527 genes were found for organism Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 6    << first  < prev  1  2  3  4  5  6    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Dgeo_2348  CDS  NC_008010  145416  146333  918  cobalamin biosynthesis protein CobD  YP_593857  normal  0.910265  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2349  CDS  NC_008010  144094  145419  1326  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  YP_593858  normal  0.328334  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2350  CDS  NC_008010  142397  144097  1701  magnesium chelatase, ChlI subunit  YP_593859  normal  0.252625  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2351  CDS  NC_008010  141609  142400  792  methyltransferase type 11  YP_593860  normal  0.0117235  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2352  CDS  NC_008010  137278  141612  4335  cobaltochelatase, CobN subunit  YP_593861  normal  0.113617  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2353  CDS  NC_008010  136257  137267  1011  high-affinity nickel-transporter  YP_593862  normal  0.0532549  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2354  CDS  NC_008010  135152  136255  1104  cobalamin synthesis protein, P47K  YP_593863  normal  0.0783828  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2355  CDS  NC_008010  133617  135155  1539  precorrin-3B C17-methyltransferase  YP_593864  normal  0.0146728  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2356  CDS  NC_008010  132826  133620  795  cobalamin biosynthesis protein CbiG  YP_593865  normal  0.194675  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2357  CDS  NC_008010  132050  132829  780  precorrin-4 C11-methyltransferase  YP_593866  normal  0.342045  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2358  CDS  NC_008010  131295  132053  759  precorrin-2 C20-methyltransferase  YP_593867  normal  0.626121  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2359  CDS  NC_008010  130183  131298  1116  cobalamin biosynthesis protein CbiD  YP_593868  normal  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2360  CDS  NC_008010  128609  130171  1563  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  YP_593869  normal  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2361  CDS  NC_008010  127926  128612  687  cobalt-precorrin-6Y C(5)-methyltransferase  YP_593870  normal  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2362  CDS  NC_008010  127301  127915  615  cob(I)alamin adenosyltransferase  YP_593871  normal  0.9608  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2363  CDS  NC_008010  126435  127304  870  periplasmic binding protein  YP_593872  normal  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2364  CDS  NC_008010  124398  126125  1728  alkaline phosphatase  YP_593873  normal  0.0542806  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2365  CDS  NC_008010  123944  124387  444  hypothetical protein  YP_593874  normal  0.156676  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2366  CDS  NC_008010  123387  123968  582  phosphoglycerate mutase  YP_593875  normal  0.18835  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2367  CDS  NC_008010  122647  123387  741  cobalamin-5-phosphate synthase CobS  YP_593876  normal  0.415535  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2368  CDS  NC_008010  120680  122416  1737  5'-nucleotidase-like  YP_593877  normal  0.287077  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2369  CDS  NC_008010  120471  120710  240  hypothetical protein  YP_593878  normal  0.135012  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2370  CDS  NC_008010  119003  120013  1011  diguanylate cyclase  YP_593879  normal  0.191447  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2371  CDS  NC_008010  117780  119000  1221  major facilitator transporter  YP_593880  normal  0.363547  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2372  CDS  NC_008010  117038  117484  447  IS1 transposase  YP_593881  normal  0.698246  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2373  CDS  NC_008010  116850  117029  180  hypothetical protein  YP_593882  normal  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2374  CDS  NC_008010  115638  116507  870  shikimate 5-dehydrogenase  YP_593883  normal  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2375  CDS  NC_008010  114208  115641  1434  xylose isomerase-like TIM barrel  YP_593884  normal  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2376  CDS  NC_008010  113966  114235  270  hypothetical protein  YP_593885  normal  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2377  CDS  NC_008010  113478  113924  447  IS1 transposase  YP_593886  normal  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2378  CDS  NC_008010  113029  113478  450  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  YP_593887  normal  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2379  CDS  NC_008010  111764  113110  1347  transposase IS66  YP_593888  normal  0.651042  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2380  CDS  NC_008010  110677  111552  876  IclR family transcriptional regulator  YP_593889  normal  0.610686  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2381  CDS  NC_008010  109770  110609  840  IclR family transcriptional regulator  YP_593890  normal  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2382  CDS  NC_008010  108644  109600  957  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  YP_593891  normal  0.60479  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2383  CDS  NC_008010  108235  108681  447  IS1 transposase  YP_593892  normal  0.597317  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2384  CDS  NC_008010  107657  108193  537  hypothetical protein  YP_593893  normal  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2385  CDS  NC_008010  106290  107681  1392  fumarate lyase  YP_593894  normal  0.72571  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2386  CDS  NC_008010  105665  106282  618  protocatechuate 3,4-dioxygenase, alpha subunit  YP_593895  normal  0.798645  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2387  CDS  NC_008010  104950  105675  726  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  YP_593896  normal  0.581164  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2388  CDS  NC_008010  103793  104953  1161  3-oxoadipate enol-lactonase  YP_593897  normal  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2389  CDS  NC_008010  102082  103317  1236  major facilitator transporter  YP_593898  normal  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2390  CDS  NC_008010  99901  102030  2130  molybdopterin oxidoreductase  YP_593899  normal  0.479736  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2391  CDS  NC_008010  97116  99686  2571  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirB  YP_593900  normal  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2392  CDS  NC_008010  96655  97005  351  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirD  YP_593901  normal  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2393  CDS  NC_008010  95843  96676  834  uroporphyrinogen III synthase HEM4  YP_593902  normal  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2394    NC_008010  94558  95569  1012      normal  0.359966  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2395  CDS  NC_008010  93656  94333  678  N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase  YP_593903  normal  0.147527  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2396  CDS  NC_008010  91961  93631  1671  