1115 genes were found for organism Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 12    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
VSAL_II0001  CDS  NC_011313  1084  3069  +  1986  oriCII binding protein RctB  YP_002264386  normal  0.865111  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0002  CDS  NC_011313  3426  3773  +  348  putative endoribonuclease L-PSP  YP_002264387  normal  0.149481  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0003  misc_feature  NC_011313  3831  5139  +  1309      normal  0.741345  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0004  misc_feature  NC_011313  5353  6816  +  1464      normal  0.985204  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0005  misc_feature  NC_011313  6934  7287  -  354      normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0006  CDS  NC_011313  7378  7692  +  315  transposase  YP_002264388  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0007  misc_feature  NC_011313  7689  9043  +  1355      normal  0.965721  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0008  CDS  NC_011313  7796  8677  +  882  transposase  YP_002264389  normal  0.919788  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0009  misc_feature  NC_011313  9115  10602  +  1488      normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0010  CDS  NC_011313  10763  12406  -  1644  hypothetical protein  YP_002264390  normal  0.736924  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0011  CDS  NC_011313  12519  14438  -  1920  putative ATP-dependent DNA helicase  YP_002264391  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0012  CDS  NC_011313  14438  14851  -  414  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  YP_002264392  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0013  CDS  NC_011313  14938  15294  +  357  hypothetical protein  YP_002264393  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0014  CDS  NC_011313  15463  16461  +  999  putative SAM-dependent methyltransferase  YP_002264394  normal  0.748104  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0015  CDS  NC_011313  16639  17757  +  1119  secretion protein, HlyD family  YP_002264395  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0016  misc_feature  NC_011313  17759  18439  +  681      normal  0.787178  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0017  CDS  NC_011313  18608  19798  -  1191  transposase  YP_002264396  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0018  CDS  NC_011313  19931  20536  -  606  outer membrane protein OmpA family  YP_002264397  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0019  CDS  NC_011313  20539  21861  -  1323  outer membrane efflux protein  YP_002264398  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0020  CDS  NC_011313  22375  31047  +  8673  hemolysin-type calcium-binding protein  YP_002264399  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0021  CDS  NC_011313  31164  31799  +  636  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  YP_002264400  normal  0.479852  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0022  misc_feature  NC_011313  31977  32105  +  129      normal  0.444539  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0023  CDS  NC_011313  32123  33610  -  1488  transposase  YP_002264401  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0024  CDS  NC_011313  33682  34029  -  348  transposase  YP_002264402  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0025  misc_feature  NC_011313  34026  34242  -  217      normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0026  CDS  NC_011313  34583  35080  -  498  hypothetical protein  YP_002264403  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0027  CDS  NC_011313  35194  36138  -  945  protein alx  YP_002264404  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0028  CDS  NC_011313  36529  37692  +  1164  hypothetical protein  YP_002264405  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0031  CDS  NC_011313  41155  42642  -  1488  transposase  YP_002264406  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0032  CDS  NC_011313  42714  43061  -  348  transposase  YP_002264407  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0033  CDS  NC_011313  43058  43372  -  315  transposase  YP_002264408  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0034  CDS  NC_011313  44608  45717  -  1110  secretion protein, HlyD family  YP_002264409  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0035  CDS  NC_011313  45894  46502  +  609  putative transcriptional regulator, TetR family  YP_002264410  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0036  CDS  NC_011313  46584  47504  -  921  membrane protein  YP_002264411  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0037  CDS  NC_011313  47611  50316  -  2706  transcriptional regulator MalT  YP_002264412  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0038  CDS  NC_011313  50713  53166  +  2454  maltodextrin phosphorylase  YP_002264413  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0039  CDS  NC_011313  53224  55404  +  2181  4-alpha-glucanotransferase  YP_002264414  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0040  misc_feature  NC_011313  55428  57608  +  2181      normal  0.639312  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0041  CDS  NC_011313  57716  58597  -  882  transposase  YP_002264415  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0042  CDS  NC_011313  58697  59011  +  315  transposase  YP_002264416  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0043  CDS  NC_011313  59008  59355  +  348  transposase  YP_002264417  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0044  misc_feature  NC_011313  59427  59831  +  405      normal  0.793288  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0045  misc_feature  NC_011313  59911  60894  +  984      normal  0.32074  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0046  CDS  NC_011313  60913  62400  -  1488  transposase  YP_002264418  normal  0.539045  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0047  CDS  NC_011313  62472  62819  -  348  transposase  YP_002264419  normal  0.280431  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0048  CDS  NC_011313  62816  63130  -  315  transposase  YP_002264420  normal  0.0737261  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0049  misc_feature  NC_011313  63212  63469  +  258      normal  0.071135  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0050  CDS  NC_011313  63564  66209  -  2646  N,N'-diacetylchitobiase precursor (chitobiase)  YP_002264421  normal  0.304506  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0051  CDS  NC_011313  66735  67235  +  501  inner membrane protein  YP_002264422  normal  0.0519203  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0052  CDS  NC_011313  67915  68814  -  900  response regulator protein  YP_002264423  normal  0.189873  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0053  CDS  NC_011313  68853  71309  -  2457  membrane associated response regulator,histidine kinase  