3142 genes were found for organism Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 32    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Dgeo_0001  CDS  NC_008025  222  1634  1413  chromosomal replication initiation protein  YP_603474  hitchhiker  0.000177247  normal  0.980205  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0003  CDS  NC_008025  2025  3107  1083  DNA polymerase III, beta subunit  YP_603476  unclonable  1.03313e-08  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
 
Dgeo_0004  CDS  NC_008025  3245  4513  1269  phosphopyruvate hydratase  YP_603477  hitchhiker  0.00896876  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0005  CDS  NC_008025  4600  6048  1449  pyruvate kinase  YP_603478  normal  0.0168768  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0006  CDS  NC_008025  6295  7536  1242  tyrosyl-tRNA synthetase  YP_603479  normal  0.274156  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0007  CDS  NC_008025  7665  8285  621  MOSC domain-containing protein  YP_603480  normal  0.278634  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0008  CDS  NC_008025  8301  8852  552  hypothetical protein  YP_603481  normal  0.332739  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0009  CDS  NC_008025  8833  9510  678  hypothetical protein  YP_603482  normal  0.400013  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0010  CDS  NC_008025  9612  11432  1821  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  YP_603483  normal  0.675928  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0011  CDS  NC_008025  11803  13008  1206  methionine gamma-lyase  YP_603484  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0012  CDS  NC_008025  13036  13686  651  hypothetical protein  YP_603485  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0013  CDS  NC_008025  13862  14044  183  50S ribosomal protein L32  YP_603486  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0014  CDS  NC_008025  14304  15089  786  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  YP_603487  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0015  CDS  NC_008025  15138  15407  270  hypothetical protein  YP_603488  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0016  CDS  NC_008025  15559  16119  561  cytochrome c oxidase, subunit II  YP_603489  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0017  CDS  NC_008025  16130  17893  1764  cytochrome c oxidase, subunit I  YP_603490  normal  0.164121  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0018  CDS  NC_008025  17893  18309  417  cytochrome c, class I  YP_603491  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0019  CDS  NC_008025  18407  19438  1032  A/G-specific adenine glycosylase  YP_603492  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0020  CDS  NC_008025  19494  20324  831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  YP_603493  normal  0.540974  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0021  CDS  NC_008025  20373  22334  1962  HRDC  YP_603494  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0022  CDS  NC_008025  22331  22666  336  hypothetical protein  YP_603495  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0023  CDS  NC_008025  22666  23487  822  ABC transporter related  YP_603496  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0024  CDS  NC_008025  23480  24499  1020  transport system permease protein  YP_603497  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0025  CDS  NC_008025  24503  25372  870  periplasmic binding protein  YP_603498  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0026  CDS  NC_008025  25679  26323  645  phospholipid/glycerol acyltransferase  YP_603499  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0027  CDS  NC_008025  26392  26643  252  hypothetical protein  YP_603500  normal  0.217063  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0028    NC_008025  26673  27367  695      normal  0.026372  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0029  CDS  NC_008025  27484  27840  357  hypothetical protein  YP_603501  hitchhiker  0.00652665  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0030  CDS  NC_008025  27906  28526  621  hypothetical protein  YP_603502  hitchhiker  0.00288533  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0031  CDS  NC_008025  28523  29392  870  hypothetical protein  YP_603503  decreased coverage  0.000287545  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0032  CDS  NC_008025  29584  30993  1410  ribonuclease II  YP_603504  normal  0.011152  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0033  CDS  NC_008025  31038  31328  291  hypothetical protein  YP_603505  normal  0.0353045  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0034  CDS  NC_008025  31472  32503  1032  peptidyl-arginine deiminase  YP_603506  normal  0.714281  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0035  CDS  NC_008025  32488  33663  1176  hypothetical protein  YP_603507  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0036  CDS  NC_008025  33677  34561  885  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  YP_603508  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0037  CDS  NC_008025  34598  35398  801  tRNA pseudouridine synthase A  YP_603509  normal  normal  0.848154  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0038  CDS  NC_008025  35401  36393  993  peptidase M23B  YP_603510  normal  normal  0.905028  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0039  CDS  NC_008025  36398  36625  228  hypothetical protein  YP_603511  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0040  CDS  NC_008025  36626  37411  786  stationary phase survival protein SurE  YP_603512  normal  normal  0.913408  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0041  CDS  NC_008025  37477  38694  1218  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  YP_603513  normal  normal  0.950338  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0042  CDS  NC_008025  38691  39425  735  cyclase/dehydrase  YP_603514  normal  normal  0.64456  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0043  CDS  NC_008025  39684  40118  435  response regulator receiver protein  YP_603515  normal  normal  0.304768  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0044  CDS  NC_008025  40286  40609  324  multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit-like protein  YP_603516  normal  normal  0.627423  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0045  CDS  NC_008025  40596  41294  699  hypothetical protein  YP_603517  normal  normal  0.905028  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0046  CDS  NC_008025  41414  42151  738  polysaccharide deacetylase  YP_603518  normal  normal  0.671199  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0047  CDS  NC_008025  42215  42886  672  hypothetical protein  YP_603519  normal  normal  0.93712  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0048  CDS  NC_008025  43033  44091  1059  permease YjgP/YjgQ  YP_603520  normal  normal  0.71316  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0049  CDS  NC_008025  44102  45205  1104  permease YjgP/YjgQ  YP_603521  normal  normal  0.748996  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0050  CDS  NC_008025  45266  46681  1416  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  YP_603522  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0051  CDS  NC_008025  46701  