32 genes were found for organism Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Rsph17025_4358  CDS  NC_009432  278  916  +  639  hypothetical protein  YP_001170508  hitchhiker  0.0000234653  normal  0.657828  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4359  CDS  NC_009432  909  2111  +  1203  relaxase/mobilization nuclease family protein  YP_001170509  normal  1  normal  0.738974  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4360  CDS  NC_009432  2174  2446  -  273  hypothetical protein  YP_001170510  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4361  CDS  NC_009432  3135  5861  +  2727  N-6 DNA methylase  YP_001170511  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4362  CDS  NC_009432  5863  6579  +  717  hypothetical protein  YP_001170512  normal  0.312054  normal  0.929771  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4363  CDS  NC_009432  6843  7394  -  552  hypothetical protein  YP_001170513  normal  0.104876  normal  0.566874  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4364  CDS  NC_009432  7401  8855  -  1455  hypothetical protein  YP_001170514  normal  0.945805  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4365  CDS  NC_009432  8876  9373  -  498  hypothetical protein  YP_001170515  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4366  CDS  NC_009432  9695  10033  +  339  TnpA family transposase  YP_001170516  normal  1  normal  0.914851  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4367  CDS  NC_009432  10391  11761  -  1371  hypothetical protein  YP_001170517  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4368  CDS  NC_009432  11754  13895  -  2142  TRAG family protein  YP_001170518  normal  1  normal  0.538935  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4369  CDS  NC_009432  13892  14920  -  1029  type II secretion system protein E  YP_001170519  normal  1  normal  0.957498  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4370  CDS  NC_009432  14917  16062  -  1146  conjugation TrbI family protein  YP_001170520  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4371  CDS  NC_009432  16064  16915  -  852  conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  YP_001170521  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4372  CDS  NC_009432  16912  17598  -  687  VirB8 family protein  YP_001170522  normal  1  normal  0.929771  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4373  CDS  NC_009432  17830  18726  -  897  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  YP_001170523  normal  1  normal  0.803128  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4374  CDS  NC_009432  18748  19005  -  258  hypothetical protein  YP_001170524  normal  0.974515  normal  0.98599  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4375  CDS  NC_009432  19014  19733  -  720  type IV secretion system family protein  YP_001170525  normal  1  normal  0.669124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4376  CDS  NC_009432  19730  22087  -  2358  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  YP_001170526  normal  1  normal  0.851787  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4377  CDS  NC_009432  22087  22416  -  330  type IV secretory pathway, VirB3 family protein  YP_001170527  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4378  CDS  NC_009432  22433  22720  -  288  hypothetical protein  YP_001170528  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4379  CDS  NC_009432  22737  23282  -  546  lytic transglycosylase, catalytic  YP_001170529  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4380  CDS  NC_009432  24138  24668  +  531  hypothetical protein  YP_001170530  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4381  CDS  NC_009432  24969  26201  +  1233  hypothetical protein  YP_001170531  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4382  CDS  NC_009432  26689  27273  +  585  resolvase domain-containing protein  YP_001170532  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4383  CDS  NC_009432  27273  28742  +  1470  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  YP_001170533  normal  0.348907  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4384  CDS  NC_009432  28735  29709  +  975  hypothetical protein  YP_001170534  normal  0.021156  normal  0.362668  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4385  CDS  NC_009432  30001  30318  -  318  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  YP_001170535  normal  0.0118502  normal  0.891502  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4386  CDS  NC_009432  30901  31851  +  951  hypothetical protein  YP_001170536  hitchhiker  0.00134743  normal  0.817249  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4387    NC_009432  32310  33775  +  1466      hitchhiker  0.000011202  normal  0.807312  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4389  CDS  NC_009432  34234  34974  +  741  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  YP_001170537  hitchhiker  0.00000188924  normal  0.759718  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4390  CDS  NC_009432  34977  35987  +  1011  parB-like partition protein  YP_001170538  decreased coverage  0.0000000297603  normal  0.71215  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>