5364 genes were found for organism Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 54    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Haur_0001  CDS  NC_009972  77  1495  1419  chromosomal replication initiation protein  YP_001542781  unclonable  3.68077e-06  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0002  CDS  NC_009972  1544  3412  1869  hypothetical protein  YP_001542782  unclonable  2.85538e-05  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0003  CDS  NC_009972  3605  4564  960  peptidase M28  YP_001542783  hitchhiker  0.00570901  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0004  CDS  NC_009972  4561  5760  1200  amidohydrolase  YP_001542784  normal  0.209653  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0005  CDS  NC_009972  5996  7444  1449  TPR repeat-containing protein  YP_001542785  normal  0.0153981  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0006  CDS  NC_009972  7580  8269  690  colicin V production protein  YP_001542786  normal  0.0174335  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0007  CDS  NC_009972  8321  9760  1440  hypothetical protein  YP_001542787  unclonable  4.46047e-06  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0008  CDS  NC_009972  9907  10536  630  appr-1-p processing domain-containing protein  YP_001542788  hitchhiker  0.00352101  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0009  CDS  NC_009972  10540  11025  486  thioesterase superfamily protein  YP_001542789  normal  0.239362  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0010  CDS  NC_009972  11112  11777  666  pyrimidine 5'-nucleotidase  YP_001542790  normal  0.32249  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0011  CDS  NC_009972  11991  12365  375  hypothetical protein  YP_001542791  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0012  CDS  NC_009972  12704  14566  1863  WD40 domain-containing protein  YP_001542792  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0013  CDS  NC_009972  14745  16076  1332  diaminopimelate decarboxylase  YP_001542793  normal  0.204017  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0014  CDS  NC_009972  16213  18150  1938  DNA primase  YP_001542794  decreased coverage  0.0081672  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0015  CDS  NC_009972  18166  19368  1203  RpoD family RNA polymerase sigma factor  YP_001542795  normal  0.0128011  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0016  CDS  NC_009972  19806  20792  987  integral membrane protein TerC  YP_001542796  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0017  CDS  NC_009972  20847  21971  1125  hypothetical protein  YP_001542797  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0018  CDS  NC_009972  22004  22594  591  TetR family transcriptional regulator  YP_001542798  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0019  CDS  NC_009972  22982  24307  1326  Alpha-L-fucosidase  YP_001542799  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0020  CDS  NC_009972  24490  24696  207  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  YP_001542800  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0021  CDS  NC_009972  24708  25772  1065  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  YP_001542801  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0022  CDS  NC_009972  26163  28562  2400  hypothetical protein  YP_001542802  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0023  CDS  NC_009972  28950  31190  2241  serine/threonine protein kinase  YP_001542803  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0024  CDS  NC_009972  31252  32151  900  amidohydrolase  YP_001542804  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0025  CDS  NC_009972  32386  33102  717  thioredoxin  YP_001542805  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0026  CDS  NC_009972  33262  33489  228  MbtH domain-containing protein  YP_001542806  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0027  CDS  NC_009972  33570  34424  855  hypothetical protein  YP_001542807  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0028  CDS  NC_009972  34479  36947  2469  ATPase  YP_001542808  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0029  CDS  NC_009972  37027  38031  1005  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  YP_001542809  decreased coverage  7.66624e-06  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0030  CDS  NC_009972  38337  38798  462  hypothetical protein  YP_001542810  hitchhiker  0.0009915  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0031  CDS  NC_009972  38809  39813  1005  hypothetical protein  YP_001542811  hitchhiker  0.00551613  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0032  CDS  NC_009972  40219  41676  1458  catalase  YP_001542812  hitchhiker  0.00175553  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0033  CDS  NC_009972  41857  42765  909  LysR family transcriptional regulator  YP_001542813  hitchhiker  0.000417374  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0034  CDS  NC_009972  42959  43624  666  hypothetical protein  YP_001542814  hitchhiker  0.000849519  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0035  CDS  NC_009972  43726  44142  417  signal-transduction protein  YP_001542815  hitchhiker  0.000525301  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0036  CDS  NC_009972  44387  44965  579  hypothetical protein  YP_001542816  hitchhiker  4.77397e-06  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0037  CDS  NC_009972  45672  47507  1836  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain-containing protein  YP_001542817  unclonable  2.2588e-05  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0038  CDS  NC_009972  47511  48557  1047  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase subunit beta  YP_001542818  normal  0.204869  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0039  CDS  NC_009972  49098  49556  459  SNARE associated Golgi protein  YP_001542819  normal  0.123227  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0040  CDS  NC_009972  49590  51005  1416  hypothetical protein  YP_001542820  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0041  CDS  NC_009972  51027  51620  594  phosphoglycerate mutase  YP_001542821  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0042  CDS  NC_009972  51606  52706  1101  glycosyl transferase group 1  YP_001542822  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0043  CDS  NC_009972  52703  53551  849  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  YP_001542823  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0044  CDS  NC_009972  53702  57784  4083  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  YP_001542824  normal  0.0143745  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0045  CDS  NC_009972  57811  60849  3039  hypothetical protein  YP_001542825  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0046  CDS  NC_009972  61205  62137  933  ATPase  YP_001542826  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0047  CDS  NC_009972  62267  63649  1383  VWA containing CoxE family protein  YP_001542827  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0048  CDS  NC_009972  63851  64852  1002  beta-lactamase domain-containing protein  YP_001542828  normal  0.514639  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0049  CDS  NC_009972  64882  65640  759  Crp/FNR family transcriptional regulator  