3913 genes were found for organism Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 40    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Ppro_0001  CDS  NC_008609  1353  1353  chromosomal replication initiation protein  YP_899700  decreased coverage  3.22878e-07  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0002  CDS  NC_008609  1565  2686  1122  DNA polymerase III, beta subunit  YP_899701  decreased coverage  0.00126039  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0003  CDS  NC_008609  2698  3810  1113  recombination protein F  YP_899702  normal  0.715959  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0004  CDS  NC_008609  3803  6211  2409  DNA gyrase, B subunit  YP_899703  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0005  CDS  NC_008609  6243  8774  2532  DNA gyrase, A subunit  YP_899704  decreased coverage  0.000262861  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0006  CDS  NC_008609  8807  10417  1611  hypothetical protein  YP_899705  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0007  CDS  NC_008609  10401  11420  1020  glycerol-3-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  YP_899706  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0008  CDS  NC_008609  11640  12665  1026  hypothetical protein  YP_899707  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0009  CDS  NC_008609  12668  13120  453  death-on-curing family protein  YP_899708  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0010  CDS  NC_008609  13140  13391  252  hypothetical protein  YP_899709  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0011  CDS  NC_008609  13408  14952  1545  hypothetical protein  YP_899710  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0012  CDS  NC_008609  15002  15478  477  2-C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase  YP_899711  normal  0.0667468  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0013  CDS  NC_008609  15699  16607  909  chaperone DnaJ domain-containing protein  YP_899712  decreased coverage  2.7802e-08  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0014  CDS  NC_008609  16744  18153  1410  protoporphyrinogen oxidase  YP_899713  hitchhiker  3.19808e-05  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0015  CDS  NC_008609  18156  18899  744  hypothetical protein  YP_899714  hitchhiker  1.14472e-06  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0016  CDS  NC_008609  19006  19989  984  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  YP_899715  hitchhiker  2.62352e-08  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0017  CDS  NC_008609  20125  20454  330  hypothetical protein  YP_899716  hitchhiker  4.34541e-07  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0018  CDS  NC_008609  20451  21251  801  inositol monophosphatase  YP_899717  hitchhiker  3.89361e-06  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0019  CDS  NC_008609  21616  22974  1359  transposase, IS4 family protein  YP_899718  hitchhiker  1.85671e-05  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0020  CDS  NC_008609  23144  23428  285  protein of unknown function YGGT  YP_899719  normal  0.310945  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0021    NC_008609  23435  23866  432      normal  0.510885  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0022  CDS  NC_008609  23874  24185  312  hypothetical protein  YP_899720  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0023  CDS  NC_008609  24425  24949  525  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  YP_899721  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0024  CDS  NC_008609  25053  26696  1644  Zinc finger-domain-containing protein  YP_899722  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0025  CDS  NC_008609  26796  27686  891  hypothetical protein  YP_899723  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0026  CDS  NC_008609  28133  29158  1026  galactose-1-phosphate uridylyltransferase  YP_899724  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0027  CDS  NC_008609  29259  31454  2196  glycoside hydrolase family protein  YP_899725  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0028  CDS  NC_008609  31489  33996  2508  nucleotidyl transferase  YP_899726  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0029  CDS  NC_008609  34051  34431  381  response regulator receiver protein  YP_899727  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0030  CDS  NC_008609  34409  36010  1602  GAF sensor signal transduction histidine kinase  YP_899728  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0031  CDS  NC_008609  36193  37674  1482  cysteinyl-tRNA synthetase  YP_899729  normal  0.173028  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0032  CDS  NC_008609  37842  38090  249  hypothetical protein  YP_899730  hitchhiker  0.00788029  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0033  CDS  NC_008609  38130  39629  1500  oxaloacetate decarboxylase  YP_899731  decreased coverage  0.000614565  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0034  CDS  NC_008609  39685  41235  1551  carboxyl transferase  YP_899732  normal  0.182676  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0035  CDS  NC_008609  41488  41877  390  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  YP_899733  normal  0.869876  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0036  CDS  NC_008609  42037  42474  438  hypothetical protein  YP_899734  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0037  CDS  NC_008609  42754  44028  1275  processing peptidase  YP_899735  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0038  CDS  NC_008609  44305  45363  1059  2-nitropropane dioxygenase, NPD  YP_899736  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0039  CDS  NC_008609  45530  46459  930  ArsR family transcriptional regulator  YP_899737  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0040  CDS  NC_008609  46556  47305  750  hypothetical protein  YP_899738  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0041  CDS  NC_008609  47363  48760  1398  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  YP_899739  normal  0.0210952  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0042  CDS  NC_008609  48856  50553  1698  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_899740  normal  0.121118  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0043  CDS  NC_008609  50797  51405  609  GDSL family lipase  YP_899741  hitchhiker  9.38694e-06  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0044  CDS  NC_008609  51547  52713  1167  S-adenosylmethionine synthetase  YP_899742  hitchhiker  8.4119e-07  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0045  CDS  NC_008609  52814  53902  1089  3-isopropylmalate dehydrogenase  YP_899743  normal  0.0146911  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0046  CDS  NC_008609  53943  55040  1098  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  YP_899744  normal  0.195109  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0047  CDS  NC_008609  55056  56075  1020  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  YP_899745  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0048  CDS  NC_008609  56278  56568  291  hypothetical protein  YP_899746  