693 genes were found for organism Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 7    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
PICST_10382  CDS  NC_009044  1066590  1069412  -  2823  predicted protein  XP_001384507  normal  0.012102  normal  0.0536067  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_10596  CDS  NC_009044  199360  201111  -  1752  predicted protein  XP_001384339  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_11238  CDS  NC_009044  1088553  1090406  +  1854  predicted protein  XP_001384163  normal  0.115884  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_11329  CDS  NC_009044  166821  168398  -  1578  methionine permease  XP_001384330  normal  1  normal  0.408127  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_11568  CDS  NC_009044  735384  736403  -  1020  predicted protein  XP_001384438  normal  0.359379  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_12458  CDS  NC_009044  835642  836340  -  699  COP9 signalosome subunit 5A / CSN subunit 5A (CSN5A) / c-JUN coactivator protein AJH2, putative (AJH2)  XP_001384461  normal  0.0331122  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_13009  CDS  NC_009044  1443380  1443934  +  555  predicted protein  XP_001384236  decreased coverage  0.0000000581836  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_1541  CDS  NC_009044  1778040  1780253  -  2214  beta-glucosidase  XP_001384652  normal  0.36185  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_17868  CDS  NC_009044  1093903  1094997  -  1095  Eukaryotic initiation factor 4F subunit p150 (eIF4F p150) (eIF-4F p150) (mRNA cap-binding protein complex subunit p150)  XP_001384511  hitchhiker  0.0000259542  normal  0.93221  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_19003  CDS  NC_009044  1586818  1588053  -  1236  predicted protein  XP_001384608  normal  0.0445647  normal  0.0373954  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_20073  CDS  NC_009044  529290  530069  +  780  predicted protein  XP_001384061  normal  0.542202  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_21863  CDS  NC_009044  954281  954958  -  678  predicted protein  XP_001384489  normal  0.212893  normal  0.0141714  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_22250  CDS  NC_009044  561353  562153  +  801  predicted protein  XP_001384069  normal  0.077918  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_22344  CDS  NC_009044  1795822  1796343  +  522  predicted protein  XP_001384297  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_22536  CDS  NC_009044  1190015  1190473  +  459  predicted protein  XP_001384181  normal  1  normal  0.272447  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_26156  CDS  NC_009044  317830  319281  -  1452  predicted protein  XP_001384360  normal  0.0902556  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_26415  CDS  NC_009044  1144996  1145781  -  786  predicted protein  XP_001384519  normal  0.550399  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_27149  CDS  NC_009044  128588  129322  -  735  conserved hypothetical protein  XP_001384323  normal  0.503803  normal  0.389081  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_27265  CDS  NC_009044  421636  422268  +  633  predicted protein  XP_001384039  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_27983  CDS  NC_009044  1774240  1777906  +  3667  Sugar UpTake (tentative)  XP_001384295  normal  0.180127  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31130  CDS  NC_009044  1879  8226  +  6348  ATP-dependent DNA helicase  XP_001383964  normal  0.715189  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31131  CDS  NC_009044  9756  16235  +  6480  ATP-dependent DNA helicase  XP_001383965  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31132  CDS  NC_009044  18225  22943  +  4719  ATP-dependent DNA helicase  XP_001383966  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31135  CDS  NC_009044  34352  35104  -  753  Granaticin polyketide synthase putative ketoacyl reductase 2  XP_001384301  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31143  CDS  NC_009044  56724  57149  -  426  predicted protein  XP_001384308  normal  0.402445  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31146  CDS  NC_009044  62839  64194  +  1356  predicted protein  XP_001383969  normal  0.815833  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31150  CDS  NC_009044  71255  72349  +  1095  galactosyltransferase  XP_001383971  normal  0.243334  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31157  CDS  NC_009044  89803  90849  -  1047  Stress-seventy subfamily A  XP_001384316  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31161  CDS  NC_009044  97268  98262  +  995  predicted protein  XP_001383977  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31162  CDS  NC_009044  98469  99791  -  1323  predicted protein  XP_001384318  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31173  CDS  NC_009044  123964  124368  +  405  Glycine-rich cell wall structural protein precursor  XP_001383984  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31183  CDS  NC_009044  146587  147708  +  1122  predicted protein  XP_001383987  normal  0.698405  normal  0.432488  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31186  CDS  NC_009044  151157  153259  +  2103  