187 genes were found for organism Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Acry_3105  CDS  NC_009467  155  2215  2061  hypothetical protein  YP_001219876  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3106  CDS  NC_009467  2212  2889  678  two component heavy metal response transcriptional regulator  YP_001219877  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3107  CDS  NC_009467  2918  4261  1344  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  YP_001219878  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3108  CDS  NC_009467  4361  5737  1377  outer membrane efflux protein  YP_001219879  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3109  CDS  NC_009467  5734  6660  927  hypothetical protein  YP_001219880  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3110  CDS  NC_009467  6670  9771  3102  acriflavin resistance protein  YP_001219881  normal  0.535167  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3111  CDS  NC_009467  9868  10911  1044  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  YP_001219882  normal  0.609339  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3112  CDS  NC_009467  11140  11562  423  hypothetical protein  YP_001219883  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3113  CDS  NC_009467  11943  12653  711  transposase  YP_001219884  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3114  CDS  NC_009467  12788  13297  510  transposase  YP_001219885  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3115  CDS  NC_009467  13423  13941  519  hypothetical protein  YP_001219886  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3116  CDS  NC_009467  14156  15196  1041  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  YP_001219887  normal  0.914842  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3117    NC_009467  15245  15412  168      normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3118  CDS  NC_009467  15617  16633  1017  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  YP_001219888  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3119  CDS  NC_009467  16732  16851  120  hypothetical protein  YP_001219889  normal  0.605614  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3120    NC_009467  16854  17743  890      normal  0.269434  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3121  CDS  NC_009467  18245  18490  246  hypothetical protein  YP_001219890  normal  0.10987  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3122  CDS  NC_009467  18463  18711  249  hypothetical protein  YP_001219891  normal  0.116578  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3123  CDS  NC_009467  18695  20044  1350  Na+/H+ antiporter NhaA  YP_001219892  normal  0.158144  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3124  CDS  NC_009467  22309  22620  312  hypothetical protein  YP_001219893  normal  0.143828  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3125  CDS  NC_009467  22631  23713  1083  transposase, IS4 family protein  YP_001219894  normal  0.343643  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3126  CDS  NC_009467  23752  24960  1209  transposase, mutator type  YP_001219895  normal  0.601222  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3127  CDS  NC_009467  25032  25379  348  hypothetical protein  YP_001219896  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3128  CDS  NC_009467  25666  26469  804  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_001219897  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3129  CDS  NC_009467  26466  26924  459  hypothetical protein  YP_001219898  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3130  CDS  NC_009467  26921  27385  465  DoxX family protein  YP_001219899  normal  0.767658  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3131  CDS  NC_009467  27401  27583  183  hypothetical protein  YP_001219900  normal  0.753056  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3132  CDS  NC_009467  27999  29513  1515  mercuric reductase  YP_001219901  normal  0.209744  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3133  CDS  NC_009467  29516  30799  1284  hypothetical protein  YP_001219902  normal  0.0763875  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3134  CDS  NC_009467  30805  32238  1434  glycoside hydrolase family protein  YP_001219903  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3135  CDS  NC_009467  32235  33797  1563  glucose-methanol-choline oxidoreductase  YP_001219904  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3136  CDS  NC_009467  33803  34612  810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001219905  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3137  CDS  NC_009467  35025  35339  315  hypothetical protein  YP_001219906  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3138  CDS  NC_009467  35500  35841  342  hypothetical protein  YP_001219907  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3139  CDS  NC_009467  35854  44382  8529  glycosyltransferase 36  YP_001219908  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3140  CDS  NC_009467  44516  45322  807  transposase, IS4 family protein  YP_001219909  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3141  CDS  NC_009467  45389  45715  327  hypothetical protein  YP_001219910  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3142    NC_009467  45834  46031  198      normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3143  CDS  NC_009467  46128  47306  1179  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  YP_001219911  normal  0.860131  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3144    NC_009467  47624  47818  195      normal  0.895869  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3145  CDS  NC_009467  48369  50351  1983  hypothetical protein  YP_001219912  normal  0.44353  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3146  CDS  NC_009467  50396  51322  927  PHB depolymerase family esterase  YP_001219913  normal  0.616621  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3147  CDS  NC_009467  51819  51989  171  CsbD family protein  YP_001219914  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3148  CDS  NC_009467  52424  52981  558  XRE family transcriptional regulator  YP_001219915  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3149  CDS  NC_009467  53133  53585  453  hypothetical protein  YP_001219916  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3150  CDS  NC_009467  53739  54068  330  hypothetical protein  YP_001219917  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3151  CDS  NC_009467  54440  54811  372  hypothetical protein  YP_001219918  normal  0.990399  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3152  CDS  NC_009467  55010  55282  273  hypothetical protein  YP_001219919  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3153  CDS  NC_009467  55649  55996  348  hypothetical protein  YP_001219920  normal  0.740304  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3154  CDS  NC_009467  56015  57064  1050  hypothetical protein  YP_001219921  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3155  