3998 genes were found for organism Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 40    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
TBFG_10001  CDS  NC_009565  102  1625  1524  chromosomal replication initiation protein  YP_001285946  normal  normal  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10002  CDS  NC_009565  2153  3361  1209  DNA polymerase III subunit beta  YP_001285947  normal  normal  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10003  CDS  NC_009565  3381  4538  1158  recombination protein F  YP_001285948  normal  normal  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10004  CDS  NC_009565  4535  5098  564  hypothetical protein  YP_001285949  normal  normal  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10005  CDS  NC_009565  5224  7368  2145  DNA gyrase subunit B  YP_001285950  normal  normal  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10006  CDS  NC_009565  7403  9919  2517  DNA gyrase subunit A  YP_001285951  normal  normal  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10007  CDS  NC_009565  10015  10929  915  hypothetical protein  YP_001285952  normal  normal  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10008  CDS  NC_009565  11975  12412  438  hypothetical protein  YP_001285953  normal  normal  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10009  CDS  NC_009565  12569  13117  549  iron-regulated peptidyl-prolyl-cis-trans-isomerase A ppiA  YP_001285954  normal  normal  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10010  CDS  NC_009565  13234  13659  426  hypothetical protein  YP_001285955  normal  normal  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10011  CDS  NC_009565  13815  14096  282  putative septation inhibitor protein  YP_001285956  normal  normal  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10012  CDS  NC_009565  14190  14978  789  hypothetical protein  YP_001285957  normal  normal  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10013  CDS  NC_009565  15015  15713  699  para-aminobenzoate synthase component II  YP_001285958  normal  normal  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10014  CDS  NC_009565  15691  17571  1881  transmembrane serine/threonine-protein kinase B pknB  YP_001285959  normal  normal  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10015  CDS  NC_009565  17568  18863  1296  transmembrane serine/threonine-protein kinase A pknA  YP_001285960  normal  normal  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10016  CDS  NC_009565  18860  20335  1476  penicillin-binding protein pbpA  YP_001285961  normal  normal  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10017  CDS  NC_009565  20332  21741  1410  cell division protein rodA  YP_001285962  normal  0.222067  normal  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10018  CDS  NC_009565  21738  23282  1545  serine/threonine phosphatase ppp  YP_001285963  decreased coverage  0.000837689  normal  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10019  CDS  NC_009565  23371  23838  468  hypothetical protein  YP_001285964  normal  0.0341337  normal  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10020  CDS  NC_009565  23962  25545  1584  hypothetical protein  YP_001285965  normal  normal  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10021  CDS  NC_009565  26014  26982  969  hypothetical protein  YP_001285966  normal  normal  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10022  CDS  NC_009565  27124  27543  420  transcriptional regulatory protein whib-like whiB5  YP_001285967  normal  normal  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10023  CDS  NC_009565  27696  28466  771  transcriptional regulator  YP_001285968  normal  normal  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10024  CDS  NC_009565  28463  29308  846  hypothetical protein  YP_001285969  normal  normal  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10025  CDS  NC_009565  29346  29708  363  hypothetical protein  YP_001285970  normal  normal  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10026  CDS  NC_009565  29823  31169  1347  hypothetical protein  YP_001285971  normal  normal  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10027  CDS  NC_009565  31290  31607  318  hypothetical protein  YP_001285972  normal  normal  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10028  CDS  NC_009565  31615  31920  306  hypothetical protein  YP_001285973  normal  normal  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10029  CDS  NC_009565  32158  33255  1098  hypothetical protein  YP_001285974  normal  normal  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10030  CDS  NC_009565  33325  33900  576  hypothetical protein  YP_001285975  normal  normal  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10031  CDS  NC_009565  34396  36711  2316  8-amino-7-oxononanoate synthase bioF2  YP_001285976  normal  0.863563  normal  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10032  CDS  NC_009565  36708  36971  264  acyl carrier protein acpA  YP_001285977  normal  0.168088  normal  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10033  CDS  NC_009565  36968  37363  396  hypothetical protein  YP_001285978  normal  0.505425  normal  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10034  CDS  NC_009565  37360  39048  1689  fatty-acid-CoA ligase fadD34  YP_001285979  normal  0.284875  normal  0.702798  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10035  