4107 genes were found for organism Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 42    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Nham_0001  CDS  NC_007964  107  1534  +  1428  chromosomal replication initiation protein  YP_575363  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0002  CDS  NC_007964  1738  2856  +  1119  DNA polymerase III subunit beta  YP_575364  normal  0.0730917  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0003  CDS  NC_007964  3021  4160  +  1140  recombination protein F  YP_575365  normal  0.0714428  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0004  CDS  NC_007964  4459  6900  +  2442  DNA gyrase subunit B  YP_575366  normal  0.0771659  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0005  CDS  NC_007964  7095  8228  -  1134  hypothetical protein  YP_575367  hitchhiker  0.00809476  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0006  CDS  NC_007964  8563  9120  +  558  hypothetical protein  YP_575368  normal  0.0161432  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0007  CDS  NC_007964  9150  9896  -  747  hypothetical protein  YP_575369  hitchhiker  0.00581263  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0008  CDS  NC_007964  9957  10241  -  285  hypothetical protein  YP_575370  hitchhiker  0.00922624  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0009  CDS  NC_007964  10492  11412  +  921  Pirin-like  YP_575371  decreased coverage  0.00543202  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0010  CDS  NC_007964  11419  12420  -  1002  PfkB  YP_575372  decreased coverage  0.00317456  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0011  CDS  NC_007964  12511  14100  +  1590  integral membrane protein MviN  YP_575373  normal  0.0295348  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0012  CDS  NC_007964  14196  15239  +  1044  tryptophanyl-tRNA synthetase  YP_575374  normal  0.0108214  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0013  CDS  NC_007964  15511  15861  +  351  ISGsu3, transposase  YP_575375  normal  0.0180659  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0014  CDS  NC_007964  15896  16621  +  726  transposase, IS4  YP_575376  normal  0.0462942  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0015  CDS  NC_007964  16865  17359  +  495  hypothetical protein  YP_575377  normal  0.0940017  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0016  CDS  NC_007964  17538  18113  +  576  nitrogen-fixing NifU-like  YP_575378  hitchhiker  0.00443934  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0017  CDS  NC_007964  18143  19273  -  1131  hypothetical protein  YP_575379  normal  0.0357647  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0018  CDS  NC_007964  19577  20275  +  699  peptidase M22, glycoprotease  YP_575380  normal  0.0268782  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0019  CDS  NC_007964  20272  20754  +  483  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  YP_575381  normal  0.0323693  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0020  CDS  NC_007964  20911  21360  +  450  ferric uptake regulator family protein  YP_575382  normal  0.0165645  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0021  CDS  NC_007964  21543  22964  +  1422  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  YP_575383  normal  0.0287805  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0022  CDS  NC_007964  22969  24018  +  1050  PhoH-like protein  YP_575384  normal  0.232507  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0023  CDS  NC_007964  24020  24592  +  573  hypothetical protein  YP_575385  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0024  CDS  NC_007964  24593  25717  +  1125  CBS:transporter-associated  YP_575386  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0025  CDS  NC_007964  25714  27339  +  1626  apolipoprotein N-acyltransferase  YP_575387  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0026  CDS  NC_007964  27538  27957  +  420  XRE family transcriptional regulator  YP_575388  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0027  CDS  NC_007964  27995  28762  +  768  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  YP_575389  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0028  CDS  NC_007964  29091  29882  +  792  hypothetical protein  YP_575390  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0029  CDS  NC_007964  29886  31496  +  1611  transcription elongation factor NusA  YP_575391  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0030  CDS  NC_007964  31572  32237  +  666  hypothetical protein  YP_575392  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0031  CDS  NC_007964  32305  34911  +  2607  translation initiation factor IF-2  YP_575393  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0032  CDS  NC_007964  35047  35460  +  414  ribosome-binding factor A  YP_575394  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0033  CDS  NC_007964  35466  36704  +  1239  tRNA pseudouridine synthase B  YP_575395  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0034  CDS  NC_007964  36707  36976  +  270  30S ribosomal protein S15  YP_575396  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0035  CDS  NC_007964  37219  39465  +  2247  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  YP_575397  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0036  CDS  NC_007964  39679  40584  -  906  LysR family transcriptional regulator  YP_575398  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0037  CDS  NC_007964  40839  43028  +  2190  catalase/peroxidase HPI  YP_575399  normal  0.539585  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0038    NC_007964  43211  43654  +  444      normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0039  CDS  NC_007964  43662  44258  +  597  glutathione S-transferase-like  YP_575400  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0040  CDS  NC_007964  44413  45261  -  849  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  YP_575401  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0041  CDS  NC_007964  45427  46650  -  1224  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  YP_575402  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0042  CDS  NC_007964  46736  47260  -  525  3-hydroxydecanoyl-(acyl carrier protein) dehydratase  YP_575403  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0043  CDS  NC_007964  48031  48528  +  498  ferric uptake regulator family protein  YP_575404  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0044  CDS  NC_007964  48625  49182  -  558  hypothetical protein  YP_575405  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0045  CDS  NC_007964  49669  50670  +  1002  glycolate reductase  YP_575406  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0046  CDS  NC_007964  50818  51618  -  801  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  YP_575407  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0047  CDS  NC_007964  51840  53186  +  1347  peptidoglycan binding domain-containing protein  YP_575408  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0048  CDS  NC_007964  53229  54110  -  882  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  YP_575409  normal  0.683783  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0049  CDS  NC_007964  54202  54963  +  762  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  YP_575410  normal  0.522687  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0050  CDS  NC_007964  54972  56528  +  1557  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  YP_575411  normal  0.725319  