43 genes were found for organism Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Noc_A0001  CDS  NC_007483  280  1080  801  hypothetical protein  YP_342044  hitchhiker  0.00000235069  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_A0002  CDS  NC_007483  1158  1667  510  hypothetical protein  YP_342045  decreased coverage  0.0000000768855  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_A0003  CDS  NC_007483  2201  2569  369  HicB  YP_342046  hitchhiker  0.00000193039  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_A0004  CDS  NC_007483  2559  2807  249  hypothetical protein  YP_342047  hitchhiker  0.000106314  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_A0005  CDS  NC_007483  2832  4016  1185  hypothetical protein  YP_342048  normal  0.0305482  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_A0006  CDS  NC_007483  4566  4880  315  hypothetical protein  YP_342049  normal  0.171718  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_A0007  CDS  NC_007483  4877  5398  522  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  YP_342050  normal  0.24859  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_A0008  CDS  NC_007483  5468  6664  1197  endonuclease/exonuclease/phosphatase  YP_342051  normal  0.203843  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_A0009  CDS  NC_007483  6835  7242  408  hypothetical protein  YP_342052  normal  0.146683  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_A0010  CDS  NC_007483  7307  8122  816  restriction endonuclease  YP_342053  normal  0.139024  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_A0011  CDS  NC_007483  8165  8899  735  hypothetical protein  YP_342054  normal  0.0855925  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_A0012  CDS  NC_007483  8874  9557  684  hypothetical protein  YP_342055  normal  0.418543  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_A0013  CDS  NC_007483  9856  10629  774  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  YP_342056  normal  0.690723  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_A0014  CDS  NC_007483  10622  11476  855  ParB-like partition protein  YP_342057  normal  0.357809  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_A0015  CDS  NC_007483  12194  13126  933  Phage integrase  YP_342058  normal  0.230922  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_A0016  CDS  NC_007483  13208  13576  369  hypothetical protein  YP_342059  normal  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_A0017  CDS  NC_007483  13795  14664  870  hypothetical protein  YP_342060  normal  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_A0018  CDS  NC_007483  14970  15236  267  hypothetical protein  YP_342061  normal  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_A0019  CDS  NC_007483  15233  16756  1524  hypothetical protein  YP_342062  normal  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_A0020  CDS  NC_007483  16960  18171  1212  hypothetical protein  YP_342063  normal  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_A0021  CDS  NC_007483  18405  18974  570  resolvase-like protein  YP_342064  normal  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_A0022  CDS  NC_007483  19141  19572  432  hypothetical protein  YP_342065  normal  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_A0023  CDS  NC_007483  19584  20546  963  hypothetical protein  YP_342066  normal  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_A0024  CDS  NC_007483  20568  20801  234  hypothetical protein  YP_342067  normal  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_A0025  CDS  NC_007483  21149  22069  921  hypothetical protein  YP_342068  normal  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_A0026  CDS  NC_007483  22070  22927  858  hypothetical protein  YP_342069  normal  0.867937  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_A0027  CDS  NC_007483  23032  23292  261  WGR  YP_342070  normal  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_A0028  CDS  NC_007483  24008  26758  2751  hypothetical protein  YP_342071  normal  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_A0029  CDS  NC_007483  26762  28843  2082  helicase-like  YP_342072  normal  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_A0030  CDS  NC_007483  28840  30180  1341  hypothetical protein  YP_342073  normal  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_A0031  CDS  NC_007483  30793  31803  1011  Abi-like  YP_342074  normal  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_A0032  CDS  NC_007483  32615  33721  1107  membrane-bound metal-dependent hydrolase  YP_342075  normal  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_A0033  CDS  NC_007483  33725  34057  333  PemK-like protein  YP_342076  normal  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_A0034  CDS  NC_007483  34032  34265  234  hypothetical protein  YP_342077  normal  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_A0035  CDS  NC_007483  34329  35051  723  hypothetical protein  YP_342078  normal  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_A0036  CDS  NC_007483  35131  35970  840  hypothetical protein  YP_342079  normal  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_A0037  CDS  NC_007483  35945  36181  237  hypothetical protein  YP_342080  normal  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_A0038  CDS  NC_007483  36262  36597  336  XRE family transcriptional regulator  YP_342081  normal  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_A0039  CDS  NC_007483  37051  37818  768  hypothetical protein  YP_342082  normal  0.937865  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_A0040  CDS  NC_007483  38194  38472  279  hypothetical protein  YP_342083  normal  0.0861806  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_A0041  CDS  NC_007483  38614  38844  231  XRE family transcriptional regulator  YP_342084  normal  0.0512908  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_A0042  CDS  NC_007483  39092  39592  501  siphovirus Gp157  YP_342085  hitchhiker  0.00558238  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Noc_A0043  CDS  NC_007483  39651  40415  765  hypothetical protein  YP_342086  hitchhiker  0.000276027  n/a    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>