4721 genes were found for organism Shewanella baltica OS155



Page 1 of 48    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Sbal_0001  CDS  NC_009052  41  1429  1389  chromosomal replication initiation protein  YP_001048407  unclonable  2.57358e-08  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0002  CDS  NC_009052  1449  2549  1101  DNA polymerase III, beta subunit  YP_001048408  unclonable  8.48773e-09  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0003  CDS  NC_009052  2751  3833  1083  recombination protein F  YP_001048409  normal  0.133569  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0004  CDS  NC_009052  3850  6267  2418  DNA gyrase, B subunit  YP_001048410  normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0005  CDS  NC_009052  6353  7015  663  glutathione S-transferase domain-containing protein  YP_001048411  normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0006  CDS  NC_009052  7256  7558  303  monoheme cytochrome c  YP_001048412  normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0007  CDS  NC_009052  7560  8786  1227  oxidoreductase, molybdopterin binding  YP_001048413  normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0008  CDS  NC_009052  8786  9169  384  monoheme cytochrome c, putative  YP_001048414  normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0009  CDS  NC_009052  9166  9501  336  monoheme cytochrome c  YP_001048415  normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0010  CDS  NC_009052  9592  10512  921  urea amidolyase related protein  YP_001048416  normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0011  CDS  NC_009052  10846  11886  1041  putative signal transduction protein  YP_001048417  normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0012  CDS  NC_009052  11974  14043  2070  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  YP_001048418  normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0013  CDS  NC_009052  14054  14959  906  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  YP_001048419  normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0014  CDS  NC_009052  15077  15691  615  DNA-3-methyladenine glycosylase I  YP_001048420  normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0015  CDS  NC_009052  15877  17673  1797  amidohydrolase  YP_001048421  normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0016  CDS  NC_009052  17727  19064  1338  WD40 domain-containing protein  YP_001048422  normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0017  CDS  NC_009052  19327  19773  447  hypothetical protein  YP_001048423  normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0018  CDS  NC_009052  19822  20067  246  sulfur transfer protein SirA  YP_001048424  normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0019    NC_009052  20238  21400  1163      normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0020  CDS  NC_009052  21644  22807  1164  3-ketoacyl-CoA thiolase  YP_001048425  normal  0.237064  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0021  CDS  NC_009052  22830  24980  2151  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  YP_001048426  decreased coverage  0.000906563  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0022  CDS  NC_009052  25471  26793  1323  proline dipeptidase  YP_001048427  normal  0.0718408  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0023  CDS  NC_009052  26821  27351  531  hypothetical protein  YP_001048428  normal  0.0828384  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0024  CDS  NC_009052  27513  28970  1458  TrkH family potassium uptake protein  YP_001048429  normal  0.0989593  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0025  CDS  NC_009052  28973  29497  525  protoporphyrinogen oxidase  YP_001048430  normal  0.0214113  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0026  CDS  NC_009052  29560  29868  309  regulatory protein, ArsR  YP_001048431  hitchhiker  0.000871967  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0027  CDS  NC_009052  30069  30620  552  protoporphyrinogen oxidase  YP_001048432  normal  0.0370554  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0028  CDS  NC_009052  30655  32097  1443  TrkH family potassium uptake protein  YP_001048433  normal  0.172554  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0029  CDS  NC_009052  32118  33527  1410  potassium transporter peripheral membrane component  YP_001048434  normal  0.313972  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0030  CDS  NC_009052  33543  34829  1287  sun protein  YP_001048435  normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0031  CDS  NC_009052  34831  35787  957  methionyl-tRNA formyltransferase  YP_001048436  normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0032  CDS  NC_009052  35796  36308  513  peptide deformylase  YP_001048437  normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0033  CDS  NC_009052  36434  37564  1131  peptidoglycan-binding LysM  YP_001048438  normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0034  CDS  NC_009052  37648  38664  1017  DNA protecting protein DprA  YP_001048439  normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0035  CDS  NC_009052  38667  39140  474  hypothetical protein  YP_001048440  normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0036  CDS  NC_009052  39254  39823  570  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  YP_001048441  normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0037  CDS  NC_009052  39950  40516  567  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  YP_001048442  normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0038  CDS  NC_009052  40542  41450  909  coproporphyrinogen III oxidase  YP_001048443  normal  0.893663  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0039  CDS  NC_009052  41485  41922  438  globin  YP_001048444  normal  0.372259  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0040  CDS  NC_009052  42076  42924  849  shikimate 5-dehydrogenase  YP_001048445  normal  0.0916944  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0041  CDS  NC_009052  42930  43205  276  hypothetical protein  YP_001048446  hitchhiker  0.00282046  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0042  CDS  NC_009052  43325  43873  549  carbonic anhydrase  YP_001048447  hitchhiker  4.54133e-06  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0043  CDS  NC_009052  49791  52241  2451  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  YP_001048448  normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0044  CDS  NC_009052  52198  53181  984  alpha/beta hydrolase fold  YP_001048449  normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0045  CDS  NC_009052  53277  55088  1812  hypothetical protein  YP_001048450  normal  0.227814  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0046  CDS  NC_009052  55299  56294  996  adenosine deaminase  YP_001048451  normal  0.105714  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0047  CDS  NC_009052  56389  57729  1341  coproporphyrinogen III oxidase  YP_001048452  normal  0.577126  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0048  CDS  NC_009052  58027  58494  468  hypothetical protein  YP_001048453  normal  0.125105  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0049  CDS  NC_009052  58569  59129  561  hypothetical protein  YP_001048454  normal  0.0161486  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0050  CDS  NC_009052  59220  59858  639  hypothetical protein  YP_001048455  hitchhiker  0.00137393  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0051  CDS  NC_009052  60679  61302  624  cytochrome c class I  YP_001048456  hitchhiker  0.00284279  