927 genes were found for organism Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 10    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Bcen2424_5867  CDS  NC_008544  49  240  192  Flp/Fap pilin component  YP_839493  normal  normal  0.234531  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5868  CDS  NC_008544  380  571  192  Flp/Fap pilin component  YP_839494  normal  normal  0.229195  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5869  CDS  NC_008544  743  1084  342  hypothetical protein  YP_839495  normal  0.973409  normal  0.237853  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5870  CDS  NC_008544  1621  2859  1239  hypothetical protein  YP_839496  normal  normal  0.26176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5871  CDS  NC_008544  2856  4235  1380  hypothetical protein  YP_839497  normal  normal  0.265551  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5872  CDS  NC_008544  4260  5303  1044  glycosyl transferase family protein  YP_839498  normal  0.146169  normal  0.2471  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5873  CDS  NC_008544  5316  5699  384  GtrA family protein  YP_839499  normal  0.65423  normal  0.230347  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5874  CDS  NC_008544  5995  6498  504  hypothetical protein  YP_839500  normal  normal  0.243491  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5875  CDS  NC_008544  6564  7103  540  hypothetical protein  YP_839501  normal  normal  0.249656  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5876  CDS  NC_008544  7176  8117  942  extracellular solute-binding protein  YP_839502  normal  normal  0.266759  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5877  CDS  NC_008544  8204  9325  1122  hypothetical protein  YP_839503  normal  normal  0.14883  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5878  CDS  NC_008544  9720  11171  1452  major facilitator transporter  YP_839504  normal  normal  0.307584  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5879  CDS  NC_008544  11224  12492  1269  phosphoribosylglycinamide synthetase  YP_839505  normal  0.521142  normal  0.293972  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5880  CDS  NC_008544  12501  13376  876  LysR family transcriptional regulator  YP_839506  normal  0.311857  normal  0.281069  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5881  CDS  NC_008544  13524  14468  945  hypothetical protein  YP_839507  normal  normal  0.469593  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5882  CDS  NC_008544  14506  15717  1212  phosphoribosylglycinamide synthetase  YP_839508  normal  normal  0.47867  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5883  CDS  NC_008544  15701  16897  1197  major facilitator transporter  YP_839509  normal  normal  0.293972  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5884  CDS  NC_008544  16993  17883  891  LysR family transcriptional regulator  YP_839510  normal  normal  0.279758  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5885  CDS  NC_008544  17950  18564  615  NIPSNAP family protein  YP_839511  normal  normal  0.433649  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5886  CDS  NC_008544  18661  19581  921  LysR family transcriptional regulator  YP_839512  normal  0.437235  normal  0.435902  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5887  CDS  NC_008544  19765  19989  225  hypothetical protein  YP_839513  normal  0.34344  normal  0.233405  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5888  CDS  NC_008544  20265  20468  204  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  YP_839514  normal  0.232235  normal  0.225892  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5889  CDS  NC_008544  20776  21879  1104  alpha/beta hydrolase fold  YP_839515  normal  0.159226  normal  0.26176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5890  CDS  NC_008544  22087  22716  630  TetR family transcriptional regulator  YP_839516  normal  0.223104  normal  0.394498  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5891  CDS  NC_008544  23072  23992  921  LysR family transcriptional regulator  YP_839517  normal  0.384931  normal  0.980568  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5892  CDS  NC_008544  24074  25024  951  2-dehydropantoate 2-reductase  YP_839518  normal  0.700658  normal  0.998449  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5893  CDS  NC_008544  25021  25413  393  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_839519  normal  0.621882  normal  0.955536  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5894  CDS  NC_008544  25416  25874  459  dehydratase  YP_839520  normal  0.36432  normal  0.974652  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5895  CDS  NC_008544  25874  27094  1221  Formyl-CoA transferase  YP_839521  normal  0.191567  normal  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5896  CDS  NC_008544  27091  27927  837  shikimate 5-dehydrogenase  YP_839522  normal  0.684807  normal  0.6752  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5897  CDS  NC_008544  28105  29337  1233  major facilitator transporter  YP_839523  normal  normal  0.733334  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5898  CDS  NC_008544  29451  30278  828  methyltransferase type 11  YP_839524  normal  normal  0.441915  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5899  CDS  NC_008544  30565  31467  903  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  