2642 genes were found for organism Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Swol_0001  CDS  NC_008346  83  1393  1311  initiation of chromosome replication  YP_752731  normal  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0002  CDS  NC_008346  1450  2679  1230  DNA-directed DNA polymerase  YP_752732  normal  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0003  CDS  NC_008346  2699  3796  1098  DNA repair and genetic recombination protein  YP_752733  normal  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0004  CDS  NC_008346  3803  4042  240  hypothetical protein  YP_752734  normal  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0005  CDS  NC_008346  4057  5958  1902  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  YP_752735  normal  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0006  CDS  NC_008346  5973  8411  2439  DNA gyrase, A subunit  YP_752736  normal  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0007  CDS  NC_008346  8470  9354  885  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  YP_752737  normal  0.328963  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0008  CDS  NC_008346  9743  10894  1152  serine--glyoxylate transaminase  YP_752738  normal  0.0160251  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0009  CDS  NC_008346  11004  12596  1593  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  YP_752739  normal  0.0352108  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0010  CDS  NC_008346  12776  14059  1284  Serine--tRNA ligase  YP_752740  normal  0.0427717  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0011  CDS  NC_008346  14740  16320  1581  putative PAS/PAC sensor protein  YP_752741  normal  0.140902  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0012  CDS  NC_008346  16325  17464  1140  hypothetical protein  YP_752742  normal  0.0572769  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0013  CDS  NC_008346  18168  18623  456  hypothetical protein  YP_752743  hitchhiker  2.52281e-05  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0014  CDS  NC_008346  18932  20284  1353  hypothetical protein  YP_752744  decreased coverage  0.000106215  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0015  CDS  NC_008346  20287  21099  813  hypothetical protein  YP_752745  normal  0.0430923  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0016  CDS  NC_008346  21440  22291  852  hypothetical protein  YP_752746  normal  0.408277  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0017  CDS  NC_008346  22808  23266  459  hypothetical protein  YP_752747  normal  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0018  CDS  NC_008346  23707  24207  501  hypothetical protein  YP_752748  normal  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0019  CDS  NC_008346  24209  24766  558  hypothetical protein  YP_752749  normal  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0020  CDS  NC_008346  24773  25507  735  hypothetical protein  YP_752750  normal  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0021  CDS  NC_008346  25523  26968  1446  DNA modification methylase-like protein  YP_752751  normal  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0022  CDS  NC_008346  27101  27949  849  multimeric flavodoxin WrbA-like protein  YP_752752  normal  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0023  CDS  NC_008346  28170  28892  723  hypothetical protein  YP_752753  normal  0.49121  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0024  CDS  NC_008346  28889  30394  1506  transposase (25)  YP_752754  normal  0.0619695  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0025  CDS  NC_008346  30491  30919  429  hypothetical protein  YP_752755  decreased coverage  0.000180686  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0026  CDS  NC_008346  31006  31611  606  TetR family transcriptional regulator  YP_752756  decreased coverage  3.27076e-06  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0027  CDS  NC_008346  31931  33280  1350  hypothetical protein  YP_752757  normal  0.0126035  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0028  CDS  NC_008346  33372  34574  1203  hypothetical protein  YP_752758  normal  0.138235  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0029  CDS  NC_008346  34607  35443  837  hypothetical protein  YP_752759  normal  0.180579  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0030  CDS  NC_008346  36176  37675  1500  DNA-directed DNA polymerase  YP_752760  hitchhiker  0.00564849  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0031  CDS  NC_008346  37717  38016  300  hypothetical protein  YP_752761  hitchhiker  0.000133634  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0032  CDS  NC_008346  38054  38647  594  recombination protein RecR  YP_752762  decreased coverage  2.44009e-06  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0033  CDS  NC_008346  38718  38987  270  hypothetical protein  YP_752763  hitchhiker  4.25241e-06  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0034  CDS  NC_008346  39030  39296  267  SigmaK-factor processing regulatory BofA  YP_752764  hitchhiker  0.000104464  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0035  CDS  NC_008346  39878  40558  681  hypothetical protein  YP_752765  normal  0.0200777  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0036  CDS  NC_008346  40637  41725  1089  putative keto/oxoacid ferredoxin oxidoreductase, alpha subunit  YP_752766  normal  0.0923729  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0037  CDS  NC_008346  41746  42501  756  putative keto/oxoacid ferredoxin oxidoreductase, beta subunit  YP_752767  normal  0.0499321  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0038  CDS  NC_008346  42502  43089  588  putative keto/oxoacid ferredoxin oxidoreductase, gamma subunit  YP_752768  normal  0.0366544  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0039  CDS  NC_008346  50562  52064  1503  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  YP_752769  normal  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0040  CDS  NC_008346  52122  52754  633  dTMP kinase  YP_752770  normal  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0041  CDS  NC_008346  52898  53347  450  hypothetical protein  YP_752771  normal  0.255674  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0042  CDS  NC_008346  53368  54330  963  DNA polymerase III, delta prime subunit  YP_752772  normal  0.0152578  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0043  CDS  NC_008346  54585  55301  717  hypothetical protein  YP_752773  hitchhiker  0.000138345  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0044  CDS  NC_008346  55303  55524  222  hypothetical protein  YP_752774  hitchhiker  4.83676e-06  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0045  CDS  NC_008346  55528  56283  756  SAM-dependent methyltransferases  YP_752775  hitchhiker  6.98926e-07  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0046  CDS  NC_008346  56294  57145  852  methyltransferases  YP_752776  hitchhiker  6.92079e-07  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0047  CDS  NC_008346  57280  57531  252  transcription regulator AbrB  YP_752777  unclonable  2.08345e-09  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0048    NC_008346  57742  57858  117      unclonable  9.07797e-10  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0049  CDS  NC_008346  58002  59939  1938  methionyl-tRNA synthetase  YP_752778  unclonable  2.87272e-06  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0050  CDS  NC_008346  