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0049  CDS  NC_008609  56573  57811  1239  hypothetical protein  YP_899747  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0050  CDS  NC_008609  57821  59731  1911  asparagine synthase  YP_899748  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0051  CDS  NC_008609  59728  60534  807  hypothetical protein  YP_899749  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0052  CDS  NC_008609  60585  60890  306  hypothetical protein  YP_899750  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0053  CDS  NC_008609  61100  61729  630  phage tail collar domain-containing protein  YP_899751  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0054  CDS  NC_008609  62017  62700  684  TPR repeat-containing protein  YP_899752  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0055  CDS  NC_008609  62697  63632  936  methionyl-tRNA formyltransferase  YP_899753  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0056  CDS  NC_008609  63704  64609  906  HPr kinase  YP_899754  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0057  CDS  NC_008609  64606  65442  837  sulfotransferase  YP_899755  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0058  CDS  NC_008609  65504  66286  783  hypothetical protein  YP_899756  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0059  CDS  NC_008609  66294  66773  480  hypothetical protein  YP_899757  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0060  CDS  NC_008609  66825  67577  753  hypothetical protein  YP_899758  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0061  CDS  NC_008609  67574  69394  1821  ABC transporter related  YP_899759  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0062  CDS  NC_008609  69391  70665  1275  hypothetical protein  YP_899760  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0063  CDS  NC_008609  70793  71698  906  sulfate adenylyltransferase subunit 2  YP_899761  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0064  CDS  NC_008609  71698  73614  1917  sulfate adenylyltransferase, large subunit  YP_899762  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0065  CDS  NC_008609  73645  76113  2469  peptidase U32  YP_899763  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0066  CDS  NC_008609  76163  78409  2247  multi-sensor hybrid histidine kinase  YP_899764  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0067  CDS  NC_008609  78467  79342  876  hypothetical protein  YP_899765  normal  0.836373  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0068  CDS  NC_008609  79363  79872  510  nuclease  YP_899766  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0069  CDS  NC_008609  80008  80685  678  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  YP_899767  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0070  CDS  NC_008609  80691  82694  2004  NADH dehydrogenase (quinone)  YP_899768  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0071  CDS  NC_008609  82764  83912  1149  Na+/H+ antiporter NhaA  YP_899769  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0072  CDS  NC_008609  83909  84523  615  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  YP_899770  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0073  CDS  NC_008609  84758  85294  537  hypothetical protein  YP_899771  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0074  CDS  NC_008609  85545  87137  1593  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  YP_899772  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0075  CDS  NC_008609  87624  88067  444  CheW protein  YP_899773  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0076  CDS  NC_008609  88064  89344  1281  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_899774  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0077  CDS  NC_008609  89429  90286  858  MCP methyltransferase, CheR-type  YP_899775  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0078  CDS  NC_008609  90416  91168  753  hypothetical protein  YP_899776  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0079  CDS  NC_008609  91161  92054  894  hypothetical protein  YP_899777  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0080  CDS  NC_008609  92125  94239  2115  1A family penicillin-binding protein  YP_899778  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0081  CDS  NC_008609  94271  94723  453  hypothetical protein  YP_899779  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0082  CDS  NC_008609  94857  95651  795  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  YP_899780  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0083  CDS  NC_008609  95756  96658  903  hypothetical protein  YP_899781  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0084  CDS  NC_008609  97153  101211  4059  YD repeat-containing protein  YP_899782  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0085  CDS  NC_008609  101720  102625  906  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  YP_899783  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0086  CDS  NC_008609  102622  103260  639  CheC, inhibitor of MCP methylation  YP_899784  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0087  CDS  NC_008609  103265  103636  372  response regulator receiver protein  YP_899785  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0088  CDS  NC_008609  103757  104968  1212  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase  YP_899786  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0089  CDS  NC_008609  105012  105635  624  beta-lactamase domain-containing protein  YP_899787  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0090  CDS  NC_008609  105800  105958  159  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  YP_899788  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0091  CDS  NC_008609  106413  108977  2565  multi-sensor signal transduction histidine kinase  YP_899789  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0092  CDS  NC_008609  109051  109521  471  response regulator receiver protein  YP_899790  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0093  CDS  NC_008609  109621  111450  1830  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  YP_899791  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0094  CDS  NC_008609  111547  112314  768  enoyl-CoA hydratase/isomerase  YP_899792  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0095    NC_008609  112340  112690  351      normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0096  CDS  NC_008609  112692  113741  1050  filamentation induced by cAMP protein Fic  YP_899793  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0097  CDS  NC_008609  114268  114516  249  hypothetical protein  YP_899794  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0098  CDS  NC_008609  114578  114973  396  hypothetical protein  YP_899795  normal  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0099  CDS  NC_008609  115003  115719  717  metallophosphoesterase  YP_899796  normal  0.732266  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Ppro_0100  CDS  NC_008609  115768  116475  708  hypothetical protein  YP_899797  hitchhiker  0.00486405  n/a    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 40    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>