3998 genes were found for organism Vibrio cholerae O395



Page 1 of 40    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
VC0395_0001  CDS  NC_009456  15  1373  1359  sn-glycerol-3-phosphate transporter  YP_001214842  hitchhiker  5.30916e-13  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0002  CDS  NC_009456  1527  2594  1068  glycerophosphodiester phosphodiesterase  YP_001214843  hitchhiker  1.33502e-06  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0003  CDS  NC_009456  2647  3327  681  putative cyclic nucleotide binding protein  YP_001214844  hitchhiker  8.97853e-05  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0004  CDS  NC_009456  3467  4198  732  uridine phosphorylase  YP_001214845  hitchhiker  0.000523211  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0005  CDS  NC_009456  4195  4929  735  pnuC protein  YP_001214846  hitchhiker  0.00212076  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0006  CDS  NC_009456  5055  6059  1005  ribose operon repressor  YP_001214847  normal  0.038565  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0007  CDS  NC_009456  6070  6990  921  ribokinase  YP_001214848  normal  0.328015  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0008  CDS  NC_009456  7129  8013  885  D-ribose transporter subunit RbsB  YP_001214849  normal  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0009  CDS  NC_009456  8068  9036  969  ribose ABC transporter permease protein  YP_001214850  normal  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0010  CDS  NC_009456  9066  10568  1503  D-ribose transporter ATP binding protein  YP_001214851  normal  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0011  CDS  NC_009456  10595  11014  420  D-ribose pyranase  YP_001214852  normal  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0012  CDS  NC_009456  11298  11558  261  putative lipoprotein  YP_001214853  normal  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0013  CDS  NC_009456  11706  12074  369  hypothetical protein  YP_001214854  normal  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0014  CDS  NC_009456  12071  15124  3054  vgrG protein  YP_001214855  normal  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0015  CDS  NC_009456  15377  16642  1266  hypothetical protein  YP_001214856  normal  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0016  CDS  NC_009456  16690  19716  3027  hypothetical protein  YP_001214857  normal  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0017  CDS  NC_009456  19706  20227  522  IcmF-related protein  YP_001214858  normal  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0018  CDS  NC_009456  20243  21652  1410  hypothetical protein  YP_001214859  normal  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0019  CDS  NC_009456  21662  22345  684  hypothetical protein  YP_001214860  normal  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0020  CDS  NC_009456  22315  23907  1593  sigma-54 dependent transcriptional regulator  YP_001214861  normal  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0021  CDS  NC_009456  23910  26519  2610  clpB protein  YP_001214862  normal  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0022  CDS  NC_009456  26545  27318  774  hypothetical protein  YP_001214863  normal  0.828521  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0023  CDS  NC_009456  27321  27800  480  hypothetical protein  YP_001214864  normal  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0024  CDS  NC_009456  27752  28657  906  hypothetical protein  YP_001214865  normal  0.668164  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0025  CDS  NC_009456  28664  29140  477  putative lipoprotein  YP_001214866  normal  0.567085  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0026  CDS  NC_009456  29143  30630  1488  hypothetical protein  YP_001214867  normal  0.498715  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0027  CDS  NC_009456  30633  31586  954  hypothetical protein  YP_001214868  normal  0.273219  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0028  CDS  NC_009456  31613  33382  1770  hypothetical protein  YP_001214869  normal  0.167709  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0029  CDS  NC_009456  33388  33813  426  hypothetical protein  YP_001214870  normal  0.475972  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0030  CDS  NC_009456  33816  35294  1479  hypothetical protein  YP_001214871  normal  0.599961  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0031  CDS  NC_009456  35335  35646  312  hypothetical protein  YP_001214872  normal  0.841066  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0032  CDS  NC_009456  35666  35842  177  hypothetical protein  YP_001214873  normal  0.865838  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0033  CDS  NC_009456  36274  37194  921  hypothetical protein  YP_001214874  normal  0.737602  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0034  CDS  NC_009456  37262  37546  285  hypothetical protein  YP_001214875  normal  0.543283  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0035  