4176 genes were found for organism Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 42    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Bcer98_0001  CDS  NC_009674  521  1861  1341  chromosomal replication initiation protein  YP_001373372  unclonable  3.25337e-07  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0002  CDS  NC_009674  2043  3188  1146  DNA polymerase III subunit beta  YP_001373373  decreased coverage  0.000678483  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0003  CDS  NC_009674  3313  3525  213  hypothetical protein  YP_001373374  normal  0.0881433  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0004  CDS  NC_009674  3538  4659  1122  recombination protein F  YP_001373375  normal  0.177605  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0005  CDS  NC_009674  4698  6620  1923  DNA gyrase subunit B  YP_001373376  normal  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0006  CDS  NC_009674  6711  9176  2466  DNA gyrase subunit A  YP_001373377  normal  0.0979169  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0007  CDS  NC_009674  14509  15504  996  hypothetical protein  YP_001373378  normal  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0008  CDS  NC_009674  15620  17083  1464  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  YP_001373379  normal  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0009  CDS  NC_009674  17190  18509  1320  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  YP_001373380  normal  0.0232011  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0010  CDS  NC_009674  18669  19556  888  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  YP_001373381  hitchhiker  1.64103e-05  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0011  CDS  NC_009674  19574  20164  591  glutamine amidotransferase subunit PdxT  YP_001373382  hitchhiker  0.00056794  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0012  CDS  NC_009674  20492  21766  1275  seryl-tRNA synthetase  YP_001373383  hitchhiker  3.27784e-05  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0013    NC_009674  22027  22554  528      unclonable  1.61769e-08  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0014  CDS  NC_009674  22591  23259  669  deoxynucleoside kinase  YP_001373384  hitchhiker  4.48441e-06  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0015  CDS  NC_009674  23262  23897  636  deoxynucleoside kinase  YP_001373385  hitchhiker  0.00125792  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0016  CDS  NC_009674  24001  24558  558  isochorismatase hydrolase  YP_001373386  normal  0.0400295  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0017  CDS  NC_009674  24674  25168  495  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  YP_001373387  normal  0.0616301  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0018  CDS  NC_009674  25645  27333  1689  DNA polymerase III subunits gamma and tau  YP_001373388  normal  0.0804011  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0019  CDS  NC_009674  27356  27685  330  hypothetical protein  YP_001373389  normal  0.0215941  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0020  CDS  NC_009674  27703  28299  597  recombination protein RecR  YP_001373390  normal  0.153698  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0021  CDS  NC_009674  28314  28535  222  hypothetical protein  YP_001373391  normal  0.140785  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0022  CDS  NC_009674  28712  29029  318  sigmaK-factor processing regulatory BofA  YP_001373392  normal  0.1645  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0023  CDS  NC_009674  34513  34692  180  CsfB protein, putative  YP_001373393  normal  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0024  CDS  NC_009674  34766  36184  1419  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  YP_001373394  normal  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0025  CDS  NC_009674  36193  36819  627  thymidylate kinase  YP_001373395  normal  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0026  CDS  NC_009674  36855  37838  984  DNA polymerase III subunit delta'  YP_001373396  normal  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0027  CDS  NC_009674  37844  38671  828  PSP1 domain-containing protein  YP_001373397  normal  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0028  CDS  NC_009674  38686  39036  351  DNA replication intiation control protein YabA  YP_001373398  normal  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0029  CDS  NC_009674  39166  39906  741  hypothetical protein  YP_001373399  normal  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0030  CDS  NC_009674  39893  40183  291  GIY-YIG nuclease superfamily protein  YP_001373400  normal  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0031  CDS  NC_009674  40152  41027  876  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole methyltransferase  YP_001373401  normal  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0032  CDS  NC_009674  41048  41332  285  AbrB family transcriptional regulator  YP_001373402  normal  0.136395  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0033  CDS  NC_009674  41718  43697  1980  methionyl-tRNA synthetase  YP_001373403  normal  0.89538  