59940  60710  771  TatD family hydrolase  YP_752779  unclonable  2.2674e-08  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0051  CDS  NC_008346  61276  62238  963  hypothetical protein  YP_752780  hitchhiker  9.84601e-06  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0052  CDS  NC_008346  62406  63020  615  hypothetical protein  YP_752781  hitchhiker  2.43051e-05  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0053  CDS  NC_008346  63394  64278  885  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  YP_752782  hitchhiker  5.7406e-05  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0054  CDS  NC_008346  64268  64741  474  hypothetical protein  YP_752783  hitchhiker  2.82525e-06  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0055  CDS  NC_008346  64925  65203  279  hypothetical protein  YP_752784  hitchhiker  9.1606e-06  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0056  CDS  NC_008346  65575  66408  834  hypothetical protein  YP_752785  normal  0.0220339  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0057  CDS  NC_008346  66575  66877  303  hypothetical protein  YP_752786  normal  0.154763  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0058  CDS  NC_008346  66946  68277  1332  glycosyltransferase-like protein  YP_752787  normal  0.336763  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0059  CDS  NC_008346  68335  69069  735  hypothetical protein  YP_752788  normal  0.293695  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0060  CDS  NC_008346  69180  69746  567  hypothetical protein  YP_752789  normal  0.328237  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0061  CDS  NC_008346  69824  70042  219  hypothetical protein  YP_752790  normal  0.393494  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0062  CDS  NC_008346  70204  71064  861  hypothetical protein  YP_752791  normal  0.968802  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0063  CDS  NC_008346  71484  72050  567  pro-sigma-E processing factor spoIIR  YP_752792  normal  0.241546  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0064  CDS  NC_008346  72232  73089  858  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  YP_752793  normal  0.0513074  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0065  CDS  NC_008346  73182  73889  708  GntR family transcriptional regulator  YP_752794  normal  0.0261299  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0066  CDS  NC_008346  73906  74682  777  hypothetical protein  YP_752795  normal  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0067  CDS  NC_008346  74850  76199  1350  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  YP_752796  normal  0.626782  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0068  CDS  NC_008346  76275  77228  954  ribose-phosphate diphosphokinase  YP_752797  normal  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0069  CDS  NC_008346  77274  77903  630  50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc  YP_752798  normal  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0070  CDS  NC_008346  77928  78479  552  aminoacyl-tRNA hydrolase  YP_752799  normal  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0071    NC_008346  78490  78727  238      normal  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0072  CDS  NC_008346  78850  79110  261  hypothetical protein  YP_752800  normal  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0073  CDS  NC_008346  79300  82521  3222  transcription-repair coupling factor  YP_752801  normal  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0074  CDS  NC_008346  82603  83700  1098  hypothetical protein  YP_752802  normal  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0075  CDS  NC_008346  84289  85428  1140  hypothetical protein  YP_752803  normal  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0076  CDS  NC_008346  85442  85639  198  hypothetical protein  YP_752804  normal  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0077  CDS  NC_008346  85752  86897  1146  hypothetical protein  YP_752805  normal  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0078  CDS  NC_008346  86965  88518  1554  germination protein  YP_752806  normal  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0079  CDS  NC_008346  88582  89706  1125  hypothetical protein  YP_752807  normal  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0080  CDS  NC_008346  90252  90812  561  AbrB family transcriptional regulator  YP_752808  normal  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0081  CDS  NC_008346  91283  92836  1554  stage V sporulation protein B  YP_752809  normal  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0082  CDS  NC_008346  93027  93794  768  MazG protein  YP_752810  normal  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0083  CDS  NC_008346  93907  94179  273  DNA-binding protein HU (DNA-binding protein II)  YP_752811  normal  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0084  CDS  NC_008346  94181  94423  243  hypothetical protein  YP_752812  normal  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0085  CDS  NC_008346  94606  94875  270  hypothetical protein  YP_752813  normal  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0086  CDS  NC_008346  94896  95342  447  hypothetical protein  YP_752814  normal  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0087  CDS  NC_008346  95394  95510  117  sigma-24 (FecI-like)  YP_752815  normal  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0088  CDS  NC_008346  95539  95793  255  hypothetical protein  YP_752816  normal  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0089  CDS  NC_008346  95874  96332  459  RNA binding S1  YP_752817  normal  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0090  CDS  NC_008346  96525  97391  867  Ppx/GppA phosphatase  YP_752818  normal  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0091  CDS  NC_008346  97799  98680  882  formate/nitrate transporter  YP_752819  normal  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0092  CDS  NC_008346  98849  99091  243  hypothetical protein  YP_752820  normal  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0093  CDS  NC_008346  99163  101637  2475  phosphoprotein phosphatase  YP_752821  normal  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0094  CDS  NC_008346  101735  103099  1365  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  YP_752822  normal  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0095  CDS  NC_008346  103565  105364  1800  ATP-dependent metalloprotease FtsH  YP_752823  normal  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0096  CDS  NC_008346  105539  106063  525  HD superfamily hydrolase  YP_752824  normal  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0097  CDS  NC_008346  106252  107490  1239  dihydropteroate synthase  YP_752825  normal  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0098  CDS  NC_008346  107483  107854  372  dihydroneopterin aldolase; RBL03201  YP_752826  normal  0.473342  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0099  CDS  NC_008346  107909  108403  495  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine diphosphokinase  YP_752827  normal  0.586233  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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Swol_0100  CDS  NC_008346  108526  109422  897  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  YP_752828  normal  0.982227  n/a    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria 
 
 
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