5816 genes were found for organism Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 59    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
PICST_1028  CDS  NC_009047  718579  721659  3081  Fungal Zn2Cys6 Cluster domain  XP_001386333  normal  normal  0.580079  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_10382  CDS  NC_009044  1066590  1069412  2823  predicted protein  XP_001384507  normal  0.012102  normal  0.0536067  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_10596  CDS  NC_009044  199360  201111  1752  predicted protein  XP_001384339  normal  normal  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_10913  CDS  NC_009042  801233  803161  1929  Fungal specific transcription factor  XP_001382926  normal  0.0760081  normal  0.897103  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_11039  CDS  NC_009042  1460977  1462530  1554  general amino acid permease  XP_001383050  normal  normal  0.154814  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_11073  CDS  NC_009046  715416  716609  1194  predicted protein  XP_001385491  normal  normal  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_11143  CDS  NC_009068  3433388  3434863  1476  Suppressor of Sulfoxyde Ethionine resistance  XP_001387230  normal  0.015921  normal  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_11162  CDS  NC_009068  354771  356240  1470  Golgi alpha-1,2- mannosyltransferase  XP_001387715  normal  normal  0.360349  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_11238  CDS  NC_009044  1088553  1090406  1854  predicted protein  XP_001384163  normal  0.115884  normal  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_11262  CDS  NC_009068  2703910  2705475  1566  predicted protein  XP_001387085  normal  0.0642487  normal  0.387343  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_11314  CDS  NC_009046  1708541  1709968  1428  possible hexose transporter  XP_001385684  normal  0.96677  normal  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_11329  CDS  NC_009044  166821  168398  1578  methionine permease  XP_001384330  normal  normal  0.408127  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_11568  CDS  NC_009044  735384  736403  1020  predicted protein  XP_001384438  normal  0.359379  normal  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_1171  CDS  NC_009043  1272892  1275552  2661  predicted protein  XP_001383529  normal  0.0269052  normal  0.0478294  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_12169  CDS  NC_009046  581701  582861  1161  predicted protein  XP_001385458  normal  0.68712  normal  0.32837  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_12325  CDS  NC_009068  1118111  1118683  573  hypothetical protein  XP_001387859  normal  normal  0.663972  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_12362  CDS  NC_009068  3455419  3456441  1023  conserved hypothetical protein  XP_001386991  normal  normal  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_12458  CDS  NC_009044  835642  836340  699  COP9 signalosome subunit 5A / CSN subunit 5A (CSN5A) / c-JUN coactivator protein AJH2, putative (AJH2)  XP_001384461  normal  0.0331122  normal  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_12709  CDS  NC_009048  283453  284106  654  non-histone protein 10  XP_001386648  normal  0.0597181  normal  0.318516  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_12788  CDS  NC_009042  1599527  1600318  792  predicted protein  XP_001382530  normal  normal  0.837038  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_12827  CDS  NC_009042  2640309  2641082  774  predicted protein  XP_001382739  normal  normal  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_12953  CDS  NC_009042  2176483  2177205  723  predicted protein  XP_001383180  decreased coverage  0.000550926  normal  0.10545  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_13009  CDS  NC_009044  1443380  1443934  555  predicted protein  XP_001384236  decreased coverage  5.81836e-08  normal  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_13204  CDS  NC_009043  1689653  1690213  561  predicted protein  XP_001383610  normal  0.318772  normal  0.517646  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_13387  CDS  NC_009042  2057570  2058076  507  predicted protein  XP_001383160  normal  normal  0.618265  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_13471  CDS  NC_009068  1152696  1153190  495  RNA-binding protein  XP_001387451  normal  normal  0.0775963  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_13503  CDS  NC_009042  1378832  1379218  387  Rhodanese-related sulfurtransferase  XP_001382487  normal  0.258058  normal  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_13665  CDS  NC_009042  537981  538364  384  Class 2 transcription repressor NC2, beta subunit (Dr1)  XP_001382339  normal  0.379904  normal  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_13887  CDS  NC_009043  385567  385857  291  predicted protein  XP_001383351  normal  normal  0.0943829  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_14132  CDS  NC_009047  987596  992392  4797  negative regulator of early meiotic expression  XP_001386202  normal  0.0438243  normal  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_14247  CDS  NC_009045  341936  345118  3183  mitochondrial DNA polymerase catalytic subunit  XP_001385083  normal  normal  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_14301  CDS  NC_009048  74562  79319  4758  predicted protein  XP_001386413  normal  normal  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_14352  CDS  NC_009047  272888  273466  579  predicted protein  XP_001386258  normal  normal  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_14509  