3904 genes were found for organism Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 40    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Cagg_0001  CDS  NC_011831  208  1644  1437  chromosomal replication initiation protein  YP_002461390  hitchhiker  3.39822e-05  hitchhiker  3.14878e-05  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0002  CDS  NC_011831  1767  3164  1398  peptidase S41  YP_002461391  normal  0.220655  hitchhiker  2.7007e-05  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0003  CDS  NC_011831  3284  4420  1137  putative transcriptional regulator, GntR family  YP_002461392  normal  0.761486  hitchhiker  0.000119798  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0004  CDS  NC_011831  4428  5351  924  pseudouridine synthase  YP_002461393  normal  hitchhiker  0.000105413  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0005  CDS  NC_011831  5441  6976  1536  hypothetical protein  YP_002461394  normal  0.833945  hitchhiker  0.000456917  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0006  CDS  NC_011831  6981  7364  384  hypothetical protein  YP_002461395  normal  0.149564  hitchhiker  0.00107444  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0007  CDS  NC_011831  7397  7654  258  hypothetical protein  YP_002461396  normal  0.45233  hitchhiker  0.00105872  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0008  CDS  NC_011831  7957  8355  399  hypothetical protein  YP_002461397  normal  0.237338  hitchhiker  0.00111293  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0009  CDS  NC_011831  8352  9077  726  ABC transporter related  YP_002461398  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0010  CDS  NC_011831  9278  12046  2769  valyl-tRNA synthetase  YP_002461399  normal  0.885408  hitchhiker  0.00234532  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0011  CDS  NC_011831  12116  12952  837  alpha/beta hydrolase fold protein  YP_002461400  normal  hitchhiker  0.00883263  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0012  CDS  NC_011831  12949  21300  8352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  YP_002461401  normal  normal  0.296104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0013  CDS  NC_011831  21400  22344  945  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  YP_002461402  normal  normal  0.992585  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0014  CDS  NC_011831  22371  23867  1497  N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase-like protein  YP_002461403  normal  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0015  CDS  NC_011831  23981  26836  2856  excinuclease ABC, A subunit  YP_002461404  normal  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0016  CDS  NC_011831  27170  27865  696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_002461405  normal  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0017  CDS  NC_011831  27934  28608  675  GTP cyclohydrolase I  YP_002461406  normal  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0018  CDS  NC_011831  28685  29509  825  6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase and hypothetical protein  YP_002461407  normal  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0019  CDS  NC_011831  29765  30901  1137  DNA polymerase III, beta subunit  YP_002461408  normal  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0020  CDS  NC_011831  30991  31680  690  two component transcriptional regulator, LuxR family  YP_002461409  normal  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0021  CDS  NC_011831  31740  33794  2055  WD40 domain protein beta Propeller  YP_002461410  normal  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0022  CDS  NC_011831  33946  34653  708  hypothetical protein  YP_002461411  normal  0.714889  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0023  CDS  NC_011831  34843  37869  3027  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  YP_002461412  normal  0.421595  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0024  CDS  NC_011831  38706  40424  1719  Formate--tetrahydrofolate ligase  YP_002461413  normal  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0025  CDS  NC_011831  40429  41718  1290  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  YP_002461414  normal  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0026  CDS  NC_011831  41728  42792  1065  Membrane dipeptidase  YP_002461415  normal  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0027  CDS  NC_011831  42950  43984  1035  FAD dependent oxidoreductase  YP_002461416  normal  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0028  CDS  NC_011831  43993  45264  1272  peptidase M16 domain protein  YP_002461417  normal  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0029  CDS  NC_011831  45295  46794  1500  putative GAF sensor protein  YP_002461418  normal  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0030  CDS  NC_011831  46933  47646  714  isochorismatase hydrolase  YP_002461419  normal  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0031  CDS  NC_011831  47887  48546  660  phosphate uptake regulator, PhoU  YP_002461420  normal  0.320331  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0032  CDS  NC_011831  48686  52276  3591  methionine synthase  YP_002461421  normal  0.392993  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0033  CDS  NC_011831  52563  54338  1776  hypothetical protein  YP_002461422  normal  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0034  