1898 genes were found for organism Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 19    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
LGAS_0001  CDS  NC_008530  102  1496  1395  chromosomal replication initiation protein  YP_813856  hitchhiker  1.3935e-05  decreased coverage  1.67388e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0002  CDS  NC_008530  1681  2811  1131  DNA polymerase sliding clamp subunit  YP_813857  decreased coverage  1.88302e-11  unclonable  1.4129e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0003  CDS  NC_008530  3089  3238  150  S4-like RNA binding protein  YP_813858  normal  hitchhiker  4.31544e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0004  CDS  NC_008530  3242  4366  1125  recombination protein F  YP_813859  normal  hitchhiker  2.60396e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0005  CDS  NC_008530  4367  6334  1968  DNA gyrase, B subunit  YP_813860  normal  0.452102  hitchhiker  2.32659e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0006  CDS  NC_008530  6345  8834  2490  DNA gyrase, A subunit  YP_813861  hitchhiker  0.000708877  hitchhiker  8.0391e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0007  CDS  NC_008530  9021  9317  297  30S ribosomal protein S6  YP_813862  hitchhiker  6.8559e-10  hitchhiker  2.413e-13  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0008  CDS  NC_008530  9351  9869  519  single-stranded DNA-binding protein  YP_813863  hitchhiker  6.12973e-07  hitchhiker  1.72856e-11  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0009  CDS  NC_008530  9894  10127  234  ribosomal protein S18  YP_813864  hitchhiker  6.9363e-08  hitchhiker  1.01757e-10  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0010  CDS  NC_008530  10222  10908  687  Mg2+ and Co2+ transporter  YP_813865  hitchhiker  0.000139051  hitchhiker  1.9085e-10  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0011  CDS  NC_008530  11245  13263  2019  signal protein  YP_813866  hitchhiker  0.00560638  hitchhiker  7.33083e-08  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0012  CDS  NC_008530  13266  13730  465  50S ribosomal protein L9  YP_813867  normal  0.181348  hitchhiker  2.09307e-05  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0013  CDS  NC_008530  13733  15106  1374  replicative DNA helicase  YP_813868  normal  hitchhiker  4.49355e-05  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0014  CDS  NC_008530  15201  16085  885  transcriptional regulator and fructokinase  YP_813869  normal  hitchhiker  0.000579085  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0015  CDS  NC_008530  16159  17301  1143  hypothetical protein  YP_813870  normal  normal  0.0111158  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0016  CDS  NC_008530  17430  19448  2019  hypothetical protein  YP_813871  normal  normal  0.0164555  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0017  CDS  NC_008530  19556  20257  702  Mg2+ transporter  YP_813872  normal  normal  0.0915905  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0019  CDS  NC_008530  20749  21375  627  phosphatase  YP_813873  normal  normal  0.379676  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0020  CDS  NC_008530  21739  21951  213  transcriptional regulator  YP_813874  normal  normal  0.555038  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0021  CDS  NC_008530  21954  22472  519  hypothetical protein  YP_813875  normal  normal  0.614815  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0022  CDS  NC_008530  22512  23558  1047  oxidoreductase  YP_813876  decreased coverage  0.00128895  normal  0.715289  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0024  CDS  NC_008530  23795  24955  1161  acetyltransferase  YP_813877  normal  0.0751333  normal  0.978526  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0025  CDS  NC_008530  25106  25753  648  putative NADH-flavin reductase  YP_813878  normal  0.0898967  normal  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0026  CDS  NC_008530  25806  26549  744  integral membrane protein  YP_813879  normal  0.667689  normal  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0027  CDS  NC_008530  26636  27343  708  HAD superfamily hydrolase  YP_813880  normal  normal  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0028  CDS  NC_008530  27379  28218  840  hypothetical protein  YP_813881  normal  normal  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0029  CDS  NC_008530  28330  28515  186  hypothetical protein  YP_813882  normal  normal  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0030  CDS  NC_008530  28890  30812  1923  translation elongation factor (GTPase)  YP_813883  normal  normal  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0031  CDS  NC_008530  30847  31773  927  Mg2+ and Co2+ transporter  YP_813884  normal  normal  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0032  CDS  NC_008530  32036  32227  192  general stress response protein  YP_813885  normal  normal  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0033  CDS  NC_008530  32262  32528  267  hypothetical protein  YP_813886  normal  normal  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0034  CDS  NC_008530  32664  33491  828  exonuclease III  YP_813887  normal  normal  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0035  CDS  NC_008530  33548  36397  2850  superfamily II DNA/RNA helicase  YP_813888  normal  0.0259774  normal  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0036  CDS  NC_008530  36492  37379  888  alpha/beta hydrolase superfamily protein  