3054 genes were found for organism Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 31    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Bcen_0001  CDS  NC_008060  278  1393  1116  carboxylate-amine ligase  YP_619890  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0002  CDS  NC_008060  1408  2622  1215  sodium/hydrogen exchanger  YP_619891  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0003  CDS  NC_008060  2666  2992  327  hypothetical protein  YP_619892  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0004  CDS  NC_008060  3294  5225  1932  5-methylaminomethyl-2-thiouridine methyltransferase  YP_619893  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0005  CDS  NC_008060  5614  5892  279  histone-like DNA-binding protein  YP_619894  normal  0.129264  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0006  CDS  NC_008060  6021  7433  1413  cobalamin synthesis protein, P47K  YP_619895  normal  0.273813  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0007  CDS  NC_008060  7488  7982  495  lytic transglycosylase, catalytic  YP_619896  normal  0.37161  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0008  CDS  NC_008060  8351  10675  2325  Type II secretion system gspD  YP_619897  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0009  CDS  NC_008060  10672  12171  1500  Type II secretion system gspE  YP_619898  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0010  CDS  NC_008060  12176  13393  1218  general secretion pathway protein F  YP_619899  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0011  CDS  NC_008060  13431  13841  411  hypothetical protein  YP_619900  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0012  CDS  NC_008060  14017  14469  453  general secretion pathway protein G  YP_619901  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0013  CDS  NC_008060  14509  15078  570  general secretion pathway protein H  YP_619902  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0014  CDS  NC_008060  15081  15482  402  general secretion pathway protein I  YP_619903  normal  0.492457  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0015  CDS  NC_008060  15490  16158  669  putative general secretion pathway protein J  YP_619904  normal  0.293753  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0016  CDS  NC_008060  16161  17270  1110  general secretion pathway protein K  YP_619905  hitchhiker  0.00504309  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0017  CDS  NC_008060  17297  18670  1374  general secretion pathway L  YP_619906  decreased coverage  0.00266304  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0018  CDS  NC_008060  18667  19173  507  general secretion pathway M protein  YP_619907  hitchhiker  0.00637635  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0019  CDS  NC_008060  19174  19998  825  hypothetical protein  YP_619908  normal  0.0328068  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0020  CDS  NC_008060  20030  21601  1572  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  YP_619909  normal  0.25615  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0021  CDS  NC_008060  21883  22170  288  hypothetical protein  YP_619910  normal  0.178292  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0022  CDS  NC_008060  22345  22833  489  MarR family transcriptional regulator  YP_619911  normal  0.0694337  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0023  CDS  NC_008060  23010  24572  1563  EmrB/QacA family drug resistance transporter  YP_619912  normal  0.834829  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0024  CDS  NC_008060  24678  24926  249  prevent-host-death protein  YP_619913  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0025  CDS  NC_008060  24923  25309  387  PilT protein-like  YP_619914  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0026  CDS  NC_008060  25334  26260  927  LysR family transcriptional regulator  YP_619915  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0027  CDS  NC_008060  26402  26875  474  LrgA  YP_619916  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0028  CDS  NC_008060  26889  27611  723  LrgB-like protein  YP_619917  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0029  CDS  NC_008060  27824  28357  534  flagellar basal body-associated protein FliL  YP_619918  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0030  CDS  NC_008060  28380  29378  999  flagellar motor switch protein FliM  YP_619919  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0031  CDS  NC_008060  29371  29859  489  flagellar motor switch FliN  YP_619920  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0032  CDS  NC_008060  29856  30437  582  flagellar biosynthesis protein, FliO  YP_619921  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0033  CDS  NC_008060  30474  31235  762  flagellar biosynthesis protein FliP  YP_619922  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0034  CDS  NC_008060  31253  31525  273  flagellar biosynthesis protein FliQ  YP_619923  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0035  CDS  NC_008060  31550  32332  783  flagellar biosynthetic protein FliR  YP_619924  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0036  CDS  NC_008060  32518  33522  1005  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  YP_619925  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0037  CDS  NC_008060  33644  34441  798  ABC transporter related  YP_619926  normal  0.613239  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0038  CDS  NC_008060  34501  35358  858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_619927  normal  0.090458  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0039  CDS  NC_008060  35447  36814  1368  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  YP_619928  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0040  CDS  NC_008060  36828  37505  678  two component transcriptional regulator  YP_619929  normal  0.617214  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0041  CDS  NC_008060  37608  38915  1308  outer membrane protein (porin)-like  YP_619930  normal  0.13166  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0042  CDS  NC_008060  39275  41293  2019  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  YP_619931  normal  0.0930861  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0043  CDS  NC_008060  41293  44319  3027  type III restriction enzyme, res subunit  YP_619932  normal  0.855331  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0044  CDS  NC_008060  44585  44941  357  hypothetical protein  YP_619933  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0045  CDS  NC_008060  45129  45341  213  hypothetical protein  YP_619934  normal  0.684692  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0046  CDS  NC_008060  45394  45696  303  hypothetical protein  YP_619935  normal  0.666702  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0047  CDS  NC_008060  45990  47003  1014  hypothetical protein  YP_619936  normal  0.78729  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0048  CDS  NC_008060  46987  48213  1227  hypothetical protein  YP_619937  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0049  CDS  NC_008060  48218  48451  234  hypothetical protein  YP_619938  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0050  CDS  NC_008060  48794  49270  477  alkylhydroperoxidase AhpD core  YP_619939  normal  0.464213  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0051  