3450 genes were found for organism Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 35    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Pcar_0001  CDS  NC_007498  72  1430  1359  chromosomal replication initiation protein  YP_355434  hitchhiker  3.98376e-16  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0002  CDS  NC_007498  1680  2798  1119  DNA polymerase III, beta subunit  YP_355435  hitchhiker  2.59068e-05  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0003  CDS  NC_007498  2856  3947  1092  DNA replication and repair protein  YP_355436  normal  0.0241212  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0004  CDS  NC_007498  3964  6351  2388  DNA gyrase, B subunit  YP_355437  normal  0.158205  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0005  CDS  NC_007498  6419  8926  2508  DNA gyrase, A subunit  YP_355438  normal  0.170541  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0006  CDS  NC_007498  8886  9737  852  hypothetical protein  YP_355439  hitchhiker  0.000521994  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0007  CDS  NC_007498  9750  10751  1002  glycerol-3-phosphate dehydrogenase (NAD+ dependent)  YP_355440  hitchhiker  1.03397e-05  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0008  CDS  NC_007498  10781  11515  735  hypothetical protein  YP_355441  hitchhiker  3.26697e-08  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0009  CDS  NC_007498  11641  12291  651  endonuclease III  YP_355442  hitchhiker  3.85159e-10  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0010  CDS  NC_007498  12298  14691  2394  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1A  YP_355443  unclonable  7.54529e-15  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0011  CDS  NC_007498  15279  16583  1305  aminotransferase  YP_355444  hitchhiker  3.47195e-10  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0012  CDS  NC_007498  16626  17624  999  hypothetical protein  YP_355445  hitchhiker  8.39505e-06  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0013  CDS  NC_007498  17775  18023  249  hypothetical protein  YP_355446  hitchhiker  5.01969e-08  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0014  CDS  NC_007498  18007  18375  369  hypothetical protein  YP_355447  hitchhiker  3.19331e-08  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0015  CDS  NC_007498  18392  19096  705  ATP synthase F0, A subunit  YP_355448  hitchhiker  3.26077e-07  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0016  CDS  NC_007498  19198  19464  267  ATP synthase F0, C subunit  YP_355449  hitchhiker  2.29893e-08  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0017  CDS  NC_007498  19795  20313  519  hypothetical protein  YP_355450  hitchhiker  7.06359e-07  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0018  CDS  NC_007498  20318  20797  480  hypothetical protein  YP_355451  hitchhiker  4.4858e-07  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0019  CDS  NC_007498  20829  22271  1443  hypothetical protein  YP_355452  hitchhiker  1.40083e-06  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0020  CDS  NC_007498  22285  23178  894  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  YP_355453  hitchhiker  1.12867e-14  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0021  CDS  NC_007498  23129  23560  432  NifU-like protein  YP_355454  hitchhiker  4.13876e-18  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0022  CDS  NC_007498  23705  24145  441  hypothetical protein  YP_355455  unclonable  2.17445e-22  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0023  CDS  NC_007498  24332  26887  2556  Rad3-related DNA helicases  YP_355456  hitchhiker  4.66591e-07  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0024  CDS  NC_007498  26990  27937  948  ADP-L-glycero-D-mannoheptose-6-epimerase  YP_355457  normal  0.495493  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0025  CDS  NC_007498  28037  28621  585  tellurite resistance protein  YP_355458  normal  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0026  CDS  NC_007498  28624  29388  765  hypothetical protein  YP_355459  normal  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0027  CDS  NC_007498  29512  31854  2343  ATP-dependent protease La  YP_355460  normal  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0028  CDS  NC_007498  31851  32840  990  thiamine-monophosphate kinase  YP_355461  normal  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0029  CDS  NC_007498  33013  34290  1278  putative methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  YP_355462  normal  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0030  CDS  NC_007498  34290  34730  441  chemotaxis signal transduction protein  YP_355463  normal  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0031  CDS  NC_007498  34694  36517  1824  chemotaxis protein histidine kinase, CheA-like  YP_355464  normal  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0032  CDS  NC_007498  36529  37260  732  putative outer membrane lipoprotein-sorting protein  YP_355465  normal  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0033  CDS  NC_007498  37412  37897  486  putative nucleotide-binding protein  YP_355466  normal  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0034  