364 genes were found for organism Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 4    << first  < prev  1  2  3  4    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
PICST_12709  CDS  NC_009048  283453  284106  -  654  non-histone protein 10  XP_001386648  normal  0.0597181  normal  0.318516  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_14301  CDS  NC_009048  74562  79319  +  4758  predicted protein  XP_001386413  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_16494  CDS  NC_009048  747342  748994  +  1653  Siderophore Iron Transport  XP_001386550  unclonable  0.000000381637  normal  0.145167  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_16628  CDS  NC_009048  712427  713995  -  1569  predicted protein  XP_001386729  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_16856  CDS  NC_009048  628073  629701  -  1629  high affinity xylose transporter (putative) (HGT3)  XP_001386715  normal  0.0752816  normal  0.401981  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_16981  CDS  NC_009048  542934  544640  +  1707  flippase  XP_001386498  normal  1  normal  0.0319066  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_18249  CDS  NC_009048  48984  50642  +  1659  predicted protein  XP_001386411  normal  1  normal  0.354188  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_21174  CDS  NC_009048  547957  548694  -  738  DNA binding transcription factor  XP_001386699  normal  1  normal  0.110005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_25920  CDS  NC_009048  823286  824641  +  1356  predicted protein  XP_001386572  normal  0.0604247  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33613  CDS  NC_009048  2573  3934  -  1362  Monocarboxylate transporter  XP_001386604  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33614  CDS  NC_009048  4787  5098  -  312  Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  XP_001386605  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33619  CDS  NC_009048  23338  24048  -  711  hypothetical protein  XP_001386608  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33621  CDS  NC_009048  28359  30224  -  1866  predicted protein  XP_001386609  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33622  CDS  NC_009048  30461  30760  -  300  predicted protein  XP_001386610  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33639  CDS  NC_009048  80839  83523  -  2685  predicted protein  XP_001386616  normal  0.224011  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33652  CDS  NC_009048  119342  119743  +  402  predicted protein  XP_001386418  normal  0.872927  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33654  CDS  NC_009048  121960  123399  +  1440  predicted protein  XP_001386420  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33656  CDS  NC_009048  125821  126999  +  1179  Quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  XP_001386422  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33673  CDS  NC_009048  183448  185196  -  1749  predicted protein  XP_001386630  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33678  CDS  NC_009048  192966  195149  -  2184  predicted protein  XP_001386633  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33685  CDS  NC_009048  213361  215370  -  2010  predicted protein  XP_001386636  normal  1  normal  0.872469  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33690  CDS  NC_009048  224035  225137  -  1103  Prephenate dehydratase (PDT)  XP_001386638  normal  0.748096  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33699  CDS  NC_009048  245795  248014  -  2220  predicted protein  XP_001386643  normal  0.937531  normal  0.0109087  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33703  CDS  NC_009048  253532  256369  +  2838  Gastrin mucin-like protein  XP_001386447  normal  1  hitchhiker  0.00049554  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33707  CDS  NC_009048  264359  265183  +  825  predicted protein  XP_001386449  normal  0.373247  hitchhiker  0.000185367  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33721  CDS  NC_009048  326614  327536  +  923  predicted protein  XP_001386455  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33722  CDS  NC_009048  329990  332212  -  2223  predicted protein  XP_001386650  normal  1  normal  0.900153  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33726  CDS  NC_009048  337269  338951  +  1683  Glucoamylase GLU1 precursor (Glucan 1,4-alpha-glucosidase) (1,4-alpha-D-glucan glucohydrolase)  XP_001386458  normal  1  normal  0.259511  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33727  CDS  NC_009048  339112  341610  -  2499  conserved hypothetical protein  XP_001386652  normal  1  normal  0.191175  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33737  CDS  NC_009048  364115  365281  -  1167  predicted protein  XP_001386657  normal  0.605326  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33739  CDS  NC_009048  366829  368650  -  1822  mating-type transcriptional regulator (putative)  XP_001386658  normal  0.0111037  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33744  CDS  NC_009048  380042  380380  -  339  SPF1 P-type ATPase  XP_001386662  normal  0.146155  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33746  CDS  NC_009048  386312  387195  -  884  predicted protein  XP_001386663  normal  0.516497  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33753  CDS  