CDS  NC_009565  39157  39930  774  hypothetical protein  YP_001285980  normal  normal  0.447139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10036  CDS  NC_009565  39978  41303  1326  integral membrane protein  YP_001285981  normal  normal  0.43551  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10037  CDS  NC_009565  41405  42013  609  hypothetical protein  YP_001285982  normal  normal  0.739012  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10038  CDS  NC_009565  42105  42452  348  transmembrane protein  YP_001285983  normal  normal  0.640594  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10039  CDS  NC_009565  42534  43466  933  secreted proline rich protein mtc28 (proline rich 28 kDa antigen)  YP_001285984  normal  normal  0.768071  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10040  CDS  NC_009565  43663  46572  2910  leucyl-tRNA synthetase  YP_001285985  normal  normal  0.928861  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10041  CDS  NC_009565  46682  47308  627  MarR family transcriptional regulator  YP_001285986  normal  normal  0.964365  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10042  CDS  NC_009565  47467  48201  735  GntR family transcriptional regulator  YP_001285987  normal  normal  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10043  CDS  NC_009565  48334  49128  795  oxidoreductase  YP_001285988  normal  normal  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10044  CDS  NC_009565  49144  50040  897  hydrolase  YP_001285989  normal  normal  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10045  CDS  NC_009565  50122  51225  1104  myo-inositol-1-phosphate synthase ino1  YP_001285990  normal  normal  0.723979  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10046  CDS  NC_009565  51286  51828  543  hypothetical protein  YP_001285991  normal  normal  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10047  CDS  NC_009565  51929  52798  870  hypothetical protein  YP_001285992  normal  normal  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10048  CDS  NC_009565  52932  53345  414  hypothetical protein  YP_001285993  normal  0.329564  normal  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10049  CDS  NC_009565  53338  55803  2466  bifunctional penicillin-binding protein 1A/1B ponA1: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  YP_001285994  normal  0.57903  normal  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10050  CDS  NC_009565  55800  57482  1683  transmembrane protein  YP_001285995  normal  normal  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10051  CDS  NC_009565  57514  58077  564  hypothetical protein  YP_001285996  normal  normal  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10052  CDS  NC_009565  58296  58586  291  30S ribosomal protein S6  YP_001285997  hitchhiker  0.00129452  normal  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10053  CDS  NC_009565  58690  59184  495  single-stranded DNA-binding protein  YP_001285998  hitchhiker  2.0035e-06  normal  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10054  CDS  NC_009565  59226  59480  255  30S ribosomal protein S18  YP_001285999  hitchhiker  7.81394e-13  normal  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10055  CDS  NC_009565  59513  59971  459  50S ribosomal protein L9  YP_001286000  hitchhiker  6.95125e-19  normal  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10056  CDS  NC_009565  60000  60521  522  hypothetical protein  YP_001286001  hitchhiker  5.5745e-31  normal  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10057  CDS  NC_009565  60500  63124  2625  replicative DNA helicase  YP_001286002  hitchhiker  2.66357e-17  normal  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10058  CDS  NC_009565  63304  63996  693  hypothetical protein  YP_001286003  decreased coverage  2.41088e-98  normal  0.757515  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10059  CDS  NC_009565  64013  65071  1059  hypothetical protein  YP_001286004  hitchhiker  5.22819e-51  normal  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10060  CDS  NC_009565  65116  65496  381  hypothetical protein  YP_001286005  hitchhiker  2.09504e-18  normal  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10061  CDS  NC_009565  65656  66798  1143  cellulase celA1  YP_001286006  normal  0.0549134  normal  0.652249  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10062  CDS  NC_009565  67027  68466  1440  oxidoreductase  YP_001286007  normal  normal  0.761932  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10063  CDS  NC_009565  68724  69764  1041  transmembrane protein  YP_001286008  normal  0.477127  normal  0.782331  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10064  CDS  NC_009565  69646  71664  2019  transmembrane protein  YP_001286009  normal  normal  0.849211  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10065  CDS  NC_009565  71963  72364  402  hypothetical protein  YP_001286010  normal  normal  0.814424  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10066  CDS  NC_009565  72416  74653  2238  isocitrate dehydrogenase [NADP] icd2  YP_001286011  normal  normal  0.655644  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10067  CDS  NC_009565  74771  75340  570  TetR family transcriptional regulator  YP_001286012  normal  normal  0.504189  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10068  CDS  NC_009565  75443  76354  912  short chain dehydrogenase  