CDS  NC_007498  37919  39286  1368  2-methylthioadenine synthetase  YP_355467  normal  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0035  CDS  NC_007498  39331  40326  996  hypothetical protein  YP_355468  normal  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0036  CDS  NC_007498  40323  40703  381  hypothetical protein  YP_355469  normal  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0037  CDS  NC_007498  40684  41274  591  hypothetical protein  YP_355470  normal  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0038  CDS  NC_007498  41413  43143  1731  ABC-type transport system, ATPase and permease components  YP_355471  normal  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0039  CDS  NC_007498  43152  44918  1767  putative ATP-binding component of a transport system  YP_355472  normal  0.0738965  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0040  CDS  NC_007498  44973  45692  720  response regulator  YP_355473  hitchhiker  1.55004e-05  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0041  CDS  NC_007498  45910  47316  1407  sodium/pantothenate symporter  YP_355474  unclonable  1.30306e-18  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0042  CDS  NC_007498  47595  49217  1623  hypothetical protein  YP_355475  hitchhiker  2.3602e-09  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0043  CDS  NC_007498  49210  50154  945  hypothetical protein  YP_355476  hitchhiker  2.74939e-08  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0044  CDS  NC_007498  50024  51082  1059  glycosyltransferase  YP_355477  hitchhiker  1.17079e-08  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0045  CDS  NC_007498  51111  52847  1737  hypothetical protein  YP_355478  hitchhiker  3.16898e-06  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0046  CDS  NC_007498  53028  56228  3201  putative serine protease  YP_355479  hitchhiker  7.07412e-12  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0047  CDS  NC_007498  56482  56820  339  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  YP_355480  normal  0.0346943  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0048  CDS  NC_007498  56904  58310  1407  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase (anaerobic), K-small subunit  YP_355481  normal  0.923386  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0049  CDS  NC_007498  58370  59431  1062  permease  YP_355482  normal  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0050  CDS  NC_007498  59568  60791  1224  cysteine desulfurase  YP_355483  normal  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0051  CDS  NC_007498  60788  61633  846  Fe-S cluster assembly protein NifU  YP_355484  normal  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0052  CDS  NC_007498  61907  63457  1551  putative methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  YP_355485  normal  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0053  CDS  NC_007498  63872  66475  2604  two component sensor histidine kinase  YP_355486  normal  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0054  CDS  NC_007498  66608  67423  816  trehalose-phosphatase  YP_355487  normal  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0055  CDS  NC_007498  67767  68369  603  hypothetical protein  YP_355488  normal  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0056  CDS  NC_007498  68688  69395  708  response regulator  YP_355489  normal  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0057  CDS  NC_007498  69782  71719  1938  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  YP_355490  normal  0.612526  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0058  CDS  NC_007498  71707  72579  873  CO dehydrogenase maturation factor  YP_355491  hitchhiker  0.000462787  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0059  CDS  NC_007498  72576  73172  597  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 1  YP_355492  hitchhiker  4.64902e-06  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0060  CDS  NC_007498  73169  74404  1236  NAD(P)H-nitrite reductase  YP_355493  decreased coverage  2.45613e-15  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0061  CDS  NC_007498  74465  75370  906  ABC-type transport system, permease component  YP_355494  hitchhiker  1.43136e-17  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0062  CDS  NC_007498  75572  77734  2163  putative potassium/proton antiporter  YP_355495  hitchhiker  0.000657168  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0063  CDS  NC_007498  78292  79017  726  hypothetical protein  YP_355496  normal  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0064  CDS  NC_007498  79282  81654  2373  collagenase-like protease  YP_355497  normal  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0065  CDS  NC_007498  81876  82559  684  DNA repair protein RadC  YP_355498  normal  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0066  CDS  NC_007498  82706  83638  933  alpha-beta hydrolase family esterase  YP_355499  normal  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0067  CDS  NC_007498  83660  84109  450  putative inosine monophosphate dehydrogenase  YP_355500  normal  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0068  CDS  NC_007498  84350  85069  