2008 genes were found for organism Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 21    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
STER_0001  CDS  NC_008532  101  1465  1365  chromosomal replication initiation protein  YP_819592  normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0002  CDS  NC_008532  1620  2756  1137  DNA polymerase III subunit beta  YP_819593  normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0003  CDS  NC_008532  2825  4081  1257  transposase  YP_819594  normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0004  CDS  NC_008532  4226  4417  192  hypothetical protein  YP_819595  normal  0.0935522  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0005  CDS  NC_008532  4630  5745  1116  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  YP_819596  normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0006  CDS  NC_008532  5818  6387  570  peptidyl-tRNA hydrolase  YP_819597  normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0007  CDS  NC_008532  6380  9886  3507  transcription-repair coupling factor  YP_819598  normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0008  CDS  NC_008532  10072  10347  276  S4 domain-containing protein  YP_819599  normal  0.340534  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0009  CDS  NC_008532  10331  10702  372  cell-cycle protein, MesJ/Ycf62 family, putative  YP_819600  normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0010  CDS  NC_008532  10702  10833  132  hypothetical protein  YP_819601  normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0011  CDS  NC_008532  10830  12122  1293  hypothetical protein  YP_819602  normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0012  CDS  NC_008532  12122  13387  1266  putative cell-cycle protein, MesJ/Ycf62 family  YP_819603  normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0013  CDS  NC_008532  13469  14011  543  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  YP_819604  normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0014  CDS  NC_008532  14027  15994  1968  cell division protein  YP_819605  normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0015  CDS  NC_008532  16037  16936  900  transposase  YP_819606  normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0016  CDS  NC_008532  17393  17929  537  transposase  YP_819607  normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0017    NC_008532  17905  18243  339      normal  0.159602  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0018  CDS  NC_008532  18257  18745  489  transposase  YP_819608  normal  0.163137  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0040  CDS  NC_008532  25595  26425  831  rod shape-determining protein MreC  YP_819609  normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0041  CDS  NC_008532  26427  26951  525  rod shape-determining protein MreD  YP_819610  normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0042  CDS  NC_008532  27036  28403  1368  glucan binding protein  YP_819611  normal  0.634979  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0043  CDS  NC_008532  28617  29582  966  ribose-phosphate pyrophosphokinase  YP_819612  normal  0.270111  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0044    NC_008532  29660  30314  655      normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0045  CDS  NC_008532  30689  31864  1176  aromatic amino acid aminotransferase  YP_819613  normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0046  CDS  NC_008532  31851  32624  774  DNA repair protein RecO  YP_819614  normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0047  CDS  NC_008532  32842  33846  1005  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsX  YP_819615  normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0048  CDS  NC_008532  33846  34091  246  acyl carrier protein  YP_819616  normal  0.858481  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0049  CDS  NC_008532  34376  35083  708  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  YP_819617  normal  0.074199  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0050  CDS  NC_008532  35139  38864  3726  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II (FGAM synthetase)  YP_819618  normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0051  CDS  NC_008532  39033  40472  1440  amidophosphoribosyltransferase  YP_819619  normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0052  CDS  NC_008532  40503  41522  1020  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  YP_819620  normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0053  CDS  NC_008532  41522  42076  555  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  YP_819621  normal  0.243956  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0054  CDS  NC_008532  42145  43692  1548  bifunctional phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase/IMP cyclohydrolase  YP_819622  normal  0.191385  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0055  CDS  NC_008532  43864  44382  519  IS861, transposase (orf1), IS3 family, truncated  YP_819623  normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0056    NC_008532  44376  44984  609      normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0057  CDS  NC_008532  45089  45928  840  cell wall protein precursor, choline binding protein  YP_819624  normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0058  CDS  NC_008532  46237  47499  1263  phosphoribosylamine--glycine ligase  YP_819625  normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0059  CDS  NC_008532  47833  48333  501  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase catalytic subunit  YP_819626  normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0060  CDS  NC_008532  48320  49411  1092  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase ATPase subunit  YP_819627  normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0061    NC_008532  49604  50359  756      normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0062  CDS  NC_008532  50368  50427  60  hypothetical protein  YP_819628  normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0063  CDS  NC_008532  50431  50595  165  hypothetical protein  YP_819629  normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0064  CDS  NC_008532  50874  52172  1299  adenylosuccinate lyase  YP_819630  normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0065  CDS  NC_008532  53036  54727  1692  arginyl-tRNA synthetase  YP_819631  normal  0.079588  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0066  CDS  NC_008532  54885  55310  426  arginine repressor  YP_819632  normal  0.558575  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0067  CDS  NC_008532  55310  55669  360  hypothetical protein  YP_819633  normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0068  CDS  NC_008532  55662  58220  2559  DNA mismatch repair protein MutS  YP_819634  normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0069  CDS  NC_008532  58254  58709  456  hypothetical protein  YP_819635  hitchhiker  0.00773804  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0070  CDS  NC_008532  58723  59097  375  response regulator  YP_819636  hitchhiker  0.000561493  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0071  