77 genes were found for organism Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
EcE24377A_E0001  CDS  NC_009790  1319  1900  -  582  IS1294, transposase, truncation  YP_001451544  normal  0.040816  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0002  CDS  NC_009790  2161  3345  +  1185  hypothetical protein  YP_001451545  normal  0.25155  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0003  CDS  NC_009790  3514  4191  +  678  IS66 family orf1  YP_001451546  normal  0.930174  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0004  CDS  NC_009790  4191  4538  +  348  IS66 family orf2  YP_001451547  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0005  CDS  NC_009790  4558  6129  +  1572  IS66 family transposase  YP_001451548  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0006  CDS  NC_009790  6254  6619  +  366  insertion sequence 2 OrfA protein  YP_001451549  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0007  CDS  NC_009790  6577  6828  +  252  IS2, transposase orfB, truncation  YP_001451550  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0008  CDS  NC_009790  7009  7182  -  174  IS91, transposase, truncation  YP_001451551  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0009  CDS  NC_009790  7137  7502  -  366  IS91, orf2  YP_001451552  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0010  CDS  NC_009790  7779  8633  -  855  IS91, transposase, truncation  YP_001451553  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0011  CDS  NC_009790  8644  9912  +  1269  hypothetical protein  YP_001451554  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0012  CDS  NC_009790  9967  10401  +  435  plasmid SOS inhibition protein B  YP_001451555  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0013  CDS  NC_009790  10398  11117  +  720  plasmid SOS inhibition protein A  YP_001451556  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0014  CDS  NC_009790  11971  12297  +  327  IS629, transposase orfA  YP_001451557  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0015    NC_009790  12297  12776  +  480      normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0016  CDS  NC_009790  13368  14891  +  1524  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  YP_001451558  normal  0.934591  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0017    NC_009790  15008  15454  +  447      normal  0.473155  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0018  CDS  NC_009790  15818  16612  -  795  IS21 family transposition helper protein  YP_001451559  normal  0.0341022  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0019  CDS  NC_009790  16612  17784  -  1173  IS21 family transposase  YP_001451560  normal  0.0506229  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0020  CDS  NC_009790  18516  19442  -  927  hypothetical protein  YP_001451561  decreased coverage  0.00212726  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0021  CDS  NC_009790  20027  20998  -  972  plasmid-partitioning protein  YP_001451562  normal  0.155316  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0022  CDS  NC_009790  20998  22164  -  1167  plasmid-partitioning protein SopA  YP_001451563  normal  0.19504  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0023  CDS  NC_009790  22120  22272  +  153  hypothetical protein  YP_001451564  normal  0.133058  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0024    NC_009790  22697  23143  -  447      normal  0.105629  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0025  CDS  NC_009790  23260  24783  -  1524  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  YP_001451565  normal  0.352503  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0026    NC_009790  25375  25854  -  480      normal  0.144429  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0027  CDS  NC_009790  25854  26180  -  327  IS629, transposase orfA  YP_001451566  normal  0.116666  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0028  CDS  NC_009790  27397  28182  +  786  putative DNA methylase  YP_001451567  normal  0.412045  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0029  CDS  NC_009790  28349  29098  -  750  hypothetical protein  YP_001451568  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0030  CDS  NC_009790  29124  29264  +  141  hypothetical protein  YP_001451569  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0031  CDS  NC_009790  29643  31004  +  1362  hypothetical protein  YP_001451570  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0032  CDS  NC_009790  31051  31614  +  564  hypothetical protein  YP_001451571  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0033  CDS  NC_009790  31654  31779  +  126  hypothetical protein  YP_001451572  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0034  CDS  NC_009790  32838  33659  +  822  hypothetical protein  YP_001451573  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0035  CDS  NC_009790  34347  35141  -  795  IS21 family transposition helper protein  YP_001451574  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0036  CDS  NC_009790  35141  36313  -  1173  IS21 family transposase  YP_001451575  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0037  CDS  NC_009790  36400  36750  -  351  hypothetical protein  YP_001451576  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0038  CDS  NC_009790  38653  40191  -  1539  IS66 family transposase  YP_001451577  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0039  CDS  NC_009790  40241  40588  -  348  IS66 