NC_009048  399099  399986  -  888  predicted protein  XP_001386666  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33758  CDS  NC_009048  409161  410360  +  1200  predicted protein  XP_001386471  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33765  CDS  NC_009048  431397  432533  +  1137  formate dehydrogenase-like protein  XP_001386476  normal  1  normal  0.108543  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33767  CDS  NC_009048  435132  436481  +  1350  predicted protein  XP_001386478  normal  0.539804  normal  0.198679  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33777  CDS  NC_009048  461713  462940  +  1228  predicted protein  XP_001386480  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33784  CDS  NC_009048  482892  484181  -  1290  predicted protein  XP_001386682  normal  1  normal  0.0856078  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33787  CDS  NC_009048  489732  491492  -  1761  predicted protein  XP_001386684  normal  0.715519  normal  0.121325  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33791  CDS  NC_009048  496033  497270  +  1238  predicted protein  XP_001386488  normal  0.561665  normal  0.280438  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33797  CDS  NC_009048  504933  505712  -  780  predicted protein  XP_001386690  normal  0.0365387  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33798  CDS  NC_009048  506092  507033  +  942  predicted protein  XP_001386489  hitchhiker  0.00086268  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33802  CDS  NC_009048  515322  517934  +  2613  hypothetical protein  XP_001386492  normal  0.287582  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33804  CDS  NC_009048  522843  523553  -  711  predicted protein  XP_001386692  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33805  CDS  NC_009048  525562  526335  -  774  predicted protein  XP_001386693  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33809  CDS  NC_009048  533206  534525  -  1320  predicted protein  XP_001386695  normal  0.0973496  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33812  CDS  NC_009048  538910  540269  +  1360  predicted protein  XP_001386497  normal  0.680191  normal  0.108909  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33820  CDS  NC_009048  558697  560127  +  1431  multidrug resistance transporter  XP_001386502  normal  1  normal  0.0731367  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33825  CDS  NC_009048  569995  571431  +  1437  predicted protein  XP_001386504  normal  1  normal  0.181338  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33834  CDS  NC_009048  587987  588511  -  525  predicted protein  XP_001386706  normal  1  normal  0.380866  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33838  CDS  NC_009048  593837  596504  -  2668  predicted protein  XP_001386707  decreased coverage  0.0040379  normal  0.128443  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33845  CDS  NC_009048  605280  607403  +  2124  predicted protein  XP_001386517  normal  0.59698  normal  0.195282  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33851  CDS  NC_009048  618185  619795  -  1611  Serine/threonine-protein kinase STE7 homolog  XP_001386712  decreased coverage  0.00756522  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33854  CDS  NC_009048  626487  627827  +  1341  predicted protein  XP_001386521  normal  0.893021  normal  0.424834  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33856  CDS  NC_009048  631100  631450  +  351  predicted protein  XP_001386522  normal  0.682867  normal  0.484619  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33860  CDS  NC_009048  638265  638669  +  405  predicted protein  XP_001386525  normal  1  normal  0.478938  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33868  CDS  NC_009048  653639  657884  +  4246  predicted protein  XP_001386530  normal  0.860131  normal  0.413671  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33873  CDS  NC_009048  670230  671303  +  1074  40 kDa putative membrane-spanning ATPase  XP_001386533  normal  0.767325  normal  0.0397668  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33874  CDS  NC_009048  672339  674972  +  2634  mitochondrial inner membrane protein  XP_001386534  normal  1  normal  0.0976785  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33877  CDS  NC_009048  679855  682200  +  2346  Phosphate metabolism transcription protein  XP_001386536  normal  1  normal  0.0517097  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33883  CDS  NC_009048  693284  694069  -  786  histidine triad superfamily, third branch  XP_001386723  normal  1  normal  0.2179  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33885  CDS  NC_009048  697427  698371  -  945  hypothetical protein  XP_001386725  normal  0.655262  normal  0.131716  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33929  CDS  NC_009048  799525  800418  -  894  predicted protein  XP_001386746  normal  0.811114  normal  0.542479  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33930  CDS  NC_009048  801438  803171  +  1734  allantoate permease  XP_001386566  normal  0.398969  normal  0.94031  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33937  CDS  NC_009048  825356  825850  +  495  predicted protein  XP_001386573  normal  0.120328  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33945  CDS  NC_009048  841990  