CDS  NC_008060  49270  50151  882  RNA polymerase sigma factor SigJ  YP_619940  normal  0.492217  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0052  CDS  NC_008060  50254  50769  516  hypothetical protein  YP_619941  normal  0.376527  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0053    NC_008060  51238  51690  453      normal  0.110775  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0054  CDS  NC_008060  51762  52022  261  hypothetical protein  YP_619942  normal  0.164941  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0055  CDS  NC_008060  52054  52383  330  hypothetical protein  YP_619943  normal  0.195277  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0056  CDS  NC_008060  52402  52659  258  hypothetical protein  YP_619944  normal  0.260566  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0057  CDS  NC_008060  52842  53159  318  hypothetical protein  YP_619945  normal  0.0856861  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0058  CDS  NC_008060  53105  53371  267  hypothetical protein  YP_619946  normal  0.259744  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0059  CDS  NC_008060  53748  54506  759  putative transmembrane anti-sigma factor  YP_619947  normal  0.13724  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0060  CDS  NC_008060  54503  55024  522  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  YP_619948  hitchhiker  0.00630554  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0061  CDS  NC_008060  55183  56268  1086  catalase-like  YP_619949  hitchhiker  0.000110872  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0062  CDS  NC_008060  56268  56798  531  cytochrome B561  YP_619950  hitchhiker  2.72347e-06  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0063  CDS  NC_008060  62822  64897  2076  molybdopterin oxidoreductase  YP_619951  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0064  CDS  NC_008060  65035  66708  1674  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  YP_619952  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0065  CDS  NC_008060  66787  67212  426  hypothetical protein  YP_619953  normal  0.7521  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0066  CDS  NC_008060  67213  68364  1152  porin  YP_619954  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0067  CDS  NC_008060  68641  69267  627  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like  YP_619955  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0068  CDS  NC_008060  69654  70082  429  cell division protein MraZ  YP_619956  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0069  CDS  NC_008060  70106  71047  942  S-adenosyl-methyltransferase MraW  YP_619957  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0070  CDS  NC_008060  71044  71385  342  cell division protein, FtsL -like  YP_619958  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0071  CDS  NC_008060  71382  73229  1848  peptidoglycan glycosyltransferase  YP_619959  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0072  CDS  NC_008060  73226  74773  1548  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  YP_619960  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0073  CDS  NC_008060  74770  76176  1407  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate--D-alanyl-D-alanyl ligase  YP_619961  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0074  CDS  NC_008060  76193  77362  1170  phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide- transferase  YP_619962  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0075  CDS  NC_008060  77391  78902  1512  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  YP_619963  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0076  CDS  NC_008060  78899  80182  1284  cell division protein FtsW  YP_619964  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0077  CDS  NC_008060  80179  81282  1104  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  YP_619965  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0078  CDS  NC_008060  81279  82676  1398  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  YP_619966  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0079  CDS  NC_008060  82678  83619  942  D-alanine--D-alanine ligase  YP_619967  normal  0.704637  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0080  CDS  NC_008060  83639  84391  753  cell division protein FtsQ  YP_619968  normal  0.0168578  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0081  CDS  NC_008060  84418  85650  1233  cell division protein FtsA  YP_619969  hitchhiker  2.40923e-05  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0082  CDS  NC_008060  85763  86959  1197  cell division protein FtsZ  YP_619970  unclonable  3.08232e-09  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0083  CDS  NC_008060  87149  87655  507  redoxin  YP_619971  hitchhiker  1.03454e-06  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0084  CDS  NC_008060  87896  88813  918  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase  YP_619972  hitchhiker  0.00107254  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0085    NC_008060  88911  89961  1051      normal  0.387173  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0086  CDS  NC_008060  90257  90733  477  hypothetical protein  YP_619973  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0087  CDS  NC_008060  90990  93788  2799  preprotein translocase subunit SecA  YP_619974  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0088  CDS  NC_008060  93933  95174  1242  bifunctional ornithine acetyltransferase/N-acetylglutamate synthase protein  YP_619975  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0089  CDS  NC_008060  95194  96063  870  hypothetical protein  YP_619976  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0090  CDS  NC_008060  96060  96503  444  NUDIX hydrolase  YP_619977  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0091  CDS  NC_008060  96564  96764  201  hypothetical protein  YP_619978  normal  0.73124  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0092  CDS  NC_008060  96793  97548  756  hypothetical protein  YP_619979  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0093  CDS  NC_008060  97658  98266  609  dephospho-CoA kinase  YP_619980  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0094  CDS  NC_008060  98268  99179  912  prepilin peptidase  YP_619981  normal  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0095  CDS  NC_008060  99224  100435  1212  type II secretion system protein  YP_619982  normal  0.568716  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0096  CDS  NC_008060  100432  101718  1287  type II secretion system protein E  YP_619983  normal  0.188131  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0097  CDS  NC_008060  101790  103163  1374  hypothetical protein  YP_619984  hitchhiker  1.40223e-05  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0098  CDS  NC_008060  103448  104443  996  trans-hexaprenyltranstransferase  YP_619985  hitchhiker  4.78178e-08  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0099  CDS  NC_008060  104654  104965  312  50S ribosomal protein L21  YP_619986  hitchhiker  2.05057e-05  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Bcen_0100  CDS  NC_008060  104990  105253  264  50S ribosomal protein L27  YP_619987  hitchhiker  0.00352754  n/a    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 31    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>