2493 genes were found for organism Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 25    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Hhal_0001  CDS  NC_008789  35  664  630  methyltransferase GidB  YP_001001598  hitchhiker  0.0073145  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0002  CDS  NC_008789  654  2555  1902  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  YP_001001599  hitchhiker  6.52105e-06  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0003  CDS  NC_008789  2616  3773  1158  beta-ketoacyl synthase  YP_001001600  unclonable  1.06531e-09  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0004  CDS  NC_008789  3787  4653  867  aminotransferase, class IV  YP_001001601  hitchhiker  0.000202983  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0005  CDS  NC_008789  4692  5675  984  aminodeoxychorismate lyase  YP_001001602  hitchhiker  9.92333e-05  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0006  CDS  NC_008789  5672  6319  648  dTMP kinase  YP_001001603  hitchhiker  0.00242626  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0007  CDS  NC_008789  6316  7371  1056  DNA polymerase III, delta prime subunit  YP_001001604  normal  0.0298207  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0008  CDS  NC_008789  7347  8477  1131  aminotransferase, class V  YP_001001605  normal  0.0672811  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0009  CDS  NC_008789  8712  9485  774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001001606  normal  0.247011  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0010  CDS  NC_008789  9578  10555  978  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  YP_001001607  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0011  CDS  NC_008789  10658  11284  627  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein B  YP_001001608  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0012  CDS  NC_008789  11435  13339  1905  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_001001609  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0013  CDS  NC_008789  13400  14152  753  hypothetical protein  YP_001001610  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0014  CDS  NC_008789  14225  15424  1200  TraB family protein  YP_001001611  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0015  CDS  NC_008789  15439  16992  1554  peptide chain release factor 3  YP_001001612  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0016  CDS  NC_008789  17214  17708  495  hypothetical protein  YP_001001613  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0017  CDS  NC_008789  17877  18401  525  3-hydroxydecanoyl-(acyl carrier protein) dehydratase  YP_001001614  normal  0.292818  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0018  CDS  NC_008789  18440  19657  1218  beta-ketoacyl synthase  YP_001001615  normal  0.83399  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0019  CDS  NC_008789  19722  21116  1395  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  YP_001001616  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0020  CDS  NC_008789  21085  22296  1212  hypothetical protein  YP_001001617  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0021  CDS  NC_008789  22730  23281  552  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  YP_001001618  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0022  CDS  NC_008789  23291  25132  1842  excinuclease ABC subunit C  YP_001001619  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0023  CDS  NC_008789  25340  25990  651  two component LuxR family transcriptional regulator  YP_001001620  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0024  CDS  NC_008789  26080  26922  843  pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis, RibD  YP_001001621  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0025  CDS  NC_008789  26958  28355  1398  fumarate lyase  YP_001001622  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0026  CDS  NC_008789  28460  29827  1368  adenylosuccinate lyase  YP_001001623  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0027  CDS  NC_008789  29899  30540  642  NUDIX hydrolase  YP_001001624  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0028  CDS  NC_008789  30558  31862  1305  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  YP_001001625  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0029  CDS  NC_008789  31870  32643  774  hypothetical protein  YP_001001626  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0030  CDS  NC_008789  32662  33042  381  holo-acyl-carrier-protein synthase  YP_001001627  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0031  CDS  NC_008789  33039  33773  735  pyridoxine 5'-phosphate synthase  YP_001001628  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0032  CDS  NC_008789  33797  34501  705  DNA repair protein RecO  YP_001001629  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0033  CDS  NC_008789  34498  35415  918  GTP-binding protein Era  YP_001001630  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0034  CDS  NC_008789  35408  36112  705  ribonuclease III  YP_001001631  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0035  CDS  NC_008789  36117  36878  762  signal peptidase I  YP_001001632  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0036  CDS  NC_008789  36888  38687  1800  GTP-binding protein LepA  YP_001001633  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0037  CDS  NC_008789  38779  40248  1470  protease Do  YP_001001634  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0038  CDS  NC_008789  40313  41302  990  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  YP_001001635  normal  0.622863  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0039  CDS  NC_008789  41289  41969  681  anti sigma-E protein, RseA  YP_001001636  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0040  CDS  NC_008789  41999  42583  585  RNA polymerase sigma factor RpoE  YP_001001637  normal  0.949199  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0041  CDS  NC_008789  42714  44405  1692  L-aspartate oxidase  YP_001001638  normal  0.852178  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0042  CDS  NC_008789  44798  45058  261  hypothetical protein  YP_001001639  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0043  CDS  NC_008789  45076  45864  789  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  YP_001001640  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0044  CDS  NC_008789  45884  47674  1791  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  YP_001001641  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0045  CDS  NC_008789  47682  48065  384  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  YP_001001642  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0046  CDS  NC_008789  48068  48457  390  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  YP_001001643  normal  0.200427  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0047  CDS  NC_008789  48718  49674  957  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  YP_001001644  normal  0.21464  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0048  CDS  NC_008789  49687  51174  1488  lysyl-tRNA synthetase  YP_001001645  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0049  CDS  NC_008789  51210  52085  876  peptide chain release factor 2  YP_001001646  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0050  CDS  NC_008789  52475  53740  1266  adenosylhomocysteinase  YP_001001647  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0051  CDS  NC_008789  53839  54336  498  hypothetical