YP_002264424  normal  0.255701  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0054  CDS  NC_011313  71442  78503  -  7062  hypothetical protein  YP_002264425  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0055  CDS  NC_011313  78698  79012  +  315  hypothetical protein  YP_002264426  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0056  CDS  NC_011313  79067  80395  +  1329  putative type I secretion protein, HlyD family  YP_002264427  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0057  CDS  NC_011313  80402  82627  +  2226  putative membrane associated response regulator  YP_002264428  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0058  CDS  NC_011313  82627  83997  +  1371  putative type I toxin secretion system, outer membrane efflux protein  YP_002264429  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0059  CDS  NC_011313  83994  85577  +  1584  putative type I toxin secretion system, membrane transport protein  YP_002264430  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0060  CDS  NC_011313  85578  87731  +  2154  putative type I toxin secretion system,ATP-binding protein  YP_002264431  normal  0.442032  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0061  CDS  NC_011313  87782  88576  -  795  exported glycosyl hydrolase, family 16  YP_002264432  normal  0.558429  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0062  CDS  NC_011313  88569  90053  -  1485  membrane protein  YP_002264433  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0063  CDS  NC_011313  90232  91932  +  1701  putative type I secretion system, ATP-binding protein  YP_002264434  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0064  CDS  NC_011313  91947  93236  +  1290  putative type I secretion protein, HlyD family  YP_002264435  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0065  CDS  NC_011313  93246  93488  +  243  membrane protein  YP_002264436  normal  0.692596  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0066  CDS  NC_011313  93524  94282  +  759  membrane protein  YP_002264437  normal  0.416482  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0067  CDS  NC_011313  94418  94579  -  162  hypothetical protein  YP_002264438  normal  0.542527  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0068  CDS  NC_011313  94576  94767  -  192  hypothetical protein  YP_002264439  normal  0.598582  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0069  CDS  NC_011313  94820  96307  -  1488  transposase  YP_002264440  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0070  CDS  NC_011313  96379  96726  -  348  transposase  YP_002264441  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0071  misc_feature  NC_011313  96723  96939  -  217      normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0072  misc_feature  NC_011313  97024  97581  +  558      normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0073  CDS  NC_011313  97685  99019  -  1335  succinylarginine dihydrolase  YP_002264442  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0074  CDS  NC_011313  99366  100550  +  1185  membrane protein  YP_002264443  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0075  CDS  NC_011313  100746  101366  -  621  hypothetical protein  YP_002264444  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0076  CDS  NC_011313  101509  102360  +  852  integral membrane protein  YP_002264445  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0077  CDS  NC_011313  102347  103216  -  870  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  YP_002264446  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0078  CDS  NC_011313  103330  104484  +  1155  putative aminotransferase  YP_002264447  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0079  CDS  NC_011313  104527  105651  +  1125  zinc carboxypeptidase  YP_002264448  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0080  CDS  NC_011313  105883  107370  -  1488  transposase  YP_002264449  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0081  CDS  NC_011313  107442  107789  -  348  transposase  YP_002264450  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0082  misc_feature  NC_011313  107786  108100  -  315      normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0083  CDS  NC_011313  108268  109188  -  921  putative permease  YP_002264451  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0084  CDS  NC_011313  109326  110519  +  1194  transposase  YP_002264452  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0085  CDS  NC_011313  110722  110889  +  168  hypothetical protein  YP_002264453  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0086  CDS  NC_011313  110942  111295  +  354  hypothetical protein  YP_002264454  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0087  CDS  NC_011313  111425  111577  +  153  hypothetical protein  YP_002264455  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0088  CDS  NC_011313  111582  111908  +  327  hypothetical protein  YP_002264456  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0089  CDS  NC_011313  112006  112983  -  978  DNA-binding transcriptional regulator FruR  YP_002264457  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0090  CDS  NC_011313  113254  114390  +  1137  bifunctional PTS system fructose-specific transporter subunit IIA/HPr protein  YP_002264458  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0091  CDS  NC_011313  114394  115371  +  978  1-phosphofructokinase  YP_002264459  normal  0.720236  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0092  CDS  NC_011313  115402  117141  +  1740  PTS system, fructose-specific IIBC component  YP_002264460  normal  0.52822  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0093  CDS  NC_011313  117309  117767  -  459  hypothetical protein  YP_002264461  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0094  misc_feature  NC_011313  117846  118418  +  573      normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0095  CDS  NC_011313  118500  118814  +  315  transposase  YP_002264462  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0096  CDS  NC_011313  118811  119158  +  348  transposase  YP_002264463  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0097  CDS  NC_011313  119315  120196  +  882  transposase  YP_002264464  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0098  CDS  NC_011313  120237  121724  +  1488  transposase  YP_002264465  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0099  CDS  NC_011313  122303  123475  -  1173  putative lipoprotein  YP_002264466  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0100  CDS  NC_011313  123595  123861  -  267  hypothetical protein  YP_002264467  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0101  CDS  NC_011313  124530  125705  -  1176  peptidase  YP_002264468  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
VSAL_II0102  CDS  NC_011313  125864  127009  +  1146  peptide methionine sulfoxide reductase  YP_002264469  normal  1  n/a    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 12    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>