2357 genes were found for organism Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 24    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Syncc9902_0001  CDS  NC_007513  247  1404  1158  DNA polymerase III subunit beta  YP_376019  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0002  CDS  NC_007513  1406  2155  750  hypothetical protein  YP_376020  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0003  CDS  NC_007513  2195  4495  2301  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  YP_376021  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0004  CDS  NC_007513  4495  6000  1506  amidophosphoribosyltransferase  YP_376022  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0005  CDS  NC_007513  5990  8410  2421  DNA gyrase/topoisomerase IV, subunit A  YP_376023  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0006  CDS  NC_007513  8498  9379  882  TPR repeat-containing protein  YP_376024  normal  0.437171  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0007  CDS  NC_007513  9399  10394  996  4Fe-4S cluster binding  YP_376025  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0008  CDS  NC_007513  10401  11048  648  hypothetical protein  YP_376026  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0009  CDS  NC_007513  11065  11829  765  hypothetical protein  YP_376027  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0010  CDS  NC_007513  11833  12468  636  transcription antitermination protein NusB  YP_376028  normal  0.728804  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0011  CDS  NC_007513  12468  14036  1569  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  YP_376029  normal  0.580658  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0012  CDS  NC_007513  14074  15483  1410  serine phosphatase  YP_376030  normal  0.407331  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0013  CDS  NC_007513  15521  16951  1431  argininosuccinate lyase  YP_376031  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0014  CDS  NC_007513  17078  17668  591  RNA-binding region RNP-1  YP_376032  normal  0.0890039  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0015  CDS  NC_007513  17690  18694  1005  tRNA-dihydrouridine synthase A  YP_376033  normal  0.0408966  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0016  CDS  NC_007513  18735  19241  507  methionine sulfoxide reductase B  YP_376034  normal  0.226802  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0017  CDS  NC_007513  19264  20481  1218  hypothetical protein  YP_376035  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0018  CDS  NC_007513  20544  20711  168  general secretion pathway protein E  YP_376036  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0019  CDS  NC_007513  20801  21475  675  heat shock protein GrpE  YP_376037  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0020  CDS  NC_007513  21475  22605  1131  chaperone protein DnaJ  YP_376038  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0021  CDS  NC_007513  22602  22832  231  hypothetical protein  YP_376039  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0022  CDS  NC_007513  22825  23727  903  GTPase EngC  YP_376040  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0023  CDS  NC_007513  23702  24043  342  hypothetical protein  YP_376041  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0024  CDS  NC_007513  24068  24964  897  UDP-N-acetylenolpyruvoylglucosamine reductase  YP_376042  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0025  CDS  NC_007513  24961  26367  1407  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  YP_376043  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0026  CDS  NC_007513  26528  27553  1026  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, type I  YP_376044  normal  0.502507  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0027  CDS  NC_007513  27609  28604  996  thiamine-monophosphate kinase  YP_376045  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0028  CDS  NC_007513  28601  29710  1110  putative cyclophilin-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  YP_376046  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0029  CDS  NC_007513  29743  30303  561  elongation factor P  YP_376047  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0030  CDS  NC_007513  30303  30776  474  Acetyl-CoA biotin carboxyl carrier  YP_376048  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0031  CDS  NC_007513  30779  31795  1017  4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase  YP_376049  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0032  CDS  NC_007513  31873  32796  924  hypothetical protein  YP_376050  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0033  CDS  NC_007513  33001  33411  411  HNH nuclease  YP_376051  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0034  CDS  NC_007513  33579  35174  1596  DEAD/DEAH box helicase-like  YP_376052  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0035  CDS  NC_007513  35514  35867  354  hypothetical protein  YP_376053  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0036  CDS  NC_007513  35984  36517  534  hypothetical protein  YP_376054  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0037  CDS  NC_007513  36581  36877  297  hypothetical protein  YP_376055  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0038  CDS  NC_007513  36898  37146  249  hypothetical protein  YP_376056  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0039  CDS  NC_007513  37279  37476  198  hypothetical protein  YP_376057  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0040  CDS  NC_007513  37604  38797  1194  soluble hydrogenase small subunit  YP_376058  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0041  CDS  NC_007513  38827  39915  1089  cobalt-precorrin-6A synthase  YP_376059  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0042  CDS  NC_007513  39948  41534  1587  GMP synthase  YP_376060  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0043  CDS  NC_007513  41718  42437  720  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  YP_376061  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0044  CDS  NC_007513  42577  43260  684  hypothetical protein  YP_376062  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0045  CDS  NC_007513  43319  43930  612  hypothetical protein  YP_376063  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0046  CDS  NC_007513  43940  44311  372  hypothetical protein  YP_376064  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0047  CDS  NC_007513  44315  46162  1848  peptidoglycan glycosyltransferase  YP_376065  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0048  CDS  NC_007513  46106  47254  1149  SqdX  YP_376066  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0049  CDS  NC_007513  47269  48465  1197  sulfolipid (UDP-sulfoquinovose) biosynthesis protein  YP_376067  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0050  CDS  NC_007513  48541  48714  174  high light-inducible protein-like  YP_376068  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0051  CDS  NC_007513  48792  49613  822  thiazole synthase  YP_376069  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0052  CDS  NC_007513  