3685 genes were found for organism Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 37    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Ppro_0001  CDS  NC_008609  1  1353  +  1353  chromosomal replication initiation protein  YP_899700  decreased coverage  0.000000322878  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0002  CDS  NC_008609  1565  2686  +  1122  DNA polymerase III, beta subunit  YP_899701  decreased coverage  0.00126039  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0003  CDS  NC_008609  2698  3810  +  1113  recombination protein F  YP_899702  normal  0.715959  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0004  CDS  NC_008609  3803  6211  +  2409  DNA gyrase, B subunit  YP_899703  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0005  CDS  NC_008609  6243  8774  +  2532  DNA gyrase, A subunit  YP_899704  decreased coverage  0.000262861  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0006  CDS  NC_008609  8807  10417  +  1611  hypothetical protein  YP_899705  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0007  CDS  NC_008609  10401  11420  +  1020  glycerol-3-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  YP_899706  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0008  CDS  NC_008609  11640  12665  +  1026  hypothetical protein  YP_899707  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0009  CDS  NC_008609  12668  13120  +  453  death-on-curing family protein  YP_899708  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0010  CDS  NC_008609  13140  13391  -  252  hypothetical protein  YP_899709  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0011  CDS  NC_008609  13408  14952  +  1545  hypothetical protein  YP_899710  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0012  CDS  NC_008609  15002  15478  +  477  2-C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase  YP_899711  normal  0.0667468  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0013  CDS  NC_008609  15699  16607  -  909  chaperone DnaJ domain-containing protein  YP_899712  decreased coverage  0.000000027802  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0014  CDS  NC_008609  16744  18153  +  1410  protoporphyrinogen oxidase  YP_899713  hitchhiker  0.0000319808  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0015  CDS  NC_008609  18156  18899  +  744  hypothetical protein  YP_899714  hitchhiker  0.00000114472  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0016  CDS  NC_008609  19006  19989  -  984  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  YP_899715  hitchhiker  0.0000000262352  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0017  CDS  NC_008609  20125  20454  -  330  hypothetical protein  YP_899716  hitchhiker  0.000000434541  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0018  CDS  NC_008609  20451  21251  -  801  inositol monophosphatase  YP_899717  hitchhiker  0.00000389361  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0019  CDS  NC_008609  21616  22974  +  1359  transposase, IS4 family protein  YP_899718  hitchhiker  0.0000185671  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0020  CDS  NC_008609  23144  23428  +  285  protein of unknown function YGGT  YP_899719  normal  0.310945  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0021    NC_008609  23435  23866  +  432      normal  0.510885  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0022  CDS  NC_008609  23874  24185  +  312  hypothetical protein  YP_899720  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0023  CDS  NC_008609  24425  24949  +  525  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  YP_899721  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0024  CDS  NC_008609  25053  26696  -  1644  Zinc finger-domain-containing protein  YP_899722  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0025  CDS  NC_008609  26796  27686  -  891  hypothetical protein  YP_899723  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0026  CDS  NC_008609  28133  29158  -  1026  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  YP_899724  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0027  CDS  NC_008609  29259  31454  -  2196  glycoside hydrolase family protein  YP_899725  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0028  CDS  NC_008609  31489  33996  -  2508  nucleotidyl transferase  YP_899726  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0029  CDS  NC_008609  34051  34431  -  381  response regulator receiver protein  YP_899727  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0030  CDS  NC_008609  34409  36010  -  1602  GAF sensor signal transduction histidine kinase  YP_899728  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0031  CDS  NC_008609  36193  37674  -  1482  cysteinyl-tRNA synthetase  YP_899729  normal  0.173028  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0032  CDS  NC_008609  37842  38090  -  249  hypothetical protein  YP_899730  hitchhiker  0.00788029  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0033  CDS  NC_008609  38130  39629  +  1500  oxaloacetate decarboxylase  YP_899731  decreased coverage  0.000614565  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0034  CDS  NC_008609  39685  41235  +  1551  carboxyl transferase  YP_899732  normal  0.182676  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0035  CDS  NC_008609  41488  41877  +  390  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  YP_899733  normal  0.869876  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0036  CDS  NC_008609  42037  42474  -  438  hypothetical protein  YP_899734  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0037  CDS  NC_008609  42754  44028  +  1275  processing peptidase  YP_899735  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0038  CDS  NC_008609  44305  45363  +  1059  2-nitropropane dioxygenase, NPD  YP_899736  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0039  CDS  NC_008609  45530  46459  +  930  ArsR family transcriptional regulator  YP_899737  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0040  CDS  NC_008609  46556  47305  +  750  hypothetical protein  YP_899738  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0041  CDS  NC_008609  47363  48760  +  1398  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  YP_899739  normal  0.0210952  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0042  CDS  NC_008609  48856  50553  -  1698  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_899740  normal  0.121118  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0043  CDS  NC_008609  50797  51405  +  609  GDSL family lipase  YP_899741  hitchhiker  0.00000938694  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0044  CDS  NC_008609  51547  52713  +  1167  S-adenosylmethionine synthetase  YP_899742  hitchhiker  0.00000084119  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0045  CDS  NC_008609  52814  53902  +  1089  3-isopropylmalate dehydrogenase  YP_899743  normal  0.0146911  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0046  CDS  NC_008609  53943  55040  +  1098  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  YP_899744  normal  0.195109  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0047  CDS  NC_008609  55056  56075  +  1020  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  YP_899745  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0048  CDS  NC_008609  56278  56568  +  291  hypothetical protein  