2477 genes were found for organism Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 25    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
PsycPRwf_0001  CDS  NC_009524  59  193  135  50S ribosomal protein L34  YP_001278911  hitchhiker  2.83755e-10  hitchhiker  5.52795e-09  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0002  CDS  NC_009524  1311  2723  1413  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_001278912  unclonable  1.88551e-09  unclonable  4.72438e-10  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0003  CDS  NC_009524  2984  4159  1176  DNA polymerase III, beta subunit  YP_001278913  hitchhiker  4.67404e-10  unclonable  5.68152e-10  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0004  CDS  NC_009524  4455  5834  1380  DNA replication and repair protein RecF  YP_001278914  hitchhiker  1.85979e-05  hitchhiker  1.60944e-08  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0005  CDS  NC_009524  6078  8732  2655  DNA gyrase, B subunit  YP_001278915  hitchhiker  0.000126845  hitchhiker  3.17646e-08  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0006  CDS  NC_009524  8933  9520  588  hypothetical protein  YP_001278916  hitchhiker  8.57448e-05  hitchhiker  9.41545e-07  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0007  CDS  NC_009524  9752  10735  984  putative SAM-dependent methyltransferase  YP_001278917  normal  0.0795791  hitchhiker  2.81072e-05  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0008  CDS  NC_009524  11220  12026  807  enoyl-CoA hydratase  YP_001278918  normal  hitchhiker  2.2678e-05  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0009  CDS  NC_009524  12247  13194  948  auxin efflux carrier  YP_001278919  normal  hitchhiker  2.22862e-05  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0010  CDS  NC_009524  13470  15656  2187  KAP P-loop domain-containing protein  YP_001278920  normal  hitchhiker  0.00154725  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0011  CDS  NC_009524  15781  16209  429  hypothetical protein  YP_001278921  normal  hitchhiker  0.00989265  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0012  CDS  NC_009524  16359  16811  453  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_001278922  normal  normal  0.0387955  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0013  CDS  NC_009524  16859  18010  1152  aminotransferase, class I and II  YP_001278923  normal  normal  0.085137  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0014  CDS  NC_009524  18165  19919  1755  choline/carnitine/betaine transporter  YP_001278924  normal  normal  0.0977143  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0015  CDS  NC_009524  20646  22244  1599  GMP synthase  YP_001278925  normal  normal  0.235317  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0016  CDS  NC_009524  22432  22764  333  hypothetical protein  YP_001278926  normal  normal  0.369451  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0017  CDS  NC_009524  22768  23745  978  alcohol dehydrogenase  YP_001278927  normal  normal  0.430943  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0018  CDS  NC_009524  23938  26958  3021  hypothetical protein  YP_001278928  normal  normal  0.774764  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0019  CDS  NC_009524  27558  29159  1602  extracellular solute-binding protein  YP_001278929  normal  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0020  CDS  NC_009524  29321  30997  1677  extracellular solute-binding protein  YP_001278930  normal  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0021  CDS  NC_009524  31051  32736  1686  extracellular solute-binding protein  YP_001278931  normal  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0022  CDS  NC_009524  32839  33759  921  alkaline phosphatase  YP_001278932  normal  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0023  CDS  NC_009524  33858  34763  906  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_001278933  normal  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0024  CDS  NC_009524  34884  35930  1047  oligopeptide transporter ATP-binding component  YP_001278934  normal  0.586703  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0025  CDS  NC_009524  35934  36977  1044  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  YP_001278935  normal  0.408235  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0026  CDS  NC_009524  37111  37845  735  hypothetical protein  YP_001278936  normal  0.0670841  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0027  CDS  NC_009524  37945  38505  561  hypothetical protein  YP_001278937  normal  0.184818  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0028  CDS  NC_009524  38638  38913  276  hypothetical protein  YP_001278938  normal  0.323512  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0029  CDS  NC_009524  39113  40153  1041  2-nitropropane dioxygenase, NPD  YP_001278939  normal  0.58495  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0030  CDS  NC_009524  40323  41258  936  hypothetical protein  YP_001278940  normal  0.304564  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0031  CDS  NC_009524  41323  42834  1512  MATE efflux family protein  YP_001278941  normal  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0032  