CDS  NC_009467  57098  58138  1041  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  YP_001219922  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3156  CDS  NC_009467  58472  59488  1017  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  YP_001219923  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3157    NC_009467  59776  60510  735      normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3158  CDS  NC_009467  60649  61905  1257  transposase  YP_001219924  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3159  CDS  NC_009467  62033  62305  273  hypothetical protein  YP_001219925  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3160  CDS  NC_009467  64741  65721  981  Na+/H+ antiporter NhaA  YP_001219926  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3161  CDS  NC_009467  65815  67458  1644  transposase, IS4 family protein  YP_001219927  normal  0.922014  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3162  CDS  NC_009467  67582  68019  438  Na+/H+ antiporter NhaA  YP_001219928  normal  0.716261  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3163  CDS  NC_009467  68003  68251  249  hypothetical protein  YP_001219929  normal  0.767658  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3164  CDS  NC_009467  68806  69588  783  IstB ATP binding domain-containing protein  YP_001219930  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3165    NC_009467  69578  70455  878      normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3166  CDS  NC_009467  70523  71398  876  IstB ATP binding domain-containing protein  YP_001219931  normal  0.731238  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3167  CDS  NC_009467  71395  72924  1530  integrase catalytic subunit  YP_001219932  normal  0.128774  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3168  CDS  NC_009467  74089  75303  1215  hypothetical protein  YP_001219933  normal  0.0790246  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3169  CDS  NC_009467  75372  79709  4338  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  YP_001219934  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3170  CDS  NC_009467  80154  81200  1047  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  YP_001219935  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3171  CDS  NC_009467  81170  82048  879  regulatory protein GntR, HTH  YP_001219936  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3172  CDS  NC_009467  82617  83825  1209  transposase, mutator type  YP_001219937  normal  0.15251  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3173  CDS  NC_009467  84454  85164  711  transposase  YP_001219938  normal  0.19085  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3174  CDS  NC_009467  86018  86296  279  plasmid stabilization system protein  YP_001219939  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3175  CDS  NC_009467  86302  86592  291  hypothetical protein  YP_001219940  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3176  CDS  NC_009467  86592  86864  273  hypothetical protein  YP_001219941  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3177  CDS  NC_009467  86998  88122  1125  hypothetical protein  YP_001219942  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3178  CDS  NC_009467  88223  88492  270  WGR domain-containing protein  YP_001219943  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3179  CDS  NC_009467  88768  91056  2289  hypothetical protein  YP_001219944  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3180  CDS  NC_009467  91393  91818  426  PilT domain-containing protein  YP_001219945  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3181  CDS  NC_009467  91815  92090  276  hypothetical protein  YP_001219946  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3182    NC_009467  92849  93131  283      normal  0.303754  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3183  CDS  NC_009467  93167  93382  216  hypothetical protein  YP_001219947  normal  0.102788  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3184  CDS  NC_009467  93525  94280  756  hypothetical protein  YP_001219948  normal  0.0240145  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3185  CDS  NC_009467  94196  95404  1209  transposase, mutator type  YP_001219949  normal  0.0504215  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3186  CDS  NC_009467  95519  95839  321  hypothetical protein  YP_001219950  normal  0.271971  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3187  CDS  NC_009467  96132  96545  414  hypothetical protein  YP_001219951  normal  0.940243  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3188  CDS  NC_009467  96950  97573  624  hypothetical protein  YP_001219952  normal  0.0815564  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3189  CDS  NC_009467  97387  98373  987  hypothetical protein  YP_001219953  normal  0.0965465  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3190  CDS  NC_009467  98745  99074  330  hypothetical protein  YP_001219954  normal  0.21408  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3191  CDS  NC_009467  99126  99464  339  hypothetical protein  YP_001219955  normal  0.331575  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3192  CDS  NC_009467  99418  99723  306  hypothetical protein  YP_001219956  normal  0.327076  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3193  CDS  NC_009467  99832  100389  558  XRE family transcriptional regulator  YP_001219957  normal  0.324962  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3194  CDS  NC_009467  100689  100994  306  CsbD family protein  YP_001219958  normal  0.828188  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3195  CDS  NC_009467  101491  102417  927  PHB depolymerase family esterase  YP_001219959  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3196  CDS  NC_009467  102462  104444  1983  hypothetical protein  YP_001219960  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3197  CDS  NC_009467  104657  105187  531  response regulator receiver protein  YP_001219961  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3198  CDS  NC_009467  105560  105916  357  hypothetical protein  YP_001219962  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3199  CDS  NC_009467  105997  106335  339  hypothetical protein  YP_001219963  normal  0.514761  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3200  CDS  NC_009467  106952  107788  837  band 7 protein  YP_001219964  normal  0.173573  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3201  CDS  NC_009467  108038  109294  1257  transposase  YP_001219965  normal  0.25369  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3202  CDS  NC_009467  109482  110726  1245  transposase, IS4 family protein  YP_001219966  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3203  CDS  NC_009467  111082  111759  678  hypothetical protein  YP_001219967  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Acry_3204  CDS  NC_009467  111777  112193  417  hypothetical protein  YP_001219968  normal  n/a    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>