49665  50210  546  hypothetical protein  YP_376070  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0053  CDS  NC_007513  50232  50747  516  TPR repeat-containing protein  YP_376071  normal  0.406426  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0054  CDS  NC_007513  50757  51104  348  50S ribosomal protein L20  YP_376072  normal  0.604551  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0055  CDS  NC_007513  51158  51355  198  50S ribosomal protein L35  YP_376073  normal  0.487079  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0056  CDS  NC_007513  51413  52960  1548  amidase enhancer  YP_376074  normal  0.982033  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0057  CDS  NC_007513  52985  54316  1332  putative glycosyltransferase  YP_376075  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0058  CDS  NC_007513  54450  56327  1878  DNA-directed DNA polymerase  YP_376076  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0059  CDS  NC_007513  56351  56986  636  hypothetical protein  YP_376077  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0060  CDS  NC_007513  57130  58395  1266  peptidase, metallopeptidase  YP_376078  normal  0.210793  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0061  CDS  NC_007513  58475  59827  1353  ATP-dependent protease ATP-binding subunit ClpX  YP_376079  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0062  CDS  NC_007513  59916  60539  624  peptidase S14, ClpP  YP_376080  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0063  CDS  NC_007513  60634  61977  1344  trigger factor  YP_376081  normal  0.461988  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0064  CDS  NC_007513  62146  63168  1023  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  YP_376082  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0065  CDS  NC_007513  63168  64076  909  dihydrodipicolinate synthase  YP_376083  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0066  CDS  NC_007513  64129  66201  2073  hypothetical protein  YP_376084  normal  0.672737  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0067  CDS  NC_007513  66229  66963  735  hypothetical protein  YP_376085  normal  0.386178  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0068  CDS  NC_007513  67000  68805  1806  aspartate kinase  YP_376086  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0069  CDS  NC_007513  68949  69236  288  hypothetical protein  YP_376087  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0070  CDS  NC_007513  69543  70748  1206  hypothetical protein  YP_376088  normal  0.0837792  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0071  CDS  NC_007513  71064  71258  195  aspartate kinase  YP_376089  normal  0.304727  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0072  CDS  NC_007513  71301  72266  966  DNA polymerase III subunit delta  YP_376090  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0073  CDS  NC_007513  72276  72923  648  putative precorrin-8X methylmutase CobH  YP_376091  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0074  CDS  NC_007513  72871  73884  1014  MesJ-like protein  YP_376092  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0075  CDS  NC_007513  73918  74676  759  hypothetical protein  YP_376093  normal  0.791623  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0076  CDS  NC_007513  74715  75125  411  hypothetical protein  YP_376094  normal  0.648217  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0077  CDS  NC_007513  75197  77236  2040  excinuclease ABC subunit B  YP_376095  normal  0.5939  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0078  CDS  NC_007513  77370  77918  549  hypothetical protein  YP_376096  normal  0.0308823  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0079  CDS  NC_007513  78049  78504  456  hypothetical protein  YP_376097  normal  0.143951  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0080  CDS  NC_007513  78547  79449  903  hypothetical protein  YP_376098  normal  0.113293  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0081  CDS  NC_007513  79456  82173  2718  DNA mismatch repair protein MutS  YP_376099  normal  0.294772  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0082  CDS  NC_007513  82312  82500  189  photosystem II reaction center protein Z  YP_376100  normal  0.123151  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0083  CDS  NC_007513  82945  83631  687  glycosyltransferase  YP_376101  normal  0.413849  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0084  CDS  NC_007513  83635  84684  1050  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  YP_376102  normal  0.174225  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0085  CDS  NC_007513  84690  85556  867  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase-like  YP_376103  normal  0.192527  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0086  CDS  NC_007513  85623  86480  858  hypothetical protein  YP_376104  normal  0.176317  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0087  CDS  NC_007513  86464  87384  921  hypothetical protein  YP_376105  normal  0.204422  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0088  CDS  NC_007513  87350  88222  873  hypothetical protein  YP_376106  normal  0.439956  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0089  CDS  NC_007513  88215  89054  840  hypothetical protein  YP_376107  normal  0.357896  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0090  CDS  NC_007513  89041  89652  612  hypothetical protein  YP_376108  normal  0.327722  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0091  CDS  NC_007513  89656  90540  885  hypothetical protein  YP_376109  normal  0.402529  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0092  CDS  NC_007513  90537  92585  2049  glutamate-1-semialdehyde aminotransferase-like  YP_376110  normal  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0093  CDS  NC_007513  92586  93320  735  hypothetical protein  YP_376111  normal  0.049709  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0094  CDS  NC_007513  93320  94198  879  hypothetical protein  YP_376112  hitchhiker  0.00182847  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0095  CDS  NC_007513  94207  95187  981  dehydrogenase and related proteins-like  YP_376113  normal  0.0526429  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0096  CDS  NC_007513  95180  96463  1284  spore coat polysaccharide biosynthesis protein spsC  YP_376114  normal  0.190204  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0097  CDS  NC_007513  96504  97061  558  hypothetical protein  YP_376115  normal  0.103065  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0098  CDS  NC_007513  97058  98605  1548  hypothetical protein  YP_376116  normal  0.108904  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0099  CDS  NC_007513  98602  99657  1056  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  YP_376117  normal  0.0171907  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Syncc9902_0100  CDS  NC_007513  99650  101056  1407  HAD family hydrolase  YP_376118  normal  0.0368988  n/a    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 24    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>