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_593904  normal  0.0683421  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2397  CDS  NC_008010  90815  91903  1089  aminoglycoside phosphotransferase  YP_593905  normal  0.0626006  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2398  CDS  NC_008010  90009  90818  810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_593906  normal  0.0863327  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2399  CDS  NC_008010  88562  89800  1239  acyl-CoA dehydrogenase-like  YP_593907  normal  0.137171  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2400  CDS  NC_008010  87358  88449  1092  strictosidine synthase  YP_593908  normal  0.245998  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2401  CDS  NC_008010  86915  87361  447  phenylacetic acid degradation-related protein  YP_593909  normal  0.203664  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2402  CDS  NC_008010  86460  86918  459  MaoC-like dehydratase  YP_593910  normal  0.18064  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2403  CDS  NC_008010  85630  86406  777  gluconate 5-dehydrogenase  YP_593911  normal  0.525317  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2404  CDS  NC_008010  84668  85501  834  alpha/beta hydrolase fold  YP_593912  normal  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2405  CDS  NC_008010  82872  84668  1797  acyl-CoA dehydrogenase-like  YP_593913  normal  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2406  CDS  NC_008010  81636  82610  975  zinc-binding alcohol dehydrogenase  YP_593914  normal  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2407  CDS  NC_008010  81169  81639  471  MerR family transcriptional regulator  YP_593915  normal  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2408  CDS  NC_008010  79764  81065  1302  MATE efflux family protein  YP_593916  normal  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2409  CDS  NC_008010  78480  79760  1281  phenylacetate-CoA ligase  YP_593917  normal  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2410  CDS  NC_008010  77075  78499  1425  FAD linked oxidase-like  YP_593918  normal  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2411  CDS  NC_008010  75909  77054  1146  extracellular ligand-binding receptor  YP_593919  normal  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2412  CDS  NC_008010  74623  75783  1161  hypothetical protein  YP_593920  normal  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2413  CDS  NC_008010  73676  74476  801  4-hydroxyphenylacetate degradation bifunctional isomerase/decarboxylase  YP_593921  normal  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2414  CDS  NC_008010  72849  73679  831  hypothetical protein  YP_593922  normal  0.53926  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2415  CDS  NC_008010  72202  72852  651  hypothetical protein  YP_593923  normal  0.839488  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2416  CDS  NC_008010  70652  72205  1554  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  YP_593924  normal  0.562889  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2417  CDS  NC_008010  69816  70655  840  NAD-dependent epimerase/dehydratase  YP_593925  normal  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2418  CDS  NC_008010  68085  69572  1488  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, oxygenase component  YP_593926  normal  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2419  CDS  NC_008010  67111  68088  978  3,4-dihydroxyphenylacetate 2,3-dioxygenase HpaD  YP_593927  normal  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2420  CDS  NC_008010  66285  67121  837  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  YP_593928  normal  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2421  CDS  NC_008010  65531  66295  765  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  YP_593929  normal  0.751865  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2422  CDS  NC_008010  65262  65459  198  hypothetical protein  YP_593930  normal  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2423  CDS  NC_008010  64300  65217  918  band 7 protein  YP_593931  normal  0.629628  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2424  CDS  NC_008010  63049  64098  1050  inner-membrane translocator  YP_593932  normal  0.69608  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2425  CDS  NC_008010  61226  63052  1827  ABC transporter-related protein  YP_593933  normal  0.630273  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2426  CDS  NC_008010  60480  61229  750  ABC transporter-related protein  YP_593934  normal  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2427  CDS  NC_008010  59254  60420  1167  calcium/proton exchanger  YP_593935  normal  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2428  CDS  NC_008010  58381  59160  780  hypothetical protein  YP_593936  normal  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2429  CDS  NC_008010  58023  58247  225  ABC transporter-like  YP_593937  normal  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2430  CDS  NC_008010  56451  57542  1092  transposase, IS4  YP_593938  normal  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2431  CDS  NC_008010  55964  56470  507  hypothetical protein  YP_593939  normal  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2432  CDS  NC_008010  53780  55948  2169  hypothetical protein  YP_593940  normal  0.160714  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2433  CDS  NC_008010  53162  53608  447  IS1 transposase  YP_593941  normal  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2434  CDS  NC_008010  52493  53095  603  hypothetical protein  YP_593942  normal  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2435  CDS  NC_008010  50403  52472  2070  hypothetical protein  YP_593943  normal  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2436  CDS  NC_008010  49948  50394  447  IS1 transposase  YP_593944  normal  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2437  CDS  NC_008010  49604  49906  303  hypothetical protein  YP_593945  normal  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2438  CDS  NC_008010  47907  49595  1689  hypothetical protein  YP_593946  normal  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2439  CDS  NC_008010  46957  47910  954  membrane protein-like  YP_593947  normal  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2440  CDS  NC_008010  45868  46926  1059  transposase, IS4  YP_593948  normal  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2441  CDS  NC_008010  43922  45853  1932  hypothetical protein  YP_593949  normal  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2442  CDS  NC_008010  41764  43848  2085  hydantoinase/oxoprolinase  YP_593950  normal  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2443  CDS  NC_008010  40548  41747  1200  iron permease FTR1  YP_593951  normal  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2444  CDS  NC_008010  39552  40544  993  hypothetical protein  YP_593952  normal  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2445  CDS  NC_008010  38439  39047  609  hypothetical protein  YP_593953  normal  0.763703  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2446  CDS  NC_008010  37993  38439  447  IS1 transposase  YP_593954  normal  0.994659  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_2447  CDS  NC_008010  37661  37951  291  hypothetical protein  YP_593955  normal  0.333595  n/a    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 6    << first  < prev  1  2  3  4  5  6    next >  last >>