CDS  NC_011831  54312  56498  2187  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  YP_002461423  normal  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0035  CDS  NC_011831  56602  58008  1407  virulence factor MVIN family protein  YP_002461424  normal  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0036  CDS  NC_011831  58214  59548  1335  protein of unknown function DUF58  YP_002461425  normal  0.764731  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0037  CDS  NC_011831  59555  60853  1299  peptidase M14 carboxypeptidase A  YP_002461426  normal  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0038  CDS  NC_011831  60904  61494  591  transferase hexapeptide repeat containing protein  YP_002461427  normal  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0039  CDS  NC_011831  61520  61987  468  hypothetical protein  YP_002461428  normal  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0040  CDS  NC_011831  62561  63841  1281  isocitrate lyase  YP_002461429  normal  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0041  CDS  NC_011831  63963  64271  309  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  YP_002461430  normal  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0042  CDS  NC_011831  64368  64583  216  hypothetical protein  YP_002461431  normal  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0043  CDS  NC_011831  64886  66121  1236  threonine dehydratase  YP_002461432  normal  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0044  CDS  NC_011831  66198  67616  1419  cell cycle protein  YP_002461433  normal  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0045  CDS  NC_011831  67703  68893  1191  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  YP_002461434  normal  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0046  CDS  NC_011831  68967  69662  696  protein of unknown function DUF1641  YP_002461435  normal  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0047  CDS  NC_011831  69782  71182  1401  beta-lactamase domain protein  YP_002461436  normal  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0048  CDS  NC_011831  71453  72349  897  transcriptional regulator, LysR family  YP_002461437  normal  0.968768  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0049  CDS  NC_011831  72346  72612  267  hypothetical protein  YP_002461438  normal  0.667349  normal  0.696922  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0050  CDS  NC_011831  72641  73261  621  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  YP_002461439  normal  0.552448  normal  0.767054  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0051  CDS  NC_011831  73349  74011  663  glutaredoxin-like domain protein  YP_002461440  normal  0.134745  normal  0.790118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0052  CDS  NC_011831  74171  75355  1185  major facilitator superfamily MFS_1  YP_002461441  normal  0.0533756  normal  0.852382  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0053  CDS  NC_011831  75502  76218  717  putative esterase  YP_002461442  normal  0.0177821  normal  0.392067  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0054  CDS  NC_011831  76343  76921  579  TadE family protein  YP_002461443  normal  0.264779  normal  0.374469  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0055  CDS  NC_011831  76934  77527  594  TadE family protein  YP_002461444  normal  0.258579  normal  0.372833  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0056  CDS  NC_011831  77590  80133  2544  von Willebrand factor type A  YP_002461445  normal  0.854643  normal  0.269901  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0057  CDS  NC_011831  80241  82853  2613  hypothetical protein  YP_002461446  normal  normal  0.279579  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0058  CDS  NC_011831  83015  85747  2733  Phosphoenolpyruvate carboxylase  YP_002461447  normal  normal  0.424552  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0059  CDS  NC_011831  85880  86518  639  Formiminotransferase-cyclodeaminase  YP_002461448  normal  normal  0.279753  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0060  CDS  NC_011831  86515  87372  858  Methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  YP_002461449  normal  normal  0.296483  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0061  CDS  NC_011831  87436  88737  1302  Phosphoribosylamine--glycine ligase  YP_002461450  normal  normal  0.490327  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0062  CDS  NC_011831  88749  89210  462  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_002461451  normal  normal  0.417234  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0063  CDS  NC_011831  89368  89847  480  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  YP_002461452  normal  normal  0.436738  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0064  CDS  NC_011831  90006  90533  528  PHA accumulation regulator DNA-binding protein  YP_002461453  normal  normal  0.603944  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0065  CDS  NC_011831  90579  91796  1218  Patatin  YP_002461454  normal  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0066  CDS  NC_011831  91798  93009  1212  glycosyl transferase group 1  YP_002461455  normal  normal  0.918731  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0067  CDS  NC_011831  93058  94926  1869  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  YP_002461456  normal  