outward-rectifier potassium channel  XP_001383990  unclonable  0.00000798921  normal  0.515447  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31188  CDS  NC_009044  155750  159415  +  3666  predicted protein  XP_001383992  unclonable  0.0032345  normal  0.0791309  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31190  CDS  NC_009044  162004  163109  +  1106  predicted protein  XP_001383994  normal  1  normal  0.14246  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31198  CDS  NC_009044  185211  186638  -  1428  phosphorylcholine transferase  XP_001384334  normal  1  normal  0.862936  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31200  CDS  NC_009044  188491  190617  -  2127  predicted protein  XP_001384335  normal  0.645088  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31206  CDS  NC_009044  202427  202780  -  354  predicted protein  XP_001384340  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31207  CDS  NC_009044  203179  203631  +  453  predicted protein  XP_001383999  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31208  CDS  NC_009044  204112  204738  -  627  predicted protein  XP_001384341  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31214  CDS  NC_009044  220450  222009  -  1560  predicted protein  XP_001384345  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31220  CDS  NC_009044  234029  234862  -  834  predicted protein  XP_001384346  normal  1  normal  0.611184  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31221  CDS  NC_009044  237762  239441  +  1680  predicted protein  XP_001384007  normal  1  normal  0.443393  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31223  CDS  NC_009044  246344  247468  +  1125  predicted protein  XP_001384009  normal  1  normal  0.611184  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31226  CDS  NC_009044  263913  264284  -  372  predicted protein  XP_001384348  normal  0.0117816  normal  0.153049  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31230  CDS  NC_009044  270346  271155  -  810  predicted protein  XP_001384350  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31232  CDS  NC_009044  274299  275249  +  951  hypothetical repeated ORF  XP_001384012  normal  0.0123925  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31236  CDS  NC_009044  292394  293743  -  1350  Strongly-conserved Zn-finger binding protein (TFIIIA)  XP_001384352  normal  0.269579  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31237  CDS  NC_009044  294269  294697  -  429  predicted protein  XP_001384353  normal  0.652624  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31239  CDS  NC_009044  297600  299123  -  1524  predicted protein  XP_001384355  normal  0.144771  normal  0.813098  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31242  CDS  NC_009044  305205  306476  -  1272  predicted protein  XP_001384357  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31247  CDS  NC_009044  311324  313845  -  2522  predicted protein  XP_001384358  normal  0.301936  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31253  CDS  NC_009044  326005  326805  -  801  predicted protein  XP_001384363  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31254  CDS  NC_009044  328149  329852  -  1704  predicted protein  XP_001384364  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31261  CDS  NC_009044  350827  351714  -  888  predicted protein  XP_001384366  decreased coverage  0.00981052  normal  0.533075  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31264  CDS  NC_009044  362114  363688  -  1575  predicted protein  XP_001384369  normal  0.497642  normal  0.642668  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31267  CDS  NC_009044  368804  369868  +  1065  predicted protein  XP_001384025  normal  0.0263815  normal  0.226493  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31270  CDS  NC_009044  376347  378185  -  1839  pre-mRNA cleavage and polyadenylation factor I component  XP_001384370  normal  1  normal  0.0585048  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31282  CDS  NC_009044  411427  412974  -  1548  predicted protein  XP_001384375  normal  0.744805  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31296  CDS  NC_009044  440495  441469  -  975  mitochondrial ADP/ATP carrier protein  XP_001384382  normal  0.830812  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31306  CDS  NC_009044  468481  469299  +  819  predicted protein  XP_001384051  normal  0.0747954  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31308  CDS  NC_009044  473726  475354  -  1629  predicted protein  XP_001384386  normal  0.0207717  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31311  CDS  NC_009044  489085  489798  +  714  predicted protein  XP_001384053  normal  1  normal  0.715057  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31312  CDS  NC_009044  490204  491319  -  1116  NAD/NADP dependent alcohol dehydrogenase  XP_001384388  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31316  CDS  NC_009044  499833  501056  +  1224  NADPH dehydrogenase (EPB1)  XP_001384056  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31323  CDS  NC_009044  516083  517864  -  1782  mitochondrial RNA helicase  XP_001384394  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31331  CDS  NC_009044  533066  535024  -  1959  predicted