2163 genes were found for organism Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 22    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Suden_0001  CDS  NC_007575  15  1322  1308  chromosomal replication initiation protein  YP_392517  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0002  CDS  NC_007575  1490  2557  1068  DNA polymerase III subunit beta  YP_392518  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0003  CDS  NC_007575  2707  5016  2310  DNA gyrase subunit B  YP_392519  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0004  CDS  NC_007575  5041  5418  378  7-cyano-7-deazaguanine reductase  YP_392520  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0005  CDS  NC_007575  5407  6642  1236  polynucleotide adenylyltransferase region  YP_392521  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0006  CDS  NC_007575  6798  8600  1803  GTP-binding protein TypA  YP_392522  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0007  CDS  NC_007575  8748  10673  1926  TonB-dependent receptor  YP_392523  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0008  CDS  NC_007575  10712  12604  1893  histidine kinase  YP_392524  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0009  CDS  NC_007575  12601  13275  675  two component transcriptional regulator  YP_392525  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0010  CDS  NC_007575  13468  16977  3510  filamentous haemagglutinin-like protein  YP_392526  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0011  CDS  NC_007575  16989  18692  1704  hemolysin activation/secretion protein-like  YP_392527  normal  0.811976  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0012  CDS  NC_007575  18752  19672  921  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  YP_392528  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0013  CDS  NC_007575  19839  20861  1023  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  YP_392529  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0014  CDS  NC_007575  20848  21591  744  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  YP_392530  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0015  CDS  NC_007575  21575  22222  648  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  YP_392531  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0016  CDS  NC_007575  22219  23298  1080  phospholipase A1  YP_392532  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0017  CDS  NC_007575  23358  24191  834  thymidylate synthase complementing protein ThyX  YP_392533  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0018  CDS  NC_007575  24196  24411  216  hypothetical protein  YP_392534  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0019  CDS  NC_007575  24423  24977  555  PhnA protein  YP_392535  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0020  CDS  NC_007575  24996  26159  1164  diguanylate cyclase  YP_392536  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0021  CDS  NC_007575  26170  27267  1098  deoxyguanosinetriphosphate triphosphohydrolase  YP_392537  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0022  CDS  NC_007575  27313  27525  213  30S ribosomal protein S21  YP_392538  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0023  CDS  NC_007575  27963  29615  1653  DNA primase  YP_392539  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0024  CDS  NC_007575  29605  30627  1023  hypothetical protein  YP_392540  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0025  CDS  NC_007575  30766  31962  1197  DEAD/DEAH box helicase-like  YP_392541  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0026  CDS  NC_007575  32011  32991  981  thiamine biosynthesis protein:ExsB  YP_392542  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0027  CDS  NC_007575  33039  33455  417  hypothetical protein  YP_392543  normal  0.26173  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0028  CDS  NC_007575  33442  33681  240  hypothetical protein  YP_392544  normal  0.404805  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0029  CDS  NC_007575  33761  35395  1635  flagellar hook-length control protein  YP_392545  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0030  CDS  NC_007575  35500  36165  666  flagellar hook capping protein  YP_392546  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0031  CDS  NC_007575  36177  37469  1293  hypothetical protein  YP_392547  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0032  CDS  NC_007575  37633  39789  2157  flagellar hook protein FlgE  YP_392548  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0033  CDS  NC_007575  39919  41082  1164  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  YP_392549  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0034  CDS  NC_007575  41083  42018  936  2-hydroxyacid dehydrogenase  YP_392550  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0035  CDS  NC_007575  42048  42419  372  cytoplasmic membrane protein  YP_392551  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0036  CDS  NC_007575  42449  45019  2571  histidine kinase  YP_392552  normal  0.772406  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0037  CDS  NC_007575  45009  46610  1602  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  YP_392553  normal  0.994153  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0038  CDS  NC_007575  46600  47304  705  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur protein  YP_392554  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0039  CDS  NC_007575  47477  47974  498  putative nucleotide-binding protein  YP_392555  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0040  CDS  NC_007575  47986  48654  669  hypothetical protein  YP_392556  normal  0.734674  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0041  CDS  NC_007575  48904  49356  453  hypothetical protein  YP_392557  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0042  CDS  NC_007575  49359  50867  1509  radical SAM family protein  YP_392558  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0043  CDS  NC_007575  51033  52298  1266  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_392559  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0044  CDS  NC_007575  52327  52815  489  putative PAS/PAC sensor protein  YP_392560  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0045  CDS  NC_007575  52872  54053  1182  putative MFS metabolite transporter  YP_392561  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0046  CDS  NC_007575  54031  54837  807  putative salt-induced outer membrane protein-like  YP_392562  normal  0.843258  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0047  CDS  NC_007575  54842  55654  813  MscS mechanosensitive ion channel  YP_392563  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0048  CDS  NC_007575  55698  56027  330  hypothetical protein  YP_392564  normal  0.829661  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0049  CDS  NC_007575  56020  56331  312  hypothetical protein  YP_392565  normal  0.998053  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0050  CDS  NC_007575  56333  57082  750  putative manganese transport system permease protein  YP_392566  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0051  CDS  NC_007575  57079  57957  879  periplasmic solute binding protein  YP_392567  normal  0.958228  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0052  CDS  