3998 genes were found for organism Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 40    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
TBFG_10001  CDS  NC_009565  102  1625  +  1524  chromosomal replication initiation protein  YP_001285946  normal  1  normal  1  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10002  CDS  NC_009565  2153  3361  +  1209  DNA polymerase III subunit beta  YP_001285947  normal  1  normal  1  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10003  CDS  NC_009565  3381  4538  +  1158  recombination protein F  YP_001285948  normal  1  normal  1  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10004  CDS  NC_009565  4535  5098  +  564  hypothetical protein  YP_001285949  normal  1  normal  1  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10005  CDS  NC_009565  5224  7368  +  2145  DNA gyrase subunit B  YP_001285950  normal  1  normal  1  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10006  CDS  NC_009565  7403  9919  +  2517  DNA gyrase subunit A  YP_001285951  normal  1  normal  1  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10007  CDS  NC_009565  10015  10929  +  915  hypothetical protein  YP_001285952  normal  1  normal  1  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10008  CDS  NC_009565  11975  12412  -  438  hypothetical protein  YP_001285953  normal  1  normal  1  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10009  CDS  NC_009565  12569  13117  +  549  iron-regulated peptidyl-prolyl-cis-trans-isomerase A ppiA  YP_001285954  normal  1  normal  1  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10010  CDS  NC_009565  13234  13659  -  426  hypothetical protein  YP_001285955  normal  1  normal  1  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10011  CDS  NC_009565  13815  14096  -  282  putative septation inhibitor protein  YP_001285956  normal  1  normal  1  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10012  CDS  NC_009565  14190  14978  +  789  hypothetical protein  YP_001285957  normal  1  normal  1  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10013  CDS  NC_009565  15015  15713  +  699  para-aminobenzoate synthase component II  YP_001285958  normal  1  normal  1  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10014  CDS  NC_009565  15691  17571  -  1881  transmembrane serine/threonine-protein kinase B pknB  YP_001285959  normal  1  normal  1  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10015  CDS  NC_009565  17568  18863  -  1296  transmembrane serine/threonine-protein kinase A pknA  YP_001285960  normal  1  normal  1  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10016  CDS  NC_009565  18860  20335  -  1476  penicillin-binding protein pbpA  YP_001285961  normal  1  normal  1  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10017  CDS  NC_009565  20332  21741  -  1410  cell division protein rodA  YP_001285962  normal  0.222067  normal  1  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10018  CDS  NC_009565  21738  23282  -  1545  serine/threonine phosphatase ppp  YP_001285963  decreased coverage  0.000837689  normal  1  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10019  CDS  NC_009565  23371  23838  -  468  hypothetical protein  YP_001285964  normal  0.0341337  normal  1  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10020  CDS  NC_009565  23962  25545  -  1584  hypothetical protein  YP_001285965  normal  1  normal  1  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10021  CDS  NC_009565  26014  26982  -  969  hypothetical protein  YP_001285966  normal  1  normal  1  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10022  CDS  NC_009565  27124  27543  -  420  transcriptional regulatory protein whib-like whiB5  YP_001285967  normal  1  normal  1  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10023  CDS  NC_009565  27696  28466  +  771  transcriptional regulator  YP_001285968  normal  1  normal  1  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10024  CDS  NC_009565  28463  29308  +  846  hypothetical protein  YP_001285969  normal  1  normal  1  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10025  CDS  NC_009565  29346  29708  +  363  hypothetical protein  YP_001285970  normal  1  normal  1  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10026  CDS  NC_009565  29823  31169  +  1347  hypothetical protein  YP_001285971  normal  1  normal  1  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10027  CDS  NC_009565  31290  31607  +  318  hypothetical protein  YP_001285972  normal  1  normal  1  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10028  CDS  NC_009565  31615  31920  +  306  hypothetical protein  YP_001285973  normal  1  normal  1  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10029  CDS  NC_009565  32158  33255  +  1098  hypothetical protein  YP_001285974  normal  1  normal  1  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10030  CDS  NC_009565  33325  33900  +  576  hypothetical protein  YP_001285975  normal  1  normal  1  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10031  CDS  NC_009565  34396  36711  +  2316  8-amino-7-oxononanoate synthase bioF2  YP_001285976  normal  0.863563  normal  1  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10032  CDS  NC_009565  36708  36971  +  264  acyl carrier protein acpA  YP_001285977  normal  0.168088  normal  1  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10033  CDS  NC_009565  36968  37363  +  396  hypothetical protein  YP_001285978  normal  0.505425  normal  1  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10034  CDS  NC_009565  37360  39048  +  1689  fatty-acid-CoA ligase fadD34  YP_001285979  normal  0.284875  normal  0.702798  