protein  XP_001384399  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31342  CDS  NC_009044  558868  559899  +  1032  predicted protein  XP_001384068  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31353  CDS  NC_009044  587275  588069  +  795  predicted protein  XP_001384074  normal  1  normal  0.255969  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31354  CDS  NC_009044  588145  589020  -  876  predicted protein  XP_001384409  normal  1  normal  0.273765  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31363  CDS  NC_009044  604746  605654  +  909  predicted protein  XP_001384079  normal  0.538947  normal  0.012404  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31367  CDS  NC_009044  613592  615445  +  1854  predicted protein  XP_001384083  normal  0.322379  normal  0.0602507  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31371  CDS  NC_009044  625944  627398  +  1455  predicted protein  XP_001384086  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31373  CDS  NC_009044  634241  635539  +  1299  predicted protein  XP_001384088  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31379  CDS  NC_009044  647470  649943  +  2474  predicted protein  XP_001384089  normal  0.828555  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31380  CDS  NC_009044  650115  651434  +  1320  predicted protein  XP_001384090  normal  1  normal  0.593991  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31390  CDS  NC_009044  676543  677766  +  1224  chitinase endochitinase 1 precursor  XP_001384092  normal  0.888541  normal  0.285609  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31393  CDS  NC_009044  689444  691075  +  1632  predicted protein  XP_001384094  hitchhiker  0.000369663  normal  0.723211  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31397  CDS  NC_009044  704596  706356  +  1761  hypothetical protein  XP_001384096  normal  0.778309  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31403  CDS  NC_009044  716912  717979  -  1068  predicted protein  XP_001384432  normal  0.694508  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31408  CDS  NC_009044  726782  727147  -  366  predicted protein  XP_001384435  decreased coverage  0.00624503  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31412  CDS  NC_009044  737567  738989  -  1423  predicted protein  XP_001384439  normal  0.249504  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31414  CDS  NC_009044  745035  745985  -  951  GATA-family of DNA binding proteins-like protein  XP_001384441  normal  0.987813  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31420  CDS  NC_009044  761301  762077  +  777  predicted protein  XP_001384102  normal  0.450745  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31423  CDS  NC_009044  770150  770533  -  384  predicted protein  XP_001384448  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31424  CDS  NC_009044  771278  771739  +  462  predicted protein  XP_001384103  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31426  CDS  NC_009044  775040  776005  +  966  Ribonuclease T2 precursor (RNase T2)  XP_001384105  normal  0.474806  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31430  CDS  NC_009044  790482  791183  +  702  predicted protein  XP_001384108  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31433  CDS  NC_009044  796169  796753  -  585  predicted protein  XP_001384451  normal  0.16491  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31436  CDS  NC_009044  801898  803037  -  1140  predicted protein  XP_001384452  normal  0.120567  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31437  CDS  NC_009044  804284  805369  -  1086  predicted protein  XP_001384453  normal  0.0803937  normal  0.280664  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31442  CDS  NC_009044  816041  817294  -  1254  predicted protein  XP_001384456  normal  0.971248  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31452  CDS  NC_009044  836762  838561  -  1800  predicted protein  XP_001384462  normal  0.277299  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31454  CDS  NC_009044  842637  845579  -  2943  hyphally-regulated cell wall protein  XP_001384463  normal  0.757453  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31458  CDS  NC_009044  858558  859481  +  924  predicted protein  XP_001384118  normal  0.278431  normal  0.5587  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31465  CDS  NC_009044  878339  878749  -  411  predicted protein  XP_001384470  normal  1  normal  0.71968  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31468  CDS  NC_009044  884156  885181  -  1026  predicted protein  XP_001384472  normal  0.561665  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31470  CDS  NC_009044  887354  888397  +  1044  predicted protein  XP_001384122  normal  1  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31474  CDS  NC_009044  895232  896581  -  1350  predicted protein  XP_001384476  normal  0.981787  normal  0.166066  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_31476  CDS  NC_009044  898505  901039  -  2535  Nucleoporin NUP84 (Nuclear pore protein NUP84)  XP_001384477  normal  0.267975  normal  1  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
Page 1 of 7    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7    next >  last >>