CDS  NC_008532  59333  59626  294  hypothetical protein  YP_819637  hitchhiker  1.81924e-06  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0072  CDS  NC_008532  59678  61621  1944  DNA mismatch repair protein  YP_819638  normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0073  CDS  NC_008532  61751  61972  222  hypothetical protein  YP_819639  normal  0.0142004  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0074  CDS  NC_008532  62124  62714  591  Holliday junction DNA helicase RuvA  YP_819640  hitchhiker  0.000176454  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0075  CDS  NC_008532  62721  63275  555  3-methyladenine DNA glycosylase  YP_819641  decreased coverage  2.23645e-06  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0076  CDS  NC_008532  63371  64642  1272  competence damage-inducible protein A  YP_819642  normal  0.0110549  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0077  CDS  NC_008532  64678  65817  1140  recombinase A  YP_819643  normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0078  CDS  NC_008532  65994  66392  399  transcriptional regulator Spx  YP_819644  normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0095  CDS  NC_008532  72798  77192  4395  DNA polymerase III PolC  YP_819645  normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0096  CDS  NC_008532  77356  78597  1242  aminopeptidase PepS  YP_819646  normal  0.216815  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0097  CDS  NC_008532  78617  78847  231  hypothetical protein  YP_819647  normal  0.126932  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0098  CDS  NC_008532  78980  79066  87  hypothetical protein  YP_819648  normal  0.0614034  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0099    NC_008532  79050  79379  330      normal  0.0527216  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0100  CDS  NC_008532  79497  80048  552  hypothetical protein  YP_819649  hitchhiker  0.000132763  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0101  CDS  NC_008532  80098  80586  489  transposase  YP_819650  normal  0.163137  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0102    NC_008532  80600  80863  264      normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0103    NC_008532  81478  82368  891      normal  0.320965  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0105  CDS  NC_008532  82956  83723  768  30S ribosomal protein S2  YP_819651  hitchhiker  0.000131996  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0106  CDS  NC_008532  83841  84881  1041  elongation factor Ts  YP_819652  normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0107  CDS  NC_008532  84991  85461  471  hypothetical protein  YP_819653  decreased coverage  0.00969269  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0108  CDS  NC_008532  85705  86160  456  class III stress gene transcriptional regulator  YP_819654  hitchhiker  0.00387323  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0109  CDS  NC_008532  86161  88611  2451  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  YP_819655  normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0110    NC_008532  88739  89971  1233      normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0111  CDS  NC_008532  90195  90881  687  transposase  YP_819656  normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0112  CDS  NC_008532  90896  91765  870  transposase  YP_819657  normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0113  CDS  NC_008532  91828  93081  1254  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase, penicillin-binding protein  YP_819658  normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0114  CDS  NC_008532  93284  95509  2226  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  YP_819659  normal  0.613671  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0115  CDS  NC_008532  95518  96288  771  hypothetical protein  YP_819660  normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0116  CDS  NC_008532  96361  96981  621  serine acetyltransferase  YP_819661  normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0117  CDS  NC_008532  97363  98706  1344  cysteinyl-tRNA synthetase  YP_819662  normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0118  CDS  NC_008532  98699  99100  402  hypothetical protein  YP_819663  normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0119  CDS  NC_008532  99382  99537  156  hypothetical protein  YP_819664  normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0120  CDS  NC_008532  99613  99801  189  hypothetical protein  YP_819665  normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0121  CDS  NC_008532  99872  100114  243  hypothetical protein  YP_819666  normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0122  CDS  NC_008532  100162  100905  744  tRNA/rRNA methyltransferase  YP_819667  normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0123  CDS  NC_008532  100944  101423  480  RNA-binding protein  YP_819668  normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0124  CDS  NC_008532  101432  102292  861  hypothetical protein  YP_819669  normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0125  CDS  NC_008532  102593  103093  501  hypothetical protein  YP_819670  normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0126  CDS  NC_008532  103241  104197  957  2-dehydropantoate 2-reductase  YP_819671  hitchhiker  0.00267865  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0127  CDS  NC_008532  104406  104852  447  50S ribosomal protein L13  YP_819672  unclonable  7.49109e-08  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0128  CDS  NC_008532  104880  105272  393  30S ribosomal protein S9  YP_819673  hitchhiker  6.06121e-07  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0129    NC_008532  105786  106010  225      hitchhiker  2.15968e-06  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0130  CDS  NC_008532  106260  106364  105  hypothetical protein  YP_819674  hitchhiker  7.80681e-07  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0131  CDS  NC_008532  106407  108122  1716  hypothetical protein  YP_819675  normal  0.416084  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0132    NC_008532  108266  109441  1176      normal  0.0586413  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0133    NC_008532  109545  109934  390      decreased coverage  4.90253e-07  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0134  CDS  NC_008532  109965  110810  846  hypothetical protein  YP_819676  hitchhiker  0.00520082  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0135  CDS  NC_008532  110820  110987  168  hypothetical protein  YP_819677  normal  0.0399924  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0136  CDS  NC_008532  111038  111550  513  transcription regulator  YP_819678  normal  0.0628959  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0137  CDS  NC_008532  111672  111776  105  hypothetical protein  YP_819679  normal  0.0547702  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
STER_0138  CDS  NC_008532  111876  113132  1257  transposase  YP_819680  normal  n/a    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 21    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>