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0051  CDS  NC_007964  56591  58030  +  1440  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  YP_575412  normal  0.0750975  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0052  CDS  NC_007964  58027  58485  +  459  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  YP_575413  normal  0.794931  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0053  CDS  NC_007964  58867  61383  +  2517  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  YP_575414  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0054  CDS  NC_007964  61380  62903  +  1524  hypothetical protein  YP_575415  normal  0.885213  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0055  CDS  NC_007964  63003  63323  +  321  hypothetical protein  YP_575416  normal  0.555564  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0056  CDS  NC_007964  63590  64312  +  723  nucleotidyl transferase  YP_575417  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0057  CDS  NC_007964  64411  67560  +  3150  hypothetical protein  YP_575418  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0058  CDS  NC_007964  67557  71045  +  3489  UvrD/REP helicase  YP_575419  normal  0.106754  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0059  CDS  NC_007964  71144  71464  +  321  thioredoxin  YP_575420  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0060  CDS  NC_007964  71708  73036  -  1329  FolC bifunctional protein  YP_575421  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0061  CDS  NC_007964  73033  73977  -  945  acetyl-CoA carboxylase subunit beta  YP_575422  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0062  CDS  NC_007964  74164  75000  -  837  tryptophan synthase subunit alpha  YP_575423  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0063  CDS  NC_007964  74997  76241  -  1245  tryptophan synthase subunit beta  YP_575424  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0064  CDS  NC_007964  76389  77066  -  678  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  YP_575425  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0065  CDS  NC_007964  77344  77691  -  348  hypothetical protein  YP_575426  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0066  CDS  NC_007964  77777  78082  -  306  integration host factor subunit beta  YP_575427  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0067  CDS  NC_007964  78251  79228  -  978  signal peptide peptidase SppA, 36K type  YP_575428  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0068  CDS  NC_007964  79411  80151  -  741  CysZ-like protein  YP_575429  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0069  CDS  NC_007964  80250  80744  -  495  hypothetical protein  YP_575430  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0070  CDS  NC_007964  80741  81676  -  936  hypothetical protein  YP_575431  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0071  CDS  NC_007964  81788  83302  +  1515  twin-arginine translocation pathway signal  YP_575432  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0072  CDS  NC_007964  83299  83970  +  672  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  YP_575433  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0073  CDS  NC_007964  84211  86664  -  2454  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  YP_575434  normal  0.252873  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0074  CDS  NC_007964  86661  87767  -  1107  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit alpha  YP_575435  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0075  CDS  NC_007964  87949  88308  -  360  50S ribosomal protein L20  YP_575436  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0076  CDS  NC_007964  88378  88578  -  201  50S ribosomal protein L35  YP_575437  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0077  CDS  NC_007964  88906  89421  -  516  translation initiation factor IF-3  YP_575438  normal  0.646828  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0078  CDS  NC_007964  89676  90449  +  774  hypothetical protein  YP_575439  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0079  CDS  NC_007964  90511  92751  -  2241  hypothetical protein  YP_575440  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0080  CDS  NC_007964  93054  94781  -  1728  putative PAS/PAC sensor protein  YP_575441  normal  0.23298  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0081  CDS  NC_007964  95549  96481  +  933  thioredoxin-related  YP_575442  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0082  CDS  NC_007964  96539  97213  +  675  peptidase S16, lon-like  YP_575443  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0083  CDS  NC_007964  97255  97452  +  198  hypothetical protein  YP_575444  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0084  CDS  NC_007964  97735  99084  -  1350  ammonium transporter  YP_575445  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0085  CDS  NC_007964  99122  99460  -  339  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  YP_575446  normal  0.308979  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0086  CDS  NC_007964  99872  100210  -  339  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  YP_575447  normal  0.0840353  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0087  CDS  NC_007964  100358  101218  -  861  acyl-CoA thioesterase II  YP_575448  normal  0.0787884  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0088  CDS  NC_007964  101377  102597  +  1221  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  YP_575449  normal  0.231112  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0089  CDS  NC_007964  102806  104077  +  1272  aminotransferase, class I and II  YP_575450  normal  0.789487  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0090  CDS  NC_007964  104090  106597  +  2508  cell divisionFtsK/SpoIIIE  YP_575451  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0091  CDS  NC_007964  106840  107859  +  1020  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  YP_575452  normal  0.296297  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0092  CDS  NC_007964  107936  108817  +  882  exodeoxyribonuclease III (xth)  YP_575453  normal  0.209408  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0093  CDS  NC_007964  108887  109336  -  450  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  YP_575454  normal  0.132878  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0094  CDS  NC_007964  109421  110107  -  687  two component transcriptional regulator  YP_575455  normal  0.402679  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0095  CDS  NC_007964  110256  110897  +  642  hypothetical protein  YP_575456  normal  0.250747  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0096  CDS  NC_007964  111017  111694  -  678  hypothetical protein  YP_575457  normal  0.480165  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0097  CDS  NC_007964  111728  112432  -  705  glutathione S-transferase-like  YP_575458  normal  0.472902  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0098  CDS  NC_007964  112586  115222  +  2637  leucyl-tRNA synthetase  YP_575459  normal  1  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0099  CDS  NC_007964  115209  115793  +  585  hypothetical protein  YP_575460  normal  0.485401  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Nham_0100  CDS  NC_007964  115805  116833  +  1029  DNA polymerase III subunit delta  YP_575461  normal  0.427702  n/a    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 42    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>