YP_813889  normal  0.0152607  normal  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0037  CDS  NC_008530  37367  37504  138  hypothetical protein  YP_813890  normal  normal  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0038  CDS  NC_008530  37424  37675  252  hypothetical protein  YP_813891  normal  normal  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0039  CDS  NC_008530  37786  38835  1050  permease  YP_813892  normal  normal  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0040  CDS  NC_008530  39078  40409  1332  glutathione reductase  YP_813893  normal  normal  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0041  CDS  NC_008530  40454  41608  1155  IMP dehydrogenase/GMP reductase  YP_813894  normal  normal  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0042  CDS  NC_008530  41682  42257  576  lysophospholipase L1 related esterase  YP_813895  normal  normal  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0043  CDS  NC_008530  42332  43363  1032  D-lactate dehydrogenase, LdhA  YP_813896  decreased coverage  0.000238116  normal  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0044  CDS  NC_008530  43603  46224  2622  adhesion exoprotein  YP_813897  normal  normal  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0045  CDS  NC_008530  46590  57668  11079  adhesion exoprotein  YP_813898  normal  normal  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0046  CDS  NC_008530  57837  60794  2958  adhesion exoprotein  YP_813899  normal  normal  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0047  CDS  NC_008530  60863  62347  1485  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  YP_813900  normal  normal  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0048  CDS  NC_008530  62531  63457  927  transcriptional regulator  YP_813901  normal  normal  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0049  CDS  NC_008530  63587  65437  1851  fumarate reductase flavoprotein subunit  YP_813902  hitchhiker  0.00375543  normal  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0050  CDS  NC_008530  65528  66892  1365  branched-chain amino acid permease  YP_813903  unclonable  3.77191e-11  normal  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0051  CDS  NC_008530  66959  67672  714  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  YP_813904  normal  0.181609  normal  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0052  CDS  NC_008530  67716  68630  915  prolyl aminopeptidase  YP_813905  normal  0.946601  normal  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0053  CDS  NC_008530  68765  69367  603  hypothetical protein  YP_813906  normal  normal  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0054  CDS  NC_008530  69430  70380  951  conjugated bile salt hydrolase-like protein  YP_813907  normal  normal  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0055  CDS  NC_008530  70398  71753  1356  conjugated bile Salt transporter  YP_813908  normal  normal  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0056    NC_008530  71778  73124  1347      normal  normal  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0057  CDS  NC_008530  73311  74171  861  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  YP_813909  normal  0.870618  normal  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0058  CDS  NC_008530  74168  75118  951  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  YP_813910  decreased coverage  0.0031105  normal  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0059  CDS  NC_008530  75131  76084  954  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  YP_813911  hitchhiker  0.00101  normal  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0060  CDS  NC_008530  76114  76938  825  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  YP_813912  hitchhiker  0.00709812  normal  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0061  CDS  NC_008530  76935  77717  783  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  YP_813913  normal  0.0168338  normal  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0064  CDS  NC_008530  78181  78888  708  DNA-binding response regulator  YP_813914  normal  0.611294  normal  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0065  CDS  NC_008530  78920  80785  1866  Signal transduction histidine kinase  YP_813915  normal  normal  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0066  CDS  NC_008530  80679  82103  1425  hypothetical protein  YP_813916  decreased coverage  0.000449157  normal  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0067  CDS  NC_008530  82093  82914  822  hypothetical protein  YP_813917  normal  0.206847  normal  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0068  CDS  NC_008530  82921  83718  798  beta-lactamase superfamily hydrolase  YP_813918  normal  normal  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0069  CDS  NC_008530  83766  85025  1260  trypsin-like serine protease  YP_813919  normal  0.0357916  normal  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0070  CDS  NC_008530  85539  86018  480  rRNA large subunit methyltransferase  YP_813920  decreased coverage  1.7339e-07  normal  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0071  CDS  NC_008530  86019  86672  654  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  YP_813921  hitchhiker  0.00121752  normal  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0072  CDS  NC_008530  86686  88038  1353  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  YP_813922  normal  normal  