CDS  NC_009524  43098  44633  1536  hypothetical protein  YP_001278942  normal  0.924965  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0033  CDS  NC_009524  44949  45491  543  hypothetical protein  YP_001278943  normal  0.156531  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0034  CDS  NC_009524  45621  46781  1161  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like protein  YP_001278944  hitchhiker  1.6789e-05  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0035  CDS  NC_009524  46962  47558  597  hypothetical protein  YP_001278945  hitchhiker  1.27558e-07  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0036  CDS  NC_009524  47808  48512  705  pseudouridine synthase  YP_001278946  unclonable  1.27048e-11  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0037  CDS  NC_009524  48862  49977  1116  hypothetical protein  YP_001278947  hitchhiker  4.03453e-05  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0038  CDS  NC_009524  50008  50667  660  hypothetical protein  YP_001278948  hitchhiker  0.00177426  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0039  CDS  NC_009524  50881  52014  1134  chaperone protein DnaJ  YP_001278949  hitchhiker  0.000553213  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0040  CDS  NC_009524  52036  52179  144  hypothetical protein  YP_001278950  normal  0.0207175  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0041  CDS  NC_009524  52237  53064  828  dihydrodipicolinate reductase  YP_001278951  normal  0.852498  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0042  CDS  NC_009524  53180  53710  531  peptide deformylase  YP_001278952  normal  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0043  CDS  NC_009524  54039  54287  249  transglycosylase-associated protein  YP_001278953  normal  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0044  CDS  NC_009524  54628  56139  1512  UDP-N-acetylmuramate  YP_001278954  normal  0.568867  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0045  CDS  NC_009524  56198  56713  516  disulphide bond formation protein DsbB  YP_001278955  normal  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0046  CDS  NC_009524  56949  58529  1581  glutamate--cysteine ligase  YP_001278956  normal  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0047  CDS  NC_009524  58951  59280  330  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  YP_001278957  normal  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0048  CDS  NC_009524  59540  61534  1995  ABC transporter related  YP_001278958  normal  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0049  CDS  NC_009524  61767  62786  1020  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  YP_001278959  normal  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0050  CDS  NC_009524  62826  63155  330  hypothetical protein  YP_001278960  normal  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0051  CDS  NC_009524  63310  64530  1221  serine/threonine transporter SstT  YP_001278961  normal  0.337249  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0052  CDS  NC_009524  65071  65571  501  DNA polymerase III chi subunit, HolC  YP_001278962  normal  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0053  CDS  NC_009524  65587  67233  1647  leucyl aminopeptidase  YP_001278963  normal  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0054  CDS  NC_009524  67680  69164  1485  permease YjgP/YjgQ family protein  YP_001278964  normal  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0055  CDS  NC_009524  69161  70510  1350  permease YjgP/YjgQ family protein  YP_001278965  normal  0.853634  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0056  CDS  NC_009524  70721  71329  609  methyltransferase small  YP_001278966  normal  0.612359  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0057  CDS  NC_009524  71419  72117  699  phosphoglycolate phosphatase  YP_001278967  normal  0.049028  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0058  CDS  NC_009524  72142  72642  501  hypothetical protein  YP_001278968  normal  0.132822  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0059  CDS  NC_009524  72940  73383  444  hypothetical protein  YP_001278969  normal  0.155402  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0060  CDS  NC_009524  73612  74238  627  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  YP_001278970  normal  0.403359  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0061  CDS  NC_009524  74243  74878  636  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisH  YP_001278971  normal  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0062  CDS  NC_009524  75246  75593  348  hypothetical protein  YP_001278972  normal  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0063  CDS  NC_009524  75685  76128  444  transmembrane pair domain-containing protein  YP_001278973  normal  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0064  CDS  NC_009524  76195  78975  2781  aconitate hydratase  YP_001278974  normal  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0065  CDS  NC_009524  79483  79842  360  hypothetical protein  YP_001278975  normal  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0066  CDS  NC_009524  79932  81788  1857  amidohydrolase 3  YP_001278976  