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0034  CDS  NC_009674  43857  44624  768  TatD family hydrolase  YP_001373404  normal  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0035  CDS  NC_009674  44779  45336  558  primase/topoisomerase like protein  YP_001373405  normal  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0036  CDS  NC_009674  45333  46211  879  dimethyladenosine transferase  YP_001373406  normal  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0037  CDS  NC_009674  46418  47281  864  peptidase U57 YabG  YP_001373407  normal  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0038  CDS  NC_009674  47654  47965  312  hypothetical protein  YP_001373408  normal  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0039  CDS  NC_009674  48058  48237  180  small, acid-soluble spore protein  YP_001373409  normal  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0040  CDS  NC_009674  48433  49302  870  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  YP_001373410  normal  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0041  CDS  NC_009674  49357  50205  849  pur operon repressor  YP_001373411  normal  0.345211  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0042  CDS  NC_009674  50384  50758  375  putative endoribonuclease L-PSP  YP_001373412  normal  0.0493131  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0043  CDS  NC_009674  50911  51204  294  regulatory protein SpoVG  YP_001373413  decreased coverage  0.000554431  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0044  CDS  NC_009674  51518  52897  1380  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  YP_001373414  decreased coverage  0.000298582  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0045  CDS  NC_009674  52916  53869  954  ribose-phosphate pyrophosphokinase  YP_001373415  normal  0.993888  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0046  CDS  NC_009674  53942  54502  561  peptidyl-tRNA hydrolase  YP_001373416  normal  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0047  CDS  NC_009674  54573  54797  225  hypothetical protein  YP_001373417  normal  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0048  CDS  NC_009674  54903  58433  3531  transcription-repair coupling factor  YP_001373418  normal  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0049  CDS  NC_009674  58569  59105  537  AbrB family transcriptional regulator  YP_001373419  normal  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0050  CDS  NC_009674  59346  60935  1590  polysaccharide biosynthesis protein  YP_001373420  normal  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0051  CDS  NC_009674  60947  62410  1464  MazG family protein  YP_001373421  normal  0.963986  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0052  CDS  NC_009674  62422  62697  276  RNA-binding S4 domain-containing protein  YP_001373422  normal  0.052055  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0053  CDS  NC_009674  62757  63065  309  YabP family protein  YP_001373423  normal  0.0153248  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0054  CDS  NC_009674  63089  63715  627  spore cortex biosynthesis protein YabQ  YP_001373424  hitchhiker  0.000975638  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0055  CDS  NC_009674  63712  64071  360  septum formation initiator  YP_001373425  hitchhiker  3.21619e-05  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0056  CDS  NC_009674  64159  64617  459  hypothetical protein  YP_001373426  decreased coverage  1.48596e-07  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0057  CDS  NC_009674  65220  67667  2448  sporulation stage II protein E  YP_001373427  normal  0.234596  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0058  CDS  NC_009674  67860  69290  1431  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  YP_001373428  normal  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0059  CDS  NC_009674  69287  69829  543  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  YP_001373429  normal  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0060  CDS  NC_009674  69915  71834  1920  ATP-dependent metalloprotease FtsH  YP_001373430  normal  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0061  CDS  NC_009674  72044  72832  789  pantothenate kinase  YP_001373431  normal  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0062  CDS  NC_009674  72836  73711  876  Hsp33-like chaperonin  YP_001373432  normal  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0063  CDS  NC_009674  73830  74753  924  cysteine synthase A  YP_001373433  normal  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0064  CDS  NC_009674  74965  76362  1398  para-aminobenzoate synthase component I  YP_001373434  normal  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0065  CDS  NC_009674  76368  76955  588  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  YP_001373435  normal  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0066  CDS  NC_009674  76949  77806  858  4-amino-4-deoxychorismate lyase  YP_001373436  normal  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0067  CDS  NC_009674  77823  78656  834  dihydropteroate synthase  YP_001373437  normal  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0068  