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0052  CDS  NC_009052  61471  62130  660  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  YP_001048457  normal  0.0150543  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0053  CDS  NC_009052  63394  66159  2766  DNA polymerase I  YP_001048458  unclonable  9.15793e-06  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0054  CDS  NC_009052  66547  67209  663  isoprenoid biosynthesis protein with amidotransferase-like domain  YP_001048459  hitchhiker  1.50521e-08  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0055  CDS  NC_009052  67291  68136  846  rhomboid family protein  YP_001048460  hitchhiker  0.000850289  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0056  CDS  NC_009052  68133  68438  306  rhodanese domain-containing protein  YP_001048461  hitchhiker  0.000464911  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0057  CDS  NC_009052  68540  69565  1026  L-threonine 3-dehydrogenase  YP_001048462  normal  0.0451496  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0058  CDS  NC_009052  69577  70770  1194  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  YP_001048463  normal  0.0257506  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0059  CDS  NC_009052  71058  71705  648  TetR family transcriptional regulator  YP_001048464  normal  0.0273669  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0060  CDS  NC_009052  71848  73113  1266  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain-containing protein  YP_001048465  normal  0.0175764  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0061  CDS  NC_009052  73139  73894  756  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  YP_001048466  normal  0.0783873  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0062  CDS  NC_009052  73994  75058  1065  glycosyl transferase family protein  YP_001048467  normal  0.982764  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0063  CDS  NC_009052  75068  76138  1071  hypothetical protein  YP_001048468  normal  0.573919  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0064  CDS  NC_009052  76123  77178  1056  hypothetical protein  YP_001048469  normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0065  CDS  NC_009052  77211  77960  750  glycosyl transferase family protein  YP_001048470  normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0066  CDS  NC_009052  78044  79156  1113  glycosyl transferase, group 1  YP_001048471  normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0067  CDS  NC_009052  79156  80277  1122  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  YP_001048472  normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0068  CDS  NC_009052  80574  81065  492  phosphopantetheine adenylyltransferase  YP_001048473  normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0069  CDS  NC_009052  81156  82631  1476  hypothetical protein  YP_001048474  normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0070  CDS  NC_009052  82697  83704  1008  NAD-dependent epimerase/dehydratase  YP_001048475  normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0071  CDS  NC_009052  83728  84891  1164  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  YP_001048476  normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0072  CDS  NC_009052  85100  85810  711  glycosyl transferase family protein  YP_001048477  normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0073  CDS  NC_009052  85831  86151  321  hypothetical protein  YP_001048478  normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0074    NC_009052  86215  86571  357      normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0075  CDS  NC_009052  86634  87449  816  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  YP_001048479  normal  0.495543  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0076  CDS  NC_009052  87485  87940  456  hypothetical protein  YP_001048480  normal  0.928332  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0077  CDS  NC_009052  88030  89013  984  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  YP_001048481  normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0078  CDS  NC_009052  89030  90841  1812  putative bifunctional molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein MobB/MoeA  YP_001048482  normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0079  CDS  NC_009052  90875  91465  591  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  YP_001048483  normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0080  CDS  NC_009052  91449  92159  711  ABC transporter related  YP_001048484  normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0081  CDS  NC_009052  92163  92870  708  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_001048485  normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0082  CDS  NC_009052  92867  93691  825  extracellular solute-binding protein  YP_001048486  normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0083  CDS  NC_009052  93928  95358  1431  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  YP_001048487  normal  0.701237  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0084  CDS  NC_009052  95360  97513  2154  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  YP_001048488  normal  0.0273141  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0085  CDS  NC_009052  97864  98322  459  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_001048489  hitchhiker  0.00857587  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0086  CDS  NC_009052  98423  99082  660  hypothetical protein  YP_001048490  normal  0.084364  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0087  CDS  NC_009052  99315  100055  741  hypothetical protein  YP_001048491  normal  0.621841  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0088  CDS  NC_009052  100068  101426  1359  isochorismate synthase  YP_001048492  normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0089  CDS  NC_009052  101851  103974  2124  TonB-dependent receptor, plug  YP_001048493  normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0090  CDS  NC_009052  103976  105346  1371  ABC transporter related  YP_001048494  normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0091  CDS  NC_009052  105336  106016  681  cobalt transport protein  YP_001048495  normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0092  CDS  NC_009052  106009  106551  543  hypothetical protein  YP_001048496  normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0093  CDS  NC_009052  106581  107033  453  hypothetical protein  YP_001048497  normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0094  CDS  NC_009052  107054  107320  267  hypothetical protein  YP_001048498  normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0095  CDS  NC_009052  107359  107598  240  hypothetical protein  YP_001048499  normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0096  CDS  NC_009052  107832  109022  1191  metal dependent phosphohydrolase  YP_001048500  normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0097  CDS  NC_009052  109135  109770  636  paraquat-inducible protein A  YP_001048501  normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0098  CDS  NC_009052  109845  110150  306  hypothetical protein  YP_001048502  normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0099  CDS  NC_009052  110147  113200  3054  CzcA family heavy metal efflux protein  YP_001048503  normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal_0100  CDS  NC_009052  113202  114230  1029  hypothetical protein  YP_001048504  normal  n/a    Shewanella baltica OS155  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 48    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>