normal  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0067  CDS  NC_009524  82072  83142  1071  hypothetical protein  YP_001278977  normal  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0068  CDS  NC_009524  83647  84540  894  alpha/beta hydrolase fold  YP_001278978  normal  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0069  CDS  NC_009524  84811  86415  1605  cholesterol oxidase  YP_001278979  normal  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0070  CDS  NC_009524  86426  87457  1032  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  YP_001278980  normal  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0071  CDS  NC_009524  87576  87959  384  hypothetical protein  YP_001278981  normal  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0072  CDS  NC_009524  88199  88789  591  cytochrome B561  YP_001278982  normal  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0073  CDS  NC_009524  89243  91897  2655  hypothetical protein  YP_001278983  normal  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0074  CDS  NC_009524  92102  92863  762  C factor cell-cell signaling protein  YP_001278984  normal  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0075  CDS  NC_009524  93199  93774  576  stress protein  YP_001278985  normal  0.0162917  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0076  CDS  NC_009524  93929  95017  1089  hypothetical protein  YP_001278986  decreased coverage  4.15937e-05  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0077  CDS  NC_009524  95318  95893  576  stress protein  YP_001278987  hitchhiker  6.62934e-06  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0078  CDS  NC_009524  95983  96735  753  hypothetical protein  YP_001278988  hitchhiker  0.00113139  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0079  CDS  NC_009524  96792  97409  618  stress protein  YP_001278989  normal  0.244583  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0080  CDS  NC_009524  97552  98790  1239  stress protein  YP_001278990  normal  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0081  CDS  NC_009524  99115  100233  1119  hypothetical protein  YP_001278991  normal  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0082  CDS  NC_009524  100375  101655  1281  hypothetical protein  YP_001278992  normal  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0083  CDS  NC_009524  101658  102512  855  hypothetical protein  YP_001278993  normal  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0084  CDS  NC_009524  102631  103830  1200  hypothetical protein  YP_001278994  normal  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0085  CDS  NC_009524  103978  105015  1038  citrate lyase beta subunit-like protein  YP_001278995  normal  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0086  CDS  NC_009524  105041  105742  702  ABC transporter related  YP_001278996  normal  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0087  CDS  NC_009524  105835  106635  801  GDSL family lipase  YP_001278997  normal  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0088  CDS  NC_009524  106771  107388  618  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_001278998  normal  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0089  CDS  NC_009524  107494  108798  1305  valine--pyruvate transaminase  YP_001278999  normal  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0090  CDS  NC_009524  108859  110148  1290  major facilitator transporter  YP_001279000  normal  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0091  CDS  NC_009524  110349  110597  249  hypothetical protein  YP_001279001  normal  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0092  CDS  NC_009524  110832  112007  1176  ApbE family lipoprotein  YP_001279002  normal  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0093  CDS  NC_009524  112127  112927  801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001279003  normal  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0094  CDS  NC_009524  113061  114344  1284  transposase, IS4 family protein  YP_001279004  normal  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0095  CDS  NC_009524  114491  115729  1239  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  YP_001279005  normal  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0096  CDS  NC_009524  115794  116402  609  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit E  YP_001279006  normal  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0097  CDS  NC_009524  116402  117076  675  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit D  YP_001279007  normal  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0098  CDS  NC_009524  117078  117941  864  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  YP_001279008  normal  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0099  CDS  NC_009524  117925  119157  1233  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit B  YP_001279009  normal  0.326828  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
PsycPRwf_0100  CDS  NC_009524  119163  120527  1365  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  YP_001279010  normal  0.178382  normal  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 25    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>