2050 genes were found for organism Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 21    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Cag_0001  CDS  NC_007514  346  1824  1479  chromosomal replication initiation protein  YP_378323  normal  0.983579  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0002  CDS  NC_007514  2113  3237  1125  DNA polymerase III, beta chain  YP_378324  normal  0.0511069  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0003  CDS  NC_007514  3251  4345  1095  RecF protein  YP_378325  normal  0.056932  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0004  CDS  NC_007514  4354  5295  942  hypothetical protein  YP_378326  normal  0.128205  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0005  CDS  NC_007514  5321  7048  1728  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  YP_378327  normal  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0006  CDS  NC_007514  7276  8118  843  orotidine 5'-phosphate decarboxylase subfamily protein  YP_378328  normal  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0007  CDS  NC_007514  8311  10410  2100  peptidase M41, FtsH  YP_378329  normal  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0008  CDS  NC_007514  10861  12009  1149  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase  YP_378330  normal  0.0203346  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0009  CDS  NC_007514  12186  13547  1362  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  YP_378331  hitchhiker  0.000631419  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0010  CDS  NC_007514  13563  14636  1074  peptide chain release factor 1  YP_378332  normal  0.116962  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0011  CDS  NC_007514  14728  15366  639  hypothetical protein  YP_378333  normal  0.986898  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0012  CDS  NC_007514  15391  15780  390  camphor resistance protein CrcB  YP_378334  normal  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0013  CDS  NC_007514  15817  16050  234  hypothetical protein  YP_378335  normal  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0014  CDS  NC_007514  16209  16631  423  Holliday junction resolvase YqgF  YP_378336  normal  0.639301  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0015  CDS  NC_007514  16701  16988  288  hypothetical protein  YP_378337  normal  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0016  CDS  NC_007514  16981  17355  375  hypothetical protein  YP_378338  normal  0.660437  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0017  CDS  NC_007514  17432  18019  588  orotate phosphoribosyltransferase  YP_378339  normal  0.722393  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0018  CDS  NC_007514  18027  18893  867  prephenate dehydrogenase  YP_378340  normal  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0019  CDS  NC_007514  18890  19750  861  putative NAD+ kinase  YP_378341  normal  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0020  CDS  NC_007514  19790  21253  1464  hypothetical protein  YP_378342  normal  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0021  CDS  NC_007514  21262  22461  1200  hypothetical protein  YP_378343  normal  0.0629415  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0022  CDS  NC_007514  22529  23458  930  patatin family protein  YP_378344  hitchhiker  0.000233601  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0023  CDS  NC_007514  23776  24714  939  peptide chain release factor 2  YP_378345  decreased coverage  5.81574e-09  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0024  CDS  NC_007514  24724  25554  831  hypothetical protein  YP_378346  hitchhiker  0.000144277  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0025  CDS  NC_007514  25717  26184  468  large-conductance mechanosensitive channel  YP_378347  hitchhiker  0.00280832  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0026  CDS  NC_007514  26628  28544  1917  preprotein translocase subunit SecD  YP_378348  normal  0.943233  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0027  CDS  NC_007514  28632  29564  933  preprotein translocase subunit SecF  YP_378349  normal  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0028  CDS  NC_007514  29679  30995  1317  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  YP_378350  normal  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0029  CDS  NC_007514  31358  33271  1914  DNA gyrase, B subunit  YP_378351  normal  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0030  CDS  NC_007514  33852  34154  303  ferredoxin, 2Fe-2S  YP_378352  normal  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0031  CDS  NC_007514  34161  34343  183  hypothetical protein  YP_378353  normal  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0032  CDS  NC_007514  34369  34647  279  hypothetical protein  YP_378354  normal  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0033  CDS  NC_007514  34929  36197  1269  hypothetical protein  YP_378355  normal  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0034  CDS  NC_007514  36458  37150  693  hypothetical protein  YP_378356  normal  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0035  CDS  NC_007514  37150  38292  1143  geranylgeranyl reductase  YP_378357  normal  0.916237  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0036  CDS  NC_007514  38299  39768  1470  glycyl-tRNA synthetase  YP_378358  normal  0.479025  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0037  CDS  NC_007514  39973  40950  978  hypothetical protein  YP_378359  normal  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0038  CDS  NC_007514  41185  42159  975  hypothetical protein  YP_378360  normal  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0039  CDS  NC_007514  42581  44194  1614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  YP_378361  normal  0.677272  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0040  CDS  NC_007514  44199  45227  1029  multidrug resistance protein A  YP_378362  normal  0.984941  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0041  CDS  NC_007514  45345  46718  1374  outer membrane protein, putative  YP_378363  normal  0.229451  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0042  CDS  NC_007514  47090  48994  1905  hypothetical protein  YP_378364  normal  0.581488  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0043  CDS  NC_007514  49023  49817  795  hypothetical protein  YP_378365  normal  0.0498442  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0044  CDS  NC_007514  49892  51085  1194  phosphoglycerate kinase  YP_378366  normal  0.200914  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0045  CDS  NC_007514  51249  52259  1011  aminodeoxychorismate lyase  YP_378367  normal  0.266308  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0046  CDS  NC_007514  52277  52603  327  chorismate mutase, putative  YP_378368  normal  0.52978  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0047  CDS  NC_007514  52929  53915  987  methyltransferase  YP_378369  normal  0.509185  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0048  CDS  NC_007514  53994  54224  231  hypothetical protein  YP_378370  normal  0.0867619  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0049  CDS  NC_007514  54326  56317  1992  penicillin-binding protein 3  YP_378371  normal  0.0588264  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0050  CDS  NC_007514  56323  57873  1551  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  YP_378372  normal  0.046851  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0051  