843219  +  1230  predicted protein  XP_001386575  normal  0.913132  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33949  CDS  NC_009048  850403  851566  -  1164  predicted protein  XP_001386755  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33956  CDS  NC_009048  862344  864746  +  2403  membrane protein involved in vacuolar protein sorting  XP_001386580  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33957  CDS  NC_009048  865300  868002  +  2703  predicted protein  XP_001386581  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33961  CDS  NC_009048  873434  874285  +  852  predicted protein  XP_001386583  normal  0.0111936  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33967  CDS  NC_009048  887154  888992  +  1839  Ferric reductase transmembrane component 7 (Ferric-chelate reductase 7)  XP_001386587  decreased coverage  0.000164458  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33971  CDS  NC_009048  905585  907219  +  1635  Sugar transporter, putative (STL12)  XP_001386589  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33982  CDS  NC_009048  930902  931849  -  948  predicted protein  XP_001386765  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33983  CDS  NC_009048  932133  932441  -  309  predicted protein  XP_001386766  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_33987  CDS  NC_009048  942466  943764  +  1299  predicted protein  XP_001386601  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_37102  CDS  NC_009048  25482  28076  +  2595  predicted protein  XP_001386406  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_37112  CDS  NC_009048  79428  80660  -  1233  predicted protein  XP_001386615  normal  0.429914  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_37138  CDS  NC_009048  201208  202905  -  1698  Arylsulfatase (AS) (Aryl-sulfate sulphohydrolase)  XP_001386634  normal  0.218235  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_37142  CDS  NC_009048  217096  218370  +  1275  Cytochrome P450 52A3 (CYPLIIA3) (Alkane-inducible P450-ALK1-A) (P450-CM1) (CYP52A3-A) (Cytochrome P-450ALK)  XP_001386440  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_37145  CDS  NC_009048  223244  223722  +  479  Skp1 Cullin-F-box ubiquitin protein ligase (SCF) subunit  XP_001386442  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_37156  CDS  NC_009048  266846  267754  -  909  predicted protein  XP_001386646  normal  1  hitchhiker  0.000192803  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_37161  CDS  NC_009048  334265  334660  -  396  predicted protein  XP_001386651  normal  0.990123  normal  0.458805  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_37167  CDS  NC_009048  356579  357739  +  1161  mitochondrial carrier protein  XP_001386462  normal  0.787045  normal  0.905393  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_37188  CDS  NC_009048  471241  472665  +  1425  mannosyltransferase  XP_001386481  normal  1  normal  0.251125  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_37206  CDS  NC_009048  535878  537974  -  2097  predicted protein  XP_001386696  normal  0.55659  normal  0.224947  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_37224  CDS  NC_009048  598212  599084  +  873  predicted protein  XP_001386514  normal  0.445132  normal  0.242751  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_37241  CDS  NC_009048  652233  653165  +  933  predicted protein  XP_001386529  normal  1  normal  0.136249  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_37279  CDS  NC_009048  794264  794707  +  444  predicted protein  XP_001386565  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_50166  CDS  NC_009048  199301  201022  +  1722  KRRI-Interacting protein 1  XP_001386436  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_50168  CDS  NC_009048  390012  392030  -  2019  predicted protein  XP_001386664  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_50184  CDS  NC_009048  501550  501888  -  339  predicted protein  XP_001386688  normal  0.913738  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_50192  CDS  NC_009048  265747  266820  +  1074  predicted protein  XP_001386450  normal  1  hitchhiker  0.000211726  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_50195  CDS  NC_009048  878465  879130  +  666  predicted protein  XP_001386585  normal  0.273335  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_50217  CDS  NC_009048  730280  730471  -  192  predicted protein  XP_001386731  normal  0.248802  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_50220  CDS  NC_009048  625560  625856  -  297  predicted protein  XP_001386714  normal  1  normal  0.345333  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_50222  CDS  NC_009048  711592  711984  +  393  predicted protein  XP_001386544  normal  1  normal  0.936228  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_50233  CDS  NC_009048  365493  366653  +  1161  predicted protein  XP_001386463  normal  0.0164202  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_50236  CDS  NC_009048  843534  844337  +  804  predicted protein  XP_001386576  normal  0.370457  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_50259  CDS  NC_009048  546497  546781  -  285  snRNA-associated protein, Sm class  XP_001386698  normal  1  normal  0.0481772  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
Page 1 of 4    << first  < prev  1  2  3  4    next >  last >>