3706 genes were found for organism Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 38    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
VIBHAR_00002  rRNA  NC_009783  3765179  1384  -  1557  16S ribosomal RNA    n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00003  CDS  NC_009783  2016  2795  -  780  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  YP_001443290  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00004  CDS  NC_009783  2788  4524  -  1737  sulfite reductase subunit beta  YP_001443291  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00005  CDS  NC_009783  4524  6419  -  1896  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein subunit alpha  YP_001443292  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00006  CDS  NC_009783  6516  6746  -  231  thymidylate kinase  YP_001443293  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00007  CDS  NC_009783  6896  7561  -  666  hypothetical protein  YP_001443294  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00008  CDS  NC_009783  7662  7877  -  216  phage shock protein G  YP_001443295  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00009  CDS  NC_009783  8041  8943  -  903  tRNA-dihydrouridine synthase A  YP_001443296  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00010  CDS  NC_009783  9277  9762  +  486  zinc uptake regulation protein  YP_001443297  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00011  CDS  NC_009783  9781  10242  +  462  chemotaxis protein CheX  YP_001443298  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00012  CDS  NC_009783  10344  11996  -  1653  glucose-6-phosphate isomerase  YP_001443299  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00013  CDS  NC_009783  12088  12243  +  156  hypothetical protein  YP_001443300  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00014  CDS  NC_009783  12243  12722  +  480  hypothetical protein  YP_001443301  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00015  CDS  NC_009783  12776  13786  -  1011  hypothetical protein  YP_001443302  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00016  CDS  NC_009783  13874  15235  -  1362  transposase  YP_001443303  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00017  CDS  NC_009783  15413  16513  -  1101  alanine racemase  YP_001443304  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00018  CDS  NC_009783  16503  17903  -  1401  replicative DNA helicase  YP_001443305  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00019  CDS  NC_009783  18224  18988  +  765  hypothetical protein  YP_001443306  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00020  CDS  NC_009783  19074  19526  -  453  50S ribosomal protein L9  YP_001443307  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00021  CDS  NC_009783  19559  19786  -  228  30S ribosomal protein S18  YP_001443308  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00022  CDS  NC_009783  19803  20093  -  291  primosomal replication protein N  YP_001443309  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00023  CDS  NC_009783  20114  20503  -  390  30S ribosomal protein S6  YP_001443310  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00024  CDS  NC_009783  20748  21419  -  672  ribulose-phosphate 3-epimerase  YP_001443311  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00025  CDS  NC_009783  21522  22361  -  840  DNA adenine methylase  YP_001443312  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00026  CDS  NC_009783  22431  23924  -  1494  hypothetical protein  YP_001443313  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00027  CDS  NC_009783  23978  25078  -  1101  3-dehydroquinate synthase  YP_001443314  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00028  CDS  NC_009783  25110  25628  -  519  shikimate kinase I  YP_001443315  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00029  CDS  NC_009783  25817  27568  -  1752  type IV pilus secretin PilQ  YP_001443316  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00030  CDS  NC_009783  27600  28115  -  516  fimbrial assembly protein PilP  YP_001443317  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00031  CDS  NC_009783  28105  28698  -  594  fimbrial assembly protein PilO  YP_001443318  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00032  CDS  NC_009783  28691  29266  -  576  fimbrial assembly protein PilN  YP_001443319  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00033  CDS  NC_009783  29250  30353  -  1104  fimbrial assembly protein PilM  YP_001443320  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00034  CDS  NC_009783  30445  33012  +  2568  penicillin-binding protein 1A  YP_001443321  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00035  CDS  NC_009783  33091  33999  -  909  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  YP_001443322  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00036  CDS  NC_009783  34174  34902  +  729  glutaredoxin  YP_001443323  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00037  CDS  NC_009783  35130  36602  +  1473  dihydrolipoamide dehydrogenase  YP_001443324  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00038  CDS  NC_009783  36700  36804  -  105  hypothetical protein  YP_001443325  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00039  CDS  NC_009783  36971  37264  +  294  hypothetical protein  YP_001443326  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00040  CDS  NC_009783  37419  39293  -  1875  bifunctional argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  YP_001443327  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00041  CDS  NC_009783  39544  40758  -  1215  argininosuccinate synthase  YP_001443328  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00042  CDS  NC_009783  40849  41640  -  792  acetylglutamate kinase  YP_001443329  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00043  CDS  NC_009783  41662  42666  -  1005  N-acetyl-gamma-glutamyl-phosphate reductase  YP_001443330  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00044  CDS  NC_009783  42811  43947  +  1137  acetylornithine deacetylase  YP_001443331  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00045  CDS  NC_009783  44193  46859  +  2667  phosphoenolpyruvate carboxylase  YP_001443332  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00046  CDS  NC_009783  47235  47840  +  606  transcriptional regulator  YP_001443333  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00047  CDS  NC_009783  47911  48813  -  903  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  YP_001443334  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00048  CDS  NC_009783  49085  51493  -  2409  bifunctional aspartate kinase II/homoserine dehydrogenase II  YP_001443335  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00049  CDS  NC_009783  51510  52670  -  1161  cystathionine gamma-synthase  YP_001443336  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00050  CDS  NC_009783  52900  53220  +  321  transcriptional repressor protein MetJ  YP_001443337  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00051  CDS  NC_009783  53331  54608  -  1278  malate oxidoreductase  YP_001443338  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00052  