30 genes were found for organism Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Sala_3189  CDS  NC_008036  290  970  681  hypothetical protein  YP_611121  n/a    n/a    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
-
 
Sala_3190  CDS  NC_008036  1028  1795  768  hypothetical protein  YP_611122  n/a    n/a    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
-
 
Sala_3191  CDS  NC_008036  1803  4727  2925  conjugal transfer relaxase TraA  YP_611123  n/a    n/a    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
-
 
Sala_3192  CDS  NC_008036  4862  5167  306  hypothetical protein  YP_611124  n/a    n/a    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
-
 
Sala_3193  CDS  NC_008036  5145  5417  273  conjugal transfer TraD  YP_611125  n/a    n/a    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
-
 
Sala_3194  CDS  NC_008036  5726  6991  1266  uncharacterized membrane-anchored protein  YP_611126  n/a    n/a    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
-
 
Sala_3195  CDS  NC_008036  7141  8589  1449  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  YP_611127  n/a    n/a    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
-
 
Sala_3196  CDS  NC_008036  8592  8852  261  hypothetical protein  YP_611128  n/a    n/a    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
-
 
Sala_3197  CDS  NC_008036  9081  10043  963  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  YP_611129  n/a    n/a    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
-
 
Sala_3198  CDS  NC_008036  10057  11700  1644  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  YP_611130  n/a    n/a    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
-
 
Sala_3199  CDS  NC_008036  11772  12170  399  hypothetical protein  YP_611131  n/a    n/a    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
-
 
Sala_3200  CDS  NC_008036  12143  12499  357  hypothetical protein  YP_611132  n/a    n/a    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
-
 
Sala_3201  CDS  NC_008036  12487  12972  486  hydrogenase maturation protease  YP_611133  n/a    n/a    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
-
 
Sala_3202  CDS  NC_008036  12976  13287  312  hypothetical protein  YP_611134  n/a    n/a    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
-
 
Sala_3203  CDS  NC_008036  13385  14383  999  hypothetical protein  YP_611135  n/a    n/a    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
-
 
Sala_3204  CDS  NC_008036  14390  14602  213  hypothetical protein  YP_611136  n/a    n/a    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
-
 
Sala_3205  CDS  NC_008036  14771  15706  936  nitrogen-fixing NifU-like  YP_611137  n/a    n/a    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
-
 
Sala_3206  CDS  NC_008036  15622  16881  1260  NHL repeat-containing protein  YP_611138  n/a    n/a    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
-
 
Sala_3207  CDS  NC_008036  16863  19244  2382  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  YP_611139  n/a    n/a    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
-
 
Sala_3208  CDS  NC_008036  19235  19531  297  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  YP_611140  n/a    n/a    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
-
 
Sala_3209  CDS  NC_008036  19525  20211  687  phosphoheptose isomerase  YP_611141  n/a    n/a    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
-
 
Sala_3210  CDS  NC_008036  20208  21341  1134  hydrogenase expression/formation protein HypD  YP_611142  n/a    n/a    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
-
 
Sala_3211  CDS  NC_008036  21338  22387  1050  hydrogenase expression/formation protein HypE  YP_611143  n/a    n/a    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
-
 
Sala_3212  CDS  NC_008036  22403  23122  720  high-affinity nickel-transporter  YP_611144  n/a    n/a    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
-
 
Sala_3213  CDS  NC_008036  23122  23364  243  zinc finger protein  YP_611145  n/a    n/a    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
-
 
Sala_3214  CDS  NC_008036  23364  24275  912  hydrogenase accessory protein HypB  YP_611146  n/a    n/a    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
-
 
Sala_3215  CDS  NC_008036  24263  24574  312  hypothetical protein  YP_611147  n/a    n/a    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
-
 
Sala_3216  CDS  NC_008036  24760  24966  207  phage transcriptional regulator, AlpA  YP_611148  n/a    n/a    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
-
 
Sala_3217  CDS  NC_008036  25814  26143  330  hypothetical protein  YP_611149  n/a    n/a    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
-
 
Sala_3218  CDS  NC_008036  26638  28125  1488  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_611150  n/a    n/a    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>