CDS  NC_009456  39332  39997  666  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  YP_001214876  normal  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0036  CDS  NC_009456  40039  41817  1779  sulfate permease family protein  YP_001214877  normal  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0037  CDS  NC_009456  41998  42657  660  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  YP_001214878  normal  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0038  CDS  NC_009456  42833  44389  1557  hypothetical protein  YP_001214879  normal  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0039  CDS  NC_009456  44389  44760  372  phage shock protein E  YP_001214880  normal  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0040  CDS  NC_009456  44797  45837  1041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  YP_001214881  normal  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0041  CDS  NC_009456  45868  47175  1308  nicotinate phosphoribosyltransferase  YP_001214882  normal  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0042  CDS  NC_009456  47574  48290  717  hypothetical protein  YP_001214883  normal  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0043  CDS  NC_009456  48303  49526  1224  hypothetical protein  YP_001214884  normal  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0044  CDS  NC_009456  49569  50267  699  hypothetical protein  YP_001214885  normal  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0045  CDS  NC_009456  50536  50892  357  hypothetical protein  YP_001214886  normal  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0046  CDS  NC_009456  51120  51293  174  hypothetical protein  YP_001214887  normal  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0047  CDS  NC_009456  51393  52022  630  hypothetical protein  YP_001214888  normal  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0048  CDS  NC_009456  52193  52489  297  hypothetical protein  YP_001214890  normal  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0049  CDS  NC_009456  52052  52204  153  hypothetical protein  YP_001214889  normal  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0050  CDS  NC_009456  52719  53612  894  hypothetical protein  YP_001214891  normal  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0051  CDS  NC_009456  53712  53840  129  hypothetical protein  YP_001214892  normal  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0052  CDS  NC_009456  53877  55178  1302  proton/glutamate symporter  YP_001214893  normal  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0053  CDS  NC_009456  55307  55471  165  hypothetical protein  YP_001214894  normal  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0054  CDS  NC_009456  55545  55925  381  hypothetical protein  YP_001214895  normal  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0055  CDS  NC_009456  56026  57228  1203  hypothetical protein  YP_001214896  normal  0.319346  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0056  CDS  NC_009456  57408  57854  447  soxR protein  YP_001214897  normal  0.0560475  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0057  CDS  NC_009456  57896  59107  1212  multidrug resistance protein D  YP_001214898  normal  0.0307213  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0058  CDS  NC_009456  59197  60084  888  LysR family transcriptional regulator  YP_001214899  normal  0.0206813  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0059  CDS  NC_009456  60352  62187  1836  GGDEF family protein  YP_001214900  hitchhiker  1.76468e-06  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0060  CDS  NC_009456  62289  63581  1293  hypothetical protein  YP_001214901  unclonable  5.86289e-16  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0061  CDS  NC_009456  63773  64105  333  hypothetical protein  YP_001214902  hitchhiker  1.39615e-12  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0062  CDS  NC_009456  64410  66071  1662  sulfate permease family protein  YP_001214903  hitchhiker  2.18031e-10  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0063  CDS  NC_009456  66507  67883  1377  hypothetical protein  YP_001214904  hitchhiker  5.75905e-05  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0064  CDS  NC_009456  68174  68641  468  hypothetical protein  YP_001214905  hitchhiker  0.00060183  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0065  CDS  NC_009456  68638  69738  1101  GGDEF family protein  YP_001214906  hitchhiker  0.00648256  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0066  CDS  NC_009456  69785  70540  756  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  YP_001214907  normal  0.0711697  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0067  CDS  NC_009456  70569  71438  870  phosphate ABC transporter, permease protein  YP_001214908  normal  0.191661  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0068  CDS  NC_009456  71438  72421  984  phosphate ABC transporter, permease protein  YP_001214909  normal  0.532516  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0069  CDS  