CDS  NC_009783  54818  55336  -  519  bacterioferritin  YP_001443339  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00053  CDS  NC_009783  55369  55557  -  189  bacterioferritin-associated ferredoxin  YP_001443340  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00054  CDS  NC_009783  55894  57078  -  1185  elongation factor Tu  YP_001443341  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00055  CDS  NC_009783  57234  59333  -  2100  elongation factor G  YP_001443342  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00056  CDS  NC_009783  59472  59942  -  471  30S ribosomal protein S7  YP_001443343  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00057  CDS  NC_009783  60043  60417  -  375  30S ribosomal protein S12  YP_001443344  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00058  CDS  NC_009783  60595  60870  -  276  hypothetical protein  YP_001443345  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00059  CDS  NC_009783  60878  61234  -  357  sulfur oxidation protein dsrF  YP_001443346  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00060  CDS  NC_009783  61231  61626  -  396  sulfur transfer complex subunit TusD  YP_001443347  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00061  CDS  NC_009783  61629  62345  -  717  hypothetical protein  YP_001443348  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00062  CDS  NC_009783  62490  63272  -  783  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  YP_001443349  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00063  CDS  NC_009783  63401  64387  +  987  hypothetical protein  YP_001443350  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00064  CDS  NC_009783  64384  64611  +  228  hypothetical protein  YP_001443351  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00065  CDS  NC_009783  64705  65646  -  942  L-asparaginase  YP_001443352  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00066  CDS  NC_009783  65777  66316  -  540  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  YP_001443353  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00067  CDS  NC_009783  66405  66650  -  246  hypothetical protein  YP_001443354  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00068  CDS  NC_009783  66641  68437  -  1797  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  YP_001443355  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00069  CDS  NC_009783  68421  69008  -  588  glutathione-regulated potassium-efflux system ancillary protein KefG  YP_001443356  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00070  CDS  NC_009783  69186  71105  +  1920  ABC transporter, ATP-binding subunit  YP_001443357  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00071  CDS  NC_009783  71102  71581  +  480  hypothetical protein  YP_001443358  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00072  CDS  NC_009783  71682  72689  +  1008  putative hydrolase  YP_001443359  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00073  CDS  NC_009783  72760  72972  +  213  hypothetical protein  YP_001443360  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00074  CDS  NC_009783  73097  73966  +  870  phosphoribulokinase  YP_001443361  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00075  CDS  NC_009783  74206  74838  +  633  cAMP-regulatory protein  YP_001443362  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00076  CDS  NC_009783  75036  75827  -  792  hypothetical protein  YP_001443363  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00077  CDS  NC_009783  76092  77549  -  1458  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  YP_001443364  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00078  CDS  NC_009783  77578  78597  -  1020  arginine N-succinyltransferase  YP_001443365  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00079  CDS  NC_009783  78706  79917  -  1212  bifunctional N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase/ acetylornithine transaminase protein  YP_001443366  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00080  CDS  NC_009783  80279  80866  -  588  para-aminobenzoate synthase component II  YP_001443367  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00081  CDS  NC_009783  81056  84004  -  2949  nuclease  YP_001443368  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00082  CDS  NC_009783  84733  85770  -  1038  tryptophanyl-tRNA synthetase  YP_001443369  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00083  CDS  NC_009783  85886  86572  -  687  phosphoglycolate phosphatase  YP_001443370  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00084  CDS  NC_009783  86698  87441  -  744  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  YP_001443371  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00085  CDS  NC_009783  87518  90010  -  2493  ribonuclease R  YP_001443372  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00086  CDS  NC_009783  90128  90553  -  426  transcriptional repressor NsrR  YP_001443373  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00087  CDS  NC_009783  90665  91849  +  1185  nitric oxide dioxygenase  YP_001443374  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00088  CDS  NC_009783  91956  92591  -  636  sodium-type polar flagellar protein MotX  YP_001443375  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00089  CDS  NC_009783  92824  94140  -  1317  adenylosuccinate synthetase  YP_001443376  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00090  CDS  NC_009783  94311  94499  +  189  hypothetical protein  YP_001443377  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00091  CDS  NC_009783  94612  95592  -  981  serine protease  YP_001443378  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00092  CDS  NC_009783  95595  96800  -  1206  serine protease  YP_001443379  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00093  CDS  NC_009783  96846  98135  -  1290  putative GTPase HflX  YP_001443380  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00094  CDS  NC_009783  98174  98437  -  264  RNA-binding protein Hfq  YP_001443381  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00095  CDS  NC_009783  98632  99564  -  933  tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase  YP_001443382  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00096  CDS  NC_009783  99561  101606  -  2046  DNA mismatch repair protein  YP_001443383  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00097  CDS  NC_009783  101625  103355  -  1731  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  YP_001443384  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00098  CDS  NC_009783  103349  103813  -  465  hypothetical protein  YP_001443385  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00099  CDS  NC_009783  104112  105239  +  1128  iron-sulfur cluster-binding protein  YP_001443386  n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00100  tRNA  NC_009783  105772  105845  -  74  tRNA-Met    n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
VIBHAR_00101  tRNA  NC_009783  106007  106079  -  73  tRNA-Gly    n/a    n/a    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 38    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>