2364 genes were found for organism Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 24    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Bamb_3219  CDS  NC_008391  13  1356  -  1344  hypothetical protein  YP_775109  normal  0.379865  normal  1  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3220  CDS  NC_008391  1434  2213  -  780  histidine kinase  YP_775110  normal  0.329298  normal  1  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3221  CDS  NC_008391  2281  3204  -  924  hypothetical protein  YP_775111  normal  0.575238  normal  1  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3222  CDS  NC_008391  3244  4143  -  900  LysR family transcriptional regulator  YP_775112  normal  0.759857  normal  1  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3223  CDS  NC_008391  4212  4595  +  384  4-oxalocrotonate tautomerase  YP_775113  normal  0.858973  normal  1  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3224  CDS  NC_008391  4722  6353  +  1632  CHAD domain-containing protein  YP_775114  normal  0.870924  normal  1  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3225  CDS  NC_008391  6402  7241  +  840  ModE family transcriptional regulator  YP_775115  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3226  CDS  NC_008391  7365  8108  -  744  ABC transporter related  YP_775116  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3227  CDS  NC_008391  8203  8883  -  681  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  YP_775117  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3228  CDS  NC_008391  8891  9688  -  798  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  YP_775118  normal  1  normal  0.682348  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3229  CDS  NC_008391  9825  10523  -  699  phosphoesterase, PA-phosphatase related  YP_775119  normal  1  normal  0.427666  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3230  CDS  NC_008391  10771  11880  +  1110  PHB depolymerase family esterase  YP_775120  normal  0.891696  normal  0.152859  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3231  CDS  NC_008391  11962  12138  +  177  hypothetical protein  YP_775121  normal  0.531201  normal  0.0645002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3232  CDS  NC_008391  12247  12666  -  420  OsmC family protein  YP_775122  normal  1  normal  0.0693677  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3233  CDS  NC_008391  12820  13272  -  453  MarR family transcriptional regulator  YP_775123  normal  0.550723  normal  0.0343876  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3234  CDS  NC_008391  13451  14260  -  810  hypothetical protein  YP_775124  normal  1  normal  0.0371045  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3235  CDS  NC_008391  14251  15249  -  999  homoserine kinase  YP_775125  normal  1  normal  0.0395685  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3236  CDS  NC_008391  15357  15764  -  408  hypothetical protein  YP_775126  normal  1  normal  0.0322615  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3237  CDS  NC_008391  15905  17431  +  1527  AMP nucleosidase  YP_775127  normal  1  normal  0.0388268  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3238  CDS  NC_008391  18272  18754  +  483  hypothetical protein  YP_775128  normal  0.0112814  normal  0.010386  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3239  CDS  NC_008391  18811  19905  -  1095  aldo/keto reductase  YP_775129  normal  0.13922  normal  0.0117807  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3240    NC_008391  19968  20335  +  368      normal  1  decreased coverage  0.00859111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3241  CDS  NC_008391  20508  20786  -  279  hypothetical protein  YP_775130  normal  1  normal  0.0533756  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3242  CDS  NC_008391  21187  21945  -  759  hypothetical protein  YP_775131  normal  1  normal  0.0247899  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3243  CDS  NC_008391  21947  24700  +  2754  DNA polymerase I  YP_775132  normal  1  normal  0.0154529  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3244  CDS  NC_008391  24980  26314  +  1335  NADH dehydrogenase  YP_775133  normal  0.385244  normal  0.0259001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3245  CDS  NC_008391  26721  27596  +  876  carboxymethylenebutenolidase  YP_775134  normal  1  normal  0.0210034  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3246  CDS  NC_008391  27648  28517  -  870  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  YP_775135  normal  1  decreased coverage  0.0068458  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3247  CDS  NC_008391  28635  29741  -  1107  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  YP_775136  normal  0.2156  normal  0.0195633  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3248  CDS  NC_008391  30012  30305  +  294  exodeoxyribonuclease VII small subunit  YP_775137  normal  0.344342  normal  0.0166439  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3249  CDS  NC_008391  30302  31186  +  885  polyprenyl synthetase  YP_775138  normal  0.923814  normal  0.018819  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3250  CDS  NC_008391  31232  33172  +  1941  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  YP_775139  normal  1  normal  0.0235548  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3251  CDS  NC_008391  33327  34136  +  810  putative GTP cyclohydrolase  YP_775140  normal  1  normal  0.018819  