NC_009456  72436  73335  900  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  YP_001214910  normal  0.524942  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0070  CDS  NC_009456  73628  75271  1644  methyl-accepting chemotaxis protein  YP_001214911  normal  0.740118  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0071  CDS  NC_009456  75405  75965  561  hypothetical protein  YP_001214912  normal  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0072  CDS  NC_009456  75962  77404  1443  putative lipoprotein  YP_001214913  normal  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0073  CDS  NC_009456  77401  79707  2307  hypothetical protein  YP_001214914  normal  0.564783  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0074  CDS  NC_009456  79717  81858  2142  heme receptor HutR  YP_001214915  normal  0.0136209  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0075  CDS  NC_009456  81858  83855  1998  protease II  YP_001214916  hitchhiker  1.67862e-12  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0076  CDS  NC_009456  84068  85426  1359  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  YP_001214917  unclonable  1.13664e-15  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0077  CDS  NC_009456  85472  85621  150  hypothetical protein  YP_001214918  unclonable  1.20506e-18  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0078  CDS  NC_009456  85846  86205  360  major outer membrane lipoprotein  YP_001214919  unclonable  5.73899e-18  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0079  CDS  NC_009456  86291  87211  921  hypothetical protein  YP_001214920  hitchhiker  1.35684e-10  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0080  CDS  NC_009456  87220  88629  1410  deoxyribodipyrimidine photolyase, cyclobutane pyrimidine dimer-specific  YP_001214921  hitchhiker  1.98558e-07  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0081  CDS  NC_009456  88639  89436  798  MerR family transcriptional regulator  YP_001214922  hitchhiker  0.00994643  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0082  CDS  NC_009456  89426  90394  969  hypothetical protein  YP_001214923  normal  0.0126049  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0083  CDS  NC_009456  90674  91411  738  purine nucleoside phosphorylase  YP_001214924  normal  0.0506882  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0084  CDS  NC_009456  91383  92945  1563  hypothetical protein  YP_001214925  normal  0.332452  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0085  CDS  NC_009456  93064  94581  1518  hypothetical protein  YP_001214926  normal  0.257447  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0086  CDS  NC_009456  94562  96142  1581  GGDEF family protein  YP_001214927  normal  0.0685503  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0087  CDS  NC_009456  96277  96666  390  hypothetical protein  YP_001214928  hitchhiker  0.00321975  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0088  CDS  NC_009456  96666  97796  1131  hypothetical protein  YP_001214929  hitchhiker  9.28582e-05  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0089  CDS  NC_009456  97991  101245  3255  tricorn protease  YP_001214930  hitchhiker  5.82269e-09  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0090  CDS  NC_009456  101478  101762  285  hypothetical protein  YP_001214931  hitchhiker  7.98856e-07  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0091  CDS  NC_009456  101894  102652  759  hypothetical protein  YP_001214932  hitchhiker  1.27543e-05  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0092  CDS  NC_009456  102731  103957  1227  sodium/glutamate symporter  YP_001214933  hitchhiker  1.11115e-05  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0093  CDS  NC_009456  104155  104271  117  hypothetical protein  YP_001214934  hitchhiker  2.82344e-06  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0094  CDS  NC_009456  104482  105408  927  hypothetical protein  YP_001214935  hitchhiker  3.05828e-06  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0095  CDS  NC_009456  105607  106029  423  hypothetical protein  YP_001214936  hitchhiker  1.00941e-08  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0096  CDS  NC_009456  106026  106607  582  SCO1/SenC family protein  YP_001214937  hitchhiker  1.73101e-10  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0097  CDS  NC_009456  106621  107073  453  hypothetical protein  YP_001214938  hitchhiker  1.66232e-12  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0098  CDS  NC_009456  107415  108632  1218  serine/threonine transporter SstT  YP_001214939  unclonable  1.49121e-15  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0099  CDS  NC_009456  108686  109510  825  putative phosphatidylglycerophosphatase B  YP_001214940  hitchhiker  0.000115517  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_0100  CDS  NC_009456  109626  110498  873  hypothetical protein  YP_001214941  normal  0.0254877  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 40    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>