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10035  CDS  NC_009565  39157  39930  -  774  hypothetical protein  YP_001285980  normal  1  normal  0.447139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10036  CDS  NC_009565  39978  41303  -  1326  integral membrane protein  YP_001285981  normal  1  normal  0.43551  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10037  CDS  NC_009565  41405  42013  +  609  hypothetical protein  YP_001285982  normal  1  normal  0.739012  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10038  CDS  NC_009565  42105  42452  -  348  transmembrane protein  YP_001285983  normal  1  normal  0.640594  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10039  CDS  NC_009565  42534  43466  -  933  secreted proline rich protein mtc28 (proline rich 28 kDa antigen)  YP_001285984  normal  1  normal  0.768071  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10040  CDS  NC_009565  43663  46572  +  2910  leucyl-tRNA synthetase  YP_001285985  normal  1  normal  0.928861  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10041  CDS  NC_009565  46682  47308  -  627  MarR family transcriptional regulator  YP_001285986  normal  1  normal  0.964365  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10042  CDS  NC_009565  47467  48201  -  735  GntR family transcriptional regulator  YP_001285987  normal  1  normal  1  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10043  CDS  NC_009565  48334  49128  -  795  oxidoreductase  YP_001285988  normal  1  normal  1  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10044  CDS  NC_009565  49144  50040  -  897  hydrolase  YP_001285989  normal  1  normal  1  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10045  CDS  NC_009565  50122  51225  -  1104  myo-inositol-1-phosphate synthase ino1  YP_001285990  normal  1  normal  0.723979  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10046  CDS  NC_009565  51286  51828  -  543  hypothetical protein  YP_001285991  normal  1  normal  1  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10047  CDS  NC_009565  51929  52798  -  870  hypothetical protein  YP_001285992  normal  1  normal  1  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10048  CDS  NC_009565  52932  53345  +  414  hypothetical protein  YP_001285993  normal  0.329564  normal  1  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10049  CDS  NC_009565  53338  55803  +  2466  bifunctional penicillin-binding protein 1A/1B ponA1: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  YP_001285994  normal  0.57903  normal  1  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10050  CDS  NC_009565  55800  57482  +  1683  transmembrane protein  YP_001285995  normal  1  normal  1  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10051  CDS  NC_009565  57514  58077  +  564  hypothetical protein  YP_001285996  normal  1  normal  1  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10052  CDS  NC_009565  58296  58586  +  291  30S ribosomal protein S6  YP_001285997  hitchhiker  0.00129452  normal  1  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10053  CDS  NC_009565  58690  59184  +  495  single-stranded DNA-binding protein  YP_001285998  hitchhiker  0.0000020035  normal  1  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10054  CDS  NC_009565  59226  59480  +  255  30S ribosomal protein S18  YP_001285999  hitchhiker  0.000000000000781394  normal  1  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10055  CDS  NC_009565  59513  59971  +  459  50S ribosomal protein L9  YP_001286000  hitchhiker  6.95125e-19  normal  1  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10056  CDS  NC_009565  60000  60521  +  522  hypothetical protein  YP_001286001  hitchhiker  5.5745e-31  normal  1  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10057  CDS  NC_009565  60500  63124  +  2625  replicative DNA helicase  YP_001286002  hitchhiker  2.66357e-17  normal  1  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10058  CDS  NC_009565  63304  63996  +  693  hypothetical protein  YP_001286003  decreased coverage  2.41088e-98  normal  0.757515  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10059  CDS  NC_009565  64013  65071  +  1059  hypothetical protein  YP_001286004  hitchhiker  5.2281899999999994e-51  normal  1  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10060  CDS  NC_009565  65116  65496  -  381  hypothetical protein  YP_001286005  hitchhiker  2.09504e-18  normal  1  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10061  CDS  NC_009565  65656  66798  +  1143  cellulase celA1  YP_001286006  normal  0.0549134  normal  0.652249  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10062  CDS  NC_009565  67027  68466  +  1440  oxidoreductase  YP_001286007  normal  1  normal  0.761932  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10063  CDS  NC_009565  68724  69764  +  1041  transmembrane protein  YP_001286008  normal  0.477127  normal  0.782331  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10064  CDS  NC_009565  69646  71664  +  2019  transmembrane protein  YP_001286009  normal  1  normal  0.849211  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10065  CDS  NC_009565  71963  72364  +  402  hypothetical protein  YP_001286010  normal  1  normal  0.814424  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10066  CDS  NC_009565  72416  74653  -  2238  isocitrate dehydrogenase [NADP] icd2  YP_001286011  normal  1  normal  0.655644  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10067  CDS  NC_009565  74771  75340  -  570  TetR family transcriptional regulator  YP_001286012  normal  1  normal  0.504189  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10068  CDS  NC_009565  