817  42542  -  726  hypothetical protein  YP_001220250  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3509  CDS  NC_009469  43114  44712  +  1599  integrase catalytic subunit  YP_001220251  normal  0.769274  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3510  CDS  NC_009469  44709  45584  +  876  IstB ATP binding domain-containing protein  YP_001220252  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3511  CDS  NC_009469  45805  46215  -  411  PilT domain-containing protein  YP_001220253  normal  0.729818  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3512  CDS  NC_009469  46212  46454  -  243  transcription factor  YP_001220254  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3513  CDS  NC_009469  46521  47201  -  681  NERD domain-containing protein  YP_001220255  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3514  CDS  NC_009469  47274  47615  -  342  hypothetical protein  YP_001220256  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3515  CDS  NC_009469  47612  48271  -  660  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  YP_001220257  normal  0.858877  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3516  CDS  NC_009469  48491  48832  +  342  hypothetical protein  YP_001220258  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3517  CDS  NC_009469  48829  49110  +  282  XRE family transcriptional regulator  YP_001220259  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3518  CDS  NC_009469  49198  50559  -  1362  replication protein C  YP_001220260  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3519  CDS  NC_009469  50726  51496  -  771  hypothetical protein  YP_001220261  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3520  CDS  NC_009469  51980  52666  +  687  lytic transglycosylase, catalytic  YP_001220262  normal  0.940795  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3521  CDS  NC_009469  52647  53012  +  366  VIRB2 type IV secretion fmaily protein  YP_001220263  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3522  CDS  NC_009469  53016  53348  +  333  type IV secretion system protein VirB3  YP_001220264  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3523  CDS  NC_009469  53338  55731  +  2394  type IV secretion system protein VirB4  YP_001220265  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3524  CDS  NC_009469  55741  56499  +  759  type IV secretion system family protein  YP_001220266  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3525  CDS  NC_009469  56729  57616  +  888  type IV secretion system protein VirB6  YP_001220267  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3526  CDS  NC_009469  57795  58496  +  702  type IV secretion system protein VirB8  YP_001220268  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3527  CDS  NC_009469  58493  59383  +  891  type IV secretion system protein VirB9  YP_001220269  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3528  CDS  NC_009469  59373  60509  +  1137  conjugation TrbI family protein  YP_001220270  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3529  CDS  NC_009469  60506  60826  +  321  hypothetical protein  YP_001220271  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3530  CDS  NC_009469  60823  61890  +  1068  type IV secretion system protein VirB11  YP_001220272  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3531  CDS  NC_009469  61890  63710  +  1821  conjugal transfer coupling protein TraG  YP_001220273  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3532  CDS  NC_009469  63838  64320  -  483  AsnC family transcriptional regulator  YP_001220274  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3533  CDS  NC_009469  64386  65438  +  1053  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  YP_001220275  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3534  CDS  NC_009469  65435  66604  +  1170  amidohydrolase  YP_001220276  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3535  CDS  NC_009469  66601  67914  +  1314  allantoate amidohydrolase  YP_001220277  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3536  CDS  NC_009469  68011  69267  -  1257  DNA-repair protein  YP_001220278  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3537  CDS  NC_009469  69273  69662  -  390  hypothetical protein  YP_001220279  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3538  CDS  NC_009469  69707  70417  +  711  hypothetical protein  YP_001220280  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3539  CDS  NC_009469  71277  72293  -  1017  hypothetical protein  YP_001220281  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3540  CDS  NC_009469  72734  73360  +  627  hypothetical protein  YP_001220282  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3541  CDS  NC_009469  73588  75783  -  2196  RecD/TraA family helicase  YP_001220283  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3542  CDS  NC_009469  76117  81168  -  5052  aldehyde dehydrogenase  YP_001220284  normal  0.311883  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3543  CDS  NC_009469  81216  81554  -  339  hypothetical protein  YP_001220285  normal  0.212062  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3544  CDS  NC_009469  81761  82492  +  732  hypothetical protein  YP_001220286  normal  0.219919  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3545  CDS  NC_009469  82502  83392  +  891  hypothetical protein  YP_001220287  normal  0.928793  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3546  CDS  NC_009469  83629  84093  +  465  hypothetical protein  YP_001220288  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3547  CDS  NC_009469  84098  84418  +  321  hypothetical protein  YP_001220289  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3548  CDS  NC_009469  84795  85472  -  678  hypothetical protein  YP_001220290  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3549  CDS  NC_009469  85472  86161  -  690  hypothetical protein  YP_001220291  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3550    NC_009469  86218  87280  -  1063      normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3552  CDS  NC_009469  87820  88932  -  1113  CitB domain-containing protein  YP_001220292  normal  1  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>