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0073  CDS  NC_008530  88019  88603  585  ABC-type cobalt transport system, permease component  YP_813923  normal  normal  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0074  CDS  NC_008530  88813  89742  930  AraC-type DNA-binding protein, response regulator  YP_813924  normal  normal  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0075  CDS  NC_008530  89782  90672  891  heat shock protein HtpX  YP_813925  normal  normal  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0076  CDS  NC_008530  90681  91238  558  hypothetical protein  YP_813926  normal  0.071632  normal  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0077  CDS  NC_008530  91355  92461  1107  di- and tricarboxylate transporter  YP_813927  hitchhiker  1.54883e-11  normal  0.998926  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0078  CDS  NC_008530  92638  93048  411  hypothetical protein  YP_813928  hitchhiker  1.34929e-12  normal  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0079  CDS  NC_008530  93127  93267  141  hypothetical protein  YP_813929  hitchhiker  3.11504e-13  normal  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0080  CDS  NC_008530  93441  94301  861  hypothetical protein  YP_813930  hitchhiker  2.15459e-07  normal  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0081  CDS  NC_008530  94434  95741  1308  glycosyltransferase  YP_813931  hitchhiker  3.23026e-06  normal  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0082  CDS  NC_008530  95751  96869  1119  endoglucanase Y  YP_813932  hitchhiker  5.32728e-08  normal  0.916342  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0083  CDS  NC_008530  96984  97628  645  HD superfamily hydrolase  YP_813933  hitchhiker  1.42377e-08  normal  0.689622  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0084  CDS  NC_008530  97630  98559  930  restriction endonuclease  YP_813934  hitchhiker  2.99612e-07  normal  0.866494  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0085  CDS  NC_008530  98606  99370  765  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  YP_813935  hitchhiker  2.03236e-07  normal  0.523772  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0086  CDS  NC_008530  99354  100967  1614  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  YP_813936  normal  0.0796672  normal  0.210719  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0087  CDS  NC_008530  101303  101872  570  3-methyladenine DNA glycosylase  YP_813937  normal  normal  0.0848019  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0088  CDS  NC_008530  101960  102358  399  hypothetical protein  YP_813938  normal  normal  0.0412988  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0089  CDS  NC_008530  102355  103137  783  hypothetical protein  YP_813939  normal  normal  0.0183454  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0090  CDS  NC_008530  103124  103654  531  methylated DNA-protein cysteine methyltransferase  YP_813940  normal  normal  0.0169354  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0091  CDS  NC_008530  103770  104483  714  NAD-dependent deacetylase  YP_813941  normal  normal  0.0206655  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0092  CDS  NC_008530  104529  105083  555  hypothetical protein  YP_813942  normal  normal  0.0117124  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0093  CDS  NC_008530  105164  106555  1392  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  YP_813943  normal  hitchhiker  0.00325157  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0094  CDS  NC_008530  106639  107346  708  Zn-dependent protease  YP_813944  normal  hitchhiker  0.00198706  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0095  CDS  NC_008530  107370  108293  924  alpha/beta hydrolase superfamily protein  YP_813945  normal  hitchhiker  0.00130774  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0096  CDS  NC_008530  108377  109132  756  RNase H  YP_813946  normal  hitchhiker  0.000638062  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0097  CDS  NC_008530  109292  110260  969  hypothetical protein  YP_813947  normal  hitchhiker  0.000152524  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0098  CDS  NC_008530  110388  111218  831  glycosyltransferase-like protein  YP_813948  normal  hitchhiker  8.50354e-06  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0099  CDS  NC_008530  111243  111905  663  alpha/beta fold family hydrolase  YP_813949  normal  hitchhiker  6.75213e-06  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0100  CDS  NC_008530  111994  112356  363  hypothetical protein  YP_813950  hitchhiker  0.00539643  hitchhiker  1.09189e-06  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0101  CDS  NC_008530  112437  113429  993  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  YP_813951  hitchhiker  6.30999e-08  hitchhiker  2.029e-06  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0102  CDS  NC_008530  113581  114795  1215  immunity protein PlnI  YP_813952  unclonable  2.9241e-12  hitchhiker  1.03836e-06  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0103  CDS  NC_008530  114928  116277  1350  gamma-aminobutyrate permease related permease  YP_813953  hitchhiker  1.03198e-05  hitchhiker  4.6337e-07  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
LGAS_0104  CDS  NC_008530  116451  117110  660  transcriptional regulator  YP_813954  hitchhiker  7.98599e-06  hitchhiker  1.02912e-07  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 19    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>