YP_001542829  normal  0.422683  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0050  CDS  NC_009972  65732  66385  654  hypothetical protein  YP_001542830  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0051  CDS  NC_009972  66439  66858  420  hypothetical protein  YP_001542831  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0052  CDS  NC_009972  67020  68072  1053  anti-sigma-factor antagonist  YP_001542832  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0053  CDS  NC_009972  68112  69212  1101  aminotransferase class I and II  YP_001542833  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0054  CDS  NC_009972  69559  70764  1206  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  YP_001542834  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0055  CDS  NC_009972  70791  71075  285  hypothetical protein  YP_001542835  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0056  CDS  NC_009972  71377  72540  1164  PGAP1 family protein  YP_001542836  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0057  CDS  NC_009972  72641  73558  918  ADP-ribosylation/crystallin J1  YP_001542837  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0058  CDS  NC_009972  73658  74212  555  hypothetical protein  YP_001542838  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0059  CDS  NC_009972  74258  74899  642  cyclase family protein  YP_001542839  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0060  CDS  NC_009972  75032  78229  3198  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  YP_001542840  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0061  CDS  NC_009972  78743  79495  753  hypothetical protein  YP_001542841  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0062  CDS  NC_009972  79505  80182  678  hypothetical protein  YP_001542842  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0063  CDS  NC_009972  80277  82202  1926  excinuclease ABC, C subunit  YP_001542843  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0064  CDS  NC_009972  82736  84370  1635  hypothetical protein  YP_001542844  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0065  CDS  NC_009972  84367  85875  1509  O-antigen polymerase  YP_001542845  normal  0.321315  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0066  CDS  NC_009972  86034  86420  387  hypothetical protein  YP_001542846  normal  0.246426  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0067  CDS  NC_009972  86433  87212  780  hypothetical protein  YP_001542847  normal  0.303807  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0068  CDS  NC_009972  87438  87788  351  hypothetical protein  YP_001542848  normal  0.0478326  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0069  CDS  NC_009972  88237  91098  2862  DNA polymerase I  YP_001542849  normal  0.512123  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0070  CDS  NC_009972  91117  93225  2109  multi-sensor signal transduction histidine kinase  YP_001542850  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0071  CDS  NC_009972  93328  94242  915  hypothetical protein  YP_001542851  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0072  CDS  NC_009972  94265  95170  906  hypothetical protein  YP_001542852  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0073  CDS  NC_009972  95172  96338  1167  hypothetical protein  YP_001542853  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0074  CDS  NC_009972  96404  97351  948  ATPase  YP_001542854  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0075  CDS  NC_009972  97351  98661  1311  hypothetical protein  YP_001542855  normal  0.258844  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0076  CDS  NC_009972  98901  99794  894  metallophosphoesterase  YP_001542856  normal  0.249391  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0077  CDS  NC_009972  100187  101365  1179  hypothetical protein  YP_001542857  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0078  CDS  NC_009972  101365  102357  993  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  YP_001542858  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0079  CDS  NC_009972  102430  104334  1905  hypothetical protein  YP_001542859  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0080  CDS  NC_009972  104516  105655  1140  polysaccharide deacetylase  YP_001542860  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0081  CDS  NC_009972  105986  106990  1005  HEAT repeat-containing PBS lyase  YP_001542861  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0082  CDS  NC_009972  107428  108180  753  LmbE family protein  YP_001542862  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0083  CDS  NC_009972  108177  109241  1065  methicillin resistance protein  YP_001542863  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0084  CDS  NC_009972  109251  110795  1545  UDP-N-acetylmuramyl-tripeptide synthetase  YP_001542864  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0085  CDS  NC_009972  110780  111388  609  hypothetical protein  YP_001542865  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0086  CDS  NC_009972  111634  112326  693  hypothetical protein  YP_001542866  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0087  CDS  NC_009972  112339  113070  732  hypothetical protein  YP_001542867  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0088  CDS  NC_009972  113386  114111  726  primosome, DnaD subunit  YP_001542868  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0089  CDS  NC_009972  113984  114784  801  IstB ATP binding domain-containing protein  YP_001542869  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0090  CDS  NC_009972  114888  118160  3273  TPR repeat-containing protein  YP_001542870  normal  0.763002  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0091  CDS  NC_009972  118259  119095  837  AraC family transcriptional regulator  YP_001542871  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0092  CDS  NC_009972  119178  119864  687  AzlC family protein  YP_001542872  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0093  CDS  NC_009972  119861  120172  312  branched-chain amino acid transport  YP_001542873  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0094  CDS  NC_009972  120426  121454  1029  cell wall hydrolase/autolysin  YP_001542874  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0095  CDS  NC_009972  121695  122441  747  response regulator receiver protein  YP_001542875  normal  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0096  CDS  NC_009972  122510  125185  2676  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  YP_001542876  normal  0.380747  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0097  CDS  NC_009972  125245  126696  1452  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, B subunit  YP_001542877  unclonable  4.07261e-06  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0098  CDS  NC_009972  126764  127735  972  hypothetical protein  YP_001542878  unclonable  7.01903e-07  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0099  CDS  NC_009972  127983  129485  1503  hypothetical protein  YP_001542879  hitchhiker  0.000355367  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Haur_0100  CDS  NC_009972  129796  131118  1323  type III restriction protein res subunit  YP_001542880  hitchhiker  0.000273539  n/a    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 54    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>