6420 genes were found for organism Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 65    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BURPS1710b_0001  rRNA  NC_007434  533  648  116  5S ribosomal RNA    unclonable  4.61312e-11  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0002  rRNA  NC_007434  830  3711  2882  23S ribosomal RNA    unclonable  2.80391e-08  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0003  tRNA  NC_007434  4065  4140  76  tRNA-Ala    unclonable  5.86808e-11  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0004  tRNA  NC_007434  4175  4251  77  tRNA-Ile    unclonable  5.86808e-11  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0005  rRNA  NC_007434  4334  5821  1488  16S ribosomal RNA    unclonable  1.29468e-09  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0006  CDS  NC_007434  6370  7647  1278  lipase/acylhydrolase, putative  YP_331424  hitchhiker  2.3586e-07  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0007  CDS  NC_007434  8346  9344  999  phenylacetate-CoA oxygenase subunit PaaA  YP_331425  normal  0.0428065  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0008  CDS  NC_007434  8747  9691  945  phenylacetic acid degradation protein PaaB  YP_331426  normal  0.0391689  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0009  CDS  NC_007434  9702  10505  804  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaI subunit  YP_331427  normal  0.235905  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0010  CDS  NC_007434  10541  11161  621  phenylacetic acid degradation protein PaaD  YP_331428  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0011  CDS  NC_007434  11163  12251  1089  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  YP_331429  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0012  CDS  NC_007434  12373  13203  831  hypothetical protein  YP_331430  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0013  CDS  NC_007434  13230  13829  600  TetR family transcriptional regulator  YP_331431  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0014  CDS  NC_007434  13951  14718  768  acetyltransferase  YP_331432  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0015  CDS  NC_007434  14837  15352  516  transcriptional regulator  YP_331433  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0016  CDS  NC_007434  15504  16601  1098  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  YP_331434  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0017  CDS  NC_007434  16837  17034  198  putative outer membrane protein  YP_331435  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0018  CDS  NC_007434  17354  20935  3582  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  YP_331436  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0019  CDS  NC_007434  21504  23825  2322  malic enzyme  YP_331437  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0020  CDS  NC_007434  24303  24989  687  orotate phosphoribosyltransferase  YP_331438  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0021  CDS  NC_007434  25291  25887  597  phosphatidylethanolamine-binding protein  YP_331439  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0022  CDS  NC_007434  26055  26849  795  flavodoxin domain-containing protein  YP_331440  normal  0.261011  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0023  CDS  NC_007434  27002  27946  945  N-acetyl-gamma-glutamyl-phosphate reductase  YP_331441  normal  0.042017  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0024  CDS  NC_007434  28421  29794  1374  putative lipoprotein  YP_331442  hitchhiker  0.00801483  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0025  CDS  NC_007434  29921  31171  1251  putative lipoprotein  YP_331443  hitchhiker  9.55667e-06  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0026  CDS  NC_007434  31191  32021  831  OmpW family outer membrane protein  YP_331444  unclonable  5.41983e-10  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0027  CDS  NC_007434  32208  33146  939  transcriptional regulatory protein  YP_331445  unclonable  7.39069e-10  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0028  CDS  NC_007434  33242  34510  1269  MFS permease  YP_331446  hitchhiker  6.23855e-05  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0029  CDS  NC_007434  34601  35269  669  amino acid transporter LysE  YP_331447  normal  0.0393564  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0030  CDS  NC_007434  35368  37179  1812  dehydrogenase  YP_331448  normal  0.698391  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0031  CDS  NC_007434  36364  37119  756  hypothetical protein  YP_331449  normal  0.885016  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0032  CDS  NC_007434  37713  38390  678  hypothetical protein  YP_331450  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0033  CDS  NC_007434  38158  38373  216  hypothetical protein  YP_331451  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0034  CDS  NC_007434  38545  38952  408  hypothetical protein  YP_331452  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0035  CDS  NC_007434  40161  40478  318  hypothetical protein  YP_331453  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0036  CDS  NC_007434  40993  42399  1407  amino acid permease  YP_331454  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0037  tRNA  NC_007434  42573  42648  76  tRNA-Ala    normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0038  CDS  NC_007434  42713  43399  687  cytochrome c family protein  YP_331455  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0039  CDS  NC_007434  43075  43875  801  phospholipid-binding domain-containing protein  YP_331456  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0040  CDS  NC_007434  43894  44472  579  phosphoheptose isomerase  YP_331457  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0041  CDS  NC_007434  44595  45077  483  hypothetical protein  YP_331458  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0042  CDS  NC_007434  45076  45963  888  hypothetical protein  YP_331459  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0043  CDS  NC_007434  46058  46693  636  rare lipoprotein A family protein  YP_331460  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0044  CDS  NC_007434  47294  47938  645  metallo-beta-lactamase superfamily protein  YP_331461  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0045  CDS  NC_007434  48132  49508  1377  hypothetical protein  YP_331462  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0046  CDS  NC_007434  48682  49140  459  AsnC family transcriptional regulator  YP_331463  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0047  CDS  NC_007434  49319  50509  1191  cation efflux family protein  YP_331464  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0048  CDS  NC_007434  50749  51126  378  H-NS histone family protein  YP_331465  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0049  CDS  NC_007434  51427  52293  867  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein  YP_331466  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0050  CDS  NC_007434  52510  53628  1119  amino acid ABC transporter, permease