4630 genes were found for organism Escherichia coli HS



Page 1 of 47    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
EcHS_A0002  CDS  NC_009800  190  255  66  thr operon leader peptide  YP_001456786  normal  0.409737  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0003  CDS  NC_009800  336  2798  2463  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  YP_001456787  normal  0.761608  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0004  CDS  NC_009800  2800  3732  933  homoserine kinase  YP_001456788  normal  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0005  CDS  NC_009800  3733  5019  1287  threonine synthase  YP_001456789  normal  0.817747  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0006  CDS  NC_009800  5309  5719  411  hypothetical protein  YP_001456790  normal  0.581091  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0007  CDS  NC_009800  5682  6458  777  hypothetical protein  YP_001456791  normal  0.865833  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0008  CDS  NC_009800  6528  7958  1431  amino acid carrier protein  YP_001456792  normal  0.876133  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0009  CDS  NC_009800  8237  9190  954  transaldolase B  YP_001456793  normal  0.967516  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0010  CDS  NC_009800  9305  9892  588  molybdenum cofactor biosynthesis protein MogA  YP_001456794  normal  0.468408  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0011  CDS  NC_009800  9927  10493  567  hypothetical protein  YP_001456795  normal  0.708242  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0012  CDS  NC_009800  10642  11355  714  hypothetical protein  YP_001456796  normal  0.242726  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0013  CDS  NC_009800  11381  11785  405  hypothetical protein  YP_001456797  normal  0.156774  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0014  CDS  NC_009800  11920  12069  150  hypothetical protein  YP_001456798  normal  0.36506  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0015  CDS  NC_009800  12162  14078  1917  molecular chaperone DnaK  YP_001456799  normal  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0016  CDS  NC_009800  14167  15297  1131  chaperone protein DnaJ  YP_001456800  normal  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0017  CDS  NC_009800  15560  16672  1113  IS186, transposase  YP_001456801  normal  0.348239  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0018  CDS  NC_009800  16750  16959  210  putative Hok/gef family protein  YP_001456802  normal  0.0312538  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0019  CDS  NC_009800  17488  18654  1167  pH-dependent sodium/proton antiporter  YP_001456803  normal  0.0237343  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0020  CDS  NC_009800  18720  19619  900  transcriptional activator NhaR  YP_001456804  hitchhiker  0.000511976  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0021  CDS  NC_009800  19658  20437  780  hypothetical protein  YP_001456805  hitchhiker  2.36561e-05  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0023    NC_009800  20629  21774  1146      hitchhiker  1.30869e-07  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0024  CDS  NC_009800  22812  23627  816  hypothetical protein  YP_001456807  hitchhiker  1.46156e-14  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0025  CDS  NC_009800  24111  24374  264  30S ribosomal protein S20  YP_001456808  decreased coverage  3.87642e-19  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0026  CDS  NC_009800  24477  24695  219  hypothetical protein  YP_001456809  hitchhiker  6.19518e-15  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0027  CDS  NC_009800  24703  25644  942  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  YP_001456810  hitchhiker  8.78578e-11  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0028  CDS  NC_009800  25687  28503  2817  isoleucyl-tRNA synthetase  YP_001456811  hitchhiker  0.00012642  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0029  CDS  NC_009800  28503  28997  495  lipoprotein signal peptidase  YP_001456812  normal  0.0677738  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0030  CDS  NC_009800  29085  29534  450  FKBP-type 16 kDa peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  YP_001456813  normal  0.0386702  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0031  CDS  NC_009800  29536  30486  951  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase  YP_001456814  normal  0.423956  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0032  CDS  NC_009800  30552  31466  915  ribonucleoside hydrolase RihC  YP_001456815  normal  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0033  CDS  NC_009800  31633  32454  822  dihydrodipicolinate reductase  YP_001456816  normal  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0034  CDS  NC_009800  32496  32663  168  hypothetical protein  YP_001456817  normal  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0035  CDS  NC_009800  32910  34058  1149  carbamoyl phosphate synthase small subunit  YP_001456818  normal  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0036  CDS  NC_009800  34076  37297  3222  carbamoyl phosphate synthase large subunit  YP_001456819  