NC_007575  58078  59361  1284  hypothetical protein  YP_392568  normal  0.567033  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0053  CDS  NC_007575  59422  59688  267  hypothetical protein  YP_392569  normal  0.732615  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0054  CDS  NC_007575  59899  60195  297  hypothetical protein  YP_392570  normal  0.801739  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0055  CDS  NC_007575  60204  62282  2079  phosphate acetyltransferase  YP_392571  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0056  CDS  NC_007575  62279  63448  1170  acetate kinase  YP_392572  normal  0.614754  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0057  CDS  NC_007575  63445  63768  324  hypothetical protein  YP_392573  normal  0.621551  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0058  CDS  NC_007575  63938  64621  684  hypothetical protein  YP_392574  normal  0.459149  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0059  CDS  NC_007575  64683  65339  657  hypothetical protein  YP_392575  normal  0.057429  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0060  CDS  NC_007575  65336  65761  426  hypothetical protein  YP_392576  normal  0.0350069  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0061  CDS  NC_007575  65748  66719  972  hypothetical protein  YP_392577  hitchhiker  0.0021495  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0062  CDS  NC_007575  66729  67370  642  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  YP_392578  hitchhiker  0.000311798  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0063  CDS  NC_007575  67363  67908  546  hypothetical protein  YP_392579  hitchhiker  0.00180347  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0064  CDS  NC_007575  67901  68683  783  ABC transporter-related protein  YP_392580  hitchhiker  0.00037782  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0065  CDS  NC_007575  69380  71065  1686  dihydroxy-acid dehydratase  YP_392581  hitchhiker  2.40463e-05  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0066  CDS  NC_007575  71086  72894  1809  threonyl-tRNA synthetase  YP_392582  decreased coverage  2.16362e-06  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0067  CDS  NC_007575  72891  73409  519  translation initiation factor IF-3  YP_392583  hitchhiker  1.01132e-10  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0068  CDS  NC_007575  73591  75507  1917  exo-beta-1 3-glucanase-like  YP_392584  hitchhiker  0.00110829  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0069  CDS  NC_007575  75488  77257  1770  ABC transporter-related protein  YP_392585  normal  0.590448  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0070  CDS  NC_007575  77263  78579  1317  major facilitator transporter  YP_392586  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0071  CDS  NC_007575  78689  79288  600  putative deoxyribonucleotide triphosphate pyrophosphatase  YP_392587  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0072  CDS  NC_007575  79420  80190  771  undecaprenol kinase  YP_392588  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0073  CDS  NC_007575  80317  81429  1113  aminotransferase, class V  YP_392589  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0074  CDS  NC_007575  81430  82278  849  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  YP_392590  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0075  CDS  NC_007575  82325  83584  1260  adenylosuccinate synthetase  YP_392591  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0076  CDS  NC_007575  83666  84040  375  hypothetical protein  YP_392592  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0077  CDS  NC_007575  84037  84549  513  PDP protein  YP_392593  normal  0.390146  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0078  CDS  NC_007575  84610  86481  1872  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  YP_392594  normal  0.331351  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0079  CDS  NC_007575  86546  87097  552  hypothetical protein  YP_392595  normal  0.11602  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0080  CDS  NC_007575  87099  88244  1146  carbamoyl phosphate synthase small subunit  YP_392596  normal  0.0555876  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0081  CDS  NC_007575  88469  89962  1494  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  YP_392597  normal  0.0206763  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0082  CDS  NC_007575  89978  90670  693  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II  YP_392598  decreased coverage  0.000421523  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0083  CDS  NC_007575  90680  90883  204  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit IV  YP_392599  decreased coverage  3.54018e-05  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0084  CDS  NC_007575  90893  91816  924  Cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  YP_392600  decreased coverage  0.000832498  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0085  CDS  NC_007575  91827  92036  210  hypothetical protein  YP_392601  hitchhiker  0.00195304  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0086  CDS  NC_007575  92144  92848  705  3-dehydroquinate dehydratase  YP_392602  normal  0.0122241  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0087  CDS  NC_007575  92835  93341  507  hypothetical protein  YP_392603  normal  0.01404  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0088  CDS  NC_007575  93356  95701  2346  hypothetical protein  YP_392604  normal  0.217564  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0089  CDS  NC_007575  95702  95935  234  hypothetical protein  YP_392605  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0090  CDS  NC_007575  95937  98648  2712  putative recombination protein RecB  YP_392606  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0091  CDS  NC_007575  98700  99212  513  NLP/P60  YP_392607  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0092  CDS  NC_007575  99332  99754  423  50S ribosomal protein L13  YP_392608  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0093  CDS  NC_007575  99765  100154  390  30S ribosomal protein S9  YP_392609  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0094  CDS  NC_007575  100269  101765  1497  extracellular solute-binding protein  YP_392610  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0095  CDS  NC_007575  101767  102405  639  HAD family hydrolase  YP_392611  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0096  CDS  NC_007575  102533  103090  558  pyruvate flavodoxin oxidoreductase subunit gamma  YP_392612  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0097  CDS  NC_007575  103101  103496  396  pyruvate flavodoxin oxidoreductase subunit delta  YP_392613  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0098  CDS  NC_007575  103496  104719  1224  pyruvate flavodoxin oxidoreductase subunit alpha  YP_392614  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0099  CDS  NC_007575  104730  105686  957  pyruvate flavodoxin oxidoreductase subunit beta  YP_392615  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Suden_0100  CDS  NC_007575  106659  106982  324  nitrate transporter  YP_392616  normal  n/a    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 22    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>