CDS  NC_007514  58082  59512  1431  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate-D-alanyl-D-alanyl ligase  YP_378373  normal  0.577094  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0052  CDS  NC_007514  59660  60766  1107  phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide- transferase  YP_378374  normal  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0053  CDS  NC_007514  60769  62163  1395  UDP-N-acetylmuramoylalanine-D-glutamate ligase  YP_378375  normal  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0054  CDS  NC_007514  62160  63374  1215  cell cycle protein FtsW  YP_378376  normal  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0055  CDS  NC_007514  63371  64459  1089  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  YP_378377  normal  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0056  CDS  NC_007514  64680  66083  1404  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  YP_378378  normal  0.442641  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0057  CDS  NC_007514  66233  67108  876  FtsQ protein, putative  YP_378379  hitchhiker  0.00293686  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0058  CDS  NC_007514  67141  68448  1308  cell division protein FtsA  YP_378380  unclonable  2.30037e-10  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0059  CDS  NC_007514  68500  69783  1284  cell division protein FtsZ  YP_378381  unclonable  2.25371e-10  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0060  CDS  NC_007514  69885  71177  1293  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  YP_378382  normal  0.0404661  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0061  CDS  NC_007514  71235  72002  768  hypothetical protein  YP_378383  normal  0.102372  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0062  CDS  NC_007514  72153  72440  288  hypothetical protein  YP_378384  normal  0.631001  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0063  CDS  NC_007514  72485  72865  381  hypothetical protein  YP_378385  normal  0.999016  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0064  CDS  NC_007514  72869  73906  1038  F0F1 ATP synthase subunit A  YP_378386  normal  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0065  CDS  NC_007514  74018  74245  228  ATP synthase F0, C subunit  YP_378387  normal  0.475844  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0066  CDS  NC_007514  74350  74877  528  F0F1 ATP synthase subunit B  YP_378388  normal  0.391852  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0067  CDS  NC_007514  74894  75433  540  F0F1 ATP synthase subunit delta  YP_378389  normal  0.0741932  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0068  CDS  NC_007514  75750  76685  936  putative lipoprotein  YP_378390  normal  0.177672  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0069  CDS  NC_007514  76707  77282  576  nicotinate-nucleotide adenylyltransferase  YP_378391  normal  0.312697  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0070  CDS  NC_007514  77346  79004  1659  arginyl-tRNA synthetase  YP_378392  normal  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0071  CDS  NC_007514  79067  79771  705  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  YP_378393  normal  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0072  CDS  NC_007514  79762  80826  1065  tryptophanyl-tRNA synthetase  YP_378394  normal  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0073  CDS  NC_007514  81266  82315  1050  deoxyhypusine synthase-like protein  YP_378395  normal  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0074  CDS  NC_007514  82330  82998  669  putative translaldolase  YP_378396  normal  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0075  CDS  NC_007514  83182  85578  2397  DNA topoisomerase I  YP_378397  normal  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0076  CDS  NC_007514  85769  87493  1725  cell wall hydrolase/autolysin  YP_378398  normal  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0077  CDS  NC_007514  87595  88578  984  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  YP_378399  normal  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0078  CDS  NC_007514  88598  89590  993  Elongator protein 3/MiaB/NifB  YP_378400  normal  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0079  CDS  NC_007514  89590  90774  1185  8-amino-7-oxononanoate synthase  YP_378401  normal  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0080  CDS  NC_007514  90774  91547  774  hypothetical protein  YP_378402  normal  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0081  CDS  NC_007514  91532  92317  786  biotin biosynthesis protein BioC  YP_378403  normal  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0082  CDS  NC_007514  92326  93009  684  dithiobiotin synthetase  YP_378404  normal  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0083  CDS  NC_007514  93049  94332  1284  adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  YP_378405  normal  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0084  CDS  NC_007514  94409  94738  330  XRE family transcriptional regulator  YP_378406  normal  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0085  CDS  NC_007514  94725  95057  333  phage-like  YP_378407  normal  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0086  CDS  NC_007514  95231  96466  1236  transposase  YP_378408  normal  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0087  CDS  NC_007514  96733  97122  390  Iojap-related protein  YP_378409  normal  0.755827  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0088  CDS  NC_007514  97415  99901  2487  DNA gyrase, subunit A  YP_378410  normal  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0090  CDS  NC_007514  100407  102116  1710  CTP synthetase  YP_378411  normal  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0091  CDS  NC_007514  107762  108169  408  hypothetical protein  YP_378412  normal  0.107179  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0092  CDS  NC_007514  108181  108708  528  hypothetical protein  YP_378413  normal  0.096062  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0093  CDS  NC_007514  108712  109719  1008  heptosyltransferase  YP_378414  normal  0.283951  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0094  CDS  NC_007514  109940  110338  399  30S ribosomal protein S6  YP_378415  normal  0.110295  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0095  CDS  NC_007514  110399  110857  459  single-strand binding protein  YP_378416  normal  0.200743  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0096  CDS  NC_007514  110910  111188  279  30S ribosomal protein S18  YP_378417  normal  0.225091  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0097  CDS  NC_007514  111223  111678  456  50S ribosomal protein L9  YP_378418  normal  0.625219  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0098  CDS  NC_007514  111785  112417  633  YgfB and YecA  YP_378419  normal  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0099  CDS  NC_007514  112665  113891  1227  sulfide dehydrogenase, flavoprotein subunit, putative  YP_378420  normal  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0100  CDS  NC_007514  114064  115485  1422  tRNA modification GTPase TrmE  YP_378421  normal  0.651435  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Cag_0101  CDS  NC_007514  115674  116975  1302  hypothetical protein  YP_378422  normal  0.292641  n/a    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 21    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>