4134 genes were found for organism Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 42    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Sputcn32_0001  CDS  NC_009438  147  1532  1386  chromosomal replication initiation protein  YP_001181536  unclonable  5.1e-09  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0002  CDS  NC_009438  1553  2653  1101  DNA polymerase III, beta subunit  YP_001181537  hitchhiker  4.90932e-08  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0003  CDS  NC_009438  2850  3932  1083  recombination protein F  YP_001181538  hitchhiker  0.00706398  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0004  CDS  NC_009438  3949  6366  2418  DNA gyrase, B subunit  YP_001181539  normal  0.195183  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0005  CDS  NC_009438  6568  7614  1047  putative signal transduction protein  YP_001181540  normal  0.373694  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0006  CDS  NC_009438  7702  9771  2070  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  YP_001181541  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0007  CDS  NC_009438  9782  10687  906  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  YP_001181542  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0008  CDS  NC_009438  10805  11401  597  DNA-3-methyladenine glycosylase I  YP_001181543  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0009  CDS  NC_009438  11525  14713  3189  amidohydrolase  YP_001181544  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0010  CDS  NC_009438  14935  15387  453  hypothetical protein  YP_001181545  normal  0.276585  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0011  CDS  NC_009438  15432  15677  246  sulfur transfer protein SirA  YP_001181546  normal  0.119018  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0012  CDS  NC_009438  15908  17071  1164  3-ketoacyl-CoA thiolase  YP_001181547  normal  0.0898923  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0013  CDS  NC_009438  17094  19244  2151  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  YP_001181548  decreased coverage  0.000142726  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0014  CDS  NC_009438  19735  21057  1323  proline dipeptidase  YP_001181549  normal  0.258964  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0015  CDS  NC_009438  21085  21699  615  hypothetical protein  YP_001181550  normal  0.191945  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0016  CDS  NC_009438  21777  23234  1458  TrkH family potassium uptake protein  YP_001181551  normal  0.917288  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0017  CDS  NC_009438  23237  23761  525  protoporphyrinogen oxidase  YP_001181552  normal  0.324297  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0018  CDS  NC_009438  23811  24119  309  regulatory protein, ArsR  YP_001181553  normal  0.413678  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0019  CDS  NC_009438  24322  24876  555  protoporphyrinogen oxidase  YP_001181554  normal  0.309289  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0020  CDS  NC_009438  24916  26358  1443  TrkH family potassium uptake protein  YP_001181555  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0021  CDS  NC_009438  26379  27788  1410  potassium transporter peripheral membrane component  YP_001181556  normal  0.881079  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0022  CDS  NC_009438  27804  29093  1290  sun protein  YP_001181557  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0023  CDS  NC_009438  29096  30052  957  methionyl-tRNA formyltransferase  YP_001181558  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0024  CDS  NC_009438  30062  30574  513  peptide deformylase  YP_001181559  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0025  CDS  NC_009438  30700  31824  1125  peptidoglycan-binding LysM  YP_001181560  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0026  CDS  NC_009438  31903  32925  1023  DNA protecting protein DprA  YP_001181561  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0027  CDS  NC_009438  32928  33401  474  hypothetical protein  YP_001181562  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0028  CDS  NC_009438  33515  34084  570  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  YP_001181563  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0029  CDS  NC_009438  34232  34798  567  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  YP_001181564  normal  0.864856  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0030  CDS  NC_009438  34824  35732  909  coproporphyrinogen III oxidase  YP_001181565  normal  0.378098  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0031  CDS  NC_009438  35767  36204  438  globin  YP_001181566  normal  0.0800503  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0032  CDS  NC_009438  36358  37206  849  shikimate 5-dehydrogenase  YP_001181567  hitchhiker  0.00424938  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0033  CDS  NC_009438  37212  37487  276  hypothetical protein  YP_001181568  hitchhiker  2.98861e-05  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0034  CDS  NC_009438  37621  38169  549  carbonic anhydrase  YP_001181569  decreased coverage  6.02369e-08  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0035  CDS  NC_009438  44241  44495  255  hypothetical protein  YP_001181570  normal  0.80121  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0036  CDS  NC_009438  44518  44973  456  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  YP_001181571  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0037  CDS  NC_009438  44959  45702  744  protein of unknown function DUF610, YibQ  YP_001181572  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0038  CDS  NC_009438  45712  46920  1209  carboxyl-terminal protease  YP_001181573  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0039  CDS  NC_009438  46950  48083  1134  peptidase M23B  YP_001181574  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0040  CDS  NC_009438  48094  49638  1545  phosphoglyceromutase  YP_001181575  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0041  CDS  NC_009438  49905  50339  435  rhodanese domain-containing protein  YP_001181576  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0042  CDS  NC_009438  50598  51083  486  preprotein translocase subunit SecB  YP_001181577  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0043  CDS  NC_009438  51088  52104  1017  NAD(P)H-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  YP_001181578  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0044  CDS  NC_009438  52525  53709  1185  hypothetical protein  YP_001181579  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0045  CDS  NC_009438  53783  54247  465  hypothetical protein  YP_001181580  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0046  CDS  NC_009438  54548  55912  1365  TrkH family potassium uptake protein  YP_001181581  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0047  CDS  NC_009438  55914  56612  699  TrkA domain-containing protein  YP_001181582  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0048  CDS  NC_009438  56655  57344  690  two component transcriptional regulator  YP_001181583  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0049  CDS  NC_009438  57345  58391  1047  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  