75443  76354  +  912  short chain dehydrogenase  YP_001286013  normal  1  normal  0.362569  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10069  CDS  NC_009565  76379  77764  -  1386  L-serine dehydratase sdaA  YP_001286014  normal  1  normal  0.203084  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10070  CDS  NC_009565  77761  79038  -  1278  serine hydroxymethyltransferase  YP_001286015  normal  0.9411  normal  0.116151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10071  CDS  NC_009565  79628  80326  +  699  maturase  YP_001286016  decreased coverage  0.000865432  normal  0.0655357  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10072  CDS  NC_009565  80757  81806  +  1050  glutamine ABC transporter membrane protein  YP_001286017  normal  0.929786  normal  0.0856316  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10073  CDS  NC_009565  81809  82801  +  993  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  YP_001286018  normal  1  normal  0.0512571  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10074  CDS  NC_009565  82881  84116  +  1236  hypothetical protein  YP_001286019  normal  1  normal  0.0244263  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10075  CDS  NC_009565  84129  85301  +  1173  aminotransferase  YP_001286020  normal  0.8846  normal  0.0279685  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10076  CDS  NC_009565  85316  85705  -  390  hypothetical protein  YP_001286021  normal  1  normal  0.116062  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10077  CDS  NC_009565  85769  86599  -  831  oxidoreductase  YP_001286022  normal  1  normal  0.101689  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10078  CDS  NC_009565  86661  87266  +  606  transcriptional regulator  YP_001286023  normal  1  normal  0.105796  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10079  CDS  NC_009565  87341  87934  -  594  hypothetical protein  YP_001286024  normal  1  normal  0.09116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10080  CDS  NC_009565  88337  89158  +  822  hypothetical protein  YP_001286025  normal  0.244052  normal  0.0632242  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10081  CDS  NC_009565  89155  89613  +  459  hypothetical protein  YP_001286026  normal  0.239804  normal  0.111783  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10082  CDS  NC_009565  89708  90052  +  345  transcriptional regulator  YP_001286027  normal  0.0459233  normal  0.101509  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10083  CDS  NC_009565  90057  90536  +  480  oxidoreductase  YP_001286028  normal  0.0168847  normal  0.111213  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10084  CDS  NC_009565  90533  92455  +  1923  oxidoreductase  YP_001286029  hitchhiker  0.00281156  normal  0.170471  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10085  CDS  NC_009565  92461  93411  +  951  formate hydrogenlyase hycD  YP_001286030  hitchhiker  0.00000000314852  normal  0.333416  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10086  CDS  NC_009565  93422  94084  +  663  hydrogenase hycP  YP_001286031  decreased coverage  0.000000000096186  normal  0.18173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10087  CDS  NC_009565  94084  95550  +  1467  hydrogenase hycQ  YP_001286032  hitchhiker  0.000000498381  normal  0.186315  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10088  CDS  NC_009565  95547  97025  +  1479  formate hydrogenase hycE  YP_001286033  normal  0.301164  normal  0.197013  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10089  CDS  NC_009565  97060  97734  +  675  hypothetical protein  YP_001286034  normal  0.29102  normal  0.214951  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10090  CDS  NC_009565  97891  98484  +  594  methyltransferase  YP_001286035  normal  0.542368  normal  0.16327  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10091  CDS  NC_009565  98613  99383  +  771  hypothetical protein  YP_001286036  normal  0.403914  normal  0.141403  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10092  CDS  NC_009565  99817  100584  +  768  bifunctional 5'-methylthioadenosine nucleosidase/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  YP_001286037  normal  0.520049  normal  0.244125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10093  CDS  NC_009565  100716  103001  +  2286  cation transporter ATPase A ctpA  YP_001286038  normal  1  normal  0.73846  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10094  CDS  NC_009565  102948  103796  -  849  hypothetical protein  YP_001286039  normal  1  normal  0.77599  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10095  CDS  NC_009565  103843  104796  -  954  hypothetical protein  YP_001286040  normal  0.391031  normal  1  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10096  CDS  NC_009565  104567  105349  -  783  hypothetical protein  YP_001286041  normal  0.493023  normal  1  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10097  CDS  NC_009565  105458  106849  +  1392  PPE family protein  YP_001286042  normal  1  normal  1  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10098  CDS  NC_009565  106868  107737  +  870  oxidoreductase  YP_001286043  normal  1  normal  0.594688  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10099  CDS  NC_009565  107734  108285  +  552  hypothetical protein  YP_001286044  normal  1  normal  0.778663  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10100  CDS  NC_009565  108290  109912  +  1623  acyl-CoA synthetase  YP_001286045  normal  1  normal  0.935703  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 40    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>