6717 genes were found for organism Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 68    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Bamb_0001  CDS  NC_008390  203  1780  1578  chromosomal replication initiation protein  YP_771896  normal  0.375862  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0002  CDS  NC_008390  1949  3055  1107  DNA polymerase III subunit beta  YP_771897  normal  0.0645593  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0003  CDS  NC_008390  3262  5736  2475  DNA gyrase subunit B  YP_771898  normal  0.147322  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0004  CDS  NC_008390  6098  8842  2745  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  YP_771899  normal  0.0928262  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0005  CDS  NC_008390  8846  11134  2289  hypothetical protein  YP_771900  normal  0.596287  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0006  CDS  NC_008390  17028  17558  531  cytochrome B561  YP_771901  hitchhiker  1.61036e-06  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0007  CDS  NC_008390  17558  18649  1092  catalase domain-containing protein  YP_771902  hitchhiker  0.00847124  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0008  CDS  NC_008390  18807  19325  519  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  YP_771903  normal  0.343199  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0009  CDS  NC_008390  19322  20083  762  putative transmembrane anti-sigma factor  YP_771904  normal  0.343688  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0010  CDS  NC_008390  20554  20877  324  hypothetical protein  YP_771905  normal  0.103563  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0011  CDS  NC_008390  21114  21560  447  hypothetical protein  YP_771906  normal  0.0490263  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0012  CDS  NC_008390  22316  23197  882  RNA polymerase sigma factor SigJ  YP_771907  normal  0.347759  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0013  CDS  NC_008390  23197  23673  477  alkylhydroperoxidase  YP_771908  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0014  CDS  NC_008390  23905  24246  342  hypothetical protein  YP_771909  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0015  CDS  NC_008390  24236  25480  1245  hypothetical protein  YP_771910  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0016  CDS  NC_008390  25464  26477  1014  hypothetical protein  YP_771911  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0017  CDS  NC_008390  26774  27076  303  hypothetical protein  YP_771912  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0018  CDS  NC_008390  27314  27688  375  hypothetical protein  YP_771913  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0019  CDS  NC_008390  27912  30947  3036  type III restriction enzyme, res subunit  YP_771914  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0020  CDS  NC_008390  30947  32965  2019  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  YP_771915  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0021  CDS  NC_008390  33326  34555  1230  outer membrane protein (porin)-like protein  YP_771916  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0022  CDS  NC_008390  34747  35424  678  two component transcriptional regulator  YP_771917  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0023  CDS  NC_008390  35437  36804  1368  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  YP_771918  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0024  CDS  NC_008390  36878  37735  858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_771919  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0025  CDS  NC_008390  37776  38573  798  ABC transporter related  YP_771920  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0026  CDS  NC_008390  38695  39699  1005  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  YP_771921  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0027  CDS  NC_008390  39843  40625  783  flagellar biosynthetic protein FliR  YP_771922  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0028  CDS  NC_008390  40654  40926  273  flagellar biosynthesis protein FliQ  YP_771923  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0029  CDS  NC_008390  40943  41704  762  flagellar biosynthesis protein FliP  YP_771924  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0030  CDS  NC_008390  41741  42307  567  flagellar biosynthesis protein, FliO  YP_771925  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0031  CDS  NC_008390  42304  42789  486  flagellar motor switch protein FliN  YP_771926  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0032  CDS  NC_008390  42782  43780  999  flagellar motor switch protein FliM  YP_771927  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0033  CDS  NC_008390  43803  44339  537  flagellar basal body-associated protein FliL  YP_771928  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0034  CDS  NC_008390  44513  45235  723  LrgB family protein  YP_771929  normal  0.306981  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0035  CDS  NC_008390  45249  45725  477  LrgA family protein  YP_771930  normal  0.204482  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0036  CDS  NC_008390  45866  46792  927  LysR family transcriptional regulator  YP_771931  normal  0.565587  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0037  CDS  NC_008390  46844  48406  1563  EmrB/QacA family drug resistance transporter  YP_771932  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0038  CDS  NC_008390  48582  49070  489  MarR family transcriptional regulator  YP_771933  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0039  CDS  NC_008390  49246  49530  285  hypothetical protein  YP_771934  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0040  CDS  NC_008390  49812  51374  1563  RND efflux system outer membrane lipoprotein  YP_771935  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0041  CDS  NC_008390  51405  52193  789  hypothetical protein  YP_771936  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0042  CDS  NC_008390  52225  52731  507  general secretion pathway M protein  YP_771937  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0043  CDS  NC_008390  52728  54098  1371  general secretion pathway protein L  YP_771938  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0044  CDS  NC_008390  54123  55244  1122  general secretion pathway protein K  YP_771939  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0045  CDS  NC_008390  55247  55951  705  putative general secretion pathway protein J  YP_771940  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0046  CDS  NC_008390  55929  56330  402  general secretion pathway protein I  YP_771941  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0047  CDS  NC_008390  56333  56881  549  general secretion pathway protein H  YP_771942  normal  0.909533  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0048  CDS  NC_008390  56925  57377  453  general secretion pathway protein G  YP_771943  normal  0.503149  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0049  CDS  NC_008390  57555  57965  411  general secretion pathway protein C  YP_771944  normal  0.454971  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0050  CDS  NC_008390  57996  59213  1218  general secretion pathway protein F  YP_771945  normal  0.899692  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0051  