29 genes were found for organism Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
VSAL_p320_01  CDS  NC_011314  127  336  210  hypothetical protein  YP_002265371  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p320_02  CDS  NC_011314  417  1130  714  hypothetical protein  YP_002265372  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p320_03  CDS  NC_011314  1404  2033  630  resolvase  YP_002265373  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p320_04  CDS  NC_011314  2052  2363  312  hypothetical protein  YP_002265374  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p320_05  CDS  NC_011314  2356  2643  288  hypothetical protein  YP_002265375  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p320_06  CDS  NC_011314  2975  3964  990  membrane protein  YP_002265376  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p320_07  CDS  NC_011314  4063  4302  240  hypothetical protein  YP_002265377  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p320_08  CDS  NC_011314  4334  4969  636  DNA-binding protein, putative plasmid partition protein  YP_002265378  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p320_09  CDS  NC_011314  5190  5381  192  hypothetical protein  YP_002265379  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p320_10  CDS  NC_011314  5398  5991  594  hypothetical protein  YP_002265380  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p320_11  CDS  NC_011314  6403  6702  300  putative DNA-damage-inducible protein  YP_002265381  normal  0.819389  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p320_12  CDS  NC_011314  7493  8353  861  hypothetical protein  YP_002265382  normal  0.459124  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p320_13  CDS  NC_011314  8744  9361  618  putative peptidase, S24-like  YP_002265383  normal  0.568691  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p320_14  CDS  NC_011314  9539  9706  168  hypothetical protein  YP_002265384  normal  0.44298  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p320_15  CDS  NC_011314  10109  10279  171  hypothetical protein  YP_002265385  normal  0.31162  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p320_16  CDS  NC_011314  10515  11087  573  hypothetical protein  YP_002265386  normal  0.364114  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p320_18  CDS  NC_011314  11555  12634  1080  putative transposase  YP_002265387  normal  0.424546  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p320_19  CDS  NC_011314  13144  14130  987  putative antirestriction protein  YP_002265388  normal  0.366429  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p320_20  CDS  NC_011314  14093  14638  546  hypothetical protein  YP_002265389  normal  0.395376  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p320_21  CDS  NC_011314  15125  15391  267  hypothetical protein  YP_002265390  normal  0.160524  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p320_22  CDS  NC_011314  15528  16211  684  hypothetical protein  YP_002265391  normal  0.0307822  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p320_23  CDS  NC_011314  16310  16576  267  hypothetical protein  YP_002265392  normal  0.0352897  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p320_24  CDS  NC_011314  16858  19917  3060  transposase  YP_002265393  normal  0.207727  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p320_26  CDS  NC_011314  21116  22195  1080  putative transposase  YP_002265394  normal  0.181682  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p320_27  CDS  NC_011314  22851  23915  1065  iron ion ABC transporter, periplasmic component  YP_002265395  normal  0.0380632  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p320_28  CDS  NC_011314  23912  24955  1044  iron ion transport system, inner membrane component  YP_002265396  normal  0.260829  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p320_29  CDS  NC_011314  24948  25694  747  iron ion ABC transporter ATP-binding protein  YP_002265397  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p320_30  CDS  NC_011314  25691  26980  1290  hypothetical protein  YP_002265398  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_p320_31  CDS  NC_011314  27160  28497  1338  putative phage intergrase  YP_002265399  normal  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>