YP_001181584  normal  0.230731  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0050  CDS  NC_009438  58629  59552  924  pirin domain-containing protein  YP_001181585  hitchhiker  0.0017274  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0051  CDS  NC_009438  59840  61030  1191  putative plasmid transfer protein  YP_001181586  unclonable  6.49628e-09  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0052  CDS  NC_009438  61217  61681  465  NLP/P60 protein  YP_001181587  hitchhiker  0.00304715  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0053  CDS  NC_009438  61972  62505  534  molybdenum cofactor biosynthesis protein MogA  YP_001181588  normal  0.315988  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0054  CDS  NC_009438  62578  62826  249  hypothetical protein  YP_001181589  normal  0.541214  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0055  CDS  NC_009438  62906  64045  1140  transport protein, putative  YP_001181590  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0056  CDS  NC_009438  64128  64862  735  ABC transporter related  YP_001181591  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0057  CDS  NC_009438  64866  66506  1641  TAP domain-containing protein  YP_001181592  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0058  CDS  NC_009438  66600  66971  372  regulatory protein GntR, HTH  YP_001181593  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0059  CDS  NC_009438  67014  67877  864  ABC transporter related  YP_001181594  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0060  CDS  NC_009438  67874  69190  1317  hypothetical protein  YP_001181595  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0061  CDS  NC_009438  69383  71179  1797  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_001181596  normal  0.783683  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0062  CDS  NC_009438  71323  73779  2457  MORN repeat-containing protein  YP_001181597  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0063  CDS  NC_009438  73905  74315  411  thioesterase superfamily protein  YP_001181598  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0064  CDS  NC_009438  74439  74987  549  HPP family protein+B94  YP_001181599  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0065  CDS  NC_009438  74984  75250  267  hypothetical protein  YP_001181600  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0066  CDS  NC_009438  75320  75760  441  thioesterase superfamily protein  YP_001181601  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0067  CDS  NC_009438  75872  76267  396  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  YP_001181602  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0068  CDS  NC_009438  76603  77727  1125  hypothetical protein  YP_001181603  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0069  CDS  NC_009438  77797  78477  681  2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane phosphatase  YP_001181604  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0070  CDS  NC_009438  78858  79286  429  hypothetical protein  YP_001181605  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0071  CDS  NC_009438  79288  81111  1824  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  YP_001181606  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0072  CDS  NC_009438  81271  81615  345  hypothetical protein  YP_001181607  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0073  CDS  NC_009438  81838  82374  537  hypothetical protein  YP_001181608  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0074  CDS  NC_009438  82489  82845  357  hypothetical protein  YP_001181609  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0075  CDS  NC_009438  83012  83443  432  MarR family transcriptional regulator  YP_001181610  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0076  CDS  NC_009438  83522  84277  756  siderophore-interacting protein  YP_001181611  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0077  CDS  NC_009438  84375  85601  1227  imidazolonepropionase  YP_001181612  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0078  CDS  NC_009438  85836  86543  708  histidine utilization repressor  YP_001181613  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0079  CDS  NC_009438  86685  88352  1668  urocanate hydratase  YP_001181614  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0080  CDS  NC_009438  88405  89946  1542  histidine ammonia-lyase  YP_001181615  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0081  CDS  NC_009438  90072  91319  1248  gamma-glutamyl phosphate reductase  YP_001181616  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0082  CDS  NC_009438  91337  92437  1101  gamma-glutamyl kinase  YP_001181617  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0083  CDS  NC_009438  92446  93942  1497  sodium/proline symporter  YP_001181618  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0084  CDS  NC_009438  94554  95909  1356  glutathione reductase  YP_001181619  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0085  CDS  NC_009438  96040  96594  555  hypothetical protein  YP_001181620  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0086  CDS  NC_009438  96810  97508  699  hypothetical protein  YP_001181621  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0087  CDS  NC_009438  97818  99857  2040  oligopeptidase A  YP_001181622  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0088  CDS  NC_009438  100033  100563  531  hypothetical protein  YP_001181623  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0089  CDS  NC_009438  100589  101236  648  glutathione S-transferase domain-containing protein  YP_001181624  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0090  CDS  NC_009438  102007  103152  1146  RND family efflux transporter MFP subunit  YP_001181625  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0091  CDS  NC_009438  103162  106296  3135  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  YP_001181626  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0092  CDS  NC_009438  106425  106712  288  hypothetical protein  YP_001181627  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0093  CDS  NC_009438  106745  107065  321  hypothetical protein  YP_001181628  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0094  CDS  NC_009438  107146  108681  1536  AbgT putative transporter  YP_001181629  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0095  CDS  NC_009438  109245  109808  564  LemA family protein  YP_001181630  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0096  CDS  NC_009438  109915  110664  750  lytic transglycosylase, catalytic  YP_001181631  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0097  CDS  NC_009438  110661  110825  165  hypothetical protein  YP_001181632  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0098  CDS  NC_009438  110989  111834  846  hypothetical protein  YP_001181633  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0099  CDS  NC_009438  111971  114235  2265  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  YP_001181634  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Sputcn32_0100  CDS  NC_009438  114456  115235  780  hypothetical protein  YP_001181635  normal  n/a    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 42    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>