CDS  NC_008390  59218  60717  1500  general secretory pathway protein E  YP_771946  normal  0.582006  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0052  CDS  NC_008390  60714  63047  2334  general secretion pathway protein D  YP_771947  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0053  CDS  NC_008390  63387  63866  480  lytic transglycosylase, catalytic  YP_771948  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0054  CDS  NC_008390  64066  65376  1311  cobalamin synthesis protein, P47K  YP_771949  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0055  CDS  NC_008390  65512  65790  279  histone family protein DNA-binding protein  YP_771950  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0056  CDS  NC_008390  66181  68139  1959  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  YP_771951  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0058  CDS  NC_008390  68815  70029  1215  sodium/hydrogen exchanger  YP_771953  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0059  CDS  NC_008390  70044  71159  1116  carboxylate-amine ligase  YP_771954  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0061  CDS  NC_008390  71665  72303  639  MarR family transcriptional regulator  YP_771956  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0062  CDS  NC_008390  72332  73042  711  glutamine amidotransferase  YP_771957  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0063  CDS  NC_008390  73256  74368  1113  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  YP_771958  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0064  CDS  NC_008390  74549  75085  537  nuclear protein SET  YP_771959  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0065  CDS  NC_008390  75176  76660  1485  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  YP_771960  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0066  CDS  NC_008390  76777  77469  693  two component transcriptional regulator  YP_771961  normal  0.530384  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0067  CDS  NC_008390  77562  77822  261  hypothetical protein  YP_771962  normal  0.727521  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0068  CDS  NC_008390  77913  78221  309  pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase  YP_771963  normal  0.586364  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0069  CDS  NC_008390  78400  79326  927  phenylalanine 4-monooxygenase  YP_771964  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0070  CDS  NC_008390  79433  79918  486  AsnC family transcriptional regulator  YP_771965  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0071  CDS  NC_008390  79973  80506  534  adenylate cyclase  YP_771966  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0072  CDS  NC_008390  80702  81640  939  LysR family transcriptional regulator  YP_771967  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0073  CDS  NC_008390  81776  83461  1686  glucose-methanol-choline oxidoreductase  YP_771968  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0074  CDS  NC_008390  83884  84663  780  ABC transporter related  YP_771969  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0075  CDS  NC_008390  84660  85415  756  ABC transporter related  YP_771970  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0076  CDS  NC_008390  85493  86692  1200  extracellular ligand-binding receptor  YP_771971  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0077  CDS  NC_008390  86812  87696  885  inner-membrane translocator  YP_771972  normal  0.981824  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0078  CDS  NC_008390  87696  88670  975  inner-membrane translocator  YP_771973  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0079  CDS  NC_008390  89193  89660  468  hypothetical protein  YP_771974  normal  0.34665  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0080  CDS  NC_008390  89778  90935  1158  extracellular ligand-binding receptor  YP_771975  normal  0.217295  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0081  CDS  NC_008390  91137  92192  1056  inner-membrane translocator  YP_771976  normal  0.274242  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0082  CDS  NC_008390  92197  93981  1785  ABC transporter related  YP_771977  normal  0.999385  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0083  CDS  NC_008390  93981  94739  759  ABC transporter related  YP_771978  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0084  CDS  NC_008390  95245  97215  1971  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  YP_771979  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0085  CDS  NC_008390  97212  97898  687  16S rRNA methyltransferase GidB  YP_771980  normal  0.446759  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0086  CDS  NC_008390  97950  98729  780  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  YP_771981  normal  0.368871  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0087  CDS  NC_008390  98737  99654  918  parB-like partition proteins  YP_771982  normal  0.183022  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0088  CDS  NC_008390  99665  100798  1134  citrate transporter  YP_771983  normal  0.0648559  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0089  CDS  NC_008390  100817  101305  489  hypothetical protein  YP_771984  hitchhiker  0.00687166  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0090  CDS  NC_008390  101356  101898  543  F0F1-type ATP synthase subunit I-like protein  YP_771985  hitchhiker  0.000624383  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0091  CDS  NC_008390  102009  102857  849  F0F1 ATP synthase subunit A  YP_771986  decreased coverage  0.000844383  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0092  CDS  NC_008390  102933  103202  270  F0F1 ATP synthase subunit C  YP_771987  normal  0.0244335  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0093  CDS  NC_008390  103331  103801  471  F0F1 ATP synthase subunit B  YP_771988  normal  0.0481406  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0094  CDS  NC_008390  103804  104343  540  F0F1 ATP synthase subunit delta  YP_771989  normal  0.244879  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0095  CDS  NC_008390  104388  105929  1542  F0F1 ATP synthase subunit alpha  YP_771990  normal  0.88314  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0096  CDS  NC_008390  105999  106874  876  F0F1 ATP synthase subunit gamma  YP_771991  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0097  CDS  NC_008390  106941  108335  1395  F0F1 ATP synthase subunit beta  YP_771992  normal  0.26731  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0098  CDS  NC_008390  108580  109005  426  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  YP_771993  normal  0.712946  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0099  CDS  NC_008390  109263  110990  1728  AMP-binding domain protein  YP_771994  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0100  CDS  NC_008390  111705  112517  813  prephenate dehydratase  YP_771995  normal  0.688966  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0101  CDS  NC_008390  112583  113761  1179  uroporphyrinogen decarboxylase  YP_771996  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_0102  CDS  NC_008390  114210  116471  2262  primosome assembly protein PriA  YP_771997  normal  n/a    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 68    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>