family orf2  YP_001451578  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0040  CDS  NC_009790  40585  40974  -  390  IS66 family orf1  YP_001451579  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0041  CDS  NC_009790  41789  42154  +  366  insertion sequence 2 OrfA protein  YP_001451580  normal  0.64652  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0042  CDS  NC_009790  42112  43023  +  912  IS2, transposase orfB  YP_001451581  normal  0.913232  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0043  CDS  NC_009790  43189  43461  +  273  IS1, transposase orfA  YP_001451582  normal  0.911422  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0044  CDS  NC_009790  43488  43883  +  396  IS1, transposase orfB  YP_001451583  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0045  CDS  NC_009790  44240  44917  +  678  IS66 family orf1  YP_001451584  normal  0.88778  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0046  CDS  NC_009790  44917  45264  +  348  IS66 family orf2  YP_001451585  normal  0.916394  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0047  CDS  NC_009790  45284  46855  +  1572  IS66 family transposase  YP_001451586  normal  0.637398  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0048    NC_009790  47113  47616  -  504      normal  0.437352  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0049  CDS  NC_009790  47535  47810  -  276  IS1, transposase orfA  YP_001451587  normal  0.561521  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0050    NC_009790  48269  48585  +  317      normal  0.10174  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0051  CDS  NC_009790  49306  53406  +  4101  secreted serine peptidase EatA  YP_001451588  normal  0.611432  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0052  CDS  NC_009790  53749  54471  -  723  HTH-type transcriptional regulator YdeO  YP_001451589  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0053  CDS  NC_009790  54701  55381  +  681  EAL domain-containing protein  YP_001451590  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0054  CDS  NC_009790  55821  56462  -  642  resolvase domain-containing protein  YP_001451591  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0055  CDS  NC_009790  56792  57505  -  714  resolvase  YP_001451592  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0056  CDS  NC_009790  57506  57811  -  306  plasmid maintenance protein CcdB  YP_001451593  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0057  CDS  NC_009790  57813  58031  -  219  plasmid maintenance protein CcdA  YP_001451594  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0058  CDS  NC_009790  58476  58733  +  258  hypothetical protein  YP_001451595  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0059  CDS  NC_009790  58733  59263  +  531  hypothetical protein  YP_001451596  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0060  CDS  NC_009790  59528  60349  +  822  polysaccharide deacetylase family protein  YP_001451597  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0061  CDS  NC_009790  60352  61440  +  1089  glycosyl transferase, group 1 family protein  YP_001451598  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0062  CDS  NC_009790  62340  62453  -  114  hypothetical protein  YP_001451600  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0063  CDS  NC_009790  61445  62395  +  951  hypothetical protein  YP_001451599  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0064    NC_009790  62460  63405  +  946      normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0065  CDS  NC_009790  63467  63685  -  219  IS630, transposase, truncation  YP_001451601  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0066  CDS  NC_009790  64940  65209  -  270  IS1294, transposase, truncation  YP_001451602  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0067    NC_009790  63830  64980  +  1151      normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0068  CDS  NC_009790  65257  66795  -  1539  IS66 family transposase  YP_001451603  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0069  CDS  NC_009790  66845  67192  -  348  IS66 family orf2  YP_001451604  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0070  CDS  NC_009790  67189  67578  -  390  IS66 family element  YP_001451605  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0071  CDS  NC_009790  67684  67782  -  99  hypothetical protein  YP_001451607  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0072  CDS  NC_009790  67666  67791  +  126  hypothetical protein  YP_001451606  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0073  CDS  NC_009790  67898  68257  +  360  type IV conjugative transfer system pilin TraA  YP_001451608  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0074  CDS  NC_009790  68259  68564  +  306  conjugal transfer pilus assembly protein TraL  YP_001451609  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0075  CDS  NC_009790  68584  69147  +  564  conjugal transfer pilus assembly protein TraE  YP_001451610  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0076  CDS  NC_009790  69460  71505  +  2046  putative type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  YP_001451611  normal  1  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
EcE24377A_E0077  CDS  NC_009790  71532  71915  +  384  type-F conjugative transfer system pilin acetylase TraX, truncation  YP_001451612  normal  0.835622  n/a    Escherichia coli E24377A  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>