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3252  CDS  NC_008391  34237  35277  -  1041  putative DNA-binding/iron metalloprotein/AP endonuclease  YP_775141  normal  1  normal  0.0191878  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3253  CDS  NC_008391  35409  36626  +  1218  hypothetical protein  YP_775142  normal  1  normal  0.0198176  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3254  CDS  NC_008391  36732  36944  +  213  30S ribosomal protein S21  YP_775143  normal  1  normal  0.0163212  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3255  CDS  NC_008391  37131  37577  +  447  GatB/Yqey domain-containing protein  YP_775144  normal  1  normal  0.016428  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3256  CDS  NC_008391  37642  39510  +  1869  DNA primase  YP_775145  normal  1  normal  0.0530643  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3257  CDS  NC_008391  39599  42016  +  2418  RNA polymerase sigma factor RpoD  YP_775146  normal  0.0133032  normal  0.0284743  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3258  CDS  NC_008391  42358  43149  -  792  carboxymuconolactone decarboxylase  YP_775147  hitchhiker  0.00392422  normal  0.0442906  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3259  CDS  NC_008391  43127  43630  -  504  cupin 2 domain-containing protein  YP_775148  normal  0.0115338  normal  0.0903256  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3260  CDS  NC_008391  43648  44415  -  768  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_775149  decreased coverage  0.00276657  normal  0.102342  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3261  CDS  NC_008391  45193  45942  -  750  creatininase  YP_775150  hitchhiker  0.00284934  normal  0.180862  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3262  CDS  NC_008391  45955  47241  -  1287  major facilitator transporter  YP_775151  normal  0.0410092  normal  0.190441  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3263  CDS  NC_008391  47412  48335  +  924  LysR family transcriptional regulator  YP_775152  normal  0.266954  normal  0.470905  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3264  CDS  NC_008391  48569  49561  +  993  hypothetical protein  YP_775153  normal  0.143791  normal  0.515437  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3265  CDS  NC_008391  49604  50224  -  621  TetR family transcriptional regulator  YP_775154  normal  0.111309  normal  0.286417  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3266  CDS  NC_008391  50440  52635  +  2196  Beta-glucosidase  YP_775155  normal  0.700577  normal  0.395195  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3267  CDS  NC_008391  52783  54030  +  1248  major facilitator transporter  YP_775156  normal  0.0780681  normal  0.364964  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3268  CDS  NC_008391  54062  55549  +  1488  sulfatase  YP_775157  normal  0.0376086  normal  0.666848  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3269  CDS  NC_008391  55728  56750  +  1023  porin  YP_775158  decreased coverage  0.00595502  normal  0.572597  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3270  CDS  NC_008391  56763  57182  +  420  transport-associated  YP_775159  normal  0.21303  normal  0.821762  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3271  CDS  NC_008391  57216  58838  +  1623  sulfatase  YP_775160  normal  0.755541  normal  0.42944  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3272  CDS  NC_008391  59028  60632  -  1605  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  YP_775161  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3273  CDS  NC_008391  60697  61320  -  624  hypothetical protein  YP_775162  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3274  CDS  NC_008391  61569  63056  -  1488  RND efflux system outer membrane lipoprotein  YP_775163  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3275  CDS  NC_008391  63070  64656  -  1587  EmrB/QacA family drug resistance transporter  YP_775164  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3276  CDS  NC_008391  64649  65767  -  1119  secretion protein HlyD family protein  YP_775165  normal  1  normal  0.996632  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3277  CDS  NC_008391  65860  66687  +  828  TetR family transcriptional regulator  YP_775166  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3278  CDS  NC_008391  66701  69295  -  2595  MscS mechanosensitive ion channel  YP_775167  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3279  CDS  NC_008391  69333  70298  -  966  luciferase family protein  YP_775168  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3280  CDS  NC_008391  70347  70652  -  306  hypothetical protein  YP_775169  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3281  CDS  NC_008391  70649  71062  -  414  hypothetical protein  YP_775170  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3282  CDS  NC_008391  71189  71395  +  207  hypothetical protein  YP_775171  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3283  CDS  NC_008391  71392  72288  +  897  NAD-dependent deacetylase  YP_775172  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3284  CDS  NC_008391  72285  72926  +  642  hypothetical protein  YP_775173  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3285  CDS  NC_008391  73024  74436  +  1413  6-phosphogluconate dehydrogenase  YP_775174  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3286  CDS  NC_008391  74635  74979  +  345  hypothetical protein  YP_775175  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3287  