normal  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0037  CDS  NC_009800  37305  37523  219  hypothetical protein  YP_001456820  normal  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0038  CDS  NC_009800  37558  37953  396  DNA-binding transcriptional activator CaiF  YP_001456821  normal  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0039  CDS  NC_009800  38039  38629  591  carnitine operon protein CaiE  YP_001456822  normal  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0040  CDS  NC_009800  38635  39420  786  carnitinyl-CoA dehydratase  YP_001456823  normal  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0041  CDS  NC_009800  39529  41097  1569  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  YP_001456824  normal  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0042  CDS  NC_009800  41156  42373  1218  crotonobetainyl-CoA:carnitine CoA-transferase  YP_001456825  normal  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0043  CDS  NC_009800  42502  43644  1143  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  YP_001456826  normal  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0044  CDS  NC_009800  43675  45189  1515  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  YP_001456827  normal  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0045  CDS  NC_009800  45204  45305  102  hypothetical protein  YP_001456828  normal  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0046  CDS  NC_009800  45484  45594  111  hypothetical protein  YP_001456829  normal  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0047  CDS  NC_009800  45663  46433  771  putative electron transfer flavoprotein FixA  YP_001456830  normal  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0048  CDS  NC_009800  46448  47389  942  putative electron transfer flavoprotein FixB  YP_001456831  normal  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0049  CDS  NC_009800  47440  48726  1287  putative oxidoreductase FixC  YP_001456832  normal  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0050  CDS  NC_009800  48723  49010  288  ferredoxin homolog FixX  YP_001456833  normal  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0051  CDS  NC_009800  49069  50400  1332  major facilitator family transporter  YP_001456834  normal  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0052  CDS  NC_009800  50508  51038  531  glutathione-regulated potassium-efflux system ancillary protein KefF  YP_001456835  normal  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0053  CDS  NC_009800  51031  52893  1863  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  YP_001456836  normal  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0054  CDS  NC_009800  53085  53564  480  dihydrofolate reductase  YP_001456837  normal  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0055  CDS  NC_009800  53642  54484  843  diadenosine tetraphosphatase  YP_001456838  normal  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0056  CDS  NC_009800  54491  54868  378  ApaG  YP_001456839  normal  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0057  CDS  NC_009800  54871  55692  822  dimethyladenosine transferase  YP_001456840  normal  0.581995  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0058  CDS  NC_009800  55689  56678  990  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  YP_001456841  normal  0.0697473  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0059  CDS  NC_009800  56678  57964  1287  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  YP_001456842  hitchhiker  4.68252e-05  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0060  CDS  NC_009800  58017  60371  2355  organic solvent tolerance protein  YP_001456843  hitchhiker  1.18129e-10  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0061  CDS  NC_009800  60626  61441  816  Dna-J like membrane chaperone protein  YP_001456844  hitchhiker  2.04638e-15  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0062  CDS  NC_009800  61558  62217  660  23S rRNA/tRNA pseudouridine synthase A  YP_001456845  hitchhiker  5.19589e-11  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0063  CDS  NC_009800  62229  65135  2907  ATP-dependent helicase HepA  YP_001456846  hitchhiker  1.44173e-05  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0064  CDS  NC_009800  65300  67651  2352  DNA polymerase II  YP_001456847  normal  0.406876  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0065  CDS  NC_009800  67726  68421  696  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  YP_001456848  normal  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0066  CDS  NC_009800  68590  70092  1503  L-arabinose isomerase  YP_001456849  normal  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0067  CDS  NC_009800  70103  71803  1701  ribulokinase  YP_001456850  normal  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0068  CDS  NC_009800  72142  73020  879  DNA-binding transcriptional regulator AraC  YP_001456851  normal  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0069  CDS  NC_009800  73106  73870  765  hypothetical protein  YP_001456852  normal  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0070  CDS  NC_009800  73984  74682  699  thiamine transporter ATP-binding subunit  YP_001456853  normal  