720  hypothetical protein  YP_355501  normal  0.0691082  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0069  CDS  NC_007498  85203  86336  1134  NADH:flavin oxidoreductase  YP_355502  hitchhiker  7.20309e-05  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0070  CDS  NC_007498  86368  86676  309  hypothetical protein  YP_355503  hitchhiker  5.8012e-09  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0071  CDS  NC_007498  86795  87673  879  putative transcriptional regulator LysR-type  YP_355504  hitchhiker  1.20497e-10  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0072  CDS  NC_007498  87863  88540  678  outer membrane immunogenic protein  YP_355505  unclonable  4.17135e-22  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0073  CDS  NC_007498  88700  89908  1209  hypothetical protein  YP_355506  decreased coverage  5.56225e-17  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0074  CDS  NC_007498  90421  90918  498  hypothetical protein  YP_355507  hitchhiker  3.60926e-06  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0075  CDS  NC_007498  91338  91877  540  hypothetical protein  YP_355508  hitchhiker  0.00225789  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0076  CDS  NC_007498  92090  93340  1251  transposase  YP_355509  normal  0.0574948  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0077  CDS  NC_007498  93789  94217  429  hypothetical protein  YP_355510  hitchhiker  0.000439598  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0078  CDS  NC_007498  94317  94886  570  flavoredoxin  YP_355511  hitchhiker  0.00025705  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0079  CDS  NC_007498  95098  95286  189  putative 4-oxalocrotonate tautomerase  YP_355512  hitchhiker  0.000137411  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0080  CDS  NC_007498  95371  96345  975  SAM-dependent methyltransferase  YP_355513  hitchhiker  0.00112476  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0081  CDS  NC_007498  96342  97079  738  SAM-dependent methyltransferase  YP_355514  hitchhiker  5.50828e-05  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0082  CDS  NC_007498  97244  97777  534  hypothetical protein  YP_355515  hitchhiker  4.52566e-08  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0083  CDS  NC_007498  97901  98233  333  hypothetical protein  YP_355516  hitchhiker  3.58317e-15  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0084  CDS  NC_007498  98336  98845  510  rubrerythrin  YP_355517  hitchhiker  1.69995e-17  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0085  CDS  NC_007498  99016  99672  657  K+ transport systems, NAD-binding component  YP_355518  unclonable  2.73294e-21  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0086  CDS  NC_007498  99713  101086  1374  TrkH family potassium uptake protein  YP_355519  hitchhiker  3.29525e-14  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0087  CDS  NC_007498  101160  103973  2814  excinuclease ABC, A subunit  YP_355520  hitchhiker  1.41309e-11  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0088  CDS  NC_007498  104081  105085  1005  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  YP_355521  hitchhiker  0.00976639  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0089  CDS  NC_007498  105318  106268  951  parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase  YP_355522  normal  0.322667  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0090  CDS  NC_007498  106325  107248  924  parvulin-like peptidyl-prolyl isomerase  YP_355523  normal  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0091  CDS  NC_007498  107317  110802  3486  transcription-repair coupling factor  YP_355524  normal  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0092  CDS  NC_007498  110871  111785  915  quinolinate synthetase  YP_355525  normal  0.871893  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0093  CDS  NC_007498  111964  112233  270  Sec-independent protein secretion pathway components  YP_355526  normal  0.0975952  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0094  CDS  NC_007498  112226  112978  753  Sec-independent protein translocase TatC  YP_355527  normal  0.0230182  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0095  CDS  NC_007498  112975  114585  1611  putative sensory transduction system, regulatory protein  YP_355528  normal  0.348008  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0096  CDS  NC_007498  114727  115665  939  putative ATP-binding component of a transport system  YP_355529  normal  0.546673  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0097  CDS  NC_007498  115662  116456  795  ABC type transport system, integral membrane protein  YP_355530  normal  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0098  CDS  NC_007498  116879  117904  1026  hypothetical protein  YP_355531  normal  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0099  CDS  NC_007498  118811  120814  2004  excinuclease ABC subunit B  YP_355532  normal  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Pcar_0100  CDS  NC_007498  120952  122397  1446  cysteinyl-tRNA synthetase  YP_355533  normal  n/a    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 35    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>