CDS  NC_009043  469963  473379  3417  predicted protein  XP_001383724  normal  normal  0.644497  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_14973  CDS  NC_009047  169255  171975  2721  predicted protein  XP_001386048  normal  0.251561  normal  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_15102  CDS  NC_009045  1384858  1387284  2427  helicase  XP_001385272  normal  hitchhiker  0.00429974  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_15404  CDS  NC_009043  970630  972252  1623  pyruvate decarboxylase regulator (PDC2)  XP_001383473  normal  normal  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_1541  CDS  NC_009044  1778040  1780253  2214  beta-glucosidase  XP_001384652  normal  0.36185  normal  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_15419  CDS  NC_009047  723959  726199  2241  predicted protein  XP_001386334  normal  0.0198581  normal  0.726976  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_15651  CDS  NC_009045  1280146  1282428  2283  serine-threonine protein kinase, PKA suppressor  XP_001384935  normal  0.0134219  normal  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_15898  CDS  NC_009042  1062829  1064931  2103  predicted protein  XP_001382982  normal  0.062814  normal  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_16270  CDS  NC_009042  2486946  2488982  2037  conserved hypothetical protein  XP_001382705  decreased coverage  0.000103062  normal  0.0590596  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_16322  CDS  NC_009046  785792  787546  1755  protein for resistance to o-dinitrobenzene, calcium, and zinc  XP_001385511  normal  normal  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_16323  CDS  NC_009043  1024255  1026132  1878  Heat shock transcription factor  XP_001383484  normal  0.173191  normal  0.0871257  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_16361  CDS  NC_009043  468409  469707  1299  predicted protein  XP_001383723  normal  0.898174  normal  0.978716  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_16362  CDS  NC_009043  449626  451386  1761  Platinum sensitivity protein  XP_001383718  normal  0.792331  normal  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_16494  CDS  NC_009048  747342  748994  1653  Siderophore Iron Transport  XP_001386550  unclonable  3.81637e-07  normal  0.145167  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_16565  CDS  NC_009046  121896  123662  1767  predicted protein  XP_001385353  normal  normal  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_16628  CDS  NC_009048  712427  713995  1569  predicted protein  XP_001386729  normal  normal  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_16647  CDS  NC_009045  1274890  1276605  1716  predicted protein  XP_001384933  normal  0.0247353  normal  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_167  CDS  NC_009045  289565  294076  4512  predicted protein  XP_001384716  normal  0.0272368  normal  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_16856  CDS  NC_009048  628073  629701  1629  high affinity xylose transporter (putative) (HGT3)  XP_001386715  normal  0.0752816  normal  0.401981  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_16981  CDS  NC_009048  542934  544640  1707  flippase  XP_001386498  normal  normal  0.0319066  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_1703  CDS  NC_009043  1802006  1804021  2016  nucleolar DEAD-box protein required for synthesis of 60S ribosomal subunits  XP_001383630  normal  normal  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_17338  CDS  NC_009043  1617197  1618621  1425  predicted protein  XP_001383932  normal  normal  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_17369  CDS  NC_009047  157023  158198  1176  hyphally regulated cell wall protein Exo-alpha-sialidase  XP_001386047  normal  normal  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_17370  CDS  NC_009068  3405186  3406763  1578  Apoptosis antagonizing transcription factor  XP_001386978  normal  0.490747  normal  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_17474  CDS  NC_009046  990088  994134  4047  hyphally regulated cell wall protein  XP_001385882  normal  normal  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_17616  CDS  NC_009068  307132  311502  4371  hyphally regulated cell wall protein  XP_001387297  normal  normal  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_17702  CDS  NC_009045  1396779  1398056  1278  predicted protein  XP_001384956  normal  normal  0.257016  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_17706  CDS  NC_009043  53621  54757  1137  positive regulator of meiosis, MAPK related ser/thr protein kinase  XP_001383288  normal  normal  0.460781  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_17775  CDS  NC_009045  35163  36662  1500  Probable sucrose utilization protein (SUC1) or maltose fermentation regulatory protein (MAL13)  XP_001384659  normal  normal  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_17868  CDS  NC_009044  1093903  1094997  1095  Eukaryotic initiation factor 4F subunit p150 (eIF4F p150) (eIF-4F p150) (mRNA cap-binding protein complex subunit p150)  XP_001384511  hitchhiker  2.59542e-05  normal  0.93221  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_18070  CDS  NC_009047  656897  658375  1479  predicted protein  XP_001386319  normal  0.235503  normal  0.132963  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_18155  CDS  NC_009043  351585  352889  1305  predicted protein  XP_001383696  normal  0.969306  normal  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_18249  CDS  NC_009048  48984  50642  1659  predicted protein  