protein, putative  YP_331467  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0051  CDS  NC_007434  53819  54961  1143  outative extracellular ligand binding protein  YP_331468  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0052  CDS  NC_007434  55417  56517  1101  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  YP_331469  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0053  CDS  NC_007434  56844  57536  693  dienelactone hydrolase  YP_331470  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0054  CDS  NC_007434  57631  59121  1491  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  YP_331471  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0055  CDS  NC_007434  59305  60135  831  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  YP_331472  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0056  CDS  NC_007434  60153  60506  354  YvlD  YP_331473  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0057  CDS  NC_007434  60670  62091  1422  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  YP_331474  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0058  CDS  NC_007434  62445  63176  732  flagellar biosynthesis sigma factor  YP_331475  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0059  CDS  NC_007434  62511  64133  1623  hypothetical protein  YP_331476  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0060  CDS  NC_007434  63201  64013  813  flagellar biosynthesis protein FlhG  YP_331477  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0061  CDS  NC_007434  64006  65757  1752  flagellar biosynthesis regulator FlhF  YP_331478  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0062  CDS  NC_007434  65754  67856  2103  flagellar biosynthesis protein FlhA  YP_331479  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0063  CDS  NC_007434  67853  69070  1218  flagellar biosynthesis protein FlhB  YP_331480  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0064  CDS  NC_007434  69766  70266  501  DNA binding protein  YP_331481  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0065  CDS  NC_007434  70304  71680  1377  hypothetical protein  YP_331482  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0066  CDS  NC_007434  70453  71757  1305  putative lipoprotein  YP_331483  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0067  CDS  NC_007434  70687  72237  1551  hypothetical protein  YP_331484  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0068  CDS  NC_007434  71780  72283  504  hypothetical protein  YP_331485  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0069  CDS  NC_007434  72481  73209  729  chemotaxis regulator CheZ  YP_331486  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0070  CDS  NC_007434  73211  73777  567  chemotaxis protein CheY  YP_331487  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0071  CDS  NC_007434  73955  75049  1095  chemotaxis-specific methylesterase  YP_331488  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0072  CDS  NC_007434  75055  75759  705  chemoreceptor glutamine deamidase CheD  YP_331489  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0073  CDS  NC_007434  75756  76700  945  chemotaxis protein methyltransferase  YP_331490  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0074  CDS  NC_007434  76707  78728  2022  methyl-accepting chemotaxis protein I  YP_331491  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0075  CDS  NC_007434  78769  79296  528  chemotaxis protein CheW  YP_331493  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0076  CDS  NC_007434  78745  81768  3024  hypothetical protein  YP_331492  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0077  CDS  NC_007434  79327  81624  2298  chemotaxis protein CheA  YP_331494  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0078  CDS  NC_007434  81656  82036  381  chemotaxis two-component response regulator CheY1  YP_331495  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0079  CDS  NC_007434  82067  83089  1023  flagellar motor protein MotB  YP_331496  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0080  CDS  NC_007434  83106  83966  861  flagellar motor protein MotA  YP_331497  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0081  CDS  NC_007434  84160  84711  552  transcriptional activator FlhC  YP_331498  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0082  CDS  NC_007434  84805  85473  669  transcriptional activator FlhD  YP_331499  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0083  CDS  NC_007434  85581  86783  1203  glycosyl transferase, group 1 family protein  YP_331500  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0084  CDS  NC_007434  86887  87183  297  H-NS histone family protein  YP_331501  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0085  CDS  NC_007434  87489  88193  705  aquaporin Z  YP_331502  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0086  CDS  NC_007434  88382  89224  843  Cof-like hydrolase  YP_331503  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0087  CDS  NC_007434  89321  90211  891  BadF/BadG/BcrA/BcrD family ATPase  YP_331504  normal  0.992685  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0088  CDS  NC_007434  90362  90970  609  DNA-3-methyladenine glycosylase I  YP_331505  normal  0.838117  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0089  CDS  NC_007434  91357  91569  213  30S ribosomal protein S21  YP_331506  normal  0.914848  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0090  CDS  NC_007434  92127  93293  1167  flagellin  YP_331507  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0091  CDS  NC_007434  93337  95010  1674  hypothetical protein  YP_331508  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0092  CDS  NC_007434  93443  94963  1521  flagellar hook-associated protein  YP_331509  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0093  CDS  NC_007434  94977  95291  315  hypothetical protein  YP_331510  normal  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0094  CDS  NC_007434  95379  97844  2466  TPR domain-containing protein  YP_331511  normal  0.822931  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0095  CDS  NC_007434  97841  98989  1149  aminotransferase  YP_331512  normal  0.325267  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0096  CDS  NC_007434  98986  100020  1035  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  YP_331513  normal  0.211291  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0097  CDS  NC_007434  100029  100253  225  hypothetical protein  YP_331514  normal  0.108948  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0098  CDS  NC_007434  100043  100270  228  cell wall surface anchor family protein, putative  YP_331515  normal  0.109358  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0099  CDS  NC_007434  100256  101320  1065  3-oxoacyl- synthase  YP_331516  normal  0.598992  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
BURPS1710b_0100  CDS  NC_007434  101260  102081  822  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  YP_331517  normal  0.231003  n/a    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 65    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>