YP_001286013  normal  normal  0.362569  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10069  CDS  NC_009565  76379  77764  1386  L-serine dehydratase sdaA  YP_001286014  normal  normal  0.203084  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10070  CDS  NC_009565  77761  79038  1278  serine hydroxymethyltransferase  YP_001286015  normal  0.9411  normal  0.116151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10071  CDS  NC_009565  79628  80326  699  maturase  YP_001286016  decreased coverage  0.000865432  normal  0.0655357  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10072  CDS  NC_009565  80757  81806  1050  glutamine ABC transporter membrane protein  YP_001286017  normal  0.929786  normal  0.0856316  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10073  CDS  NC_009565  81809  82801  993  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  YP_001286018  normal  normal  0.0512571  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10074  CDS  NC_009565  82881  84116  1236  hypothetical protein  YP_001286019  normal  normal  0.0244263  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10075  CDS  NC_009565  84129  85301  1173  aminotransferase  YP_001286020  normal  0.8846  normal  0.0279685  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10076  CDS  NC_009565  85316  85705  390  hypothetical protein  YP_001286021  normal  normal  0.116062  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10077  CDS  NC_009565  85769  86599  831  oxidoreductase  YP_001286022  normal  normal  0.101689  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10078  CDS  NC_009565  86661  87266  606  transcriptional regulator  YP_001286023  normal  normal  0.105796  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10079  CDS  NC_009565  87341  87934  594  hypothetical protein  YP_001286024  normal  normal  0.09116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10080  CDS  NC_009565  88337  89158  822  hypothetical protein  YP_001286025  normal  0.244052  normal  0.0632242  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10081  CDS  NC_009565  89155  89613  459  hypothetical protein  YP_001286026  normal  0.239804  normal  0.111783  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10082  CDS  NC_009565  89708  90052  345  transcriptional regulator  YP_001286027  normal  0.0459233  normal  0.101509  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10083  CDS  NC_009565  90057  90536  480  oxidoreductase  YP_001286028  normal  0.0168847  normal  0.111213  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10084  CDS  NC_009565  90533  92455  1923  oxidoreductase  YP_001286029  hitchhiker  0.00281156  normal  0.170471  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10085  CDS  NC_009565  92461  93411  951  formate hydrogenlyase hycD  YP_001286030  hitchhiker  3.14852e-09  normal  0.333416  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10086  CDS  NC_009565  93422  94084  663  hydrogenase hycP  YP_001286031  decreased coverage  9.6186e-11  normal  0.18173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10087  CDS  NC_009565  94084  95550  1467  hydrogenase hycQ  YP_001286032  hitchhiker  4.98381e-07  normal  0.186315  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10088  CDS  NC_009565  95547  97025  1479  formate hydrogenase hycE  YP_001286033  normal  0.301164  normal  0.197013  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10089  CDS  NC_009565  97060  97734  675  hypothetical protein  YP_001286034  normal  0.29102  normal  0.214951  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10090  CDS  NC_009565  97891  98484  594  methyltransferase  YP_001286035  normal  0.542368  normal  0.16327  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10091  CDS  NC_009565  98613  99383  771  hypothetical protein  YP_001286036  normal  0.403914  normal  0.141403  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10092  CDS  NC_009565  99817  100584  768  bifunctional 5'-methylthioadenosine nucleosidase/S-adenosylhomocysteine nucleosidase  YP_001286037  normal  0.520049  normal  0.244125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10093  CDS  NC_009565  100716  103001  2286  cation transporter ATPase A ctpA  YP_001286038  normal  normal  0.73846  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10094  CDS  NC_009565  102948  103796  849  hypothetical protein  YP_001286039  normal  normal  0.77599  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10095  CDS  NC_009565  103843  104796  954  hypothetical protein  YP_001286040  normal  0.391031  normal  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10096  CDS  NC_009565  104567  105349  783  hypothetical protein  YP_001286041  normal  0.493023  normal  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10097  CDS  NC_009565  105458  106849  1392  PPE family protein  YP_001286042  normal  normal  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10098  CDS  NC_009565  106868  107737  870  oxidoreductase  YP_001286043  normal  normal  0.594688  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10099  CDS  NC_009565  107734  108285  552  hypothetical protein  YP_001286044  normal  normal  0.778663  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
TBFG_10100  CDS  NC_009565  108290  109912  1623  acyl-CoA synthetase  YP_001286045  normal  normal  0.935703  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 40    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>