CDS  NC_008391  75091  75411  -  321  hypothetical protein  YP_775176  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3288  CDS  NC_008391  75826  76557  +  732  peptidase M23B  YP_775177  normal  1  normal  0.982679  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3289  CDS  NC_008391  76606  77316  -  711  hypothetical protein  YP_775178  normal  0.356174  normal  0.642024  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3290  CDS  NC_008391  77476  78012  +  537  cytochrome B561  YP_775179  normal  0.363067  normal  0.604346  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3291  CDS  NC_008391  78169  78537  +  369  hypothetical protein  YP_775180  normal  0.386827  normal  0.577974  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3292  CDS  NC_008391  78621  80750  +  2130  TonB-dependent copper receptor  YP_775181  normal  1  normal  0.49865  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3293  CDS  NC_008391  80980  82074  +  1095  triacylglycerol lipase  YP_775182  normal  1  normal  0.435156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3294  CDS  NC_008391  82078  83112  +  1035  lipase chaperone  YP_775183  normal  0.704339  normal  0.691191  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3295  CDS  NC_008391  83152  84675  -  1524  GntR family transcriptional regulator  YP_775184  normal  1  normal  0.761418  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3296  CDS  NC_008391  84784  85878  +  1095  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  YP_775185  normal  1  normal  1  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3297  CDS  NC_008391  85956  87002  +  1047  extracellular solute-binding protein  YP_775186  normal  0.519451  normal  1  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3298  CDS  NC_008391  87105  88367  +  1263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_775187  normal  0.753859  normal  1  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3299  CDS  NC_008391  88405  89241  +  837  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_775188  normal  0.735344  normal  0.669781  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3300  CDS  NC_008391  89371  90864  +  1494  major facilitator transporter  YP_775189  normal  1  normal  0.471538  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3301  CDS  NC_008391  90937  92676  -  1740  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  YP_775190  normal  1  normal  0.479146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3302  CDS  NC_008391  93377  93700  +  324  ArsR family transcriptional regulator  YP_775191  normal  1  normal  0.402945  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3303  CDS  NC_008391  93697  94128  +  432  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  YP_775192  normal  1  normal  0.399094  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3304  CDS  NC_008391  94125  94565  +  441  hypothetical protein  YP_775193  normal  1  normal  0.63153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3305  CDS  NC_008391  94709  97426  -  2718  aconitate hydratase  YP_775194  normal  1  normal  0.877438  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3306  CDS  NC_008391  97479  98930  -  1452  2-methylcitrate dehydratase  YP_775195  normal  1  normal  0.494444  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3307  CDS  NC_008391  98962  99471  -  510  hypothetical protein  YP_775196  normal  1  normal  0.43876  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3308  CDS  NC_008391  99695  100699  -  1005  HpcH/HpaI aldolase  YP_775197  normal  1  normal  0.747689  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3309  CDS  NC_008391  100886  101872  -  987  malate dehydrogenase  YP_775198  normal  1  normal  0.49865  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3310  CDS  NC_008391  102161  102985  +  825  GntR family transcriptional regulator  YP_775199  normal  1  normal  0.758694  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3311  CDS  NC_008391  103155  103571  +  417  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  YP_775200  normal  1  normal  0.682348  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3312  CDS  NC_008391  103576  103944  +  369  succinate dehydrogenase, cytochrome b subunit  YP_775201  normal  0.713417  normal  0.657196  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3313  CDS  NC_008391  103948  105723  +  1776  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  YP_775202  normal  1  normal  0.775913  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3314  CDS  NC_008391  105745  106446  +  702  succinate dehydrogenase iron-sulfur subunit  YP_775203  normal  1  normal  0.964929  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3315  CDS  NC_008391  106453  106725  +  273  hypothetical protein  YP_775204  normal  0.83082  normal  0.599148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3316  CDS  NC_008391  106792  108093  +  1302  type II citrate synthase  YP_775205  normal  0.229262  normal  0.697255  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3317  CDS  NC_008391  108183  109166  -  984  AraC family transcriptional regulator  YP_775206  normal  1  normal  0.672566  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_3318  CDS  NC_008391  109238  109627  +  390  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_775207  normal  1  normal  0.666848  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 24    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>