YP_899746  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0049  CDS  NC_008609  56573  57811  +  1239  hypothetical protein  YP_899747  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0050  CDS  NC_008609  57821  59731  +  1911  asparagine synthase  YP_899748  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0051  CDS  NC_008609  59728  60534  +  807  hypothetical protein  YP_899749  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0052  CDS  NC_008609  60585  60890  -  306  hypothetical protein  YP_899750  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0053  CDS  NC_008609  61100  61729  +  630  phage tail collar domain-containing protein  YP_899751  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0054  CDS  NC_008609  62017  62700  +  684  TPR repeat-containing protein  YP_899752  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0055  CDS  NC_008609  62697  63632  +  936  methionyl-tRNA formyltransferase  YP_899753  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0056  CDS  NC_008609  63704  64609  +  906  HPr kinase  YP_899754  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0057  CDS  NC_008609  64606  65442  +  837  sulfotransferase  YP_899755  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0058  CDS  NC_008609  65504  66286  +  783  hypothetical protein  YP_899756  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0059  CDS  NC_008609  66294  66773  +  480  hypothetical protein  YP_899757  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0060  CDS  NC_008609  66825  67577  +  753  hypothetical protein  YP_899758  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0061  CDS  NC_008609  67574  69394  +  1821  ABC transporter related  YP_899759  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0062  CDS  NC_008609  69391  70665  +  1275  hypothetical protein  YP_899760  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0063  CDS  NC_008609  70793  71698  +  906  sulfate adenylyltransferase subunit 2  YP_899761  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0064  CDS  NC_008609  71698  73614  +  1917  sulfate adenylyltransferase, large subunit  YP_899762  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0065  CDS  NC_008609  73645  76113  +  2469  peptidase U32  YP_899763  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0066  CDS  NC_008609  76163  78409  +  2247  multi-sensor hybrid histidine kinase  YP_899764  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0067  CDS  NC_008609  78467  79342  +  876  hypothetical protein  YP_899765  normal  0.836373  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0068  CDS  NC_008609  79363  79872  +  510  nuclease  YP_899766  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0069  CDS  NC_008609  80008  80685  +  678  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  YP_899767  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0070  CDS  NC_008609  80691  82694  +  2004  NADH dehydrogenase (quinone)  YP_899768  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0071  CDS  NC_008609  82764  83912  -  1149  Na+/H+ antiporter NhaA  YP_899769  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0072  CDS  NC_008609  83909  84523  -  615  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  YP_899770  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0073  CDS  NC_008609  84758  85294  -  537  hypothetical protein  YP_899771  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0074  CDS  NC_008609  85545  87137  -  1593  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  YP_899772  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0075  CDS  NC_008609  87624  88067  -  444  CheW protein  YP_899773  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0076  CDS  NC_008609  88064  89344  -  1281  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_899774  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0077  CDS  NC_008609  89429  90286  -  858  MCP methyltransferase, CheR-type  YP_899775  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0078  CDS  NC_008609  90416  91168  +  753  hypothetical protein  YP_899776  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0079  CDS  NC_008609  91161  92054  +  894  hypothetical protein  YP_899777  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0080  CDS  NC_008609  92125  94239  +  2115  1A family penicillin-binding protein  YP_899778  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0081  CDS  NC_008609  94271  94723  +  453  hypothetical protein  YP_899779  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0082  CDS  NC_008609  94857  95651  -  795  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  YP_899780  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0083  CDS  NC_008609  95756  96658  +  903  hypothetical protein  YP_899781  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0084  CDS  NC_008609  97153  101211  -  4059  YD repeat-containing protein  YP_899782  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0085  CDS  NC_008609  101720  102625  -  906  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  YP_899783  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0086  CDS  NC_008609  102622  103260  -  639  CheC, inhibitor of MCP methylation  YP_899784  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0087  CDS  NC_008609  103265  103636  -  372  response regulator receiver protein  YP_899785  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0088  CDS  NC_008609  103757  104968  -  1212  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase  YP_899786  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0089  CDS  NC_008609  105012  105635  -  624  beta-lactamase domain-containing protein  YP_899787  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0090  CDS  NC_008609  105800  105958  +  159  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  YP_899788  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0091  CDS  NC_008609  106413  108977  +  2565  multi-sensor signal transduction histidine kinase  YP_899789  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0092  CDS  NC_008609  109051  109521  +  471  response regulator receiver protein  YP_899790  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0093  CDS  NC_008609  109621  111450  +  1830  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  YP_899791  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0094  CDS  NC_008609  111547  112314  -  768  enoyl-CoA hydratase/isomerase  YP_899792  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0095    NC_008609  112340  112690  +  351      normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0096  CDS  NC_008609  112692  113741  +  1050  filamentation induced by cAMP protein Fic  YP_899793  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0097  CDS  NC_008609  114268  114516  -  249  hypothetical protein  YP_899794  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0098  CDS  NC_008609  114578  114973  -  396  hypothetical protein  YP_899795  normal  1  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0099  CDS  NC_008609  115003  115719  -  717  metallophosphoesterase  YP_899796  normal  0.732266  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0100  CDS  NC_008609  115768  116475  -  708  hypothetical protein  YP_899797  hitchhiker  0.00486405  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 37    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>