protein  YP_001001648  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0052  CDS  NC_008789  54365  57076  2712  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_001001649  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0053  CDS  NC_008789  57173  61033  3861  FAD linked oxidase domain-containing protein  YP_001001650  normal  0.170448  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0054  CDS  NC_008789  61061  61396  336  hypothetical protein  YP_001001651  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0055  CDS  NC_008789  61435  62016  582  NnrU family protein  YP_001001652  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0056  CDS  NC_008789  62060  63517  1458  Fmu (Sun) domain-containing protein  YP_001001653  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0057  CDS  NC_008789  63692  66202  2511  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  YP_001001654  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0058  CDS  NC_008789  66163  67236  1074  diguanylate phosphodiesterase  YP_001001655  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0059  CDS  NC_008789  67406  70006  2601  phosphoenolpyruvate synthase  YP_001001656  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0060  CDS  NC_008789  70003  71352  1350  glutamate dehydrogenase  YP_001001657  normal  0.742683  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0061  CDS  NC_008789  72023  72604  582  RnfA-Nqr electron transport subunit  YP_001001658  normal  0.745  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0062  CDS  NC_008789  72594  73253  660  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  YP_001001659  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0063  CDS  NC_008789  73253  73945  693  FMN-binding domain-containing protein  YP_001001660  normal  0.650559  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0064  CDS  NC_008789  73945  74961  1017  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  YP_001001661  normal  0.601171  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0065  CDS  NC_008789  74961  76307  1347  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  YP_001001662  normal  0.791332  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0066  CDS  NC_008789  76310  81277  4968  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain-containing protein  YP_001001663  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0067  CDS  NC_008789  81420  82301  882  Fe-S cluster domain-containing protein  YP_001001664  normal  0.730786  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0068  CDS  NC_008789  82544  84139  1596  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  YP_001001665  normal  0.935304  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0069  CDS  NC_008789  84136  84681  546  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  YP_001001666  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0070  CDS  NC_008789  84693  86030  1338  phenylacetate--CoA ligase  YP_001001667  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0071  CDS  NC_008789  86033  86470  438  amino acid-binding ACT domain-containing protein  YP_001001668  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0072  CDS  NC_008789  86491  87513  1023  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  YP_001001669  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0073  CDS  NC_008789  87562  88062  501  disulphide bond formation protein DsbB  YP_001001670  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0074  CDS  NC_008789  88297  88644  348  alkylhydroperoxidase  YP_001001671  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0075  CDS  NC_008789  88759  89415  657  rhodanese domain-containing protein  YP_001001672  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0076  CDS  NC_008789  89423  89863  441  choline/carnitine/betaine transporter  YP_001001673  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0077  CDS  NC_008789  89860  91500  1641  choline/carnitine/betaine transporter  YP_001001674  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0078  CDS  NC_008789  91497  93020  1524  glycerol kinase  YP_001001675  normal  0.503423  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0079  CDS  NC_008789  93202  94839  1638  FAD dependent oxidoreductase  YP_001001676  normal  0.656011  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0080  CDS  NC_008789  94836  95159  324  hypothetical protein  YP_001001677  normal  0.616063  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0081  CDS  NC_008789  95269  95949  681  phosphate uptake regulator, PhoU  YP_001001678  normal  0.299222  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0082  CDS  NC_008789  95971  97173  1203  Na+/Pi-cotransporter  YP_001001679  normal  0.241914  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0083  CDS  NC_008789  97322  97759  438  hypothetical protein  YP_001001680  normal  0.0908948  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0084  CDS  NC_008789  97972  99594  1623  hypothetical protein  YP_001001681  normal  0.42899  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0085  CDS  NC_008789  99698  100210  513  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  YP_001001682  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0086  CDS  NC_008789  100258  101337  1080  anthranilate phosphoribosyltransferase  YP_001001683  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0087  CDS  NC_008789  101376  102353  978  alcohol dehydrogenase  YP_001001684  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0088  CDS  NC_008789  102396  103454  1059  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl) glucosamine N-acyltransferase  YP_001001685  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0089  CDS  NC_008789  103596  104891  1296  hypothetical protein  YP_001001686  normal  0.678836  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0090  CDS  NC_008789  105086  105304  219  hypothetical protein  YP_001001687  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0091  CDS  NC_008789  105624  106055  432  protein tyrosine phosphatase  YP_001001688  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0092  CDS  NC_008789  106110  106850  741  phosphate uptake regulator, PhoU  YP_001001689  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0093  CDS  NC_008789  106862  107716  855  phosphate transporter ATP-binding protein  YP_001001690  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0094  CDS  NC_008789  107730  109406  1677  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  YP_001001691  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0095  CDS  NC_008789  109426  111753  2328  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_001001692  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0096  CDS  NC_008789  111948  112913  966  phosphate binding protein  YP_001001693  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0097  CDS  NC_008789  112981  114321  1341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  YP_001001694  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0098  CDS  NC_008789  114343  115032  690  two component transcriptional regulator  YP_001001695  normal  0.761303  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0099    NC_008789  115233  116408  1176      normal  0.519951  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Hhal_0100  CDS  NC_008789  116586  117209  624  hypothetical protein  YP_001001696  normal  n/a    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 25    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>