CDS  NC_009674  78657  79019  363  dihydroneopterin aldolase  YP_001373438  normal  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0069  CDS  NC_009674  79016  79531  516  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  YP_001373439  normal  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0070  CDS  NC_009674  79528  79686  159  XRE family transcriptional regulator  YP_001373440  normal  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0071  CDS  NC_009674  79710  80708  999  nifR3 family TIM-barrel protein  YP_001373441  normal  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0072  CDS  NC_009674  80869  82368  1500  lysyl-tRNA synthetase  YP_001373442  normal  0.407963  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0073  CDS  NC_009674  93696  94157  462  transcriptional repressor, CtsR  YP_001373443  normal  0.173946  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0074  CDS  NC_009674  94313  94861  549  UvrB/UvrC protein  YP_001373444  normal  0.0417571  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0075  CDS  NC_009674  94866  95936  1071  ATP:guanido phosphotransferase  YP_001373445  normal  0.102603  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0076  CDS  NC_009674  95952  98387  2436  ATPase  YP_001373446  normal  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0077  CDS  NC_009674  98475  99851  1377  DNA repair protein RadA  YP_001373447  normal  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0078  CDS  NC_009674  99855  100928  1074  DNA integrity scanning protein DisA  YP_001373448  normal  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0079  CDS  NC_009674  101090  102202  1113  PilT domain-containing protein  YP_001373449  normal  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0080  CDS  NC_009674  102219  102899  681  2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase  YP_001373450  normal  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0081  CDS  NC_009674  103009  103485  477  2-C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase  YP_001373451  normal  0.0684949  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0082  CDS  NC_009674  103575  105032  1458  glutamyl-tRNA synthetase  YP_001373452  hitchhiker  5.2897e-07  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0083  CDS  NC_009674  105538  106203  666  serine O-acetyltransferase  YP_001373453  hitchhiker  0.00127612  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0084  CDS  NC_009674  106184  107581  1398  cysteinyl-tRNA synthetase  YP_001373454  hitchhiker  0.000240351  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0085  CDS  NC_009674  107584  107991  408  hypothetical protein  YP_001373455  hitchhiker  8.04774e-06  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0086  CDS  NC_009674  107988  108731  744  RNA methyltransferase  YP_001373456  hitchhiker  2.84808e-06  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0087  CDS  NC_009674  108735  109247  513  hypothetical protein  YP_001373457  hitchhiker  1.09377e-07  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0088  CDS  NC_009674  109315  109977  663  RNA polymerase factor sigma-70  YP_001373458  unclonable  9.37894e-09  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0089  CDS  NC_009674  110272  110451  180  preprotein translocase subunit SecE  YP_001373459  unclonable  1.39585e-09  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0090  CDS  NC_009674  110572  111105  534  transcription antitermination protein NusG  YP_001373460  unclonable  9.96375e-09  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0091  CDS  NC_009674  111275  111700  426  50S ribosomal protein L11  YP_001373461  unclonable  5.90069e-09  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0092  CDS  NC_009674  111883  112575  693  50S ribosomal protein L1  YP_001373462  unclonable  1.71982e-08  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0093  CDS  NC_009674  112808  113308  501  50S ribosomal protein L10  YP_001373463  unclonable  7.59135e-09  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0094  CDS  NC_009674  113376  113735  360  50S ribosomal protein L7/L12  YP_001373464  unclonable  3.7425e-09  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0095  CDS  NC_009674  113811  114410  600  methyltransferase small  YP_001373465  hitchhiker  2.27182e-06  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0096    NC_009674  114701  118233  3533      normal  0.0314976  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0097  CDS  NC_009674  118271  121885  3615  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  YP_001373466  hitchhiker  0.00687501  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0098  CDS  NC_009674  121999  122247  249  hypothetical protein  YP_001373467  unclonable  3.38227e-09  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0099  CDS  NC_009674  122362  122784  423  30S ribosomal protein S12  YP_001373468  unclonable  8.14574e-09  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Bcer98_0100  CDS  NC_009674  122814  123284  471  30S ribosomal protein S7  YP_001373469  unclonable  9.00899e-09  n/a    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 42    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>