YP_839525  normal  normal  0.702285  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5900  CDS  NC_008544  31525  32853  1329  major facilitator transporter  YP_839526  normal  normal  0.482098  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5901  CDS  NC_008544  32870  33181  312  hypothetical protein  YP_839527  normal  normal  0.418121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5902  CDS  NC_008544  33249  34169  921  LysR family transcriptional regulator  YP_839528  normal  normal  0.446699  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5903  CDS  NC_008544  34472  35575  1104  tartrate dehydrogenase  YP_839529  normal  normal  0.440083  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5904  CDS  NC_008544  35579  37027  1449  aldehyde dehydrogenase  YP_839530  normal  normal  0.474261  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5905  CDS  NC_008544  37307  38245  939  cysteine synthase  YP_839531  normal  normal  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5906  CDS  NC_008544  38292  38699  408  membrane-associated proteins in eicosanoid and glutathione metabolism (MAPEG)  YP_839532  normal  normal  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5907  CDS  NC_008544  38922  39788  867  NmrA family protein  YP_839533  normal  normal  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5908  CDS  NC_008544  39999  40919  921  LysR family transcriptional regulator  YP_839534  normal  normal  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5909  CDS  NC_008544  40981  42033  1053  IS605 family transposase OrfB  YP_839535  normal  normal  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5910  CDS  NC_008544  42103  43065  963  AraC family transcriptional regulator  YP_839536  normal  normal  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5911  CDS  NC_008544  43218  44141  924  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_839537  normal  normal  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5912  CDS  NC_008544  44309  45049  741  GntR family transcriptional regulator  YP_839538  normal  normal  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5913  CDS  NC_008544  45046  46428  1383  aminotransferase  YP_839539  normal  normal  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5914  CDS  NC_008544  46439  47773  1335  glutamate--ammonia ligase  YP_839540  normal  normal  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5915  CDS  NC_008544  47855  48202  348  hypothetical protein  YP_839541  normal  normal  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5916  CDS  NC_008544  48274  49038  765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_839542  normal  normal  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5917  CDS  NC_008544  49180  50097  918  LysR family transcriptional regulator  YP_839543  normal  normal  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5918  CDS  NC_008544  50232  50576  345  regulatory protein, LysR  YP_839544  normal  normal  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5919  CDS  NC_008544  50634  51371  738  extracellular solute-binding protein  YP_839545  normal  normal  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5920  CDS  NC_008544  51588  52499  912  ABC transporter related  YP_839546  normal  normal  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5921  CDS  NC_008544  52545  53519  975  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_839547  normal  normal  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5922  CDS  NC_008544  53583  55454  1872  amidase  YP_839548  normal  normal  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5923  CDS  NC_008544  55451  59068  3618  biotin carboxylation region  YP_839549  normal  0.559652  normal  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5924  CDS  NC_008544  59157  59813  657  hypothetical protein  YP_839550  normal  0.179476  normal  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5925  CDS  NC_008544  59825  60580  756  hypothetical protein  YP_839551  normal  0.278629  normal  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5926  CDS  NC_008544  60780  61046  267  hypothetical protein  YP_839552  normal  0.768533  normal  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5927  CDS  NC_008544  61466  62488  1023  ABC transport system substrate-binding protein  YP_839553  normal  normal  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5928  CDS  NC_008544  62636  63355  720  metallophosphoesterase  YP_839554  normal  normal  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5929  CDS  NC_008544  63639  64088  450  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_839555  normal  normal  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5930  CDS  NC_008544  64481  65005  525  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_839556  normal  normal  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5931  CDS  NC_008544  65108  65539  432  NUDIX hydrolase  YP_839557  normal  normal  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5932  CDS  NC_008544  65833  66114  282  hypothetical protein  YP_839558  normal  normal  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5933  CDS  NC_008544  66426  66992  567  hypothetical protein  YP_839559  normal  normal  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5934  CDS  NC_008544  67251  68213  963  LysR family transcriptional regulator  