48812  2112  phosphate acetyltransferase  YP_603523  normal  normal  0.833181  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0052  CDS  NC_008025  48809  49996  1188  acetate kinase  YP_603524  normal  normal  0.737495  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0053  CDS  NC_008025  50064  50513  450  hypothetical protein  YP_603525  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0054  CDS  NC_008025  50524  52458  1935  hypothetical protein  YP_603526  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0055  CDS  NC_008025  52487  54076  1590  hypothetical protein  YP_603527  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0056  CDS  NC_008025  54073  54783  711  roadblock/LC7 domain-contain protein  YP_603528  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0057  CDS  NC_008025  54859  56049  1191  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  YP_603529  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0058  CDS  NC_008025  56125  56844  720  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  YP_603530  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0059  CDS  NC_008025  57092  58465  1374  Alpha,alpha-trehalose-phosphate synthase (UDP-forming)  YP_603531  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0060  CDS  NC_008025  58462  59178  717  HAD family hydrolase  YP_603532  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0061  CDS  NC_008025  59257  59499  243  hypothetical protein  YP_603533  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0062  CDS  NC_008025  59640  60263  624  phosphoglycerate mutase  YP_603534  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0063  CDS  NC_008025  60394  61812  1419  amidophosphoribosyltransferase  YP_603535  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0064  CDS  NC_008025  61809  64049  2241  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  YP_603536  normal  0.250893  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0065  CDS  NC_008025  64046  64714  669  phosphoribosylformylglycinamidine synthase I  YP_603537  normal  0.393472  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0066  CDS  NC_008025  64711  64968  258  phosphoribosylformylglycinamidine synthetase PurS  YP_603538  normal  0.600392  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0067  CDS  NC_008025  65028  65753  726  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  YP_603539  normal  0.456741  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0068  CDS  NC_008025  66048  66899  852  HemK family modification methylase  YP_603540  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0069  CDS  NC_008025  66937  67527  591  single-stranded nucleic acid binding R3H  YP_603541  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0070  CDS  NC_008025  67615  68199  585  peptidylprolyl isomerase  YP_603542  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0071  CDS  NC_008025  68257  69522  1266  peptidase M29, aminopeptidase II  YP_603543  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0072  CDS  NC_008025  69773  70234  462  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  YP_603544  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0073  CDS  NC_008025  70231  70722  492  2-C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase  YP_603545  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0074  CDS  NC_008025  70807  71430  624  hypothetical protein  YP_603546  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0075  CDS  NC_008025  71427  72053  627  NUDIX hydrolase  YP_603547  normal  0.8643  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0076  CDS  NC_008025  72291  72848  558  DinB  YP_603548  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0077  CDS  NC_008025  72893  73894  1002  dihydrouridine synthase, DuS  YP_603549  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0078  CDS  NC_008025  74053  74559  507  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_603550  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0079  CDS  NC_008025  74592  75341  750  acetylglutamate kinase  YP_603551  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0080  CDS  NC_008025  75346  75954  609  ribosomal protein N-acetyltransferase, putative  YP_603552  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0081  CDS  NC_008025  75968  77083  1116  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase, ATPase subunit  YP_603553  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0082  CDS  NC_008025  77080  77613  534  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase, catalytic subunit  YP_603554  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0083  CDS  NC_008025  77636  78850  1215  FolC bifunctional protein  YP_603555  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0084  CDS  NC_008025  79358  79795  438  hypothetical protein  YP_603556  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0085  CDS  NC_008025  80110  80535  426  hypothetical protein  YP_603557  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0086  CDS  NC_008025  80725  81318  594  hypothetical protein  YP_603558  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0087  CDS  NC_008025  81377  82045  669  two component transcriptional regulator  YP_603559  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0088  CDS  NC_008025  82042  83121  1080  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  YP_603560  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0089  CDS  NC_008025  83147  85648  2502  ATPase, P type cation/copper-transporter  YP_603561  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0090  CDS  NC_008025  85816  86034  219  heavy metal transport/detoxification protein  YP_603562  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0091  CDS  NC_008025  86034  86378  345  hypothetical protein  YP_603563  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0092  CDS  NC_008025  86421  87728  1308  hypothetical protein  YP_603564  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0093  CDS  NC_008025  87831  88760  930  porphobilinogen deaminase  YP_603565  normal  0.779159  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0094  CDS  NC_008025  88951  89916  966  asparaginase/glutaminase  YP_603566  normal  0.875352  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0095  CDS  NC_008025  89945  90562  618  DedA family protein  YP_603567  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0096  CDS  NC_008025  90628  91344  717  HAD family hydrolase  YP_603568  normal  0.803846  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0097  CDS  NC_008025  91376  92311  936  twin-arginine translocation pathway signal  YP_603569  normal  0.848842  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0098  CDS  NC_008025  92543  93220  678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_603570  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0099  CDS  NC_008025  93423  94889  1467  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetases  YP_603571  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0100  CDS  NC_008025  94990  95373  384  ArsR family transcriptional regulator  YP_603572  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Dgeo_0101  CDS  NC_008025  95398  96021  624  deoxynucleoside kinase  YP_603573  normal  normal  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 32    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>