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0068  CDS  NC_011831  95160  95771  612  hypothetical protein  YP_002461457  normal  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0069  CDS  NC_011831  95755  96984  1230  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  YP_002461458  normal  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0070  CDS  NC_011831  97206  98444  1239  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  YP_002461459  normal  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0071  CDS  NC_011831  98462  100132  1671  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, A subunit  YP_002461460  normal  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0072  CDS  NC_011831  100286  101782  1497  glycerol kinase  YP_002461461  normal  0.811469  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0073  CDS  NC_011831  101827  102471  645  dihydroxyacetone kinase, L subunit  YP_002461462  normal  0.706959  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0074  CDS  NC_011831  102542  103540  999  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  YP_002461463  normal  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0075  CDS  NC_011831  103652  104386  735  major intrinsic protein  YP_002461464  normal  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0076  CDS  NC_011831  104847  106724  1878  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  YP_002461465  normal  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0077  CDS  NC_011831  106858  108042  1185  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  YP_002461466  normal  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0078  CDS  NC_011831  108272  110380  2109  glycoside hydrolase family 3 domain protein  YP_002461467  normal  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0079  CDS  NC_011831  110523  112742  2220  glycoside hydrolase family 35  YP_002461468  normal  0.579135  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0080  CDS  NC_011831  112820  114058  1239  hypothetical protein  YP_002461469  normal  0.815437  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0081  CDS  NC_011831  114062  115045  984  transcriptional regulator, LacI family  YP_002461470  normal  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0082  CDS  NC_011831  115167  116567  1401  hypothetical protein  YP_002461471  normal  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0083  CDS  NC_011831  116560  117489  930  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002461472  normal  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0084  CDS  NC_011831  117692  118561  870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002461473  normal  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0085  CDS  NC_011831  118747  120876  2130  hypothetical protein  YP_002461474  normal  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0086  CDS  NC_011831  120910  122952  2043  NHL repeat-containing protein  YP_002461475  normal  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0087  CDS  NC_011831  122991  123893  903  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002461476  normal  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0088  CDS  NC_011831  123895  124809  915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002461477  normal  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0089  CDS  NC_011831  124799  127654  2856  extracellular solute-binding protein family 1  YP_002461478  normal  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0090  CDS  NC_011831  127748  129217  1470  extracellular solute-binding protein family 1  YP_002461479  normal  0.271567  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0091  CDS  NC_011831  129378  131927  2550  glycosyltransferase 36  YP_002461480  decreased coverage  0.00140222  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0092  CDS  NC_011831  132160  132459  300  hypothetical protein  YP_002461481  hitchhiker  1.00169e-05  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0093  CDS  NC_011831  132483  132938  456  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_002461482  hitchhiker  0.0017164  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0094  CDS  NC_011831  132943  133371  429  Holliday junction resolvase YqgF  YP_002461483  hitchhiker  0.0018567  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0095  CDS  NC_011831  133364  135445  2082  hypothetical protein  YP_002461484  normal  0.0150917  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0096  CDS  NC_011831  135513  138197  2685  alanyl-tRNA synthetase  YP_002461485  normal  0.172086  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0097  CDS  NC_011831  138623  139165  543  hypothetical protein  YP_002461486  normal  0.0204036  normal  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0098  CDS  NC_011831  139328  140656  1329  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  YP_002461487  normal  0.0434945  normal  0.951053  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0099  CDS  NC_011831  140674  141666  993  hypothetical protein  YP_002461488  normal  0.152697  normal  0.913948  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Cagg_0100  CDS  NC_011831  141878  143425  1548  nicotinate phosphoribosyltransferase  YP_002461489  hitchhiker  0.00987122  normal  0.985664  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 40    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>