YP_839560  normal  normal  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5935  CDS  NC_008544  69028  69261  234  hypothetical protein  YP_839561  normal  normal  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5936  CDS  NC_008544  69400  70521  1122  histidine kinase  YP_839562  normal  normal  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5937  CDS  NC_008544  70767  72032  1266  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  YP_839563  normal  normal  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5938  CDS  NC_008544  72080  73915  1836  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  YP_839564  normal  normal  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5939  CDS  NC_008544  73933  75351  1419  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  YP_839565  normal  normal  0.862183  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5940  CDS  NC_008544  75473  75928  456  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_839566  normal  normal  0.465162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5941  CDS  NC_008544  76186  76590  405  hypothetical protein  YP_839567  normal  normal  0.446699  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5942  CDS  NC_008544  76761  77966  1206  sodium:dicarboxylate symporter  YP_839568  normal  normal  0.482098  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5943  CDS  NC_008544  77983  78645  663  GntR family transcriptional regulator  YP_839569  normal  normal  0.441915  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5944  CDS  NC_008544  78796  79260  465  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_839570  normal  normal  0.423747  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5945  CDS  NC_008544  79306  79617  312  hypothetical protein  YP_839571  normal  normal  0.405595  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5946  CDS  NC_008544  80029  81195  1167  porin  YP_839572  normal  normal  0.303303  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5947  CDS  NC_008544  81228  82193  966  LysR family transcriptional regulator  YP_839573  normal  normal  0.287273  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5948  CDS  NC_008544  82311  83531  1221  major facilitator transporter  YP_839574  normal  normal  0.291144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5949  CDS  NC_008544  83528  84424  897  2-dehydropantoate 2-reductase  YP_839575  normal  0.688574  normal  0.155835  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5950  CDS  NC_008544  84559  85158  600  ThiJ/PfpI domain-containing protein  YP_839576  normal  normal  0.140067  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5951  CDS  NC_008544  85568  86725  1158  hypothetical protein  YP_839577  normal  0.195751  normal  0.264299  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5952  CDS  NC_008544  86785  86946  162  putative lipoprotein  YP_839578  normal  0.983609  normal  0.233405  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5953  CDS  NC_008544  87028  87501  474  hypothetical protein  YP_839579  normal  normal  0.241213  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5954  CDS  NC_008544  87504  88676  1173  chromate transporter  YP_839580  normal  normal  0.0766957  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5955  CDS  NC_008544  88696  89658  963  putative chromate resistance signal peptide protein  YP_839581  normal  normal  0.0687386  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5956  CDS  NC_008544  90021  90350  330  hypothetical protein  YP_839582  normal  normal  0.0653341  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5957  CDS  NC_008544  90609  90941  333  hypothetical protein  YP_839583  normal  normal  0.070316  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5958  CDS  NC_008544  90945  91199  255  hypothetical protein  YP_839584  normal  normal  0.0679893  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5959  CDS  NC_008544  91233  91445  213  30S ribosomal protein S21  YP_839585  normal  normal  0.0675902  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5960  CDS  NC_008544  91535  92638  1104  transposase, IS4 family protein  YP_839586  normal  normal  0.0771683  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5961  CDS  NC_008544  93015  94292  1278  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  YP_839587  normal  0.616492  normal  0.0368269  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5962  CDS  NC_008544  94276  95025  750  two component transcriptional regulator  YP_839588  normal  normal  0.0352079  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5963  CDS  NC_008544  95351  96607  1257  RND family efflux transporter MFP subunit  YP_839589  normal  normal  0.0363452  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5964  CDS  NC_008544  96620  99817  3198  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  YP_839590  normal  normal  0.054891  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5965  CDS  NC_008544  99814  101241  1428  RND efflux system outer membrane lipoprotein  YP_839591  normal  normal  0.037067  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen2424_5966  CDS  NC_008544  101297  102346  1050  extracellular solute-binding protein  YP_839592  normal  normal  0.0148213  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 10    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10    next >  last >>