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0071  CDS  NC_009800  74666  76276  1611  thiamine transporter membrane protein  YP_001456854  normal  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0072  CDS  NC_009800  76252  77235  984  thiamine transporter substrate binding subunit  YP_001456855  normal  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0073  CDS  NC_009800  77279  77398  120  putative lipoprotein  YP_001456856  normal  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0074  CDS  NC_009800  77399  79054  1656  transcriptional regulator SgrR  YP_001456857  normal  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0075  CDS  NC_009800  79376  80554  1179  sugar efflux transporter A  YP_001456858  normal  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0076  CDS  NC_009800  80603  81208  606  isopropylmalate isomerase small subunit  YP_001456859  normal  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0077  CDS  NC_009800  81219  82619  1401  isopropylmalate isomerase large subunit  YP_001456860  normal  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0078  CDS  NC_009800  82622  83713  1092  3-isopropylmalate dehydrogenase  YP_001456861  normal  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0079  CDS  NC_009800  83713  85284  1572  2-isopropylmalate synthase  YP_001456862  normal  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0080  CDS  NC_009800  85377  85463  87  leu operon leader peptide  YP_001456863  normal  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0081  CDS  NC_009800  86123  87067  945  leucine transcriptional activator  YP_001456864  normal  0.669516  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0082  CDS  NC_009800  87103  87225  123  hypothetical protein  YP_001456865  normal  0.82491  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0083  CDS  NC_009800  87385  89109  1725  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  YP_001456866  normal  0.630637  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0084  CDS  NC_009800  89112  89603  492  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  YP_001456867  normal  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0085  CDS  NC_009800  89655  89786  132  hypothetical protein  YP_001456868  normal  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0086  CDS  NC_009800  89783  90787  1005  DNA-binding transcriptional regulator FruR  YP_001456869  normal  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0087  CDS  NC_009800  91389  91847  459  cell division protein MraZ  YP_001456870  normal  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0088  CDS  NC_009800  91849  92790  942  S-adenosyl-methyltransferase MraW  YP_001456871  normal  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0089  CDS  NC_009800  92787  93152  366  cell division protein FtsL  YP_001456872  normal  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0090  CDS  NC_009800  93168  94934  1767  peptidoglycan synthetase FtsI  YP_001456873  normal  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0091  CDS  NC_009800  94921  96408  1488  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase  YP_001456874  normal  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0092  CDS  NC_009800  96405  97763  1359  UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide--D-alanyl-D- alanine ligase  YP_001456875  normal  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0093  CDS  NC_009800  97757  98839  1083  phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide- transferase  YP_001456876  normal  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0094  CDS  NC_009800  98842  100158  1317  UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate synthetase  YP_001456877  normal  0.684668  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0095  CDS  NC_009800  100158  101402  1245  cell division protein FtsW  YP_001456878  normal  0.747639  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0096  CDS  NC_009800  101399  102466  1068  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  YP_001456879  normal  0.178087  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0097  CDS  NC_009800  102520  103995  1476  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  YP_001456880  normal  0.0154515  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0098  CDS  NC_009800  103988  104908  921  D-alanine--D-alanine ligase  YP_001456881  hitchhiker  6.99622e-08  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0099  CDS  NC_009800  104910  105740  831  cell division protein FtsQ  YP_001456882  hitchhiker  1.53055e-11  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0100  CDS  NC_009800  105737  106999  1263  cell division protein FtsA  YP_001456883  decreased coverage  2.5263e-18  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0101  CDS  NC_009800  107060  108211  1152  cell division protein FtsZ  YP_001456884  decreased coverage  1.47391e-18  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
EcHS_A0102  CDS  NC_009800  108312  109229  918  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase  YP_001456885  hitchhiker  1.52337e-17  n/a    Escherichia coli HS  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 47    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>