XP_001386411  normal  normal  0.354188  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_18300  CDS  NC_009045  47354  48739  1386  Regulator of Ty1 Transposition  XP_001385033  normal  normal  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_18667  CDS  NC_009042  566978  568315  1338  RNA polymerase I specific transcription initiation factor RRN7  XP_001382346  normal  0.143542  normal  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_19003  CDS  NC_009044  1586818  1588053  1236  predicted protein  XP_001384608  normal  0.0445647  normal  0.0373954  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_191  CDS  NC_009043  296834  300922  4089  Sterol 3-beta-glucosyltransferase (Autophagy-related protein 26) (UDP-glycosyltransferase 51)  XP_001383338  normal  normal  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_19145  CDS  NC_009046  496192  497157  966  predicted protein  XP_001385785  normal  normal  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_19189  CDS  NC_009047  941845  943029  1185  predicted protein  XP_001386369  normal  normal  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_19381  CDS  NC_009043  1216635  1217801  1167  predicted protein  XP_001383862  normal  0.797995  normal  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_19384  CDS  NC_009068  2731372  2732706  1335  predicted protein  XP_001386853  normal  normal  0.250044  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_19389  CDS  NC_009045  1360673  1361836  1164  predicted protein  XP_001385267  normal  hitchhiker  0.000708555  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_1946  CDS  NC_009047  1034396  1036966  2571  predicted protein  XP_001386206  normal  0.136034  normal  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_19605  CDS  NC_009043  560565  561689  1125  predicted protein  XP_001383385  normal  normal  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_19671  CDS  NC_009046  1484152  1485354  1203  Box C/D snoRNA accumulation  XP_001385634  normal  0.19013  normal  0.236513  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_19764  CDS  NC_009043  949483  950148  666  predicted protein  XP_001383811  normal  0.296451  normal  0.782052  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_20073  CDS  NC_009044  529290  530069  780  predicted protein  XP_001384061  normal  0.542202  normal  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_20287  CDS  NC_009042  460275  461207  933  predicted protein  XP_001382324  unclonable  3.60095e-08  normal  0.0368137  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_20558  CDS  NC_009047  57261  58244  984  predicted protein  XP_001386027  normal  0.0845057  normal  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_20969  CDS  NC_009047  1083126  1084070  945  pH-regulated antigen precursor  XP_001386401  normal  normal  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_21007  CDS  NC_009046  142039  142587  549  predicted protein  XP_001385721  normal  normal  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_21174  CDS  NC_009048  547957  548694  738  DNA binding transcription factor  XP_001386699  normal  normal  0.110005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_21178  CDS  NC_009045  1596282  1597442  1161  predicted protein  XP_001385001  normal  normal  0.132821  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_21863  CDS  NC_009044  954281  954958  678  predicted protein  XP_001384489  normal  0.212893  normal  0.0141714  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_21871  CDS  NC_009042  2558048  2558587  540  predicted protein  XP_001382725  normal  0.0734787  normal  0.41286  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_21982  CDS  NC_009042  574445  575029  585  predicted protein  XP_001382349  normal  normal  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_22250  CDS  NC_009044  561353  562153  801  predicted protein  XP_001384069  normal  0.077918  normal  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_22344  CDS  NC_009044  1795822  1796343  522  predicted protein  XP_001384297  normal  normal  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_22479  CDS  NC_009046  219423  219890  468  predicted protein  XP_001385379  normal  normal  0.125717  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_22536  CDS  NC_009044  1190015  1190473  459  predicted protein  XP_001384181  normal  normal  0.272447  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_22565  CDS  NC_009045  602707  603201  495  predicted protein  XP_001384783  decreased coverage  0.0043227  normal  0.0742578  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_22975  CDS  NC_009046  1305707  1306069  363  predicted protein  XP_001385602  normal  normal  0.984982  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_23026  CDS  NC_009046  338989  339426  438  predicted protein  XP_001385410  normal  0.996662  normal  0.0237859  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_23033  CDS  NC_009068  1846807  1847103  297  predicted protein  XP_001387593  normal  normal  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_2329  CDS  NC_009043  820437  822293  1857  nucleotide excision repair protein  XP_001383439  normal  normal  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_23459  CDS  NC_009047  881149  881331  183  predicted protein  XP_001386358  normal  0.466482  normal  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
PICST_23467  CDS  NC_009045  277397  277729  333  predicted protein  XP_001384712  normal  normal  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota 
 
 
-
 
Page 1 of 59    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>